MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 2107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015183	GGGCG	2	10	1337785	1337794	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1002	NC_015183	CTTGT	2	10	1338777	1338786	0 %	60 %	20 %	20 %	325292767
1003	NC_015183	TCATG	2	10	1338787	1338796	20 %	40 %	20 %	20 %	325292767
1004	NC_015183	GTGCT	2	10	1338875	1338884	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1005	NC_015183	ATCCG	2	10	1339285	1339294	20 %	20 %	20 %	40 %	325292768
1006	NC_015183	GCCGT	2	10	1339558	1339567	0 %	20 %	40 %	40 %	325292768
1007	NC_015183	GGGCA	2	10	1342456	1342465	20 %	0 %	60 %	20 %	325292773
1008	NC_015183	CGGCT	2	10	1343604	1343613	0 %	20 %	40 %	40 %	325292774
1009	NC_015183	GGAAG	2	10	1343973	1343982	40 %	0 %	60 %	0 %	325292774
1010	NC_015183	GGACA	2	10	1344440	1344449	40 %	0 %	40 %	20 %	325292775
1011	NC_015183	ATCGT	2	10	1344711	1344720	20 %	40 %	20 %	20 %	325292775
1012	NC_015183	TGATC	2	10	1345902	1345911	20 %	40 %	20 %	20 %	325292776
1013	NC_015183	AGGGC	2	10	1347178	1347187	20 %	0 %	60 %	20 %	325292777
1014	NC_015183	GCGCG	2	10	1349442	1349451	0 %	0 %	60 %	40 %	325292778
1015	NC_015183	TCGCC	2	10	1350048	1350057	0 %	20 %	20 %	60 %	325292778
1016	NC_015183	TTCCT	2	10	1350104	1350113	0 %	60 %	0 %	40 %	325292778
1017	NC_015183	TCGAA	2	10	1351952	1351961	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1018	NC_015183	CGGTT	2	10	1353801	1353810	0 %	40 %	40 %	20 %	325292781
1019	NC_015183	GGAAA	2	10	1355352	1355361	60 %	0 %	40 %	0 %	325292783
1020	NC_015183	CCGGT	2	10	1357214	1357223	0 %	20 %	40 %	40 %	325292784
1021	NC_015183	CCGCG	2	10	1358175	1358184	0 %	0 %	40 %	60 %	325292786
1022	NC_015183	GACCA	2	10	1361698	1361707	40 %	0 %	20 %	40 %	325292789
1023	NC_015183	CTGCT	2	10	1364794	1364803	0 %	40 %	20 %	40 %	325292792
1024	NC_015183	AGGGC	2	10	1367121	1367130	20 %	0 %	60 %	20 %	325292794
1025	NC_015183	CGACG	2	10	1367346	1367355	20 %	0 %	40 %	40 %	325292794
1026	NC_015183	GCGCG	2	10	1367429	1367438	0 %	0 %	60 %	40 %	325292794
1027	NC_015183	GGAAA	2	10	1368817	1368826	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_015183	GCGAT	2	10	1369150	1369159	20 %	20 %	40 %	20 %	325292796
1029	NC_015183	CCTTC	2	10	1369824	1369833	0 %	40 %	0 %	60 %	325292797
1030	NC_015183	TCGGT	2	10	1371559	1371568	0 %	40 %	40 %	20 %	325292800
1031	NC_015183	CGATC	2	10	1373705	1373714	20 %	20 %	20 %	40 %	325292803
1032	NC_015183	GCGCC	2	10	1374383	1374392	0 %	0 %	40 %	60 %	325292803
1033	NC_015183	ATCCG	2	10	1375860	1375869	20 %	20 %	20 %	40 %	325292806
1034	NC_015183	GCCAA	2	10	1377730	1377739	40 %	0 %	20 %	40 %	325292808
1035	NC_015183	TTGGT	2	10	1377995	1378004	0 %	60 %	40 %	0 %	325292809
1036	NC_015183	GCAAC	2	10	1378046	1378055	40 %	0 %	20 %	40 %	325292809
1037	NC_015183	TAAGG	2	10	1380584	1380593	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_015183	CGACG	2	10	1381772	1381781	20 %	0 %	40 %	40 %	325292815
1039	NC_015183	AATGG	2	10	1382576	1382585	40 %	20 %	40 %	0 %	325292816
1040	NC_015183	AATGA	2	10	1383813	1383822	60 %	20 %	20 %	0 %	325292818
1041	NC_015183	TCCCG	2	10	1383909	1383918	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1042	NC_015183	GACCG	2	10	1384905	1384914	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1043	NC_015183	AGATT	2	10	1388471	1388480	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_015183	CCCTG	2	10	1389373	1389382	0 %	20 %	20 %	60 %	325292823
1045	NC_015183	GCCAA	2	10	1389590	1389599	40 %	0 %	20 %	40 %	325292823
1046	NC_015183	CTGGC	2	10	1391066	1391075	0 %	20 %	40 %	40 %	325292825
1047	NC_015183	CAATC	2	10	1392645	1392654	40 %	20 %	0 %	40 %	325292827
1048	NC_015183	GATCG	2	10	1394822	1394831	20 %	20 %	40 %	20 %	325292829
1049	NC_015183	TGGAA	2	10	1396222	1396231	40 %	20 %	40 %	0 %	325292829
1050	NC_015183	CCGCT	2	10	1396804	1396813	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1051	NC_015183	GGTTT	2	10	1397051	1397060	0 %	60 %	40 %	0 %	325292831
1052	NC_015183	TGCGG	2	10	1398935	1398944	0 %	20 %	60 %	20 %	325292833
1053	NC_015183	CAGCC	2	10	1400969	1400978	20 %	0 %	20 %	60 %	325292834
1054	NC_015183	CGCGG	2	10	1404952	1404961	0 %	0 %	60 %	40 %	325292838
1055	NC_015183	GATTT	2	10	1406396	1406405	20 %	60 %	20 %	0 %	325292839
1056	NC_015183	ATGTC	2	10	1407408	1407417	20 %	40 %	20 %	20 %	325292841
1057	NC_015183	GGCGC	2	10	1408118	1408127	0 %	0 %	60 %	40 %	325292841
1058	NC_015183	CCAGA	2	10	1411736	1411745	40 %	0 %	20 %	40 %	325292845
1059	NC_015183	ATCGG	2	10	1412535	1412544	20 %	20 %	40 %	20 %	325292846
1060	NC_015183	CGCCA	2	10	1413203	1413212	20 %	0 %	20 %	60 %	325292846
1061	NC_015183	CCGGC	2	10	1413823	1413832	0 %	0 %	40 %	60 %	325292846
1062	NC_015183	TGCGC	2	10	1417046	1417055	0 %	20 %	40 %	40 %	325292849
1063	NC_015183	TCCAT	2	10	1417141	1417150	20 %	40 %	0 %	40 %	325292849
1064	NC_015183	TAGGA	2	10	1417223	1417232	40 %	20 %	40 %	0 %	325292849
1065	NC_015183	TGCCC	2	10	1418025	1418034	0 %	20 %	20 %	60 %	325292850
1066	NC_015183	ATGAC	2	10	1418450	1418459	40 %	20 %	20 %	20 %	325292851
1067	NC_015183	AAGCG	2	10	1420178	1420187	40 %	0 %	40 %	20 %	325292852
1068	NC_015183	CCAAG	2	10	1422264	1422273	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1069	NC_015183	CGTTG	2	10	1424596	1424605	0 %	40 %	40 %	20 %	325292859
1070	NC_015183	ACATC	2	10	1427311	1427320	40 %	20 %	0 %	40 %	325292861
1071	NC_015183	GGCGT	2	10	1427710	1427719	0 %	20 %	60 %	20 %	325292861
1072	NC_015183	AACAG	2	10	1429455	1429464	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1073	NC_015183	ACCCT	2	10	1430362	1430371	20 %	20 %	0 %	60 %	325292863
1074	NC_015183	GCGCT	2	10	1430568	1430577	0 %	20 %	40 %	40 %	325292863
1075	NC_015183	CGGCA	2	10	1430771	1430780	20 %	0 %	40 %	40 %	325292863
1076	NC_015183	CTCCG	2	10	1431418	1431427	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1077	NC_015183	GCATG	2	10	1441767	1441776	20 %	20 %	40 %	20 %	325292873
1078	NC_015183	AGCCG	2	10	1441785	1441794	20 %	0 %	40 %	40 %	325292873
1079	NC_015183	CCGCA	2	10	1444597	1444606	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1080	NC_015183	CTGCG	2	10	1446284	1446293	0 %	20 %	40 %	40 %	325292881
1081	NC_015183	CAGAG	2	10	1446524	1446533	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1082	NC_015183	AAGCA	2	10	1447216	1447225	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1083	NC_015183	TTACT	2	10	1447296	1447305	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1084	NC_015183	TGCCG	2	10	1449496	1449505	0 %	20 %	40 %	40 %	325292883
1085	NC_015183	TGCGC	2	10	1452644	1452653	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1086	NC_015183	AGATC	2	10	1455628	1455637	40 %	20 %	20 %	20 %	325292890
1087	NC_015183	ATGCG	2	10	1455691	1455700	20 %	20 %	40 %	20 %	325292890
1088	NC_015183	CGTCA	2	10	1455928	1455937	20 %	20 %	20 %	40 %	325292890
1089	NC_015183	CGTTT	2	10	1456044	1456053	0 %	60 %	20 %	20 %	325292891
1090	NC_015183	CCTTC	2	10	1457340	1457349	0 %	40 %	0 %	60 %	325292891
1091	NC_015183	TCGCC	2	10	1461950	1461959	0 %	20 %	20 %	60 %	325292900
1092	NC_015183	TCAGA	2	10	1462732	1462741	40 %	20 %	20 %	20 %	325292901
1093	NC_015183	GCCTC	2	10	1464879	1464888	0 %	20 %	20 %	60 %	325292903
1094	NC_015183	CTCGC	2	10	1467428	1467437	0 %	20 %	20 %	60 %	325292905
1095	NC_015183	CGAAA	2	10	1467473	1467482	60 %	0 %	20 %	20 %	325292905
1096	NC_015183	CTTTT	2	10	1467791	1467800	0 %	80 %	0 %	20 %	325292905
1097	NC_015183	TGCGT	2	10	1467869	1467878	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1098	NC_015183	GACGC	2	10	1468514	1468523	20 %	0 %	40 %	40 %	325292906
1099	NC_015183	TGGCT	2	10	1469629	1469638	0 %	40 %	40 %	20 %	325292907
1100	NC_015183	AAAAG	2	10	1471478	1471487	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_015183	GCCAC	2	10	1473558	1473567	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1102	NC_015183	GGGAT	2	10	1474429	1474438	20 %	20 %	60 %	0 %	325292914
1103	NC_015183	ATGAA	2	10	1477007	1477016	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_015183	GCGTG	2	10	1482009	1482018	0 %	20 %	60 %	20 %	325292922
1105	NC_015183	CTGGA	2	10	1482128	1482137	20 %	20 %	40 %	20 %	325292922
1106	NC_015183	CTTCC	2	10	1482220	1482229	0 %	40 %	0 %	60 %	325292922
1107	NC_015183	CTTCG	2	10	1483906	1483915	0 %	40 %	20 %	40 %	325292923
1108	NC_015183	ATGAA	2	10	1488596	1488605	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_015183	GATCG	2	10	1489345	1489354	20 %	20 %	40 %	20 %	325292927
1110	NC_015183	CGGCG	2	10	1492187	1492196	0 %	0 %	60 %	40 %	325292929
1111	NC_015183	ACCAC	2	10	1494375	1494384	40 %	0 %	0 %	60 %	325292931
1112	NC_015183	TTTCA	2	10	1495603	1495612	20 %	60 %	0 %	20 %	325292933
1113	NC_015183	GTCTG	2	10	1495639	1495648	0 %	40 %	40 %	20 %	325292933
1114	NC_015183	TTGCG	2	10	1496383	1496392	0 %	40 %	40 %	20 %	325292934
1115	NC_015183	GCGTT	2	10	1497428	1497437	0 %	40 %	40 %	20 %	325292936
1116	NC_015183	CGTAT	2	10	1497677	1497686	20 %	40 %	20 %	20 %	325292937
1117	NC_015183	TTGCC	2	10	1500304	1500313	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1118	NC_015183	GAGGT	2	10	1507483	1507492	20 %	20 %	60 %	0 %	325292946
1119	NC_015183	GCCCT	2	10	1508552	1508561	0 %	20 %	20 %	60 %	325292949
1120	NC_015183	GATCA	2	10	1511486	1511495	40 %	20 %	20 %	20 %	325292953
1121	NC_015183	GGTCA	2	10	1515042	1515051	20 %	20 %	40 %	20 %	325292958
1122	NC_015183	GTCGC	2	10	1518497	1518506	0 %	20 %	40 %	40 %	325292960
1123	NC_015183	CCGGT	2	10	1519449	1519458	0 %	20 %	40 %	40 %	325292961
1124	NC_015183	TCGCT	2	10	1519814	1519823	0 %	40 %	20 %	40 %	325292961
1125	NC_015183	GCCCT	2	10	1520371	1520380	0 %	20 %	20 %	60 %	325292962
1126	NC_015183	AATAA	2	10	1520865	1520874	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1243	NC_015183	GGTCA	2	10	1666731	1666740	20 %	20 %	40 %	20 %	325293102
1244	NC_015183	GGCGC	2	10	1667486	1667495	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1245	NC_015183	TCACG	2	10	1668823	1668832	20 %	20 %	20 %	40 %	325293103
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1247	NC_015183	CCTGA	2	10	1670710	1670719	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1248	NC_015183	CGGGC	2	10	1672694	1672703	0 %	0 %	60 %	40 %	325293105
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1252	NC_015183	TTGCC	2	10	1674048	1674057	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1351	NC_015183	GACGG	2	10	1799966	1799975	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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1359	NC_015183	GCAAG	2	10	1805253	1805262	40 %	0 %	40 %	20 %	325293247
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1364	NC_015183	GGATC	2	10	1810654	1810663	20 %	20 %	40 %	20 %	325293252
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1484	NC_015183	TTTCC	2	10	1965471	1965480	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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