MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 2107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015183	TTCGT	2	10	684116	684125	0 %	60 %	20 %	20 %	325292109
502	NC_015183	CGCAT	2	10	685796	685805	20 %	20 %	20 %	40 %	325292112
503	NC_015183	GTGCC	2	10	687395	687404	0 %	20 %	40 %	40 %	325292113
504	NC_015183	GTCCG	2	10	688878	688887	0 %	20 %	40 %	40 %	325292115
505	NC_015183	GGGAG	2	10	690138	690147	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015183	GGCAC	2	10	690182	690191	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
507	NC_015183	CACCG	2	10	690609	690618	20 %	0 %	20 %	60 %	325292117
508	NC_015183	ATCGC	2	10	695207	695216	20 %	20 %	20 %	40 %	325292121
509	NC_015183	CGCAG	2	10	695375	695384	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
510	NC_015183	AGCGG	2	10	696802	696811	20 %	0 %	60 %	20 %	325292122
511	NC_015183	CGTCT	2	10	698723	698732	0 %	40 %	20 %	40 %	325292125
512	NC_015183	GGCTG	2	10	699460	699469	0 %	20 %	60 %	20 %	325292126
513	NC_015183	AAGGA	2	10	700159	700168	60 %	0 %	40 %	0 %	325292127
514	NC_015183	GGCTT	2	10	700747	700756	0 %	40 %	40 %	20 %	325292127
515	NC_015183	GCCGG	2	10	702002	702011	0 %	0 %	60 %	40 %	325292128
516	NC_015183	GAACA	2	10	703460	703469	60 %	0 %	20 %	20 %	325292130
517	NC_015183	TGGCC	2	10	708108	708117	0 %	20 %	40 %	40 %	325292136
518	NC_015183	TCGCC	2	10	708568	708577	0 %	20 %	20 %	60 %	325292137
519	NC_015183	CAGGA	2	10	710701	710710	40 %	0 %	40 %	20 %	325292139
520	NC_015183	CAGGG	2	10	713595	713604	20 %	0 %	60 %	20 %	325292142
521	NC_015183	GCGCT	2	10	715833	715842	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
522	NC_015183	AACCG	2	10	716755	716764	40 %	0 %	20 %	40 %	325292147
523	NC_015183	CGGCA	2	10	721620	721629	20 %	0 %	40 %	40 %	325292151
524	NC_015183	GATCC	2	10	721654	721663	20 %	20 %	20 %	40 %	325292151
525	NC_015183	GGCAT	2	10	721786	721795	20 %	20 %	40 %	20 %	325292151
526	NC_015183	CCGGA	2	10	722521	722530	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
527	NC_015183	GCCGC	2	10	726123	726132	0 %	0 %	40 %	60 %	325292157
528	NC_015183	GGCGC	2	10	726224	726233	0 %	0 %	60 %	40 %	325292157
529	NC_015183	TGCGC	2	10	727622	727631	0 %	20 %	40 %	40 %	325292158
530	NC_015183	GCGCT	2	10	728846	728855	0 %	20 %	40 %	40 %	325292159
531	NC_015183	AAGGC	2	10	730557	730566	40 %	0 %	40 %	20 %	325292162
532	NC_015183	GTCCA	2	10	731653	731662	20 %	20 %	20 %	40 %	325292162
533	NC_015183	AACTG	2	10	732400	732409	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
534	NC_015183	GAAAA	2	10	732994	733003	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015183	GGCGA	2	10	733875	733884	20 %	0 %	60 %	20 %	325292164
536	NC_015183	TGGAC	2	10	734603	734612	20 %	20 %	40 %	20 %	325292165
537	NC_015183	TGGCG	2	10	735984	735993	0 %	20 %	60 %	20 %	325292167
538	NC_015183	TGGTC	2	10	740770	740779	0 %	40 %	40 %	20 %	325292170
539	NC_015183	CGGTT	2	10	742849	742858	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
540	NC_015183	CCGCG	2	10	744741	744750	0 %	0 %	40 %	60 %	325292175
541	NC_015183	ATCGC	2	10	745776	745785	20 %	20 %	20 %	40 %	325292176
542	NC_015183	TCCGC	2	10	746057	746066	0 %	20 %	20 %	60 %	325292177
543	NC_015183	GCTTC	2	10	746693	746702	0 %	40 %	20 %	40 %	325292177
544	NC_015183	ACAGC	2	10	746819	746828	40 %	0 %	20 %	40 %	325292177
545	NC_015183	GCGGA	2	10	751866	751875	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
546	NC_015183	GCCCG	2	10	752095	752104	0 %	0 %	40 %	60 %	325292183
547	NC_015183	AAGGG	2	10	756473	756482	40 %	0 %	60 %	0 %	325292184
548	NC_015183	CGCGC	2	10	758503	758512	0 %	0 %	40 %	60 %	325292185
549	NC_015183	ATGCC	2	10	764373	764382	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
550	NC_015183	CGTCA	2	10	765632	765641	20 %	20 %	20 %	40 %	325292191
551	NC_015183	GAGAT	2	10	771013	771022	40 %	20 %	40 %	0 %	325292196
552	NC_015183	TGACA	2	10	771734	771743	40 %	20 %	20 %	20 %	325292197
553	NC_015183	TCGGC	2	10	773088	773097	0 %	20 %	40 %	40 %	325292199
554	NC_015183	TGCGC	2	10	774448	774457	0 %	20 %	40 %	40 %	325292200
555	NC_015183	TCTGG	2	10	775461	775470	0 %	40 %	40 %	20 %	325292201
556	NC_015183	CCAAC	2	10	777088	777097	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
557	NC_015183	AGGGC	2	10	778232	778241	20 %	0 %	60 %	20 %	325292203
558	NC_015183	GCGCC	2	10	779662	779671	0 %	0 %	40 %	60 %	325292204
559	NC_015183	CTGGC	2	10	783572	783581	0 %	20 %	40 %	40 %	325292208
560	NC_015183	GCCGT	2	10	784098	784107	0 %	20 %	40 %	40 %	325292208
561	NC_015183	GCCTG	2	10	784459	784468	0 %	20 %	40 %	40 %	325292208
562	NC_015183	TGCCG	2	10	788551	788560	0 %	20 %	40 %	40 %	325292213
563	NC_015183	TCGGC	2	10	791483	791492	0 %	20 %	40 %	40 %	325292217
564	NC_015183	GCTCG	2	10	791592	791601	0 %	20 %	40 %	40 %	325292217
565	NC_015183	GTTCG	2	10	791994	792003	0 %	40 %	40 %	20 %	325292217
566	NC_015183	CCCAT	2	10	792225	792234	20 %	20 %	0 %	60 %	325292217
567	NC_015183	CCGGT	2	10	792781	792790	0 %	20 %	40 %	40 %	325292217
568	NC_015183	AAAAC	2	10	792981	792990	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
569	NC_015183	AGCGC	2	10	793609	793618	20 %	0 %	40 %	40 %	325292218
570	NC_015183	GCCGA	2	10	795793	795802	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
571	NC_015183	ACCGC	2	10	797937	797946	20 %	0 %	20 %	60 %	325292221
572	NC_015183	CCGTG	2	10	797961	797970	0 %	20 %	40 %	40 %	325292221
573	NC_015183	AGGTC	2	10	799651	799660	20 %	20 %	40 %	20 %	325292221
574	NC_015183	GGTCG	2	10	800459	800468	0 %	20 %	60 %	20 %	325292222
575	NC_015183	GGCAA	2	10	800680	800689	40 %	0 %	40 %	20 %	325292222
576	NC_015183	CTTTC	2	10	800972	800981	0 %	60 %	0 %	40 %	325292223
577	NC_015183	AAGCC	2	10	801662	801671	40 %	0 %	20 %	40 %	325292223
578	NC_015183	GCGCC	2	10	802092	802101	0 %	0 %	40 %	60 %	325292224
579	NC_015183	GGGAA	2	10	802199	802208	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
580	NC_015183	AATTG	2	10	802316	802325	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015183	CCAAC	2	10	802347	802356	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
582	NC_015183	ATGCC	2	10	802365	802374	20 %	20 %	20 %	40 %	325292225
583	NC_015183	AAGGA	2	10	802871	802880	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015183	GCAGG	2	10	802927	802936	20 %	0 %	60 %	20 %	325292226
585	NC_015183	GGCAA	2	10	805404	805413	40 %	0 %	40 %	20 %	325292228
586	NC_015183	AGCGG	2	10	806998	807007	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
587	NC_015183	GGCAC	2	10	807959	807968	20 %	0 %	40 %	40 %	325292232
588	NC_015183	GACGG	2	10	807982	807991	20 %	0 %	60 %	20 %	325292232
589	NC_015183	TGCGG	2	10	810709	810718	0 %	20 %	60 %	20 %	325292235
590	NC_015183	GCGCC	2	10	813699	813708	0 %	0 %	40 %	60 %	325292240
591	NC_015183	AAGCG	2	10	813922	813931	40 %	0 %	40 %	20 %	325292240
592	NC_015183	GCGCG	2	10	815145	815154	0 %	0 %	60 %	40 %	325292242
593	NC_015183	GACCG	2	10	816567	816576	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
594	NC_015183	CAGCG	2	10	816773	816782	20 %	0 %	40 %	40 %	325292244
595	NC_015183	CCATG	2	10	819602	819611	20 %	20 %	20 %	40 %	325292247
596	NC_015183	TGCAG	2	10	821040	821049	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
597	NC_015183	CTTCC	2	10	821117	821126	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
598	NC_015183	CCTCG	2	10	821613	821622	0 %	20 %	20 %	60 %	325292249
599	NC_015183	CGATG	2	10	822111	822120	20 %	20 %	40 %	20 %	325292249
600	NC_015183	GCCGC	2	10	828896	828905	0 %	0 %	40 %	60 %	325292256
601	NC_015183	GCGAT	2	10	829922	829931	20 %	20 %	40 %	20 %	325292258
602	NC_015183	GCCTT	2	10	831999	832008	0 %	40 %	20 %	40 %	325292261
603	NC_015183	GCGCG	2	10	832959	832968	0 %	0 %	60 %	40 %	325292263
604	NC_015183	CCGGA	2	10	834427	834436	20 %	0 %	40 %	40 %	325292265
605	NC_015183	GGTTC	2	10	835104	835113	0 %	40 %	40 %	20 %	325292267
606	NC_015183	GGTCG	2	10	837492	837501	0 %	20 %	60 %	20 %	325292269
607	NC_015183	TTTGG	2	10	838651	838660	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
608	NC_015183	TGGAG	2	10	838781	838790	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
609	NC_015183	GGCAG	2	10	838838	838847	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
610	NC_015183	GTAAT	2	10	841208	841217	40 %	40 %	20 %	0 %	325292273
611	NC_015183	CCTTG	2	10	842091	842100	0 %	40 %	20 %	40 %	325292273
612	NC_015183	GTAGG	2	10	842361	842370	20 %	20 %	60 %	0 %	325292273
613	NC_015183	CCTTG	2	10	842767	842776	0 %	40 %	20 %	40 %	325292274
614	NC_015183	CGGCG	2	10	845322	845331	0 %	0 %	60 %	40 %	325292277
615	NC_015183	GCCGG	2	10	846620	846629	0 %	0 %	60 %	40 %	325292278
616	NC_015183	CGCGG	2	10	847993	848002	0 %	0 %	60 %	40 %	325292279
617	NC_015183	GCGCG	2	10	848039	848048	0 %	0 %	60 %	40 %	325292279
618	NC_015183	TCGCA	2	10	848837	848846	20 %	20 %	20 %	40 %	325292280
619	NC_015183	TCCGG	2	10	851467	851476	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
620	NC_015183	CGTGC	2	10	853382	853391	0 %	20 %	40 %	40 %	325292286
621	NC_015183	GTCTC	2	10	854762	854771	0 %	40 %	20 %	40 %	325292287
622	NC_015183	GCGGG	2	10	855318	855327	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
623	NC_015183	GGTGC	2	10	855452	855461	0 %	20 %	60 %	20 %	325292289
624	NC_015183	GTCCG	2	10	857069	857078	0 %	20 %	40 %	40 %	325292290
625	NC_015183	TCCTG	2	10	859808	859817	0 %	40 %	20 %	40 %	325292295
626	NC_015183	CCGGC	2	10	860124	860133	0 %	0 %	40 %	60 %	325292295
627	NC_015183	AGGCG	2	10	864099	864108	20 %	0 %	60 %	20 %	325292299
628	NC_015183	GCTGA	2	10	865522	865531	20 %	20 %	40 %	20 %	325292301
629	NC_015183	GCGTC	2	10	865635	865644	0 %	20 %	40 %	40 %	325292301
630	NC_015183	GGCGC	2	10	868083	868092	0 %	0 %	60 %	40 %	325292305
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