MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 1787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013205	CACAT	2	10	2852	2861	40 %	20 %	0 %	40 %	258510023
2	NC_013205	ACCGC	2	10	3534	3543	20 %	0 %	20 %	60 %	258510024
3	NC_013205	TCGGC	2	10	4079	4088	0 %	20 %	40 %	40 %	258510024
4	NC_013205	GACGC	2	10	6811	6820	20 %	0 %	40 %	40 %	258510026
5	NC_013205	GCCGC	2	10	8258	8267	0 %	0 %	40 %	60 %	258510026
6	NC_013205	GACGT	2	10	10438	10447	20 %	20 %	40 %	20 %	258510030
7	NC_013205	GCTCG	2	10	18410	18419	0 %	20 %	40 %	40 %	258510032
8	NC_013205	GGCGC	2	10	20374	20383	0 %	0 %	60 %	40 %	258510034
9	NC_013205	CCTTC	2	10	21193	21202	0 %	40 %	0 %	60 %	258510036
10	NC_013205	AGGTG	2	10	24395	24404	20 %	20 %	60 %	0 %	258510037
11	NC_013205	AGATG	2	10	25379	25388	40 %	20 %	40 %	0 %	258510038
12	NC_013205	CTTCC	2	10	28510	28519	0 %	40 %	0 %	60 %	258510040
13	NC_013205	TGGCT	2	10	28987	28996	0 %	40 %	40 %	20 %	258510040
14	NC_013205	CCGCG	2	10	33506	33515	0 %	0 %	40 %	60 %	258510044
15	NC_013205	GCGTC	2	10	34339	34348	0 %	20 %	40 %	40 %	258510045
16	NC_013205	CGCGG	2	10	34375	34384	0 %	0 %	60 %	40 %	258510045
17	NC_013205	GAAGC	2	10	38051	38060	40 %	0 %	40 %	20 %	258510047
18	NC_013205	AGCCA	2	10	40675	40684	40 %	0 %	20 %	40 %	258510048
19	NC_013205	GCGCC	2	10	42233	42242	0 %	0 %	40 %	60 %	258510049
20	NC_013205	GCGAT	2	10	44196	44205	20 %	20 %	40 %	20 %	258510051
21	NC_013205	GCCTT	2	10	44253	44262	0 %	40 %	20 %	40 %	258510051
22	NC_013205	GCCGC	2	10	44501	44510	0 %	0 %	40 %	60 %	258510051
23	NC_013205	GTCCG	2	10	44622	44631	0 %	20 %	40 %	40 %	258510051
24	NC_013205	CTGCC	2	10	44672	44681	0 %	20 %	20 %	60 %	258510051
25	NC_013205	TTTCG	2	10	44936	44945	0 %	60 %	20 %	20 %	258510051
26	NC_013205	AGCGG	2	10	48410	48419	20 %	0 %	60 %	20 %	258510055
27	NC_013205	GCGCG	2	10	50106	50115	0 %	0 %	60 %	40 %	258510058
28	NC_013205	CGCGC	2	10	50582	50591	0 %	0 %	40 %	60 %	258510058
29	NC_013205	CGAGG	2	10	52463	52472	20 %	0 %	60 %	20 %	258510059
30	NC_013205	CCACA	2	10	52843	52852	40 %	0 %	0 %	60 %	258510060
31	NC_013205	CCGCA	2	10	53734	53743	20 %	0 %	20 %	60 %	258510061
32	NC_013205	AGGTG	2	10	54773	54782	20 %	20 %	60 %	0 %	258510062
33	NC_013205	CGATT	2	10	54860	54869	20 %	40 %	20 %	20 %	258510062
34	NC_013205	TGGGC	2	10	57332	57341	0 %	20 %	60 %	20 %	258510064
35	NC_013205	TCGTG	2	10	58204	58213	0 %	40 %	40 %	20 %	258510066
36	NC_013205	GCCGC	2	10	58255	58264	0 %	0 %	40 %	60 %	258510066
37	NC_013205	CTGGC	2	10	59078	59087	0 %	20 %	40 %	40 %	258510067
38	NC_013205	CGGAG	2	10	62566	62575	20 %	0 %	60 %	20 %	258510068
39	NC_013205	TCGCG	2	10	64245	64254	0 %	20 %	40 %	40 %	258510070
40	NC_013205	CGAGG	2	10	64354	64363	20 %	0 %	60 %	20 %	258510070
41	NC_013205	CCTGC	2	10	64541	64550	0 %	20 %	20 %	60 %	258510070
42	NC_013205	GCGGA	2	10	68466	68475	20 %	0 %	60 %	20 %	258510073
43	NC_013205	CGGAG	2	10	70538	70547	20 %	0 %	60 %	20 %	258510074
44	NC_013205	CTCGT	2	10	79131	79140	0 %	40 %	20 %	40 %	258510081
45	NC_013205	CGATG	2	10	79571	79580	20 %	20 %	40 %	20 %	258510081
46	NC_013205	ACGGC	2	10	80350	80359	20 %	0 %	40 %	40 %	258510081
47	NC_013205	CGATG	2	10	81163	81172	20 %	20 %	40 %	20 %	258510083
48	NC_013205	GGCGC	2	10	81760	81769	0 %	0 %	60 %	40 %	258510083
49	NC_013205	GCGAG	2	10	82213	82222	20 %	0 %	60 %	20 %	258510083
50	NC_013205	CGAGG	2	10	83227	83236	20 %	0 %	60 %	20 %	258510084
51	NC_013205	CGAGC	2	10	83511	83520	20 %	0 %	40 %	40 %	258510084
52	NC_013205	CTGTG	2	10	83988	83997	0 %	40 %	40 %	20 %	258510084
53	NC_013205	GTCGA	2	10	85357	85366	20 %	20 %	40 %	20 %	258510086
54	NC_013205	GTCCA	2	10	87049	87058	20 %	20 %	20 %	40 %	258510086
55	NC_013205	GACGA	2	10	87931	87940	40 %	0 %	40 %	20 %	258510087
56	NC_013205	CCGGG	2	10	92541	92550	0 %	0 %	60 %	40 %	258510092
57	NC_013205	GCCGA	2	10	92744	92753	20 %	0 %	40 %	40 %	258510092
58	NC_013205	GGCGC	2	10	93113	93122	0 %	0 %	60 %	40 %	258510092
59	NC_013205	GGCGT	2	10	94446	94455	0 %	20 %	60 %	20 %	258510094
60	NC_013205	CGCGC	2	10	100112	100121	0 %	0 %	40 %	60 %	258510098
61	NC_013205	CCGGC	2	10	100864	100873	0 %	0 %	40 %	60 %	258510099
62	NC_013205	GAGCG	2	10	102450	102459	20 %	0 %	60 %	20 %	258510101
63	NC_013205	CGGCG	2	10	103263	103272	0 %	0 %	60 %	40 %	258510101
64	NC_013205	CGCTT	2	10	105720	105729	0 %	40 %	20 %	40 %	258510102
65	NC_013205	GCGAG	2	10	106581	106590	20 %	0 %	60 %	20 %	258510102
66	NC_013205	CGTGG	2	10	108833	108842	0 %	20 %	60 %	20 %	258510105
67	NC_013205	CCTCG	2	10	109211	109220	0 %	20 %	20 %	60 %	258510105
68	NC_013205	CCATC	2	10	110172	110181	20 %	20 %	0 %	60 %	258510107
69	NC_013205	CGGCG	2	10	110286	110295	0 %	0 %	60 %	40 %	258510107
70	NC_013205	CCGCG	2	10	111350	111359	0 %	0 %	40 %	60 %	258510110
71	NC_013205	GAAGC	2	10	112528	112537	40 %	0 %	40 %	20 %	258510110
72	NC_013205	CGGCG	2	10	112990	112999	0 %	0 %	60 %	40 %	258510110
73	NC_013205	ACGCC	2	10	117136	117145	20 %	0 %	20 %	60 %	258510115
74	NC_013205	CTCGG	3	15	118915	118929	0 %	20 %	40 %	40 %	258510117
75	NC_013205	GGGTG	2	10	119939	119948	0 %	20 %	80 %	0 %	258510120
76	NC_013205	TCGAG	2	10	120747	120756	20 %	20 %	40 %	20 %	258510120
77	NC_013205	ACGAG	2	10	121230	121239	40 %	0 %	40 %	20 %	258510120
78	NC_013205	CGATT	2	10	125384	125393	20 %	40 %	20 %	20 %	258510125
79	NC_013205	AGGCG	2	10	127385	127394	20 %	0 %	60 %	20 %	258510127
80	NC_013205	ATGAG	2	10	128518	128527	40 %	20 %	40 %	0 %	258510129
81	NC_013205	GGTGC	2	10	134522	134531	0 %	20 %	60 %	20 %	258510135
82	NC_013205	GCTTC	2	10	135463	135472	0 %	40 %	20 %	40 %	258510136
83	NC_013205	CGCGG	2	10	137609	137618	0 %	0 %	60 %	40 %	258510139
84	NC_013205	CTGCC	2	10	137880	137889	0 %	20 %	20 %	60 %	258510139
85	NC_013205	CGCCT	2	10	140081	140090	0 %	20 %	20 %	60 %	258510142
86	NC_013205	GGACG	2	10	144427	144436	20 %	0 %	60 %	20 %	258510147
87	NC_013205	CCGCG	2	10	145676	145685	0 %	0 %	40 %	60 %	258510148
88	NC_013205	GCGCC	2	10	145863	145872	0 %	0 %	40 %	60 %	258510148
89	NC_013205	TCGTC	2	10	146564	146573	0 %	40 %	20 %	40 %	258510149
90	NC_013205	CGGCG	2	10	152029	152038	0 %	0 %	60 %	40 %	258510154
91	NC_013205	GTGGC	2	10	152207	152216	0 %	20 %	60 %	20 %	258510154
92	NC_013205	GTGGC	2	10	152418	152427	0 %	20 %	60 %	20 %	258510155
93	NC_013205	AACGG	2	10	153312	153321	40 %	0 %	40 %	20 %	258510156
94	NC_013205	TGAGC	2	10	153541	153550	20 %	20 %	40 %	20 %	258510156
95	NC_013205	TGACC	2	10	153953	153962	20 %	20 %	20 %	40 %	258510157
96	NC_013205	TGGCG	2	10	154581	154590	0 %	20 %	60 %	20 %	258510158
97	NC_013205	CGGCG	2	10	155165	155174	0 %	0 %	60 %	40 %	258510158
98	NC_013205	CGGGC	2	10	155516	155525	0 %	0 %	60 %	40 %	258510158
99	NC_013205	GGAAG	2	10	156525	156534	40 %	0 %	60 %	0 %	258510159
100	NC_013205	GGCGT	2	10	156847	156856	0 %	20 %	60 %	20 %	258510159
101	NC_013205	ATCCC	2	10	157115	157124	20 %	20 %	0 %	60 %	258510159
102	NC_013205	ACGGC	2	10	157897	157906	20 %	0 %	40 %	40 %	258510160
103	NC_013205	GGCGT	2	10	160064	160073	0 %	20 %	60 %	20 %	258510162
104	NC_013205	CGGAG	2	10	160525	160534	20 %	0 %	60 %	20 %	258510162
105	NC_013205	TCGCG	2	10	162281	162290	0 %	20 %	40 %	40 %	258510164
106	NC_013205	TCGAT	2	10	163831	163840	20 %	40 %	20 %	20 %	258510166
107	NC_013205	CAGGG	2	10	166964	166973	20 %	0 %	60 %	20 %	258510168
108	NC_013205	TGCGC	2	10	167574	167583	0 %	20 %	40 %	40 %	258510169
109	NC_013205	ATCGC	2	10	170947	170956	20 %	20 %	20 %	40 %	258510171
110	NC_013205	CGTGG	2	10	175178	175187	0 %	20 %	60 %	20 %	258510174
111	NC_013205	AGCCG	2	10	177386	177395	20 %	0 %	40 %	40 %	258510177
112	NC_013205	GGGGC	2	10	180643	180652	0 %	0 %	80 %	20 %	258510179
113	NC_013205	CGCGC	2	10	185339	185348	0 %	0 %	40 %	60 %	258510185
114	NC_013205	CTTCG	2	10	186233	186242	0 %	40 %	20 %	40 %	258510186
115	NC_013205	GGCAG	2	10	187324	187333	20 %	0 %	60 %	20 %	258510187
116	NC_013205	CCGCG	2	10	190942	190951	0 %	0 %	40 %	60 %	258510191
117	NC_013205	GGCGG	2	10	192255	192264	0 %	0 %	80 %	20 %	258510191
118	NC_013205	GCTTT	2	10	192626	192635	0 %	60 %	20 %	20 %	258510192
119	NC_013205	CTCGC	2	10	193783	193792	0 %	20 %	20 %	60 %	258510193
120	NC_013205	GGCAC	2	10	195364	195373	20 %	0 %	40 %	40 %	258510196
121	NC_013205	GACGC	2	10	195801	195810	20 %	0 %	40 %	40 %	258510196
122	NC_013205	CGCTG	2	10	198196	198205	0 %	20 %	40 %	40 %	258510198
123	NC_013205	GGATG	2	10	198690	198699	20 %	20 %	60 %	0 %	258510200
124	NC_013205	GCGGA	2	10	200116	200125	20 %	0 %	60 %	20 %	258510200
125	NC_013205	CGCGC	2	10	205082	205091	0 %	0 %	40 %	60 %	258510204
126	NC_013205	AGTCG	2	10	206595	206604	20 %	20 %	40 %	20 %	258510208
127	NC_013205	GCCAA	2	10	208822	208831	40 %	0 %	20 %	40 %	258510213
128	NC_013205	GCGCC	2	10	208881	208890	0 %	0 %	40 %	60 %	258510213
129	NC_013205	CGCGC	2	10	210049	210058	0 %	0 %	40 %	60 %	258510213
130	NC_013205	GCCGG	2	10	210342	210351	0 %	0 %	60 %	40 %	258510213
131	NC_013205	CGGCA	2	10	211438	211447	20 %	0 %	40 %	40 %	258510214
132	NC_013205	GCGCG	2	10	213514	213523	0 %	0 %	60 %	40 %	258510216
133	NC_013205	CGCGG	2	10	215985	215994	0 %	0 %	60 %	40 %	258510218
134	NC_013205	GACTT	2	10	218917	218926	20 %	40 %	20 %	20 %	258510220
135	NC_013205	GGACG	2	10	220594	220603	20 %	0 %	60 %	20 %	258510221
136	NC_013205	CCGCG	2	10	221957	221966	0 %	0 %	40 %	60 %	258510223
137	NC_013205	CGGGC	2	10	222697	222706	0 %	0 %	60 %	40 %	258510224
138	NC_013205	GCATG	2	10	225504	225513	20 %	20 %	40 %	20 %	258510227
139	NC_013205	TTTTG	2	10	232279	232288	0 %	80 %	20 %	0 %	258510230
140	NC_013205	GGATG	2	10	232292	232301	20 %	20 %	60 %	0 %	258510230
141	NC_013205	CGCGG	2	10	232460	232469	0 %	0 %	60 %	40 %	258510230
142	NC_013205	GTATT	2	10	232673	232682	20 %	60 %	20 %	0 %	258510230
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152	NC_013205	GCTCG	2	10	243908	243917	0 %	20 %	40 %	40 %	258510241
153	NC_013205	ATCGC	2	10	244180	244189	20 %	20 %	20 %	40 %	258510241
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159	NC_013205	CTCGC	2	10	256222	256231	0 %	20 %	20 %	60 %	258510252
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170	NC_013205	CGGCG	2	10	279181	279190	0 %	0 %	60 %	40 %	258510271
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195	NC_013205	AGCGG	2	10	336030	336039	20 %	0 %	60 %	20 %	258510304
196	NC_013205	GACGG	2	10	336062	336071	20 %	0 %	60 %	20 %	258510304
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199	NC_013205	TGCGC	2	10	338386	338395	0 %	20 %	40 %	40 %	258510307
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202	NC_013205	GCTCG	2	10	347151	347160	0 %	20 %	40 %	40 %	258510315
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211	NC_013205	GCGAA	2	10	354723	354732	40 %	0 %	40 %	20 %	258510322
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246	NC_013205	CGGCA	2	10	405525	405534	20 %	0 %	40 %	40 %	258510360
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248	NC_013205	AGGGA	2	10	407447	407456	40 %	0 %	60 %	0 %	258510361
249	NC_013205	AGGCG	2	10	411888	411897	20 %	0 %	60 %	20 %	258510368
250	NC_013205	CCCGC	2	10	412713	412722	0 %	0 %	20 %	80 %	258510369
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252	NC_013205	GGCCG	2	10	413681	413690	0 %	0 %	60 %	40 %	258510369
253	NC_013205	CGGTA	2	10	417510	417519	20 %	20 %	40 %	20 %	258510374
254	NC_013205	GGTGG	2	10	418801	418810	0 %	20 %	80 %	0 %	258510375
255	NC_013205	TCGCG	2	10	419556	419565	0 %	20 %	40 %	40 %	258510376
256	NC_013205	TTTCC	2	10	425654	425663	0 %	60 %	0 %	40 %	258510386
257	NC_013205	CCATC	2	10	426784	426793	20 %	20 %	0 %	60 %	258510387
258	NC_013205	GCCAG	2	10	427738	427747	20 %	0 %	40 %	40 %	258510387
259	NC_013205	GCCCG	2	10	428669	428678	0 %	0 %	40 %	60 %	258510388
260	NC_013205	TGGGC	2	10	428908	428917	0 %	20 %	60 %	20 %	258510388
261	NC_013205	ACGTC	2	10	429027	429036	20 %	20 %	20 %	40 %	258510388
262	NC_013205	CGGGA	2	10	430786	430795	20 %	0 %	60 %	20 %	258510391
263	NC_013205	GGTCA	2	10	433435	433444	20 %	20 %	40 %	20 %	258510394
264	NC_013205	CGGCG	2	10	434495	434504	0 %	0 %	60 %	40 %	258510395
265	NC_013205	CCGTC	2	10	436808	436817	0 %	20 %	20 %	60 %	258510397
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381	NC_013205	CGGCT	2	10	650282	650291	0 %	20 %	40 %	40 %	258510606
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384	NC_013205	CGGCA	2	10	652511	652520	20 %	0 %	40 %	40 %	258510609
385	NC_013205	TGGCG	2	10	652523	652532	0 %	20 %	60 %	20 %	258510609
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388	NC_013205	AACGA	2	10	655372	655381	60 %	0 %	20 %	20 %	258510613
389	NC_013205	ATCAC	2	10	655424	655433	40 %	20 %	0 %	40 %	258510613
390	NC_013205	AAACG	2	10	656293	656302	60 %	0 %	20 %	20 %	258510614
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