MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 1787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013205	CGCAC	2	10	857999	858008	20 %	0 %	20 %	60 %	258510789
502	NC_013205	CGAGA	2	10	860329	860338	40 %	0 %	40 %	20 %	258510789
503	NC_013205	GGATC	2	10	860343	860352	20 %	20 %	40 %	20 %	258510789
504	NC_013205	GGCGC	2	10	861403	861412	0 %	0 %	60 %	40 %	258510789
505	NC_013205	TTCGC	2	10	863780	863789	0 %	40 %	20 %	40 %	258510790
506	NC_013205	GTCAA	2	10	865528	865537	40 %	20 %	20 %	20 %	258510791
507	NC_013205	TTACA	2	10	867011	867020	40 %	40 %	0 %	20 %	258510793
508	NC_013205	ACTTG	2	10	867408	867417	20 %	40 %	20 %	20 %	258510793
509	NC_013205	CACTC	2	10	868560	868569	20 %	20 %	0 %	60 %	258510794
510	NC_013205	GGGGC	2	10	868946	868955	0 %	0 %	80 %	20 %	258510794
511	NC_013205	GAGTG	2	10	870380	870389	20 %	20 %	60 %	0 %	258510795
512	NC_013205	CGAAT	2	10	871763	871772	40 %	20 %	20 %	20 %	258510796
513	NC_013205	TGGGG	2	10	872257	872266	0 %	20 %	80 %	0 %	258510797
514	NC_013205	GCGAC	2	10	872799	872808	20 %	0 %	40 %	40 %	258510797
515	NC_013205	GCTCG	2	10	872938	872947	0 %	20 %	40 %	40 %	258510797
516	NC_013205	CGGCG	2	10	873739	873748	0 %	0 %	60 %	40 %	258510798
517	NC_013205	CCGAT	2	10	874063	874072	20 %	20 %	20 %	40 %	258510798
518	NC_013205	GCGCG	2	10	874724	874733	0 %	0 %	60 %	40 %	258510799
519	NC_013205	ACGGC	2	10	879146	879155	20 %	0 %	40 %	40 %	258510802
520	NC_013205	ACGGC	2	10	879311	879320	20 %	0 %	40 %	40 %	258510802
521	NC_013205	TTCGA	2	10	881143	881152	20 %	40 %	20 %	20 %	258510804
522	NC_013205	CGCGC	2	10	881966	881975	0 %	0 %	40 %	60 %	258510806
523	NC_013205	TCGCC	2	10	882070	882079	0 %	20 %	20 %	60 %	258510806
524	NC_013205	GCTGG	2	10	882697	882706	0 %	20 %	60 %	20 %	258510807
525	NC_013205	TGTGG	2	10	884220	884229	0 %	40 %	60 %	0 %	258510808
526	NC_013205	TTCGG	2	10	884998	885007	0 %	40 %	40 %	20 %	258510810
527	NC_013205	GGCCG	2	10	886492	886501	0 %	0 %	60 %	40 %	258510811
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529	NC_013205	TCGCG	2	10	894870	894879	0 %	20 %	40 %	40 %	258510821
530	NC_013205	GACGG	2	10	897674	897683	20 %	0 %	60 %	20 %	258510824
531	NC_013205	GGCGC	2	10	901769	901778	0 %	0 %	60 %	40 %	258510828
532	NC_013205	TGTCG	2	10	903768	903777	0 %	40 %	40 %	20 %	258510830
533	NC_013205	TCGAC	2	10	903983	903992	20 %	20 %	20 %	40 %	258510830
534	NC_013205	GGCGC	2	10	905353	905362	0 %	0 %	60 %	40 %	258510830
535	NC_013205	CACCT	2	10	908323	908332	20 %	20 %	0 %	60 %	258510832
536	NC_013205	CCGTC	2	10	910073	910082	0 %	20 %	20 %	60 %	258510833
537	NC_013205	CGGCG	2	10	915525	915534	0 %	0 %	60 %	40 %	258510837
538	NC_013205	CGAGG	2	10	921593	921602	20 %	0 %	60 %	20 %	258510842
539	NC_013205	TGCCG	2	10	922231	922240	0 %	20 %	40 %	40 %	258510842
540	NC_013205	CCGCG	2	10	924266	924275	0 %	0 %	40 %	60 %	258510846
541	NC_013205	AGGCG	2	10	925325	925334	20 %	0 %	60 %	20 %	258510846
542	NC_013205	GATCT	2	10	926654	926663	20 %	40 %	20 %	20 %	258510847
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544	NC_013205	GATTC	2	10	929241	929250	20 %	40 %	20 %	20 %	258510848
545	NC_013205	GGCTT	2	10	930771	930780	0 %	40 %	40 %	20 %	258510849
546	NC_013205	GGCGC	2	10	937604	937613	0 %	0 %	60 %	40 %	258510858
547	NC_013205	GGCGA	2	10	937789	937798	20 %	0 %	60 %	20 %	258510858
548	NC_013205	TCACG	2	10	939512	939521	20 %	20 %	20 %	40 %	258510859
549	NC_013205	CCGGC	2	10	940455	940464	0 %	0 %	40 %	60 %	258510861
550	NC_013205	CTTCC	2	10	944045	944054	0 %	40 %	0 %	60 %	258510864
551	NC_013205	CCTCG	2	10	944593	944602	0 %	20 %	20 %	60 %	258510865
552	NC_013205	CGGCG	2	10	948791	948800	0 %	0 %	60 %	40 %	258510869
553	NC_013205	CTCGT	2	10	949218	949227	0 %	40 %	20 %	40 %	258510869
554	NC_013205	GCAGC	2	10	949291	949300	20 %	0 %	40 %	40 %	258510869
555	NC_013205	GGTCA	2	10	952659	952668	20 %	20 %	40 %	20 %	258510871
556	NC_013205	CACGG	2	10	954711	954720	20 %	0 %	40 %	40 %	258510873
557	NC_013205	CGGAT	2	10	956310	956319	20 %	20 %	40 %	20 %	258510876
558	NC_013205	CGCGA	2	10	958518	958527	20 %	0 %	40 %	40 %	258510880
559	NC_013205	CGAGG	2	10	960084	960093	20 %	0 %	60 %	20 %	258510881
560	NC_013205	TGCGC	2	10	964407	964416	0 %	20 %	40 %	40 %	258510886
561	NC_013205	GCGCA	2	10	964519	964528	20 %	0 %	40 %	40 %	258510886
562	NC_013205	CGCGA	2	10	966014	966023	20 %	0 %	40 %	40 %	258510887
563	NC_013205	TCCGC	2	10	966026	966035	0 %	20 %	20 %	60 %	258510887
564	NC_013205	ATGGG	2	10	967119	967128	20 %	20 %	60 %	0 %	258510889
565	NC_013205	TTGAC	2	10	970571	970580	20 %	40 %	20 %	20 %	258510892
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567	NC_013205	TCGCT	2	10	976076	976085	0 %	40 %	20 %	40 %	258510896
568	NC_013205	CGGCG	2	10	976239	976248	0 %	0 %	60 %	40 %	258510896
569	NC_013205	GCGGT	2	10	978658	978667	0 %	20 %	60 %	20 %	258510898
570	NC_013205	TCGCG	2	10	979108	979117	0 %	20 %	40 %	40 %	258510899
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574	NC_013205	TCGTC	2	10	982250	982259	0 %	40 %	20 %	40 %	258510901
575	NC_013205	TGGCT	2	10	982264	982273	0 %	40 %	40 %	20 %	258510901
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607	NC_013205	ATGGC	2	10	1032679	1032688	20 %	20 %	40 %	20 %	258510953
608	NC_013205	GGCGC	2	10	1033994	1034003	0 %	0 %	60 %	40 %	258510954
609	NC_013205	CACGC	2	10	1034680	1034689	20 %	0 %	20 %	60 %	258510954
610	NC_013205	GGGCA	2	10	1035214	1035223	20 %	0 %	60 %	20 %	258510954
611	NC_013205	AGCGG	2	10	1040899	1040908	20 %	0 %	60 %	20 %	258510963
612	NC_013205	GCGCC	2	10	1041597	1041606	0 %	0 %	40 %	60 %	258510963
613	NC_013205	TCGCG	2	10	1042642	1042651	0 %	20 %	40 %	40 %	258510964
614	NC_013205	GCTCG	2	10	1046921	1046930	0 %	20 %	40 %	40 %	258510967
615	NC_013205	GGCGC	2	10	1049757	1049766	0 %	0 %	60 %	40 %	258510970
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619	NC_013205	TCCGG	2	10	1057283	1057292	0 %	20 %	40 %	40 %	258510977
620	NC_013205	CGGTG	2	10	1057737	1057746	0 %	20 %	60 %	20 %	258510977
621	NC_013205	CGCGG	2	10	1057807	1057816	0 %	0 %	60 %	40 %	258510977
622	NC_013205	GCAGG	2	10	1058007	1058016	20 %	0 %	60 %	20 %	258510977
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625	NC_013205	GGGCA	2	10	1061772	1061781	20 %	0 %	60 %	20 %	258510981
626	NC_013205	GATCA	2	10	1064312	1064321	40 %	20 %	20 %	20 %	258510985
627	NC_013205	CCGCG	2	10	1067434	1067443	0 %	0 %	40 %	60 %	258510989
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629	NC_013205	CGAAT	2	10	1069187	1069196	40 %	20 %	20 %	20 %	258510990
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637	NC_013205	TCGAT	2	10	1075126	1075135	20 %	40 %	20 %	20 %	258510998
638	NC_013205	CGCTG	2	10	1075989	1075998	0 %	20 %	40 %	40 %	258510998
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998	NC_013205	GCGAG	2	10	1736170	1736179	20 %	0 %	60 %	20 %	258511631
999	NC_013205	AGGTG	2	10	1736962	1736971	20 %	20 %	60 %	0 %	258511631
1000	NC_013205	CAGCG	2	10	1737382	1737391	20 %	0 %	40 %	40 %	258511632

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