MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 1787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013205	CGCTT	2	10	1738815	1738824	0 %	40 %	20 %	40 %	258511633
1002	NC_013205	TCGCG	2	10	1743944	1743953	0 %	20 %	40 %	40 %	258511639
1003	NC_013205	TCTCG	2	10	1744252	1744261	0 %	40 %	20 %	40 %	258511639
1004	NC_013205	CGCAC	2	10	1745984	1745993	20 %	0 %	20 %	60 %	258511641
1005	NC_013205	CGAAG	2	10	1746356	1746365	40 %	0 %	40 %	20 %	258511641
1006	NC_013205	AAGGA	2	10	1746945	1746954	60 %	0 %	40 %	0 %	258511642
1007	NC_013205	TGAGG	2	10	1747471	1747480	20 %	20 %	60 %	0 %	258511642
1008	NC_013205	GATGC	2	10	1748889	1748898	20 %	20 %	40 %	20 %	258511644
1009	NC_013205	ACGCC	2	10	1750834	1750843	20 %	0 %	20 %	60 %	258511646
1010	NC_013205	CGGAC	2	10	1751121	1751130	20 %	0 %	40 %	40 %	258511647
1011	NC_013205	CGCTG	2	10	1751348	1751357	0 %	20 %	40 %	40 %	258511648
1012	NC_013205	TCGAA	2	10	1753189	1753198	40 %	20 %	20 %	20 %	258511649
1013	NC_013205	GAAAC	2	10	1754185	1754194	60 %	0 %	20 %	20 %	258511649
1014	NC_013205	GCTGA	2	10	1756543	1756552	20 %	20 %	40 %	20 %	258511654
1015	NC_013205	GCGCA	2	10	1760814	1760823	20 %	0 %	40 %	40 %	258511660
1016	NC_013205	CTTCC	2	10	1761205	1761214	0 %	40 %	0 %	60 %	258511661
1017	NC_013205	GAAAT	2	10	1761790	1761799	60 %	20 %	20 %	0 %	258511661
1018	NC_013205	GCGCA	2	10	1764042	1764051	20 %	0 %	40 %	40 %	258511664
1019	NC_013205	GACGA	2	10	1764235	1764244	40 %	0 %	40 %	20 %	258511664
1020	NC_013205	TCCGC	2	10	1765076	1765085	0 %	20 %	20 %	60 %	258511664
1021	NC_013205	CCGTG	2	10	1766907	1766916	0 %	20 %	40 %	40 %	258511667
1022	NC_013205	GATCC	2	10	1768713	1768722	20 %	20 %	20 %	40 %	258511668
1023	NC_013205	ACCTC	2	10	1771036	1771045	20 %	20 %	0 %	60 %	258511671
1024	NC_013205	CGCGC	2	10	1772529	1772538	0 %	0 %	40 %	60 %	258511673
1025	NC_013205	TGTCG	2	10	1773283	1773292	0 %	40 %	40 %	20 %	258511674
1026	NC_013205	ACCCG	2	10	1773952	1773961	20 %	0 %	20 %	60 %	258511675
1027	NC_013205	GCGCA	2	10	1774631	1774640	20 %	0 %	40 %	40 %	258511675
1028	NC_013205	GCCGC	2	10	1774743	1774752	0 %	0 %	40 %	60 %	258511675
1029	NC_013205	ACGTG	2	10	1778755	1778764	20 %	20 %	40 %	20 %	258511680
1030	NC_013205	CGAGG	2	10	1785905	1785914	20 %	0 %	60 %	20 %	258511682
1031	NC_013205	CAGGG	2	10	1787741	1787750	20 %	0 %	60 %	20 %	258511684
1032	NC_013205	TCCCG	2	10	1789029	1789038	0 %	20 %	20 %	60 %	258511686
1033	NC_013205	TGCTG	2	10	1795207	1795216	0 %	40 %	40 %	20 %	258511695
1034	NC_013205	ACGCC	2	10	1796903	1796912	20 %	0 %	20 %	60 %	258511697
1035	NC_013205	CACGG	2	10	1798122	1798131	20 %	0 %	40 %	40 %	258511699
1036	NC_013205	GCTTC	2	10	1799010	1799019	0 %	40 %	20 %	40 %	258511701
1037	NC_013205	TCCAA	2	10	1801619	1801628	40 %	20 %	0 %	40 %	258511705
1038	NC_013205	GCTCC	2	10	1805497	1805506	0 %	20 %	20 %	60 %	258511711
1039	NC_013205	CGATC	2	10	1806317	1806326	20 %	20 %	20 %	40 %	258511713
1040	NC_013205	GCGCG	2	10	1807336	1807345	0 %	0 %	60 %	40 %	258511714
1041	NC_013205	TCGCG	2	10	1807500	1807509	0 %	20 %	40 %	40 %	258511714
1042	NC_013205	TCGAA	2	10	1809622	1809631	40 %	20 %	20 %	20 %	258511716
1043	NC_013205	GCGCC	2	10	1810417	1810426	0 %	0 %	40 %	60 %	258511716
1044	NC_013205	GTCCG	2	10	1811228	1811237	0 %	20 %	40 %	40 %	258511717
1045	NC_013205	CCGCA	2	10	1812867	1812876	20 %	0 %	20 %	60 %	258511720
1046	NC_013205	CGCGA	2	10	1813159	1813168	20 %	0 %	40 %	40 %	258511720
1047	NC_013205	AGTCG	2	10	1813256	1813265	20 %	20 %	40 %	20 %	258511720
1048	NC_013205	TCCGC	2	10	1814283	1814292	0 %	20 %	20 %	60 %	258511722
1049	NC_013205	CGCGC	2	10	1814486	1814495	0 %	0 %	40 %	60 %	258511722
1050	NC_013205	TCGCT	2	10	1816976	1816985	0 %	40 %	20 %	40 %	258511725
1051	NC_013205	TGCGG	2	10	1818049	1818058	0 %	20 %	60 %	20 %	258511726
1052	NC_013205	GGAGC	2	10	1823865	1823874	20 %	0 %	60 %	20 %	258511733
1053	NC_013205	GCGAG	2	10	1823909	1823918	20 %	0 %	60 %	20 %	258511733
1054	NC_013205	CGTCA	2	10	1825916	1825925	20 %	20 %	20 %	40 %	258511735
1055	NC_013205	TCGCC	2	10	1826794	1826803	0 %	20 %	20 %	60 %	258511736
1056	NC_013205	CCTCG	2	10	1826825	1826834	0 %	20 %	20 %	60 %	258511736
1057	NC_013205	GCCAA	2	10	1831736	1831745	40 %	0 %	20 %	40 %	258511741
1058	NC_013205	ACCGT	2	10	1832664	1832673	20 %	20 %	20 %	40 %	258511743
1059	NC_013205	CGCCC	2	10	1832912	1832921	0 %	0 %	20 %	80 %	258511743
1060	NC_013205	AAGCG	2	10	1835181	1835190	40 %	0 %	40 %	20 %	258511745
1061	NC_013205	TCGAC	2	10	1838471	1838480	20 %	20 %	20 %	40 %	258511750
1062	NC_013205	CGGAT	2	10	1842162	1842171	20 %	20 %	40 %	20 %	258511755
1063	NC_013205	AGTTC	2	10	1846454	1846463	20 %	40 %	20 %	20 %	258511762
1064	NC_013205	GCCGC	2	10	1847924	1847933	0 %	0 %	40 %	60 %	258511765
1065	NC_013205	CCGGC	2	10	1848491	1848500	0 %	0 %	40 %	60 %	258511765
1066	NC_013205	CGAAG	2	10	1851778	1851787	40 %	0 %	40 %	20 %	258511767
1067	NC_013205	GTCCG	2	10	1854564	1854573	0 %	20 %	40 %	40 %	258511770
1068	NC_013205	CAGCC	2	10	1854978	1854987	20 %	0 %	20 %	60 %	258511770
1069	NC_013205	GCGAC	2	10	1855541	1855550	20 %	0 %	40 %	40 %	258511771
1070	NC_013205	CCACG	2	10	1856025	1856034	20 %	0 %	20 %	60 %	258511772
1071	NC_013205	CCTCG	2	10	1856260	1856269	0 %	20 %	20 %	60 %	258511772
1072	NC_013205	CACAA	2	10	1856348	1856357	60 %	0 %	0 %	40 %	258511772
1073	NC_013205	ATCCA	2	10	1858793	1858802	40 %	20 %	0 %	40 %	258511777
1074	NC_013205	GCTCG	2	10	1860314	1860323	0 %	20 %	40 %	40 %	258511779
1075	NC_013205	CCACG	2	10	1860560	1860569	20 %	0 %	20 %	60 %	258511780
1076	NC_013205	TCCGA	2	10	1863201	1863210	20 %	20 %	20 %	40 %	258511784
1077	NC_013205	TGCGA	2	10	1866178	1866187	20 %	20 %	40 %	20 %	258511788
1078	NC_013205	CCCGC	2	10	1869369	1869378	0 %	0 %	20 %	80 %	258511792
1079	NC_013205	CACCG	2	10	1870748	1870757	20 %	0 %	20 %	60 %	258511793
1080	NC_013205	CATGA	2	10	1871964	1871973	40 %	20 %	20 %	20 %	258511794
1081	NC_013205	TTCGG	2	10	1873664	1873673	0 %	40 %	40 %	20 %	258511795
1082	NC_013205	CTTCC	2	10	1879660	1879669	0 %	40 %	0 %	60 %	258511798
1083	NC_013205	GATGA	2	10	1889206	1889215	40 %	20 %	40 %	0 %	258511808
1084	NC_013205	TCGCC	2	10	1890263	1890272	0 %	20 %	20 %	60 %	258511809
1085	NC_013205	CGGGG	2	10	1892606	1892615	0 %	0 %	80 %	20 %	258511810
1086	NC_013205	CGATC	2	10	1895686	1895695	20 %	20 %	20 %	40 %	258511812
1087	NC_013205	ATCGA	2	10	1899122	1899131	40 %	20 %	20 %	20 %	258511816
1088	NC_013205	TCAGC	2	10	1902089	1902098	20 %	20 %	20 %	40 %	258511819
1089	NC_013205	AGCGA	2	10	1904466	1904475	40 %	0 %	40 %	20 %	258511822
1090	NC_013205	GAATC	2	10	1907275	1907284	40 %	20 %	20 %	20 %	258511825
1091	NC_013205	GGCCA	2	10	1907540	1907549	20 %	0 %	40 %	40 %	258511825
1092	NC_013205	GCCGA	2	10	1907886	1907895	20 %	0 %	40 %	40 %	258511825
1093	NC_013205	CACAG	2	10	1908605	1908614	40 %	0 %	20 %	40 %	258511826
1094	NC_013205	CGTGA	2	10	1911156	1911165	20 %	20 %	40 %	20 %	258511829
1095	NC_013205	TGCGC	2	10	1912687	1912696	0 %	20 %	40 %	40 %	258511830
1096	NC_013205	TTCCG	2	10	1913564	1913573	0 %	40 %	20 %	40 %	258511831
1097	NC_013205	CGAAG	2	10	1915325	1915334	40 %	0 %	40 %	20 %	258511832
1098	NC_013205	GAACG	2	10	1915795	1915804	40 %	0 %	40 %	20 %	258511832
1099	NC_013205	GTCAC	2	10	1916531	1916540	20 %	20 %	20 %	40 %	258511832
1100	NC_013205	GAACG	2	10	1921265	1921274	40 %	0 %	40 %	20 %	258511837
1101	NC_013205	CCGAC	2	10	1921486	1921495	20 %	0 %	20 %	60 %	258511837
1102	NC_013205	AACGC	2	10	1921743	1921752	40 %	0 %	20 %	40 %	258511837
1103	NC_013205	AAGCG	2	10	1922350	1922359	40 %	0 %	40 %	20 %	258511838
1104	NC_013205	GCGTC	2	10	1923414	1923423	0 %	20 %	40 %	40 %	258511840
1105	NC_013205	TCGAT	2	10	1924566	1924575	20 %	40 %	20 %	20 %	258511842
1106	NC_013205	CAGAA	2	10	1925610	1925619	60 %	0 %	20 %	20 %	258511843
1107	NC_013205	CCTGC	2	10	1926074	1926083	0 %	20 %	20 %	60 %	258511843
1108	NC_013205	CCATC	2	10	1926989	1926998	20 %	20 %	0 %	60 %	258511844
1109	NC_013205	ACGCC	2	10	1927891	1927900	20 %	0 %	20 %	60 %	258511846
1110	NC_013205	ATCCA	2	10	1928155	1928164	40 %	20 %	0 %	40 %	258511846
1111	NC_013205	GTCCG	2	10	1929999	1930008	0 %	20 %	40 %	40 %	258511849
1112	NC_013205	TCCAA	2	10	1930103	1930112	40 %	20 %	0 %	40 %	258511849
1113	NC_013205	ACGCG	2	10	1930235	1930244	20 %	0 %	40 %	40 %	258511849
1114	NC_013205	GGCGT	2	10	1931327	1931336	0 %	20 %	60 %	20 %	258511851
1115	NC_013205	GGCGC	2	10	1931808	1931817	0 %	0 %	60 %	40 %	258511852
1116	NC_013205	TGCGC	2	10	1932856	1932865	0 %	20 %	40 %	40 %	258511853
1117	NC_013205	ACGCC	2	10	1935979	1935988	20 %	0 %	20 %	60 %	258511854
1118	NC_013205	CTCGA	2	10	1936305	1936314	20 %	20 %	20 %	40 %	258511854
1119	NC_013205	CCGCC	2	10	1936633	1936642	0 %	0 %	20 %	80 %	258511855
1120	NC_013205	GCGCG	2	10	1943644	1943653	0 %	0 %	60 %	40 %	258511862
1121	NC_013205	TCACC	2	10	1946242	1946251	20 %	20 %	0 %	60 %	258511865
1122	NC_013205	TGGCC	2	10	1947748	1947757	0 %	20 %	40 %	40 %	258511866
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1124	NC_013205	CTTGC	2	10	1951424	1951433	0 %	40 %	20 %	40 %	258511870
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1368	NC_013205	TGAGG	2	10	2332107	2332116	20 %	20 %	60 %	0 %	258512234
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1492	NC_013205	CCAGG	2	10	2498398	2498407	20 %	0 %	40 %	40 %	258512396
1493	NC_013205	CCGTG	2	10	2499104	2499113	0 %	20 %	40 %	40 %	258512398
1494	NC_013205	GTCGA	2	10	2499640	2499649	20 %	20 %	40 %	20 %	258512398
1495	NC_013205	CCGCC	2	10	2501160	2501169	0 %	0 %	20 %	80 %	258512399
1496	NC_013205	AGTCC	2	10	2502455	2502464	20 %	20 %	20 %	40 %	258512400
1497	NC_013205	TCGCG	2	10	2502930	2502939	0 %	20 %	40 %	40 %	258512400
1498	NC_013205	GCCGC	2	10	2503833	2503842	0 %	0 %	40 %	60 %	258512401
1499	NC_013205	CGGCT	2	10	2503921	2503930	0 %	20 %	40 %	40 %	258512401
1500	NC_013205	GGCGC	2	10	2505275	2505284	0 %	0 %	60 %	40 %	258512402

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