MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 1579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013156	ATTTC	2	10	3836	3845	20 %	60 %	0 %	20 %	256809978
2	NC_013156	TTTAA	2	10	5219	5228	40 %	60 %	0 %	0 %	256809979
3	NC_013156	TAAGT	2	10	6381	6390	40 %	40 %	20 %	0 %	256809979
4	NC_013156	AAGTA	2	10	6946	6955	60 %	20 %	20 %	0 %	256809980
5	NC_013156	ATATG	2	10	7261	7270	40 %	40 %	20 %	0 %	256809980
6	NC_013156	TGTAA	2	10	8679	8688	40 %	40 %	20 %	0 %	256809981
7	NC_013156	TAAAG	2	10	8943	8952	60 %	20 %	20 %	0 %	256809981
8	NC_013156	AATAA	2	10	9282	9291	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013156	TAAAA	2	10	9928	9937	80 %	20 %	0 %	0 %	256809982
10	NC_013156	TTTAA	2	10	9953	9962	40 %	60 %	0 %	0 %	256809982
11	NC_013156	TTTAT	2	10	11559	11568	20 %	80 %	0 %	0 %	256809984
12	NC_013156	TCCTC	2	10	12014	12023	0 %	40 %	0 %	60 %	256809986
13	NC_013156	ATTAT	2	10	12890	12899	40 %	60 %	0 %	0 %	256809987
14	NC_013156	TTTAT	2	10	13109	13118	20 %	80 %	0 %	0 %	256809987
15	NC_013156	ACAAA	2	10	13964	13973	80 %	0 %	0 %	20 %	256809988
16	NC_013156	TTAAA	2	10	15291	15300	60 %	40 %	0 %	0 %	256809990
17	NC_013156	ATTTA	2	10	16694	16703	40 %	60 %	0 %	0 %	256809991
18	NC_013156	ACCCA	2	10	16754	16763	40 %	0 %	0 %	60 %	256809991
19	NC_013156	ATTAA	2	10	17456	17465	60 %	40 %	0 %	0 %	256809992
20	NC_013156	AATTT	2	10	18326	18335	40 %	60 %	0 %	0 %	256809994
21	NC_013156	TGTTT	2	10	19090	19099	0 %	80 %	20 %	0 %	256809994
22	NC_013156	TATAA	2	10	21524	21533	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013156	AAATA	2	10	22194	22203	80 %	20 %	0 %	0 %	256809998
24	NC_013156	ATAAG	2	10	22424	22433	60 %	20 %	20 %	0 %	256809998
25	NC_013156	TTTAA	2	10	24041	24050	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013156	AAGGG	2	10	24397	24406	40 %	0 %	60 %	0 %	256809999
27	NC_013156	AACCA	2	10	24770	24779	60 %	0 %	0 %	40 %	256810000
28	NC_013156	ATAGG	2	10	25169	25178	40 %	20 %	40 %	0 %	256810000
29	NC_013156	TAAAT	2	10	26076	26085	60 %	40 %	0 %	0 %	256810000
30	NC_013156	AGATG	2	10	26448	26457	40 %	20 %	40 %	0 %	256810000
31	NC_013156	AAAGA	2	10	26527	26536	80 %	0 %	20 %	0 %	256810000
32	NC_013156	TAATT	2	10	27474	27483	40 %	60 %	0 %	0 %	256810001
33	NC_013156	ACAAA	2	10	27813	27822	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_013156	AAAGG	2	10	29371	29380	60 %	0 %	40 %	0 %	256810003
35	NC_013156	AGAGG	2	10	30852	30861	40 %	0 %	60 %	0 %	256810004
36	NC_013156	TTTGA	2	10	32756	32765	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013156	TTATA	3	15	33644	33658	40 %	60 %	0 %	0 %	256810008
38	NC_013156	AAAAG	2	10	34170	34179	80 %	0 %	20 %	0 %	256810009
39	NC_013156	ATAAA	2	10	34320	34329	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013156	ATTAG	2	10	34636	34645	40 %	40 %	20 %	0 %	256810010
41	NC_013156	GAGAT	2	10	35231	35240	40 %	20 %	40 %	0 %	256810010
42	NC_013156	AAAAC	2	10	37401	37410	80 %	0 %	0 %	20 %	256810012
43	NC_013156	ATAAA	2	10	37954	37963	80 %	20 %	0 %	0 %	256810012
44	NC_013156	ACATA	2	10	38494	38503	60 %	20 %	0 %	20 %	256810012
45	NC_013156	TTTTA	2	10	38845	38854	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013156	TTAGA	2	10	39481	39490	40 %	40 %	20 %	0 %	256810013
47	NC_013156	ATTTT	2	10	40651	40660	20 %	80 %	0 %	0 %	256810014
48	NC_013156	GGACT	2	10	41091	41100	20 %	20 %	40 %	20 %	256810015
49	NC_013156	AGATA	2	10	41431	41440	60 %	20 %	20 %	0 %	256810015
50	NC_013156	ATTTT	2	10	42393	42402	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013156	GAAAT	2	10	42937	42946	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013156	ATTTC	2	10	43063	43072	20 %	60 %	0 %	20 %	256810016
53	NC_013156	AAAGC	2	10	43556	43565	60 %	0 %	20 %	20 %	256810016
54	NC_013156	TTAAT	2	10	46054	46063	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013156	CTCTC	2	10	46715	46724	0 %	40 %	0 %	60 %	256810019
56	NC_013156	AATAA	2	10	47714	47723	80 %	20 %	0 %	0 %	256810020
57	NC_013156	ATTAG	2	10	48709	48718	40 %	40 %	20 %	0 %	256810022
58	NC_013156	TTTTA	2	10	49584	49593	20 %	80 %	0 %	0 %	256810022
59	NC_013156	ATCCA	2	10	49700	49709	40 %	20 %	0 %	40 %	256810022
60	NC_013156	CTAAG	2	10	49757	49766	40 %	20 %	20 %	20 %	256810022
61	NC_013156	ACATT	2	10	52077	52086	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_013156	TAAAA	2	10	52679	52688	80 %	20 %	0 %	0 %	256810023
63	NC_013156	GCCAC	2	10	53039	53048	20 %	0 %	20 %	60 %	256810024
64	NC_013156	GAGGG	2	10	54057	54066	20 %	0 %	80 %	0 %	256810024
65	NC_013156	TAAAT	2	10	58506	58515	60 %	40 %	0 %	0 %	256810030
66	NC_013156	AATCC	2	10	58993	59002	40 %	20 %	0 %	40 %	256810030
67	NC_013156	ATGGA	2	10	59117	59126	40 %	20 %	40 %	0 %	256810030
68	NC_013156	CTTTT	2	10	59690	59699	0 %	80 %	0 %	20 %	256810030
69	NC_013156	AATAT	2	10	60869	60878	60 %	40 %	0 %	0 %	256810032
70	NC_013156	TATAA	2	10	61203	61212	60 %	40 %	0 %	0 %	256810034
71	NC_013156	TAGAA	2	10	64215	64224	60 %	20 %	20 %	0 %	256810038
72	NC_013156	ATTAA	2	10	65248	65257	60 %	40 %	0 %	0 %	256810038
73	NC_013156	CTGGT	2	10	66003	66012	0 %	40 %	40 %	20 %	256810039
74	NC_013156	TCTTT	2	10	67763	67772	0 %	80 %	0 %	20 %	256810041
75	NC_013156	TGTTT	2	10	69269	69278	0 %	80 %	20 %	0 %	256810044
76	NC_013156	AATTT	2	10	69628	69637	40 %	60 %	0 %	0 %	256810044
77	NC_013156	TAAAA	2	10	70405	70414	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013156	GAGAT	2	10	71216	71225	40 %	20 %	40 %	0 %	256810046
79	NC_013156	TTCAT	2	10	72120	72129	20 %	60 %	0 %	20 %	256810047
80	NC_013156	GTTTA	2	10	72553	72562	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013156	AAATT	2	10	75602	75611	60 %	40 %	0 %	0 %	256810052
82	NC_013156	TCATT	2	10	76244	76253	20 %	60 %	0 %	20 %	256810052
83	NC_013156	AAAAT	2	10	76396	76405	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013156	TAAAA	2	10	80237	80246	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013156	TAAAC	2	10	80760	80769	60 %	20 %	0 %	20 %	256810057
86	NC_013156	CCTTC	2	10	81711	81720	0 %	40 %	0 %	60 %	256810058
87	NC_013156	TATAA	2	10	82026	82035	60 %	40 %	0 %	0 %	256810058
88	NC_013156	TTGTT	2	10	82970	82979	0 %	80 %	20 %	0 %	256810059
89	NC_013156	TAAAT	2	10	83275	83284	60 %	40 %	0 %	0 %	256810059
90	NC_013156	TTATA	2	10	83952	83961	40 %	60 %	0 %	0 %	256810061
91	NC_013156	TTCTT	2	10	84274	84283	0 %	80 %	0 %	20 %	256810061
92	NC_013156	AAACA	2	10	84438	84447	80 %	0 %	0 %	20 %	256810062
93	NC_013156	ATTTA	2	10	85257	85266	40 %	60 %	0 %	0 %	256810062
94	NC_013156	TTTCA	2	10	85554	85563	20 %	60 %	0 %	20 %	256810062
95	NC_013156	AATAA	2	10	85870	85879	80 %	20 %	0 %	0 %	256810062
96	NC_013156	ATTGG	2	10	87047	87056	20 %	40 %	40 %	0 %	256810063
97	NC_013156	TCATC	2	10	87294	87303	20 %	40 %	0 %	40 %	256810063
98	NC_013156	TTGTT	2	10	88934	88943	0 %	80 %	20 %	0 %	256810066
99	NC_013156	GTTTA	2	10	89422	89431	20 %	60 %	20 %	0 %	256810067
100	NC_013156	ATCCA	2	10	90926	90935	40 %	20 %	0 %	40 %	256810068
101	NC_013156	TATTC	2	10	91326	91335	20 %	60 %	0 %	20 %	256810068
102	NC_013156	GAACA	2	10	92171	92180	60 %	0 %	20 %	20 %	256810068
103	NC_013156	AATTA	2	10	92485	92494	60 %	40 %	0 %	0 %	256810068
104	NC_013156	ATTTT	2	10	92711	92720	20 %	80 %	0 %	0 %	256810068
105	NC_013156	AAAAG	2	10	93038	93047	80 %	0 %	20 %	0 %	256810068
106	NC_013156	AGAAA	2	10	98289	98298	80 %	0 %	20 %	0 %	256810075
107	NC_013156	CTCTC	2	10	98860	98869	0 %	40 %	0 %	60 %	256810076
108	NC_013156	ATGTT	2	10	99131	99140	20 %	60 %	20 %	0 %	256810076
109	NC_013156	TTCCT	2	10	99559	99568	0 %	60 %	0 %	40 %	256810077
110	NC_013156	TCTTA	2	10	100738	100747	20 %	60 %	0 %	20 %	256810079
111	NC_013156	AAGAA	2	10	100904	100913	80 %	0 %	20 %	0 %	256810079
112	NC_013156	ACTTT	2	10	101453	101462	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_013156	TTAAA	2	10	101912	101921	60 %	40 %	0 %	0 %	256810080
114	NC_013156	GAAAA	2	10	102925	102934	80 %	0 %	20 %	0 %	256810080
115	NC_013156	GAAAA	2	10	102996	103005	80 %	0 %	20 %	0 %	256810080
116	NC_013156	TATTT	2	10	103694	103703	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013156	CAAAA	2	10	104289	104298	80 %	0 %	0 %	20 %	256810083
118	NC_013156	TTAAA	2	10	104842	104851	60 %	40 %	0 %	0 %	256810083
119	NC_013156	AATTT	2	10	105090	105099	40 %	60 %	0 %	0 %	256810083
120	NC_013156	GATAA	2	10	105336	105345	60 %	20 %	20 %	0 %	256810083
121	NC_013156	TGTTT	2	10	108589	108598	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013156	CAAAT	2	10	109799	109808	60 %	20 %	0 %	20 %	256810090
123	NC_013156	ATTGG	2	10	110868	110877	20 %	40 %	40 %	0 %	256810090
124	NC_013156	TAAAA	2	10	112194	112203	80 %	20 %	0 %	0 %	256810091
125	NC_013156	TAATT	2	10	113365	113374	40 %	60 %	0 %	0 %	256810093
126	NC_013156	AAATC	2	10	113671	113680	60 %	20 %	0 %	20 %	256810093
127	NC_013156	ATTTT	2	10	114252	114261	20 %	80 %	0 %	0 %	256810094
128	NC_013156	TTTCA	2	10	114402	114411	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_013156	TTTCT	2	10	115572	115581	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_013156	ATTAA	2	10	116059	116068	60 %	40 %	0 %	0 %	256810097
131	NC_013156	TCCTC	2	10	116089	116098	0 %	40 %	0 %	60 %	256810097
132	NC_013156	ATTCA	2	10	116592	116601	40 %	40 %	0 %	20 %	256810097
133	NC_013156	GCTTA	2	10	116700	116709	20 %	40 %	20 %	20 %	256810097
134	NC_013156	ATCCA	2	10	118079	118088	40 %	20 %	0 %	40 %	256810098
135	NC_013156	CTAAA	2	10	119069	119078	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_013156	ATTTT	2	10	119177	119186	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013156	GGGAT	2	10	119887	119896	20 %	20 %	60 %	0 %	256810099
138	NC_013156	AATAA	2	10	120557	120566	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013156	TTTAA	2	10	123191	123200	40 %	60 %	0 %	0 %	256810102
140	NC_013156	TTATT	2	10	123517	123526	20 %	80 %	0 %	0 %	256810103
141	NC_013156	AAATT	2	10	123580	123589	60 %	40 %	0 %	0 %	256810103
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143	NC_013156	GTTAT	2	10	125691	125700	20 %	60 %	20 %	0 %	256810105
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147	NC_013156	TTCAA	2	10	129565	129574	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_013156	TTGTA	2	10	129859	129868	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_013156	ATTTT	2	10	148995	149004	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_013156	ATTGA	2	10	158395	158404	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
185	NC_013156	GTTAA	2	10	159039	159048	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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243	NC_013156	ATCAA	2	10	215117	215126	60 %	20 %	0 %	20 %	256810190
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250	NC_013156	CAATC	2	10	222470	222479	40 %	20 %	0 %	40 %	256810199
251	NC_013156	AATTT	2	10	222900	222909	40 %	60 %	0 %	0 %	256810199
252	NC_013156	AAGAT	2	10	224792	224801	60 %	20 %	20 %	0 %	256810202
253	NC_013156	TACAT	2	10	226179	226188	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
254	NC_013156	TCCAC	2	10	227554	227563	20 %	20 %	0 %	60 %	256810204
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256	NC_013156	AGCTA	2	10	232262	232271	40 %	20 %	20 %	20 %	256810207
257	NC_013156	TAAAT	2	10	232504	232513	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_013156	AATGA	2	10	232889	232898	60 %	20 %	20 %	0 %	256810208
259	NC_013156	ATAAA	2	10	233035	233044	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_013156	TAAAA	2	10	233928	233937	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_013156	GGTAA	2	10	233996	234005	40 %	20 %	40 %	0 %	256810210
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264	NC_013156	GTTCT	2	10	239400	239409	0 %	60 %	20 %	20 %	256810213
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269	NC_013156	TTCTT	2	10	245461	245470	0 %	80 %	0 %	20 %	256810219
270	NC_013156	CTTCT	2	10	246600	246609	0 %	60 %	0 %	40 %	256810219
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403	NC_013156	AGGGG	2	10	345781	345790	20 %	0 %	80 %	0 %	256810321
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