MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 1579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013156	GATTT	2	10	450734	450743	20 %	60 %	20 %	0 %	256810429
502	NC_013156	AGTTG	2	10	451439	451448	20 %	40 %	40 %	0 %	256810430
503	NC_013156	TAAGT	2	10	451457	451466	40 %	40 %	20 %	0 %	256810430
504	NC_013156	TGTTT	2	10	451978	451987	0 %	80 %	20 %	0 %	256810431
505	NC_013156	ATCCT	2	10	452055	452064	20 %	40 %	0 %	40 %	256810431
506	NC_013156	CCAAT	2	10	453078	453087	40 %	20 %	0 %	40 %	256810431
507	NC_013156	CTACA	2	10	455072	455081	40 %	20 %	0 %	40 %	256810433
508	NC_013156	TTGTT	2	10	457728	457737	0 %	80 %	20 %	0 %	256810438
509	NC_013156	AATGT	2	10	458687	458696	40 %	40 %	20 %	0 %	256810441
510	NC_013156	AATCC	2	10	458929	458938	40 %	20 %	0 %	40 %	256810441
511	NC_013156	TTAAC	2	10	459399	459408	40 %	40 %	0 %	20 %	256810442
512	NC_013156	TGCAT	2	10	459648	459657	20 %	40 %	20 %	20 %	256810443
513	NC_013156	ACCTA	2	10	459879	459888	40 %	20 %	0 %	40 %	256810443
514	NC_013156	TTTTC	2	10	460047	460056	0 %	80 %	0 %	20 %	256810443
515	NC_013156	GGCTA	2	10	461685	461694	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
516	NC_013156	AAATT	2	10	462920	462929	60 %	40 %	0 %	0 %	256810448
517	NC_013156	AGCTG	2	10	464086	464095	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
518	NC_013156	TCTCC	2	10	464632	464641	0 %	40 %	0 %	60 %	256810449
519	NC_013156	AACAT	2	10	464670	464679	60 %	20 %	0 %	20 %	256810449
520	NC_013156	TTCAA	2	10	464751	464760	40 %	40 %	0 %	20 %	256810449
521	NC_013156	CCTTC	2	10	465160	465169	0 %	40 %	0 %	60 %	256810449
522	NC_013156	ATCCA	2	10	465896	465905	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
523	NC_013156	TTAAT	2	10	466782	466791	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_013156	AATTA	2	10	470026	470035	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_013156	TGAGG	2	10	470135	470144	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
526	NC_013156	GAAAA	2	10	472309	472318	80 %	0 %	20 %	0 %	256810455
527	NC_013156	AATGT	2	10	474988	474997	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
528	NC_013156	CAATA	2	10	475863	475872	60 %	20 %	0 %	20 %	256810457
529	NC_013156	TTGTT	2	10	475941	475950	0 %	80 %	20 %	0 %	256810457
530	NC_013156	AAATC	2	10	476129	476138	60 %	20 %	0 %	20 %	256810457
531	NC_013156	TAAAT	2	10	477165	477174	60 %	40 %	0 %	0 %	256810458
532	NC_013156	CAAAG	2	10	477814	477823	60 %	0 %	20 %	20 %	256810459
533	NC_013156	TTGGA	2	10	478360	478369	20 %	40 %	40 %	0 %	256810459
534	NC_013156	GAATT	2	10	478509	478518	40 %	40 %	20 %	0 %	256810459
535	NC_013156	ATGAG	2	10	478536	478545	40 %	20 %	40 %	0 %	256810459
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539	NC_013156	AAAAT	2	10	480479	480488	80 %	20 %	0 %	0 %	256810461
540	NC_013156	GGATG	2	10	481139	481148	20 %	20 %	60 %	0 %	256810461
541	NC_013156	AGGAA	2	10	481271	481280	60 %	0 %	40 %	0 %	256810461
542	NC_013156	CGAAG	2	10	481870	481879	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
543	NC_013156	ATTTT	2	10	483460	483469	20 %	80 %	0 %	0 %	256810463
544	NC_013156	GAATT	2	10	483917	483926	40 %	40 %	20 %	0 %	256810463
545	NC_013156	TTTTG	2	10	486015	486024	0 %	80 %	20 %	0 %	256810466
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547	NC_013156	TTGTA	2	10	487497	487506	20 %	60 %	20 %	0 %	256810467
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549	NC_013156	ATGTT	2	10	488796	488805	20 %	60 %	20 %	0 %	256810468
550	NC_013156	ATTTT	2	10	489368	489377	20 %	80 %	0 %	0 %	256810469
551	NC_013156	AAATT	2	10	490533	490542	60 %	40 %	0 %	0 %	256810470
552	NC_013156	TAATA	2	10	492107	492116	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_013156	TAACT	2	10	496175	496184	40 %	40 %	0 %	20 %	256810477
554	NC_013156	CCCAA	2	10	496192	496201	40 %	0 %	0 %	60 %	256810477
555	NC_013156	AGTAA	2	10	499164	499173	60 %	20 %	20 %	0 %	256810479
556	NC_013156	TAACA	2	10	499224	499233	60 %	20 %	0 %	20 %	256810479
557	NC_013156	ATAAA	2	10	499818	499827	80 %	20 %	0 %	0 %	256810479
558	NC_013156	CCCTC	2	10	500442	500451	0 %	20 %	0 %	80 %	256810480
559	NC_013156	TCTTT	2	10	500814	500823	0 %	80 %	0 %	20 %	256810480
560	NC_013156	CCAAA	2	10	501144	501153	60 %	0 %	0 %	40 %	256810481
561	NC_013156	ATCTC	2	10	501355	501364	20 %	40 %	0 %	40 %	256810481
562	NC_013156	AAATA	2	10	502398	502407	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_013156	TATTT	2	10	502416	502425	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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578	NC_013156	CAAAT	2	10	518023	518032	60 %	20 %	0 %	20 %	256810496
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587	NC_013156	TAATT	2	10	532282	532291	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_013156	CTTTA	2	10	532765	532774	20 %	60 %	0 %	20 %	256810513
589	NC_013156	TTTGA	2	10	533856	533865	20 %	60 %	20 %	0 %	256810515
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597	NC_013156	ATTTA	2	10	541413	541422	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_013156	TCCAC	2	10	542861	542870	20 %	20 %	0 %	60 %	256810524
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601	NC_013156	AATTA	2	10	544280	544289	60 %	40 %	0 %	0 %	256810526
602	NC_013156	AAATT	2	10	544709	544718	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_013156	AACAA	2	10	549259	549268	80 %	0 %	0 %	20 %	256810530
604	NC_013156	TCGCT	2	10	550453	550462	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
605	NC_013156	TTATC	2	10	551414	551423	20 %	60 %	0 %	20 %	256810532
606	NC_013156	AATTG	2	10	552145	552154	40 %	40 %	20 %	0 %	256810532
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612	NC_013156	TTTTA	2	10	557422	557431	20 %	80 %	0 %	0 %	256810540
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615	NC_013156	ATTTT	2	10	563122	563131	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_013156	TGAAA	2	10	563264	563273	60 %	20 %	20 %	0 %	256810546
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630	NC_013156	CAGAA	2	10	578553	578562	60 %	0 %	20 %	20 %	256810564
631	NC_013156	CTATG	2	10	580762	580771	20 %	40 %	20 %	20 %	256810567
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