MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 1579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013156	TTGGA	2	10	945322	945331	20 %	40 %	40 %	0 %	256810954
1002	NC_013156	GATAA	2	10	946836	946845	60 %	20 %	20 %	0 %	256810956
1003	NC_013156	CTATC	2	10	947462	947471	20 %	40 %	0 %	40 %	256810957
1004	NC_013156	CTATA	2	10	947528	947537	40 %	40 %	0 %	20 %	256810957
1005	NC_013156	ACTTT	2	10	948482	948491	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1006	NC_013156	AAAAC	2	10	950821	950830	80 %	0 %	0 %	20 %	256810959
1007	NC_013156	TAAAA	2	10	950904	950913	80 %	20 %	0 %	0 %	256810960
1008	NC_013156	AAAAG	2	10	952178	952187	80 %	0 %	20 %	0 %	256810961
1009	NC_013156	TTTGG	2	10	952374	952383	0 %	60 %	40 %	0 %	256810961
1010	NC_013156	TGGAG	2	10	952739	952748	20 %	20 %	60 %	0 %	256810961
1011	NC_013156	AATTT	2	10	952914	952923	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_013156	TGAAG	2	10	953931	953940	40 %	20 %	40 %	0 %	256810962
1013	NC_013156	TTGAT	2	10	954193	954202	20 %	60 %	20 %	0 %	256810963
1014	NC_013156	AGTTG	2	10	954239	954248	20 %	40 %	40 %	0 %	256810963
1015	NC_013156	GATGT	2	10	955132	955141	20 %	40 %	40 %	0 %	256810963
1016	NC_013156	TCCCC	2	10	955594	955603	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1017	NC_013156	ATTTG	2	10	955911	955920	20 %	60 %	20 %	0 %	256810964
1018	NC_013156	TACAA	2	10	956226	956235	60 %	20 %	0 %	20 %	256810964
1019	NC_013156	TAAAA	2	10	956626	956635	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_013156	TAACT	2	10	956835	956844	40 %	40 %	0 %	20 %	256810965
1021	NC_013156	AAGAA	2	10	958810	958819	80 %	0 %	20 %	0 %	256810968
1022	NC_013156	GGAGC	2	10	958974	958983	20 %	0 %	60 %	20 %	256810969
1023	NC_013156	CATAT	2	10	959571	959580	40 %	40 %	0 %	20 %	256810969
1024	NC_013156	ATAAA	2	10	963177	963186	80 %	20 %	0 %	0 %	256810973
1025	NC_013156	TTGTT	2	10	964135	964144	0 %	80 %	20 %	0 %	256810974
1026	NC_013156	TTAAA	2	10	964777	964786	60 %	40 %	0 %	0 %	256810974
1027	NC_013156	TTACA	2	10	966418	966427	40 %	40 %	0 %	20 %	256810977
1028	NC_013156	TTTTC	2	10	966802	966811	0 %	80 %	0 %	20 %	256810977
1029	NC_013156	TAAAT	2	10	967907	967916	60 %	40 %	0 %	0 %	256810979
1030	NC_013156	ATATC	2	10	968212	968221	40 %	40 %	0 %	20 %	256810979
1031	NC_013156	AAAAT	2	10	970395	970404	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_013156	CATGC	2	10	970537	970546	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1033	NC_013156	ATTTG	2	10	970973	970982	20 %	60 %	20 %	0 %	256810981
1034	NC_013156	ATTTT	2	10	971916	971925	20 %	80 %	0 %	0 %	256810982
1035	NC_013156	TTTAT	2	10	972974	972983	20 %	80 %	0 %	0 %	256810983
1036	NC_013156	TTTCC	2	10	973572	973581	0 %	60 %	0 %	40 %	256810984
1037	NC_013156	TGTTT	2	10	973965	973974	0 %	80 %	20 %	0 %	256810984
1038	NC_013156	CTTTT	2	10	974257	974266	0 %	80 %	0 %	20 %	256810984
1039	NC_013156	CTTTT	2	10	975372	975381	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1040	NC_013156	AAAAT	2	10	975388	975397	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_013156	AAAAT	2	10	976518	976527	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_013156	ATTTA	2	10	976594	976603	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_013156	CTTTC	2	10	977258	977267	0 %	60 %	0 %	40 %	256810988
1044	NC_013156	TTAAA	2	10	977863	977872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_013156	TTTTA	2	10	978217	978226	20 %	80 %	0 %	0 %	256810989
1046	NC_013156	CAATA	2	10	978538	978547	60 %	20 %	0 %	20 %	256810990
1047	NC_013156	ATTTA	2	10	978997	979006	40 %	60 %	0 %	0 %	256810991
1048	NC_013156	TTATC	2	10	979161	979170	20 %	60 %	0 %	20 %	256810991
1049	NC_013156	TGCAT	2	10	979817	979826	20 %	40 %	20 %	20 %	256810991
1050	NC_013156	CATCC	2	10	983325	983334	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1051	NC_013156	CTCTC	2	10	983933	983942	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1052	NC_013156	TTCTA	2	10	985245	985254	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1053	NC_013156	AAATT	2	10	985682	985691	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_013156	TCCCA	2	10	986885	986894	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1055	NC_013156	TAAGT	2	10	986948	986957	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_013156	AATAA	2	10	987019	987028	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_013156	CTAAT	2	10	987086	987095	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1058	NC_013156	TCATT	2	10	987266	987275	20 %	60 %	0 %	20 %	256810995
1059	NC_013156	TCCTT	2	10	988572	988581	0 %	60 %	0 %	40 %	256810996
1060	NC_013156	TTCAG	2	10	989675	989684	20 %	40 %	20 %	20 %	256810998
1061	NC_013156	ATTAT	2	10	991299	991308	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_013156	AATCT	2	10	991627	991636	40 %	40 %	0 %	20 %	256811001
1063	NC_013156	ACTTT	2	10	991793	991802	20 %	60 %	0 %	20 %	256811001
1064	NC_013156	ATTTA	2	10	992782	992791	40 %	60 %	0 %	0 %	256811003
1065	NC_013156	TCCCC	2	10	992838	992847	0 %	20 %	0 %	80 %	256811003
1066	NC_013156	TTATT	2	10	993822	993831	20 %	80 %	0 %	0 %	256811004
1067	NC_013156	TAAAA	2	10	995170	995179	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_013156	GGAGG	2	10	995249	995258	20 %	0 %	80 %	0 %	256811006
1069	NC_013156	TAAAT	2	10	995724	995733	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_013156	TACTG	2	10	996727	996736	20 %	40 %	20 %	20 %	256811008
1071	NC_013156	TTTTA	2	10	998736	998745	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_013156	AGCTC	2	10	999714	999723	20 %	20 %	20 %	40 %	256811013
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1084	NC_013156	ACCCC	2	10	1015199	1015208	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1085	NC_013156	TCCCC	2	10	1017762	1017771	0 %	20 %	0 %	80 %	256811022
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1099	NC_013156	ATCAA	2	10	1029040	1029049	60 %	20 %	0 %	20 %	256811034
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1101	NC_013156	TTTTA	2	10	1030933	1030942	20 %	80 %	0 %	0 %	256811037
1102	NC_013156	TCCCC	2	10	1031103	1031112	0 %	20 %	0 %	80 %	256811037
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1110	NC_013156	TTGTT	2	10	1042242	1042251	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1112	NC_013156	TAAAA	2	10	1043826	1043835	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_013156	TCATC	2	10	1044183	1044192	20 %	40 %	0 %	40 %	256811051
1114	NC_013156	ATTCC	2	10	1044210	1044219	20 %	40 %	0 %	40 %	256811051
1115	NC_013156	TATTT	2	10	1047582	1047591	20 %	80 %	0 %	0 %	256811054
1116	NC_013156	ATTTC	2	10	1048040	1048049	20 %	60 %	0 %	20 %	256811054
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1119	NC_013156	ATGTT	2	10	1051065	1051074	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1122	NC_013156	TCTTT	2	10	1052620	1052629	0 %	80 %	0 %	20 %	256811061
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1125	NC_013156	ACAGC	2	10	1055090	1055099	40 %	0 %	20 %	40 %	256811063
1126	NC_013156	ATTTC	2	10	1055960	1055969	20 %	60 %	0 %	20 %	256811063
1127	NC_013156	AATAA	2	10	1059496	1059505	80 %	20 %	0 %	0 %	256811067
1128	NC_013156	TAAAT	2	10	1059520	1059529	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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