MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 78049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012943	CAG	2	6	233058	233063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797119
4002	NC_012943	GCT	2	6	233099	233104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797119
4003	NC_012943	TCG	2	6	233154	233159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797119
4004	NC_012943	TAT	2	6	233213	233218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253797119
4005	NC_012943	GTG	2	6	233241	233246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797119
4006	NC_012943	GAG	2	6	233250	233255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253797119
4007	NC_012943	GAT	2	6	233288	233293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797119
4008	NC_012943	GCC	2	6	233334	233339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797119
4009	NC_012943	GGC	2	6	233345	233350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797119
4010	NC_012943	TGG	2	6	233371	233376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797119
4011	NC_012943	TCG	2	6	233377	233382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797119
4012	NC_012943	TGC	2	6	233422	233427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797119
4013	NC_012943	CGG	2	6	233428	233433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797119
4014	NC_012943	TTC	2	6	233463	233468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253797119
4015	NC_012943	CGA	2	6	233585	233590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797119
4016	NC_012943	GCT	2	6	233619	233624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797119
4017	NC_012943	CGG	3	9	233659	233667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797119
4018	NC_012943	GGC	2	6	233750	233755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797119
4019	NC_012943	AGA	2	6	233776	233781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253797119
4020	NC_012943	CCG	2	6	233807	233812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797119
4021	NC_012943	GAC	2	6	233898	233903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797119
4022	NC_012943	CGG	2	6	234178	234183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797119
4023	NC_012943	CGC	2	6	234233	234238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797119
4024	NC_012943	CGA	2	6	234272	234277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797119
4025	NC_012943	CGT	2	6	234287	234292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797119
4026	NC_012943	CGA	2	6	234322	234327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797119
4027	NC_012943	CGC	2	6	234374	234379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797119
4028	NC_012943	CCG	2	6	234383	234388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797119
4029	NC_012943	CGG	2	6	234574	234579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797120
4030	NC_012943	CGG	2	6	234602	234607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797120
4031	NC_012943	GAA	2	6	234655	234660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253797120
4032	NC_012943	CAG	2	6	234730	234735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797120
4033	NC_012943	CGA	2	6	234816	234821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797120
4034	NC_012943	TCG	3	9	234890	234898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797120
4035	NC_012943	CCA	2	6	234901	234906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797120
4036	NC_012943	TCG	2	6	234947	234952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797120
4037	NC_012943	CCG	2	6	234992	234997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797120
4038	NC_012943	GGC	2	6	235003	235008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797120
4039	NC_012943	TCG	2	6	235010	235015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797120
4040	NC_012943	TGG	2	6	235033	235038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797120
4041	NC_012943	GTA	2	6	235084	235089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797120
4042	NC_012943	TCG	2	6	235121	235126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797120
4043	NC_012943	GTC	2	6	235204	235209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797120
4044	NC_012943	AGT	2	6	235230	235235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797120
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4049	NC_012943	CCA	2	6	235452	235457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797120
4050	NC_012943	GCT	2	6	235488	235493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797120
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4052	NC_012943	CGA	2	6	235839	235844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797120
4053	NC_012943	CGG	2	6	235935	235940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797120
4054	NC_012943	GTA	2	6	235957	235962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797120
4055	NC_012943	TCG	2	6	235967	235972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797120
4056	NC_012943	GCC	3	9	236053	236061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797120
4057	NC_012943	GCG	2	6	236090	236095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797120
4058	NC_012943	TCG	2	6	236138	236143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797120
4059	NC_012943	TCG	2	6	236180	236185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797120
4060	NC_012943	GCA	2	6	236234	236239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797120
4061	NC_012943	GAT	2	6	236257	236262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797120
4062	NC_012943	GTC	2	6	236380	236385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797120
4063	NC_012943	AAG	2	6	236525	236530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253797121
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4065	NC_012943	CGC	2	6	236556	236561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797121
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4067	NC_012943	ATC	2	6	236586	236591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797121
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4070	NC_012943	GAT	2	6	236673	236678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797121
4071	NC_012943	CCG	2	6	236738	236743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797121
4072	NC_012943	ACA	2	6	236780	236785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253797121
4073	NC_012943	ACG	2	6	236810	236815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797121
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4075	NC_012943	CAG	2	6	236895	236900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797121
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4078	NC_012943	TGC	2	6	237020	237025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797121
4079	NC_012943	TGA	2	6	237119	237124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797121
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4083	NC_012943	CGC	2	6	237203	237208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797122
4084	NC_012943	TGG	2	6	237246	237251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797122
4085	NC_012943	TGC	2	6	237274	237279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797122
4086	NC_012943	TGG	2	6	237280	237285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797122
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4090	NC_012943	CGG	3	9	237403	237411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797122
4091	NC_012943	GAC	2	6	237434	237439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797122
4092	NC_012943	GTG	2	6	237474	237479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797122
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4103	NC_012943	GCG	2	6	238300	238305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797123
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4105	NC_012943	CGC	2	6	238376	238381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797124
4106	NC_012943	GCC	2	6	238488	238493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797124
4107	NC_012943	AGT	2	6	238509	238514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797124
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4112	NC_012943	GGT	2	6	238765	238770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797124
4113	NC_012943	GCC	2	6	238979	238984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797124
4114	NC_012943	CGC	2	6	239023	239028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797124
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4118	NC_012943	ACG	2	6	239186	239191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797124
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4355	NC_012943	CTT	2	6	252670	252675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253797133
4356	NC_012943	GCC	2	6	252731	252736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797133
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4473	NC_012943	TCG	2	6	260042	260047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797139
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