MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 78049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012943	GCA	2	6	61975	61980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796973
1002	NC_012943	GAA	2	6	62073	62078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253796973
1003	NC_012943	CGG	2	6	62135	62140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796973
1004	NC_012943	CGA	2	6	62166	62171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796973
1005	NC_012943	CGT	2	6	62192	62197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796973
1006	NC_012943	GCG	2	6	62245	62250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796973
1007	NC_012943	GTT	2	6	62340	62345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796973
1008	NC_012943	TGG	2	6	62367	62372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796973
1009	NC_012943	CTA	2	6	62412	62417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796973
1010	NC_012943	CGA	2	6	62442	62447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796973
1011	NC_012943	TGC	2	6	62459	62464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796973
1012	NC_012943	GGC	2	6	62509	62514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796973
1013	NC_012943	GGC	2	6	62525	62530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796973
1014	NC_012943	GGC	2	6	62601	62606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796973
1015	NC_012943	TGC	2	6	62615	62620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796973
1016	NC_012943	GAT	2	6	62712	62717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253796973
1017	NC_012943	CGA	2	6	62738	62743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796973
1018	NC_012943	CGT	2	6	62847	62852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796973
1019	NC_012943	TCG	2	6	62915	62920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796973
1020	NC_012943	CTG	2	6	62974	62979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796973
1021	NC_012943	CGA	2	6	63003	63008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796973
1022	NC_012943	CGA	2	6	63059	63064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796973
1023	NC_012943	GGT	2	6	63348	63353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796974
1024	NC_012943	ATC	2	6	63420	63425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796974
1025	NC_012943	CTG	2	6	63438	63443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796974
1026	NC_012943	CAG	2	6	63451	63456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796974
1027	NC_012943	CGA	2	6	63463	63468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796974
1028	NC_012943	GCC	2	6	63502	63507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796974
1029	NC_012943	GTC	2	6	63513	63518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796974
1030	NC_012943	CAG	2	6	63527	63532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796974
1031	NC_012943	GCG	2	6	63576	63581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796974
1032	NC_012943	CGT	2	6	63599	63604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796974
1033	NC_012943	CGG	2	6	63629	63634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796974
1034	NC_012943	CAT	2	6	63674	63679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796974
1035	NC_012943	GTG	2	6	63695	63700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796974
1036	NC_012943	TGC	2	6	63716	63721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796974
1037	NC_012943	GCC	2	6	63742	63747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796974
1038	NC_012943	TCG	2	6	63769	63774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796974
1039	NC_012943	GAC	2	6	63816	63821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796974
1040	NC_012943	GCC	2	6	63835	63840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796974
1041	NC_012943	GCC	2	6	63843	63848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796974
1042	NC_012943	TCA	2	6	63970	63975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796974
1043	NC_012943	TAC	2	6	63987	63992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796974
1044	NC_012943	CCT	2	6	64035	64040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253796975
1045	NC_012943	CGC	2	6	64120	64125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796975
1046	NC_012943	TCG	3	9	64193	64201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796975
1047	NC_012943	CAT	2	6	64230	64235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796975
1048	NC_012943	CCA	2	6	64244	64249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796975
1049	NC_012943	CAG	2	6	64420	64425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796975
1050	NC_012943	GCG	2	6	64536	64541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796975
1051	NC_012943	CAG	2	6	64549	64554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796975
1052	NC_012943	CGC	2	6	64555	64560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796975
1053	NC_012943	ACT	2	6	64789	64794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796975
1054	NC_012943	GCT	2	6	64914	64919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796975
1055	NC_012943	CGA	2	6	65022	65027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796975
1056	NC_012943	GCT	2	6	65129	65134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796976
1057	NC_012943	ACC	2	6	65157	65162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796976
1058	NC_012943	GGC	2	6	65167	65172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796976
1059	NC_012943	CCG	2	6	65191	65196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796976
1060	NC_012943	CGG	2	6	65483	65488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796976
1061	NC_012943	GTC	2	6	65734	65739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796977
1062	NC_012943	ATT	2	6	65767	65772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253796977
1063	NC_012943	TCA	2	6	65787	65792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796977
1064	NC_012943	CCT	2	6	65825	65830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253796977
1065	NC_012943	CGG	2	6	65959	65964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796977
1066	NC_012943	CGC	2	6	65972	65977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796977
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1069	NC_012943	CGG	2	6	66071	66076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796977
1070	NC_012943	GCG	2	6	66099	66104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796977
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1072	NC_012943	CGA	2	6	66250	66255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796977
1073	NC_012943	TCG	2	6	66259	66264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796977
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1085	NC_012943	GCG	2	6	67555	67560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796978
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1088	NC_012943	CGT	2	6	67763	67768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796978
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1092	NC_012943	CGC	2	6	68047	68052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796978
1093	NC_012943	CGG	2	6	68063	68068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796978
1094	NC_012943	ACG	2	6	68082	68087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796978
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1101	NC_012943	GCC	3	9	68612	68620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796979
1102	NC_012943	GCC	2	6	68635	68640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796979
1103	NC_012943	CTG	2	6	68774	68779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796980
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1107	NC_012943	CTG	2	6	68966	68971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796980
1108	NC_012943	CGA	2	6	69001	69006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796980
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1488	NC_012943	TGG	2	6	92499	92504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797002
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1490	NC_012943	CGG	2	6	92628	92633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797002
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