MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 78049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012943	ACG	2	6	32370	32375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796945
502	NC_012943	AGA	3	9	32425	32433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253796945
503	NC_012943	GCG	2	6	32541	32546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796945
504	NC_012943	CGG	2	6	32548	32553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796945
505	NC_012943	GCC	3	9	32636	32644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796945
506	NC_012943	CCT	2	6	32671	32676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253796945
507	NC_012943	ACG	2	6	32738	32743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796945
508	NC_012943	TTG	2	6	32810	32815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796945
509	NC_012943	ACG	2	6	32861	32866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796945
510	NC_012943	ACG	2	6	33003	33008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796945
511	NC_012943	CGG	2	6	33039	33044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796945
512	NC_012943	GCC	3	9	33056	33064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796945
513	NC_012943	CCA	2	6	33106	33111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796945
514	NC_012943	TGT	2	6	33162	33167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796945
515	NC_012943	GCC	2	6	33170	33175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796945
516	NC_012943	TCG	2	6	33381	33386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796946
517	NC_012943	TTC	2	6	33393	33398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253796946
518	NC_012943	GGC	2	6	33412	33417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796946
519	NC_012943	TGA	2	6	33540	33545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253796946
520	NC_012943	CGA	2	6	33604	33609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796946
521	NC_012943	CGG	2	6	33637	33642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796946
522	NC_012943	CCA	2	6	34542	34547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796947
523	NC_012943	GGT	2	6	34590	34595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796947
524	NC_012943	GAC	2	6	34733	34738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796947
525	NC_012943	TGA	2	6	34752	34757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253796947
526	NC_012943	CGA	2	6	34969	34974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796947
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529	NC_012943	GTT	2	6	35113	35118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796947
530	NC_012943	CTT	2	6	35143	35148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253796947
531	NC_012943	GCG	2	6	35243	35248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796947
532	NC_012943	ATG	3	9	35414	35422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253796947
533	NC_012943	CGA	2	6	35449	35454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796947
534	NC_012943	GGA	2	6	35461	35466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253796947
535	NC_012943	CGG	2	6	35572	35577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796947
536	NC_012943	GGT	2	6	35698	35703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796947
537	NC_012943	CGG	2	6	35712	35717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796947
538	NC_012943	GCT	2	6	35742	35747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796947
539	NC_012943	CGC	2	6	35827	35832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796947
540	NC_012943	GGC	2	6	35866	35871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796947
541	NC_012943	ATC	2	6	35903	35908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796947
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543	NC_012943	CGC	2	6	35941	35946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796947
544	NC_012943	ACC	2	6	35994	35999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796947
545	NC_012943	CGC	2	6	36014	36019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796947
546	NC_012943	GCC	2	6	36030	36035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796947
547	NC_012943	ATC	2	6	36038	36043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796947
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551	NC_012943	CGG	2	6	36256	36261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796947
552	NC_012943	CGT	2	6	36283	36288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796947
553	NC_012943	GCC	2	6	36337	36342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796947
554	NC_012943	GCC	2	6	36344	36349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796947
555	NC_012943	CGG	2	6	36398	36403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796947
556	NC_012943	GGA	2	6	36590	36595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253796947
557	NC_012943	ACC	2	6	36628	36633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796947
558	NC_012943	CCA	2	6	36729	36734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796948
559	NC_012943	TCG	2	6	36783	36788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796948
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561	NC_012943	CGA	2	6	36975	36980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796949
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563	NC_012943	CGC	2	6	37011	37016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796949
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572	NC_012943	CTG	2	6	37677	37682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796950
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575	NC_012943	CAG	2	6	37760	37765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796950
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602	NC_012943	ACG	2	6	38927	38932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796950
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605	NC_012943	CGG	2	6	39290	39295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796951
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607	NC_012943	GTT	2	6	39396	39401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796951
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609	NC_012943	CAG	2	6	39600	39605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796951
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611	NC_012943	GCC	2	6	39667	39672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796951
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615	NC_012943	TCA	2	6	39725	39730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796951
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995	NC_012943	TGA	2	6	61517	61522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253796973
996	NC_012943	AAG	2	6	61531	61536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253796973
997	NC_012943	AGC	2	6	61646	61651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796973
998	NC_012943	CCA	2	6	61709	61714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796973
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1000	NC_012943	GAT	2	6	61827	61832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253796973

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