MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Aggregatibacter aphrophilus NJ8700 chromosome

Total Repeats: 1787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012913	TAAAG	2	10	85	94	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012913	AGATA	2	10	540	549	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012913	ATGAT	2	10	1451	1460	40 %	40 %	20 %	0 %	251791818
4	NC_012913	GGCGT	2	10	4385	4394	0 %	20 %	60 %	20 %	251791819
5	NC_012913	TAGAT	2	10	4563	4572	40 %	40 %	20 %	0 %	251791819
6	NC_012913	CCGTG	2	10	5462	5471	0 %	20 %	40 %	40 %	251791820
7	NC_012913	TTTCA	2	10	5601	5610	20 %	60 %	0 %	20 %	251791820
8	NC_012913	TAAAA	2	10	5837	5846	80 %	20 %	0 %	0 %	251791821
9	NC_012913	CCATC	2	10	8225	8234	20 %	20 %	0 %	60 %	251791825
10	NC_012913	TACGT	2	10	9784	9793	20 %	40 %	20 %	20 %	251791826
11	NC_012913	TTGCA	2	10	11294	11303	20 %	40 %	20 %	20 %	251791827
12	NC_012913	GCGTT	2	10	11883	11892	0 %	40 %	40 %	20 %	251791828
13	NC_012913	TATGC	2	10	13447	13456	20 %	40 %	20 %	20 %	251791831
14	NC_012913	TAAAC	2	10	14051	14060	60 %	20 %	0 %	20 %	251791831
15	NC_012913	GACCG	2	10	14306	14315	20 %	0 %	40 %	40 %	251791831
16	NC_012913	AAACC	2	10	14389	14398	60 %	0 %	0 %	40 %	251791831
17	NC_012913	TACGG	2	10	15113	15122	20 %	20 %	40 %	20 %	251791832
18	NC_012913	CAATG	2	10	15721	15730	40 %	20 %	20 %	20 %	251791833
19	NC_012913	GCTCC	2	10	15855	15864	0 %	20 %	20 %	60 %	251791833
20	NC_012913	CAATG	2	10	17636	17645	40 %	20 %	20 %	20 %	251791834
21	NC_012913	ACATC	2	10	18547	18556	40 %	20 %	0 %	40 %	251791834
22	NC_012913	ACCGT	2	10	19686	19695	20 %	20 %	20 %	40 %	251791834
23	NC_012913	AATTA	2	10	20104	20113	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012913	CATCT	2	10	20385	20394	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_012913	CACAA	2	10	22202	22211	60 %	0 %	0 %	40 %	251791836
26	NC_012913	TCTTG	2	10	24613	24622	0 %	60 %	20 %	20 %	251791838
27	NC_012913	CTCAC	2	10	29162	29171	20 %	20 %	0 %	60 %	251791842
28	NC_012913	CGGTA	2	10	30754	30763	20 %	20 %	40 %	20 %	251791845
29	NC_012913	TCTGA	2	10	31007	31016	20 %	40 %	20 %	20 %	251791845
30	NC_012913	TTATT	2	10	31234	31243	20 %	80 %	0 %	0 %	251791846
31	NC_012913	GCTTT	2	10	32375	32384	0 %	60 %	20 %	20 %	251791846
32	NC_012913	ACAAG	2	10	32397	32406	60 %	0 %	20 %	20 %	251791846
33	NC_012913	GAGTA	2	10	33041	33050	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012913	ATTTT	2	10	35172	35181	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012913	CAAAG	2	10	37634	37643	60 %	0 %	20 %	20 %	251791852
36	NC_012913	AACAA	2	10	38119	38128	80 %	0 %	0 %	20 %	251791852
37	NC_012913	AAACC	2	10	38401	38410	60 %	0 %	0 %	40 %	251791853
38	NC_012913	ATTCC	2	10	39502	39511	20 %	40 %	0 %	40 %	251791854
39	NC_012913	GTGTT	2	10	40443	40452	0 %	60 %	40 %	0 %	251791855
40	NC_012913	CTTTG	2	10	40559	40568	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_012913	ATTGT	2	10	44956	44965	20 %	60 %	20 %	0 %	251791859
42	NC_012913	TTGGC	2	10	45622	45631	0 %	40 %	40 %	20 %	251791859
43	NC_012913	ATGTT	2	10	45915	45924	20 %	60 %	20 %	0 %	251791860
44	NC_012913	TGGCG	2	10	48934	48943	0 %	20 %	60 %	20 %	251791861
45	NC_012913	AGAAA	2	10	49704	49713	80 %	0 %	20 %	0 %	251791863
46	NC_012913	CACAC	2	10	50001	50010	40 %	0 %	0 %	60 %	251791864
47	NC_012913	GATGT	2	10	51174	51183	20 %	40 %	40 %	0 %	251791865
48	NC_012913	TAAAT	2	10	53399	53408	60 %	40 %	0 %	0 %	251791867
49	NC_012913	AATTA	2	10	53751	53760	60 %	40 %	0 %	0 %	251791868
50	NC_012913	AAATG	2	10	57191	57200	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012913	TTTTA	2	10	57926	57935	20 %	80 %	0 %	0 %	251791872
52	NC_012913	AACGC	2	10	57992	58001	40 %	0 %	20 %	40 %	251791872
53	NC_012913	CGTGG	2	10	59168	59177	0 %	20 %	60 %	20 %	251791873
54	NC_012913	GGGGA	2	10	60538	60547	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012913	GGAGT	2	10	61055	61064	20 %	20 %	60 %	0 %	251791877
56	NC_012913	GAAAA	2	10	62849	62858	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012913	AGTTA	2	10	62965	62974	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012913	ATTTA	2	10	64332	64341	40 %	60 %	0 %	0 %	251791878
59	NC_012913	ATCTT	2	10	65734	65743	20 %	60 %	0 %	20 %	251791878
60	NC_012913	CCAAA	2	10	67346	67355	60 %	0 %	0 %	40 %	251791878
61	NC_012913	CGGCA	2	10	70583	70592	20 %	0 %	40 %	40 %	251791879
62	NC_012913	GTGCG	2	10	71326	71335	0 %	20 %	60 %	20 %	251791879
63	NC_012913	TTCCG	2	10	72390	72399	0 %	40 %	20 %	40 %	251791881
64	NC_012913	CGGGG	2	10	72751	72760	0 %	0 %	80 %	20 %	251791881
65	NC_012913	CGGTG	2	10	72944	72953	0 %	20 %	60 %	20 %	251791881
66	NC_012913	ATGTA	2	10	75492	75501	40 %	40 %	20 %	0 %	251791882
67	NC_012913	ATAAA	2	10	75541	75550	80 %	20 %	0 %	0 %	251791882
68	NC_012913	AATGG	2	10	80951	80960	40 %	20 %	40 %	0 %	251791887
69	NC_012913	AATAA	2	10	82866	82875	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012913	TCATT	2	10	83597	83606	20 %	60 %	0 %	20 %	251791889
71	NC_012913	ATGCA	2	10	84774	84783	40 %	20 %	20 %	20 %	251791890
72	NC_012913	TCTCA	2	10	84970	84979	20 %	40 %	0 %	40 %	251791890
73	NC_012913	GTTTG	2	10	86250	86259	0 %	60 %	40 %	0 %	251791892
74	NC_012913	GGCTT	2	10	86906	86915	0 %	40 %	40 %	20 %	251791893
75	NC_012913	CCGCA	2	10	86922	86931	20 %	0 %	20 %	60 %	251791893
76	NC_012913	ATTTG	2	10	87089	87098	20 %	60 %	20 %	0 %	251791893
77	NC_012913	GCTTG	2	10	87191	87200	0 %	40 %	40 %	20 %	251791893
78	NC_012913	AAACC	2	10	87665	87674	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_012913	GAAGA	2	10	88427	88436	60 %	0 %	40 %	0 %	251791895
80	NC_012913	ATTTA	2	10	89951	89960	40 %	60 %	0 %	0 %	251791897
81	NC_012913	GTGAT	2	10	90437	90446	20 %	40 %	40 %	0 %	251791897
82	NC_012913	ATTCA	2	10	90823	90832	40 %	40 %	0 %	20 %	251791898
83	NC_012913	ACGGT	2	10	91935	91944	20 %	20 %	40 %	20 %	251791899
84	NC_012913	TAAAA	2	10	93188	93197	80 %	20 %	0 %	0 %	251791900
85	NC_012913	GAAAA	2	10	93587	93596	80 %	0 %	20 %	0 %	251791901
86	NC_012913	ATTCC	2	10	93636	93645	20 %	40 %	0 %	40 %	251791901
87	NC_012913	TTATG	2	10	93956	93965	20 %	60 %	20 %	0 %	251791901
88	NC_012913	TTTGC	2	10	95121	95130	0 %	60 %	20 %	20 %	251791902
89	NC_012913	TGTTT	2	10	97268	97277	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012913	TAAGC	2	10	99860	99869	40 %	20 %	20 %	20 %	251791908
91	NC_012913	AAAAT	2	10	100437	100446	80 %	20 %	0 %	0 %	251791908
92	NC_012913	CAACC	2	10	101850	101859	40 %	0 %	0 %	60 %	251791909
93	NC_012913	AGCAG	2	10	102136	102145	40 %	0 %	40 %	20 %	251791909
94	NC_012913	AAGTT	2	10	102401	102410	40 %	40 %	20 %	0 %	251791909
95	NC_012913	AGAAA	2	10	102700	102709	80 %	0 %	20 %	0 %	251791910
96	NC_012913	AGTTT	2	10	103331	103340	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012913	TTAAT	2	10	103342	103351	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012913	TGCCT	2	10	107729	107738	0 %	40 %	20 %	40 %	251791917
99	NC_012913	TTTTG	2	10	108348	108357	0 %	80 %	20 %	0 %	251791917
100	NC_012913	CAATT	2	10	112339	112348	40 %	40 %	0 %	20 %	251791922
101	NC_012913	AAAGA	2	10	121544	121553	80 %	0 %	20 %	0 %	251791932
102	NC_012913	TGGCA	2	10	121862	121871	20 %	20 %	40 %	20 %	251791932
103	NC_012913	ACGAA	2	10	122148	122157	60 %	0 %	20 %	20 %	251791933
104	NC_012913	ATTTA	2	10	123630	123639	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012913	TCCAT	2	10	123990	123999	20 %	40 %	0 %	40 %	251791934
106	NC_012913	TAAGT	2	10	124129	124138	40 %	40 %	20 %	0 %	251791934
107	NC_012913	CAATT	2	10	126163	126172	40 %	40 %	0 %	20 %	251791936
108	NC_012913	GTTTT	2	10	128061	128070	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012913	GTTTG	2	10	128496	128505	0 %	60 %	40 %	0 %	251791939
110	NC_012913	TGCGG	2	10	131104	131113	0 %	20 %	60 %	20 %	251791941
111	NC_012913	ACACC	2	10	134738	134747	40 %	0 %	0 %	60 %	251791944
112	NC_012913	GTTTT	2	10	135027	135036	0 %	80 %	20 %	0 %	251791944
113	NC_012913	ACGTA	2	10	138906	138915	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_012913	TAATT	2	10	141525	141534	40 %	60 %	0 %	0 %	251791950
115	NC_012913	TGGGG	2	10	142333	142342	0 %	20 %	80 %	0 %	251791950
116	NC_012913	AATGG	2	10	144426	144435	40 %	20 %	40 %	0 %	251791952
117	NC_012913	ATTAA	2	10	144776	144785	60 %	40 %	0 %	0 %	251791953
118	NC_012913	CGCAC	2	10	145845	145854	20 %	0 %	20 %	60 %	251791954
119	NC_012913	TTGCT	2	10	146849	146858	0 %	60 %	20 %	20 %	251791955
120	NC_012913	TCATT	2	10	148336	148345	20 %	60 %	0 %	20 %	251791957
121	NC_012913	TGGTG	2	10	149246	149255	0 %	40 %	60 %	0 %	251791959
122	NC_012913	TTGGC	2	10	153032	153041	0 %	40 %	40 %	20 %	251791961
123	NC_012913	GTGTT	2	10	153199	153208	0 %	60 %	40 %	0 %	251791961
124	NC_012913	TGCTT	2	10	155139	155148	0 %	60 %	20 %	20 %	251791964
125	NC_012913	CCAAA	2	10	155507	155516	60 %	0 %	0 %	40 %	251791964
126	NC_012913	TTCAC	2	10	156992	157001	20 %	40 %	0 %	40 %	251791967
127	NC_012913	CCATA	2	10	157652	157661	40 %	20 %	0 %	40 %	251791967
128	NC_012913	CATTG	2	10	158366	158375	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_012913	CTAAA	2	10	159052	159061	60 %	20 %	0 %	20 %	251791970
130	NC_012913	GCCGT	2	10	159898	159907	0 %	20 %	40 %	40 %	251791970
131	NC_012913	CCCCG	2	10	160636	160645	0 %	0 %	20 %	80 %	251791971
132	NC_012913	AAATC	2	10	162501	162510	60 %	20 %	0 %	20 %	251791975
133	NC_012913	TGAAA	2	10	162624	162633	60 %	20 %	20 %	0 %	251791975
134	NC_012913	TTTCA	2	10	164259	164268	20 %	60 %	0 %	20 %	251791976
135	NC_012913	GGCGT	2	10	164456	164465	0 %	20 %	60 %	20 %	251791976
136	NC_012913	GTTTG	2	10	164468	164477	0 %	60 %	40 %	0 %	251791976
137	NC_012913	CAAAT	2	10	164740	164749	60 %	20 %	0 %	20 %	251791976
138	NC_012913	TCGGT	2	10	165187	165196	0 %	40 %	40 %	20 %	251791977
139	NC_012913	ATTCC	2	10	167958	167967	20 %	40 %	0 %	40 %	251791980
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142	NC_012913	GAAAG	2	10	168532	168541	60 %	0 %	40 %	0 %	251791980
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152	NC_012913	TAAAG	2	10	178905	178914	60 %	20 %	20 %	0 %	251791989
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156	NC_012913	TACCT	2	10	181402	181411	20 %	40 %	0 %	40 %	251791992
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263	NC_012913	TATTG	2	10	312541	312550	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_012913	GCCTT	2	10	319003	319012	0 %	40 %	20 %	40 %	251792117
270	NC_012913	TTTTA	2	10	320268	320277	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_012913	GGTAT	2	10	322937	322946	20 %	40 %	40 %	0 %	251792119
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291	NC_012913	CTTTT	2	10	350415	350424	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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391	NC_012913	CAGCG	2	10	505589	505598	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
392	NC_012913	TGGGC	2	10	508825	508834	0 %	20 %	60 %	20 %	251792291
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394	NC_012913	GTTAT	2	10	509853	509862	20 %	60 %	20 %	0 %	251792292
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398	NC_012913	CTGGA	2	10	513432	513441	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
399	NC_012913	CAAAG	2	10	515078	515087	60 %	0 %	20 %	20 %	251792298
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402	NC_012913	CAGCA	2	10	525146	525155	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
403	NC_012913	GTCAA	2	10	527545	527554	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
404	NC_012913	TGGGG	2	10	527696	527705	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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