MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Aggregatibacter aphrophilus NJ8700 chromosome

Total Repeats: 1787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012913	ACTTT	2	10	1250726	1250735	20 %	60 %	0 %	20 %	251792962
1002	NC_012913	TTCCA	2	10	1251214	1251223	20 %	40 %	0 %	40 %	251792962
1003	NC_012913	TCCAT	2	10	1251788	1251797	20 %	40 %	0 %	40 %	251792962
1004	NC_012913	CCCAT	2	10	1252092	1252101	20 %	20 %	0 %	60 %	251792963
1005	NC_012913	TAATT	2	10	1253711	1253720	40 %	60 %	0 %	0 %	251792965
1006	NC_012913	TCCAA	2	10	1254303	1254312	40 %	20 %	0 %	40 %	251792965
1007	NC_012913	ATTTA	2	10	1255114	1255123	40 %	60 %	0 %	0 %	251792966
1008	NC_012913	AAAAT	2	10	1256088	1256097	80 %	20 %	0 %	0 %	251792967
1009	NC_012913	ATACA	2	10	1256427	1256436	60 %	20 %	0 %	20 %	251792967
1010	NC_012913	AATAA	2	10	1256636	1256645	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_012913	TAAAT	2	10	1258390	1258399	60 %	40 %	0 %	0 %	251792968
1012	NC_012913	GTAAA	2	10	1260336	1260345	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_012913	ATTCA	2	10	1262679	1262688	40 %	40 %	0 %	20 %	251792973
1014	NC_012913	CAACG	2	10	1265508	1265517	40 %	0 %	20 %	40 %	251792976
1015	NC_012913	ACATC	2	10	1269618	1269627	40 %	20 %	0 %	40 %	251792979
1016	NC_012913	TACCG	2	10	1272006	1272015	20 %	20 %	20 %	40 %	251792981
1017	NC_012913	TGGTT	2	10	1273227	1273236	0 %	60 %	40 %	0 %	251792982
1018	NC_012913	TTGCT	2	10	1274281	1274290	0 %	60 %	20 %	20 %	251792984
1019	NC_012913	CAATT	2	10	1275363	1275372	40 %	40 %	0 %	20 %	251792984
1020	NC_012913	CGCGC	2	10	1276548	1276557	0 %	0 %	40 %	60 %	251792985
1021	NC_012913	ATTTA	2	10	1277133	1277142	40 %	60 %	0 %	0 %	251792985
1022	NC_012913	TTTGG	2	10	1277910	1277919	0 %	60 %	40 %	0 %	251792986
1023	NC_012913	TGGCG	2	10	1278517	1278526	0 %	20 %	60 %	20 %	251792986
1024	NC_012913	CATTG	2	10	1279012	1279021	20 %	40 %	20 %	20 %	251792987
1025	NC_012913	ATTCT	2	10	1279698	1279707	20 %	60 %	0 %	20 %	251792988
1026	NC_012913	ATTTA	2	10	1282273	1282282	40 %	60 %	0 %	0 %	251792988
1027	NC_012913	AACTT	2	10	1282553	1282562	40 %	40 %	0 %	20 %	251792988
1028	NC_012913	CTTTT	2	10	1282766	1282775	0 %	80 %	0 %	20 %	251792989
1029	NC_012913	GGTTT	2	10	1283334	1283343	0 %	60 %	40 %	0 %	251792990
1030	NC_012913	TTTAA	2	10	1285148	1285157	40 %	60 %	0 %	0 %	251792992
1031	NC_012913	AAATG	2	10	1286440	1286449	60 %	20 %	20 %	0 %	251792994
1032	NC_012913	ATAAA	2	10	1288595	1288604	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_012913	AAACC	2	10	1290388	1290397	60 %	0 %	0 %	40 %	251792998
1034	NC_012913	AGGCG	2	10	1290566	1290575	20 %	0 %	60 %	20 %	251792998
1035	NC_012913	GGCAC	2	10	1290609	1290618	20 %	0 %	40 %	40 %	251792998
1036	NC_012913	GTGCG	2	10	1291288	1291297	0 %	20 %	60 %	20 %	251793000
1037	NC_012913	CTGCT	2	10	1291364	1291373	0 %	40 %	20 %	40 %	251793000
1038	NC_012913	AGAAA	2	10	1293662	1293671	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_012913	AATTA	2	10	1294236	1294245	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_012913	ACTCA	2	10	1296146	1296155	40 %	20 %	0 %	40 %	251793007
1041	NC_012913	TAATG	2	10	1296172	1296181	40 %	40 %	20 %	0 %	251793007
1042	NC_012913	GTTGG	2	10	1298178	1298187	0 %	40 %	60 %	0 %	251793008
1043	NC_012913	TGAAA	2	10	1300819	1300828	60 %	20 %	20 %	0 %	251793012
1044	NC_012913	AAGTG	2	10	1302168	1302177	40 %	20 %	40 %	0 %	251793013
1045	NC_012913	TAGCC	2	10	1302368	1302377	20 %	20 %	20 %	40 %	251793014
1046	NC_012913	ATTTT	2	10	1304021	1304030	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_012913	CATTT	2	10	1305187	1305196	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1048	NC_012913	TATGC	2	10	1307746	1307755	20 %	40 %	20 %	20 %	251793018
1049	NC_012913	AACTA	2	10	1310560	1310569	60 %	20 %	0 %	20 %	251793022
1050	NC_012913	AGGCA	2	10	1312916	1312925	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1051	NC_012913	ATCTC	2	10	1317956	1317965	20 %	40 %	0 %	40 %	251793029
1052	NC_012913	CCGCA	2	10	1319154	1319163	20 %	0 %	20 %	60 %	251793029
1053	NC_012913	ATTCA	2	10	1321924	1321933	40 %	40 %	0 %	20 %	251793030
1054	NC_012913	CTTTT	2	10	1323165	1323174	0 %	80 %	0 %	20 %	251793031
1055	NC_012913	CCAAT	2	10	1323321	1323330	40 %	20 %	0 %	40 %	251793031
1056	NC_012913	TCACC	2	10	1323383	1323392	20 %	20 %	0 %	60 %	251793031
1057	NC_012913	TGTAA	2	10	1324416	1324425	40 %	40 %	20 %	0 %	251793032
1058	NC_012913	AAAAT	3	15	1325543	1325557	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_012913	GTTTG	2	10	1325691	1325700	0 %	60 %	40 %	0 %	251793033
1060	NC_012913	CACAA	2	10	1326601	1326610	60 %	0 %	0 %	40 %	251793033
1061	NC_012913	TTGTT	2	10	1328260	1328269	0 %	80 %	20 %	0 %	251793035
1062	NC_012913	TCACT	2	10	1330341	1330350	20 %	40 %	0 %	40 %	251793037
1063	NC_012913	TTTCA	2	10	1330555	1330564	20 %	60 %	0 %	20 %	251793037
1064	NC_012913	TAAGT	2	10	1334486	1334495	40 %	40 %	20 %	0 %	251793039
1065	NC_012913	TTATG	2	10	1336311	1336320	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_012913	CTTTG	2	10	1336480	1336489	0 %	60 %	20 %	20 %	251793041
1067	NC_012913	GTATT	2	10	1336594	1336603	20 %	60 %	20 %	0 %	251793041
1068	NC_012913	TGGTT	2	10	1343521	1343530	0 %	60 %	40 %	0 %	251793047
1069	NC_012913	CCAAA	2	10	1345792	1345801	60 %	0 %	0 %	40 %	251793048
1070	NC_012913	AATAC	2	10	1346364	1346373	60 %	20 %	0 %	20 %	251793048
1071	NC_012913	CACTT	2	10	1347531	1347540	20 %	40 %	0 %	40 %	251793049
1072	NC_012913	ATTGA	2	10	1347604	1347613	40 %	40 %	20 %	0 %	251793050
1073	NC_012913	TGCCG	2	10	1347732	1347741	0 %	20 %	40 %	40 %	251793050
1074	NC_012913	CCTTG	2	10	1348859	1348868	0 %	40 %	20 %	40 %	251793052
1075	NC_012913	ACGCA	2	10	1350261	1350270	40 %	0 %	20 %	40 %	251793052
1076	NC_012913	ACCAA	2	10	1352456	1352465	60 %	0 %	0 %	40 %	251793054
1077	NC_012913	ATTCT	2	10	1353632	1353641	20 %	60 %	0 %	20 %	251793056
1078	NC_012913	ATTGT	2	10	1358079	1358088	20 %	60 %	20 %	0 %	251793059
1079	NC_012913	TCTGC	2	10	1362030	1362039	0 %	40 %	20 %	40 %	251793063
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1081	NC_012913	ATAAA	2	10	1365379	1365388	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_012913	AATAA	2	10	1365988	1365997	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_012913	TTTAA	2	10	1366019	1366028	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_012913	GATAA	2	10	1368053	1368062	60 %	20 %	20 %	0 %	251793072
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1087	NC_012913	TTGAT	2	10	1369764	1369773	20 %	60 %	20 %	0 %	251793073
1088	NC_012913	ATAAA	2	10	1370166	1370175	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_012913	TAAAA	2	10	1371554	1371563	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_012913	CTTTT	2	10	1371608	1371617	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1091	NC_012913	AATGG	2	10	1372269	1372278	40 %	20 %	40 %	0 %	251793075
1092	NC_012913	AAAAT	2	10	1372384	1372393	80 %	20 %	0 %	0 %	251793075
1093	NC_012913	CGGAT	2	10	1373165	1373174	20 %	20 %	40 %	20 %	251793075
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1095	NC_012913	AAAAT	2	10	1373670	1373679	80 %	20 %	0 %	0 %	251793075
1096	NC_012913	TTTTC	2	10	1373943	1373952	0 %	80 %	0 %	20 %	251793075
1097	NC_012913	TTAAA	2	10	1374224	1374233	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_012913	TCGCC	2	10	1374958	1374967	0 %	20 %	20 %	60 %	251793076
1099	NC_012913	ATAAC	2	10	1375877	1375886	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1100	NC_012913	ATTTA	2	10	1375898	1375907	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_012913	CTTTT	2	10	1375968	1375977	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1102	NC_012913	GAATT	2	10	1377078	1377087	40 %	40 %	20 %	0 %	251793078
1103	NC_012913	GCCCG	2	10	1378800	1378809	0 %	0 %	40 %	60 %	251793079
1104	NC_012913	AAAAT	2	10	1379926	1379935	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_012913	TAACT	2	10	1379980	1379989	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1106	NC_012913	TTCAC	2	10	1382879	1382888	20 %	40 %	0 %	40 %	251793083
1107	NC_012913	CTGCT	2	10	1382896	1382905	0 %	40 %	20 %	40 %	251793083
1108	NC_012913	TGAGT	2	10	1385945	1385954	20 %	40 %	40 %	0 %	251793088
1109	NC_012913	TTCAT	2	10	1386039	1386048	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1110	NC_012913	GTAAA	2	10	1386809	1386818	60 %	20 %	20 %	0 %	251793090
1111	NC_012913	ATGGC	2	10	1387448	1387457	20 %	20 %	40 %	20 %	251793091
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1498	NC_012913	TATAA	2	10	1942011	1942020	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1499	NC_012913	AAACC	2	10	1943635	1943644	60 %	0 %	0 %	40 %	251793637
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