MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Aggregatibacter aphrophilus NJ8700 chromosome

Total Repeats: 1787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012913	AACCA	2	10	1945631	1945640	60 %	0 %	0 %	40 %	251793640
1502	NC_012913	TAATT	2	10	1946097	1946106	40 %	60 %	0 %	0 %	251793640
1503	NC_012913	ACGTA	2	10	1947065	1947074	40 %	20 %	20 %	20 %	251793642
1504	NC_012913	CATTT	2	10	1947146	1947155	20 %	60 %	0 %	20 %	251793642
1505	NC_012913	AAATT	2	10	1947620	1947629	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_012913	AAATT	2	10	1949237	1949246	60 %	40 %	0 %	0 %	251793646
1507	NC_012913	GCACG	2	10	1949463	1949472	20 %	0 %	40 %	40 %	251793646
1508	NC_012913	ACATC	2	10	1949517	1949526	40 %	20 %	0 %	40 %	251793646
1509	NC_012913	TTCAT	2	10	1949864	1949873	20 %	60 %	0 %	20 %	251793646
1510	NC_012913	CGGTA	2	10	1950458	1950467	20 %	20 %	40 %	20 %	251793647
1511	NC_012913	CGCAA	2	10	1950831	1950840	40 %	0 %	20 %	40 %	251793647
1512	NC_012913	GTTGC	2	10	1951166	1951175	0 %	40 %	40 %	20 %	251793647
1513	NC_012913	AAGCG	2	10	1951364	1951373	40 %	0 %	40 %	20 %	251793647
1514	NC_012913	CCGTT	2	10	1952099	1952108	0 %	40 %	20 %	40 %	251793648
1515	NC_012913	CGCAC	2	10	1952702	1952711	20 %	0 %	20 %	60 %	251793648
1516	NC_012913	CAGCG	2	10	1954623	1954632	20 %	0 %	40 %	40 %	251793650
1517	NC_012913	TAATT	2	10	1955325	1955334	40 %	60 %	0 %	0 %	251793650
1518	NC_012913	CAAAA	2	10	1955610	1955619	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1519	NC_012913	TTTTA	2	10	1957233	1957242	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_012913	GGCTG	2	10	1957745	1957754	0 %	20 %	60 %	20 %	251793653
1521	NC_012913	AAGTG	2	10	1957837	1957846	40 %	20 %	40 %	0 %	251793653
1522	NC_012913	TATGA	2	10	1959497	1959506	40 %	40 %	20 %	0 %	251793654
1523	NC_012913	CAAAG	2	10	1959932	1959941	60 %	0 %	20 %	20 %	251793654
1524	NC_012913	TTGAA	2	10	1964416	1964425	40 %	40 %	20 %	0 %	251793657
1525	NC_012913	AAAAT	2	10	1965088	1965097	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_012913	AAACA	2	10	1965290	1965299	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1527	NC_012913	AAAGT	2	10	1965339	1965348	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_012913	GGCAT	2	10	1967892	1967901	20 %	20 %	40 %	20 %	251793661
1529	NC_012913	AAATT	2	10	1968500	1968509	60 %	40 %	0 %	0 %	251793662
1530	NC_012913	ATCTT	2	10	1971125	1971134	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1531	NC_012913	CATTA	2	10	1971773	1971782	40 %	40 %	0 %	20 %	251793666
1532	NC_012913	AACTT	2	10	1975097	1975106	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1533	NC_012913	AGTTA	2	10	1976332	1976341	40 %	40 %	20 %	0 %	251793672
1534	NC_012913	AAGCG	2	10	1976536	1976545	40 %	0 %	40 %	20 %	251793673
1535	NC_012913	GAAAA	2	10	1978344	1978353	80 %	0 %	20 %	0 %	251793674
1536	NC_012913	TAATT	2	10	1978798	1978807	40 %	60 %	0 %	0 %	251793674
1537	NC_012913	TTTAA	2	10	1980338	1980347	40 %	60 %	0 %	0 %	251793676
1538	NC_012913	TCTTT	2	10	1981099	1981108	0 %	80 %	0 %	20 %	251793677
1539	NC_012913	CTATT	2	10	1981111	1981120	20 %	60 %	0 %	20 %	251793677
1540	NC_012913	CATCA	2	10	1982394	1982403	40 %	20 %	0 %	40 %	251793678
1541	NC_012913	TTTTG	2	10	1982561	1982570	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_012913	AATTT	2	10	1983665	1983674	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_012913	GCCTT	2	10	1984378	1984387	0 %	40 %	20 %	40 %	251793680
1544	NC_012913	TCATC	2	10	1988179	1988188	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1545	NC_012913	CTTTT	2	10	1989010	1989019	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1546	NC_012913	ATAGC	2	10	1992725	1992734	40 %	20 %	20 %	20 %	251793688
1547	NC_012913	AAATC	2	10	1993259	1993268	60 %	20 %	0 %	20 %	251793689
1548	NC_012913	CCCAA	2	10	1993307	1993316	40 %	0 %	0 %	60 %	251793689
1549	NC_012913	CATAT	2	10	1993752	1993761	40 %	40 %	0 %	20 %	251793689
1550	NC_012913	ACGCC	2	10	1994460	1994469	20 %	0 %	20 %	60 %	251793690
1551	NC_012913	CAAAA	2	10	1997465	1997474	80 %	0 %	0 %	20 %	251793692
1552	NC_012913	TTGCC	2	10	1998106	1998115	0 %	40 %	20 %	40 %	251793692
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1554	NC_012913	TTGGC	2	10	2000481	2000490	0 %	40 %	40 %	20 %	251793695
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1556	NC_012913	ATTAG	2	10	2008129	2008138	40 %	40 %	20 %	0 %	251793701
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1558	NC_012913	AAATT	2	10	2009414	2009423	60 %	40 %	0 %	0 %	251793704
1559	NC_012913	CATTA	2	10	2009467	2009476	40 %	40 %	0 %	20 %	251793704
1560	NC_012913	TTCTC	2	10	2014548	2014557	0 %	60 %	0 %	40 %	251793709
1561	NC_012913	CTTTT	2	10	2019519	2019528	0 %	80 %	0 %	20 %	251793712
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1565	NC_012913	AATTG	2	10	2021119	2021128	40 %	40 %	20 %	0 %	251793714
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1571	NC_012913	AGGCG	2	10	2026497	2026506	20 %	0 %	60 %	20 %	251793722
1572	NC_012913	TTGGT	2	10	2028983	2028992	0 %	60 %	40 %	0 %	251793724
1573	NC_012913	AGATG	2	10	2030156	2030165	40 %	20 %	40 %	0 %	251793725
1574	NC_012913	TTCAA	2	10	2030239	2030248	40 %	40 %	0 %	20 %	251793725
1575	NC_012913	ATATC	2	10	2030624	2030633	40 %	40 %	0 %	20 %	251793725
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1580	NC_012913	TTCGT	2	10	2038917	2038926	0 %	60 %	20 %	20 %	251793738
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1582	NC_012913	GTGAT	2	10	2039755	2039764	20 %	40 %	40 %	0 %	251793740
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1584	NC_012913	AAAAT	2	10	2041900	2041909	80 %	20 %	0 %	0 %	251793743
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1587	NC_012913	GTTTT	2	10	2046620	2046629	0 %	80 %	20 %	0 %	251793747
1588	NC_012913	CACGC	2	10	2047764	2047773	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1589	NC_012913	TAGCA	2	10	2050081	2050090	40 %	20 %	20 %	20 %	251793750
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1591	NC_012913	AATTT	2	10	2052358	2052367	40 %	60 %	0 %	0 %	251793753
1592	NC_012913	GGTAT	2	10	2052413	2052422	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_012913	TTGGG	2	10	2052754	2052763	0 %	40 %	60 %	0 %	251793754
1594	NC_012913	CTTGG	2	10	2056677	2056686	0 %	40 %	40 %	20 %	251793757
1595	NC_012913	TTGGT	2	10	2056910	2056919	0 %	60 %	40 %	0 %	251793757
1596	NC_012913	CGAAC	2	10	2057962	2057971	40 %	0 %	20 %	40 %	251793759
1597	NC_012913	ATTGT	2	10	2058401	2058410	20 %	60 %	20 %	0 %	251793760
1598	NC_012913	CTGAA	2	10	2062077	2062086	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1599	NC_012913	AGAAA	2	10	2062312	2062321	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_012913	ATTGC	2	10	2064830	2064839	20 %	40 %	20 %	20 %	251793766
1601	NC_012913	GGCAT	2	10	2064968	2064977	20 %	20 %	40 %	20 %	251793767
1602	NC_012913	TATTT	2	10	2065141	2065150	20 %	80 %	0 %	0 %	251793767
1603	NC_012913	ATAAA	2	10	2065440	2065449	80 %	20 %	0 %	0 %	251793767
1604	NC_012913	CGTGG	2	10	2065806	2065815	0 %	20 %	60 %	20 %	251793768
1605	NC_012913	TGGGG	2	10	2066628	2066637	0 %	20 %	80 %	0 %	251793768
1606	NC_012913	GGAAT	2	10	2068322	2068331	40 %	20 %	40 %	0 %	251793769
1607	NC_012913	TGCGT	2	10	2069137	2069146	0 %	40 %	40 %	20 %	251793770
1608	NC_012913	TGGCT	2	10	2069402	2069411	0 %	40 %	40 %	20 %	251793771
1609	NC_012913	TAAGC	2	10	2071287	2071296	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1610	NC_012913	GATGC	2	10	2071459	2071468	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1611	NC_012913	CATTC	2	10	2075333	2075342	20 %	40 %	0 %	40 %	251793776
1612	NC_012913	AAAAG	2	10	2076540	2076549	80 %	0 %	20 %	0 %	251793777
1613	NC_012913	ATAAA	2	10	2077346	2077355	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_012913	GCAAT	2	10	2077431	2077440	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1615	NC_012913	TGAGA	2	10	2077735	2077744	40 %	20 %	40 %	0 %	251793778
1616	NC_012913	TAATT	2	10	2077834	2077843	40 %	60 %	0 %	0 %	251793778
1617	NC_012913	ATAAA	2	10	2078320	2078329	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_012913	AGGTA	2	10	2078874	2078883	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_012913	TGTAA	2	10	2079200	2079209	40 %	40 %	20 %	0 %	251793780
1620	NC_012913	GGGCA	2	10	2079238	2079247	20 %	0 %	60 %	20 %	251793780
1621	NC_012913	TTTTC	2	10	2079979	2079988	0 %	80 %	0 %	20 %	251793780
1622	NC_012913	TGTAA	2	10	2080851	2080860	40 %	40 %	20 %	0 %	251793782
1623	NC_012913	GGGCA	2	10	2080889	2080898	20 %	0 %	60 %	20 %	251793782
1624	NC_012913	CAAGA	2	10	2081537	2081546	60 %	0 %	20 %	20 %	251793783
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1752	NC_012913	ACAAA	2	10	2261438	2261447	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1753	NC_012913	TCTTT	2	10	2261672	2261681	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1754	NC_012913	ATTAA	2	10	2263037	2263046	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1755	NC_012913	GATCA	2	10	2266978	2266987	40 %	20 %	20 %	20 %	251793983
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1758	NC_012913	TTATG	2	10	2269275	2269284	20 %	60 %	20 %	0 %	251793988
1759	NC_012913	TTGAT	2	10	2269604	2269613	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1760	NC_012913	CGGTG	2	10	2275911	2275920	0 %	20 %	60 %	20 %	251793995
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1762	NC_012913	ATTTT	2	10	2281287	2281296	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1763	NC_012913	CGTTA	2	10	2281609	2281618	20 %	40 %	20 %	20 %	251794002
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1784	NC_012913	TAATA	2	10	2311170	2311179	60 %	40 %	0 %	0 %	251794033
1785	NC_012913	TCCAA	2	10	2311835	2311844	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1786	NC_012913	CGATT	2	10	2312699	2312708	20 %	40 %	20 %	20 %	251794035
1787	NC_012913	ATTGT	2	10	2312950	2312959	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.