MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 2746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011989	GCGCA	2	10	3396865	3396874	20 %	0 %	40 %	40 %	222149969
2502	NC_011989	TGCGC	2	10	3400288	3400297	0 %	20 %	40 %	40 %	222149973
2503	NC_011989	TCGCC	2	10	3401819	3401828	0 %	20 %	20 %	60 %	222149975
2504	NC_011989	CGGTT	2	10	3402019	3402028	0 %	40 %	40 %	20 %	222149975
2505	NC_011989	TCAGC	2	10	3403577	3403586	20 %	20 %	20 %	40 %	222149977
2506	NC_011989	ACGGC	2	10	3404883	3404892	20 %	0 %	40 %	40 %	222149979
2507	NC_011989	CGCGC	2	10	3405073	3405082	0 %	0 %	40 %	60 %	222149979
2508	NC_011989	CCGTG	2	10	3407454	3407463	0 %	20 %	40 %	40 %	222149980
2509	NC_011989	TGTCG	2	10	3407635	3407644	0 %	40 %	40 %	20 %	222149980
2510	NC_011989	CTGGC	2	10	3412595	3412604	0 %	20 %	40 %	40 %	222149987
2511	NC_011989	CGGCG	2	10	3413207	3413216	0 %	0 %	60 %	40 %	222149987
2512	NC_011989	CCTCG	2	10	3413743	3413752	0 %	20 %	20 %	60 %	222149988
2513	NC_011989	TTCCG	2	10	3414180	3414189	0 %	40 %	20 %	40 %	222149988
2514	NC_011989	CAGGC	2	10	3415377	3415386	20 %	0 %	40 %	40 %	222149990
2515	NC_011989	GAAAA	2	10	3416495	3416504	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_011989	TGCCC	2	10	3418052	3418061	0 %	20 %	20 %	60 %	222149992
2517	NC_011989	ACCGC	2	10	3418415	3418424	20 %	0 %	20 %	60 %	222149992
2518	NC_011989	GGCTT	2	10	3418993	3419002	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2519	NC_011989	TCCTG	2	10	3421213	3421222	0 %	40 %	20 %	40 %	222149994
2520	NC_011989	CCGTC	2	10	3421600	3421609	0 %	20 %	20 %	60 %	222149995
2521	NC_011989	TTCGA	2	10	3423333	3423342	20 %	40 %	20 %	20 %	222149996
2522	NC_011989	TGATT	2	10	3423871	3423880	20 %	60 %	20 %	0 %	222149996
2523	NC_011989	GTTCT	2	10	3424730	3424739	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2524	NC_011989	CGCGC	2	10	3425291	3425300	0 %	0 %	40 %	60 %	222149998
2525	NC_011989	TGGCC	2	10	3426873	3426882	0 %	20 %	40 %	40 %	222150000
2526	NC_011989	AGGAC	2	10	3427442	3427451	40 %	0 %	40 %	20 %	222150001
2527	NC_011989	CGCTT	2	10	3427889	3427898	0 %	40 %	20 %	40 %	222150002
2528	NC_011989	AAACC	2	10	3430798	3430807	60 %	0 %	0 %	40 %	222150004
2529	NC_011989	GCGAA	2	10	3436116	3436125	40 %	0 %	40 %	20 %	222150008
2530	NC_011989	ACTCA	2	10	3439633	3439642	40 %	20 %	0 %	40 %	222150011
2531	NC_011989	GCGCC	2	10	3440151	3440160	0 %	0 %	40 %	60 %	222150011
2532	NC_011989	GCGAC	2	10	3440312	3440321	20 %	0 %	40 %	40 %	222150011
2533	NC_011989	ACCTC	2	10	3442666	3442675	20 %	20 %	0 %	60 %	222150012
2534	NC_011989	GGCCC	2	10	3443213	3443222	0 %	0 %	40 %	60 %	222150012
2535	NC_011989	AAAAC	2	10	3445070	3445079	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2536	NC_011989	GTGCG	2	10	3446377	3446386	0 %	20 %	60 %	20 %	222150013
2537	NC_011989	CGCAT	2	10	3447334	3447343	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2538	NC_011989	GCCCG	2	10	3449060	3449069	0 %	0 %	40 %	60 %	222150015
2539	NC_011989	CGGAA	2	10	3449074	3449083	40 %	0 %	40 %	20 %	222150015
2540	NC_011989	GATAC	2	10	3450272	3450281	40 %	20 %	20 %	20 %	222150017
2541	NC_011989	GACAT	2	10	3454625	3454634	40 %	20 %	20 %	20 %	222150019
2542	NC_011989	TTTTA	2	10	3459101	3459110	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_011989	CAGCT	2	10	3459440	3459449	20 %	20 %	20 %	40 %	222150024
2544	NC_011989	GCTCA	2	10	3459485	3459494	20 %	20 %	20 %	40 %	222150024
2545	NC_011989	AACGC	2	10	3461738	3461747	40 %	0 %	20 %	40 %	222150026
2546	NC_011989	TTGAT	2	10	3463697	3463706	20 %	60 %	20 %	0 %	222150027
2547	NC_011989	CGCGG	2	10	3463729	3463738	0 %	0 %	60 %	40 %	222150027
2548	NC_011989	CAAAC	2	10	3464702	3464711	60 %	0 %	0 %	40 %	222150029
2549	NC_011989	AAAAT	2	10	3464960	3464969	80 %	20 %	0 %	0 %	222150029
2550	NC_011989	GCCCG	2	10	3465878	3465887	0 %	0 %	40 %	60 %	222150030
2551	NC_011989	TCGGC	2	10	3465937	3465946	0 %	20 %	40 %	40 %	222150030
2552	NC_011989	CAGCA	2	10	3466295	3466304	40 %	0 %	20 %	40 %	222150030
2553	NC_011989	GAACA	2	10	3467406	3467415	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2554	NC_011989	CACCC	2	10	3467487	3467496	20 %	0 %	0 %	80 %	222150031
2555	NC_011989	TGCGG	2	10	3468473	3468482	0 %	20 %	60 %	20 %	222150031
2556	NC_011989	TTGGC	2	10	3468676	3468685	0 %	40 %	40 %	20 %	222150031
2557	NC_011989	CGCGG	2	10	3470611	3470620	0 %	0 %	60 %	40 %	222150032
2558	NC_011989	TTTGC	2	10	3470633	3470642	0 %	60 %	20 %	20 %	222150032
2559	NC_011989	CAAGG	2	10	3472209	3472218	40 %	0 %	40 %	20 %	222150033
2560	NC_011989	GCCAT	2	10	3473670	3473679	20 %	20 %	20 %	40 %	222150034
2561	NC_011989	ACACC	2	10	3474376	3474385	40 %	0 %	0 %	60 %	222150035
2562	NC_011989	CGCAT	2	10	3475112	3475121	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2563	NC_011989	CCAAA	2	10	3478669	3478678	60 %	0 %	0 %	40 %	222150038
2564	NC_011989	ACTTC	2	10	3481883	3481892	20 %	40 %	0 %	40 %	222150041
2565	NC_011989	CCGGT	2	10	3487709	3487718	0 %	20 %	40 %	40 %	222150046
2566	NC_011989	CCAGA	2	10	3488614	3488623	40 %	0 %	20 %	40 %	222150048
2567	NC_011989	TGGAA	2	10	3489017	3489026	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_011989	AGTGC	2	10	3489051	3489060	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2569	NC_011989	AAGGC	2	10	3491865	3491874	40 %	0 %	40 %	20 %	222150053
2570	NC_011989	TCGGC	2	10	3493604	3493613	0 %	20 %	40 %	40 %	222150055
2571	NC_011989	CGCGG	2	10	3493675	3493684	0 %	0 %	60 %	40 %	222150055
2572	NC_011989	AAGCG	2	10	3498184	3498193	40 %	0 %	40 %	20 %	222150059
2573	NC_011989	CCCGG	2	10	3499353	3499362	0 %	0 %	40 %	60 %	222150061
2574	NC_011989	CCCGG	2	10	3505296	3505305	0 %	0 %	40 %	60 %	222150067
2575	NC_011989	ATCGG	2	10	3506651	3506660	20 %	20 %	40 %	20 %	222150068
2576	NC_011989	CGGCA	2	10	3507232	3507241	20 %	0 %	40 %	40 %	222150068
2577	NC_011989	TTCAG	2	10	3507311	3507320	20 %	40 %	20 %	20 %	222150068
2578	NC_011989	CATTC	2	10	3508344	3508353	20 %	40 %	0 %	40 %	222150068
2579	NC_011989	ATGGA	2	10	3509771	3509780	40 %	20 %	40 %	0 %	222150069
2580	NC_011989	TCAGC	2	10	3510158	3510167	20 %	20 %	20 %	40 %	222150070
2581	NC_011989	TCGAT	2	10	3510221	3510230	20 %	40 %	20 %	20 %	222150070
2582	NC_011989	CTGGC	2	10	3513580	3513589	0 %	20 %	40 %	40 %	222150073
2583	NC_011989	TCGCC	2	10	3517030	3517039	0 %	20 %	20 %	60 %	222150077
2584	NC_011989	CGGCA	2	10	3519862	3519871	20 %	0 %	40 %	40 %	222150082
2585	NC_011989	CTGCG	2	10	3521154	3521163	0 %	20 %	40 %	40 %	222150082
2586	NC_011989	GCTTC	2	10	3523236	3523245	0 %	40 %	20 %	40 %	222150083
2587	NC_011989	CAAGG	2	10	3523672	3523681	40 %	0 %	40 %	20 %	222150084
2588	NC_011989	ATCCT	2	10	3523917	3523926	20 %	40 %	0 %	40 %	222150084
2589	NC_011989	CAGAC	2	10	3527131	3527140	40 %	0 %	20 %	40 %	222150087
2590	NC_011989	CCCAG	2	10	3527904	3527913	20 %	0 %	20 %	60 %	222150087
2591	NC_011989	CGGCC	2	10	3529645	3529654	0 %	0 %	40 %	60 %	222150089
2592	NC_011989	GCTTG	2	10	3534405	3534414	0 %	40 %	40 %	20 %	222150095
2593	NC_011989	CCGGG	2	10	3534761	3534770	0 %	0 %	60 %	40 %	222150096
2594	NC_011989	GGCTG	2	10	3535140	3535149	0 %	20 %	60 %	20 %	222150096
2595	NC_011989	TCCTG	2	10	3536669	3536678	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2596	NC_011989	GGCAC	2	10	3537237	3537246	20 %	0 %	40 %	40 %	222150098
2597	NC_011989	CAACC	2	10	3538655	3538664	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2598	NC_011989	TGAAC	2	10	3540825	3540834	40 %	20 %	20 %	20 %	222150102
2599	NC_011989	CTGGC	2	10	3540908	3540917	0 %	20 %	40 %	40 %	222150102
2600	NC_011989	TGGCG	2	10	3544518	3544527	0 %	20 %	60 %	20 %	222150107
2601	NC_011989	ATTTT	2	10	3544923	3544932	20 %	80 %	0 %	0 %	222150108
2602	NC_011989	GCACC	2	10	3545472	3545481	20 %	0 %	20 %	60 %	222150108
2603	NC_011989	GCGCC	2	10	3547709	3547718	0 %	0 %	40 %	60 %	222150111
2604	NC_011989	ATCGG	2	10	3554075	3554084	20 %	20 %	40 %	20 %	222150115
2605	NC_011989	CCTGT	2	10	3555233	3555242	0 %	40 %	20 %	40 %	222150116
2606	NC_011989	CAAGC	2	10	3556137	3556146	40 %	0 %	20 %	40 %	222150117
2607	NC_011989	GGCCG	2	10	3559936	3559945	0 %	0 %	60 %	40 %	222150122
2608	NC_011989	GAGCA	2	10	3562432	3562441	40 %	0 %	40 %	20 %	222150122
2609	NC_011989	CAGGA	2	10	3563299	3563308	40 %	0 %	40 %	20 %	222150123
2610	NC_011989	TCCGG	2	10	3565993	3566002	0 %	20 %	40 %	40 %	222150126
2611	NC_011989	ATTTC	2	10	3566883	3566892	20 %	60 %	0 %	20 %	222150126
2612	NC_011989	GCCTT	2	10	3567072	3567081	0 %	40 %	20 %	40 %	222150127
2613	NC_011989	CCGGC	2	10	3572343	3572352	0 %	0 %	40 %	60 %	222150132
2614	NC_011989	GCGAT	2	10	3572514	3572523	20 %	20 %	40 %	20 %	222150132
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2616	NC_011989	CGGCG	2	10	3573610	3573619	0 %	0 %	60 %	40 %	222150133
2617	NC_011989	CGGCG	2	10	3574893	3574902	0 %	0 %	60 %	40 %	222150135
2618	NC_011989	CACGG	2	10	3575513	3575522	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2619	NC_011989	TCCAG	2	10	3575868	3575877	20 %	20 %	20 %	40 %	222150136
2620	NC_011989	TTTCG	2	10	3577000	3577009	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2621	NC_011989	ATGGC	2	10	3577778	3577787	20 %	20 %	40 %	20 %	222150139
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2623	NC_011989	ATGAC	2	10	3578423	3578432	40 %	20 %	20 %	20 %	222150139
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.