MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 2746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011989	CGATC	2	10	2082828	2082837	20 %	20 %	20 %	40 %	222148860
1502	NC_011989	GGCGC	2	10	2083652	2083661	0 %	0 %	60 %	40 %	222148861
1503	NC_011989	ATGCC	2	10	2085131	2085140	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1504	NC_011989	TTCGA	2	10	2085920	2085929	20 %	40 %	20 %	20 %	222148863
1505	NC_011989	AATCG	2	10	2085930	2085939	40 %	20 %	20 %	20 %	222148863
1506	NC_011989	AGTGG	2	10	2087569	2087578	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_011989	GTCAA	2	10	2094267	2094276	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1508	NC_011989	ACTGG	2	10	2095983	2095992	20 %	20 %	40 %	20 %	222148875
1509	NC_011989	TCGCT	2	10	2096174	2096183	0 %	40 %	20 %	40 %	222148875
1510	NC_011989	GGCCT	2	10	2096284	2096293	0 %	20 %	40 %	40 %	222148875
1511	NC_011989	CATTC	2	10	2097856	2097865	20 %	40 %	0 %	40 %	222148877
1512	NC_011989	ATCGC	2	10	2100333	2100342	20 %	20 %	20 %	40 %	222148879
1513	NC_011989	TGGAA	2	10	2105710	2105719	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_011989	GCGCA	2	10	2106750	2106759	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1515	NC_011989	CGACA	2	10	2107800	2107809	40 %	0 %	20 %	40 %	222148884
1516	NC_011989	CGAAG	2	10	2107982	2107991	40 %	0 %	40 %	20 %	222148884
1517	NC_011989	GGCGC	2	10	2108844	2108853	0 %	0 %	60 %	40 %	222148884
1518	NC_011989	TCGCC	2	10	2112168	2112177	0 %	20 %	20 %	60 %	222148886
1519	NC_011989	TCACC	2	10	2113067	2113076	20 %	20 %	0 %	60 %	222148887
1520	NC_011989	GATGA	2	10	2113629	2113638	40 %	20 %	40 %	0 %	222148888
1521	NC_011989	CGGAC	2	10	2114210	2114219	20 %	0 %	40 %	40 %	222148888
1522	NC_011989	ATCGG	2	10	2115248	2115257	20 %	20 %	40 %	20 %	222148889
1523	NC_011989	CGCCA	2	10	2115448	2115457	20 %	0 %	20 %	60 %	222148889
1524	NC_011989	GCCGC	2	10	2116309	2116318	0 %	0 %	40 %	60 %	222148889
1525	NC_011989	GCCCT	2	10	2116592	2116601	0 %	20 %	20 %	60 %	222148889
1526	NC_011989	CAGGA	2	10	2116873	2116882	40 %	0 %	40 %	20 %	222148889
1527	NC_011989	TGCAA	2	10	2117475	2117484	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1528	NC_011989	CGCCT	2	10	2119271	2119280	0 %	20 %	20 %	60 %	222148891
1529	NC_011989	CAAGC	2	10	2120170	2120179	40 %	0 %	20 %	40 %	222148891
1530	NC_011989	GGACA	2	10	2120366	2120375	40 %	0 %	40 %	20 %	222148891
1531	NC_011989	GACGT	2	10	2120498	2120507	20 %	20 %	40 %	20 %	222148891
1532	NC_011989	CCGAT	2	10	2120790	2120799	20 %	20 %	20 %	40 %	222148891
1533	NC_011989	GCCAT	2	10	2125064	2125073	20 %	20 %	20 %	40 %	222148896
1534	NC_011989	ATGGC	2	10	2127396	2127405	20 %	20 %	40 %	20 %	222148898
1535	NC_011989	TGGCT	2	10	2127968	2127977	0 %	40 %	40 %	20 %	222148898
1536	NC_011989	ATATG	2	10	2128009	2128018	40 %	40 %	20 %	0 %	222148898
1537	NC_011989	CAAGC	2	10	2129413	2129422	40 %	0 %	20 %	40 %	222148899
1538	NC_011989	GAACC	2	10	2131244	2131253	40 %	0 %	20 %	40 %	222148901
1539	NC_011989	GCCCG	2	10	2132256	2132265	0 %	0 %	40 %	60 %	222148902
1540	NC_011989	GCCGA	2	10	2134110	2134119	20 %	0 %	40 %	40 %	222148903
1541	NC_011989	TCGGC	2	10	2134243	2134252	0 %	20 %	40 %	40 %	222148904
1542	NC_011989	CGTCC	2	10	2134265	2134274	0 %	20 %	20 %	60 %	222148904
1543	NC_011989	TTGAC	2	10	2135077	2135086	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1544	NC_011989	TGCCC	2	10	2136119	2136128	0 %	20 %	20 %	60 %	222148906
1545	NC_011989	GATCA	2	10	2137796	2137805	40 %	20 %	20 %	20 %	222148907
1546	NC_011989	ACGCA	2	10	2138022	2138031	40 %	0 %	20 %	40 %	222148908
1547	NC_011989	TCGTT	2	10	2138955	2138964	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1548	NC_011989	ATGCG	2	10	2139231	2139240	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1549	NC_011989	GGCGG	2	10	2141310	2141319	0 %	0 %	80 %	20 %	222148911
1550	NC_011989	CAGAA	2	10	2141469	2141478	60 %	0 %	20 %	20 %	222148911
1551	NC_011989	GGACA	2	10	2143041	2143050	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1552	NC_011989	GCCTT	2	10	2147584	2147593	0 %	40 %	20 %	40 %	222148917
1553	NC_011989	ATCCG	2	10	2152347	2152356	20 %	20 %	20 %	40 %	222148918
1554	NC_011989	CAAGG	2	10	2153896	2153905	40 %	0 %	40 %	20 %	222148919
1555	NC_011989	TGCCC	2	10	2154019	2154028	0 %	20 %	20 %	60 %	222148919
1556	NC_011989	CGCGC	2	10	2155811	2155820	0 %	0 %	40 %	60 %	222148921
1557	NC_011989	GCGCA	2	10	2156884	2156893	20 %	0 %	40 %	40 %	222148922
1558	NC_011989	TGATC	2	10	2158263	2158272	20 %	40 %	20 %	20 %	222148923
1559	NC_011989	GCACG	2	10	2158671	2158680	20 %	0 %	40 %	40 %	222148923
1560	NC_011989	GGTTC	2	10	2159161	2159170	0 %	40 %	40 %	20 %	222148923
1561	NC_011989	GCCGG	2	10	2159498	2159507	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1562	NC_011989	CAAAA	2	10	2159748	2159757	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1563	NC_011989	GCGCT	2	10	2160709	2160718	0 %	20 %	40 %	40 %	222148924
1564	NC_011989	TGCAA	2	10	2161037	2161046	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1565	NC_011989	GGCCA	2	10	2161974	2161983	20 %	0 %	40 %	40 %	222148926
1566	NC_011989	CGCTG	2	10	2163062	2163071	0 %	20 %	40 %	40 %	222148926
1567	NC_011989	GATCA	2	10	2163255	2163264	40 %	20 %	20 %	20 %	222148926
1568	NC_011989	CAAAA	2	10	2163467	2163476	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1569	NC_011989	TTGAA	2	10	2164175	2164184	40 %	40 %	20 %	0 %	222148927
1570	NC_011989	GGCCT	2	10	2165133	2165142	0 %	20 %	40 %	40 %	222148928
1571	NC_011989	CGCCT	2	10	2165337	2165346	0 %	20 %	20 %	60 %	222148928
1572	NC_011989	CCGGC	2	10	2171507	2171516	0 %	0 %	40 %	60 %	222148934
1573	NC_011989	GGCCC	2	10	2171672	2171681	0 %	0 %	40 %	60 %	222148935
1574	NC_011989	CGGCC	2	10	2172975	2172984	0 %	0 %	40 %	60 %	222148936
1575	NC_011989	GCCAT	2	10	2174291	2174300	20 %	20 %	20 %	40 %	222148937
1576	NC_011989	ACATT	2	10	2175043	2175052	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1577	NC_011989	TCGTG	2	10	2176064	2176073	0 %	40 %	40 %	20 %	222148940
1578	NC_011989	ATTCC	2	10	2176833	2176842	20 %	40 %	0 %	40 %	222148940
1579	NC_011989	GTCAT	2	10	2177876	2177885	20 %	40 %	20 %	20 %	222148941
1580	NC_011989	TGGGC	2	10	2178700	2178709	0 %	20 %	60 %	20 %	222148942
1581	NC_011989	GCGCC	2	10	2178790	2178799	0 %	0 %	40 %	60 %	222148942
1582	NC_011989	GCGCC	2	10	2179640	2179649	0 %	0 %	40 %	60 %	222148942
1583	NC_011989	CTGGG	2	10	2180236	2180245	0 %	20 %	60 %	20 %	222148943
1584	NC_011989	GATGC	2	10	2180380	2180389	20 %	20 %	40 %	20 %	222148943
1585	NC_011989	CTCAC	2	10	2180941	2180950	20 %	20 %	0 %	60 %	222148944
1586	NC_011989	GCCGC	2	10	2181162	2181171	0 %	0 %	40 %	60 %	222148944
1587	NC_011989	CTTCA	2	10	2182537	2182546	20 %	40 %	0 %	40 %	222148945
1588	NC_011989	TTCGT	2	10	2184671	2184680	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1589	NC_011989	TCGGC	2	10	2185159	2185168	0 %	20 %	40 %	40 %	222148947
1590	NC_011989	GAACG	2	10	2186456	2186465	40 %	0 %	40 %	20 %	222148950
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1592	NC_011989	GCAAG	2	10	2191601	2191610	40 %	0 %	40 %	20 %	222148952
1593	NC_011989	CCCGG	2	10	2192204	2192213	0 %	0 %	40 %	60 %	222148953
1594	NC_011989	CACCG	2	10	2193095	2193104	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1595	NC_011989	ACGTG	2	10	2196217	2196226	20 %	20 %	40 %	20 %	222148958
1596	NC_011989	GCGCC	2	10	2196864	2196873	0 %	0 %	40 %	60 %	222148959
1597	NC_011989	GATCG	2	10	2197277	2197286	20 %	20 %	40 %	20 %	222148959
1598	NC_011989	CCGCA	2	10	2197707	2197716	20 %	0 %	20 %	60 %	222148960
1599	NC_011989	GCTTT	2	10	2198075	2198084	0 %	60 %	20 %	20 %	222148961
1600	NC_011989	GGAGC	2	10	2201492	2201501	20 %	0 %	60 %	20 %	222148963
1601	NC_011989	GAATG	2	10	2205263	2205272	40 %	20 %	40 %	0 %	222148966
1602	NC_011989	CCGGC	2	10	2209632	2209641	0 %	0 %	40 %	60 %	222148971
1603	NC_011989	TGCGC	2	10	2212928	2212937	0 %	20 %	40 %	40 %	222148974
1604	NC_011989	ATGCG	3	15	2215132	2215146	20 %	20 %	40 %	20 %	222148975
1605	NC_011989	GCTCG	2	10	2215217	2215226	0 %	20 %	40 %	40 %	222148975
1606	NC_011989	AGGTC	2	10	2215849	2215858	20 %	20 %	40 %	20 %	222148975
1607	NC_011989	AACGG	2	10	2216150	2216159	40 %	0 %	40 %	20 %	222148975
1608	NC_011989	CGGTC	2	10	2216288	2216297	0 %	20 %	40 %	40 %	222148975
1609	NC_011989	CAGGT	2	10	2217500	2217509	20 %	20 %	40 %	20 %	222148976
1610	NC_011989	AAATC	2	10	2218689	2218698	60 %	20 %	0 %	20 %	222148978
1611	NC_011989	AGCTT	2	10	2221351	2221360	20 %	40 %	20 %	20 %	222148980
1612	NC_011989	CGCAT	2	10	2221491	2221500	20 %	20 %	20 %	40 %	222148980
1613	NC_011989	AGCGC	2	10	2223631	2223640	20 %	0 %	40 %	40 %	222148981
1614	NC_011989	GAAAG	2	10	2225586	2225595	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_011989	TGCGC	2	10	2227071	2227080	0 %	20 %	40 %	40 %	222148983
1616	NC_011989	CCGGG	2	10	2231650	2231659	0 %	0 %	60 %	40 %	222148986
1617	NC_011989	GCGAA	2	10	2232246	2232255	40 %	0 %	40 %	20 %	222148987
1618	NC_011989	GCAGC	2	10	2232322	2232331	20 %	0 %	40 %	40 %	222148987
1619	NC_011989	AGGTC	2	10	2232598	2232607	20 %	20 %	40 %	20 %	222148987
1620	NC_011989	CATCG	2	10	2233215	2233224	20 %	20 %	20 %	40 %	222148988
1621	NC_011989	ATCTT	2	10	2233789	2233798	20 %	60 %	0 %	20 %	222148988
1622	NC_011989	TGCGA	2	10	2235961	2235970	20 %	20 %	40 %	20 %	222148991
1623	NC_011989	CCCCA	2	10	2240746	2240755	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1624	NC_011989	TACAA	2	10	2242194	2242203	60 %	20 %	0 %	20 %	222148996
1625	NC_011989	CCTGT	2	10	2242573	2242582	0 %	40 %	20 %	40 %	222148996
1626	NC_011989	TCACC	2	10	2242630	2242639	20 %	20 %	0 %	60 %	222148996
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1629	NC_011989	ACCTG	2	10	2246670	2246679	20 %	20 %	20 %	40 %	222149000
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1634	NC_011989	CCTTT	2	10	2253036	2253045	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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1642	NC_011989	GGCCA	2	10	2264003	2264012	20 %	0 %	40 %	40 %	222149017
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1648	NC_011989	GATCA	2	10	2271887	2271896	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1658	NC_011989	TCGCT	2	10	2286242	2286251	0 %	40 %	20 %	40 %	222149032
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1662	NC_011989	GGCCG	3	15	2295191	2295205	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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1664	NC_011989	GTCGC	2	10	2297838	2297847	0 %	20 %	40 %	40 %	222149040
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1669	NC_011989	GAGCC	2	10	2308600	2308609	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1670	NC_011989	ATCCA	2	10	2311095	2311104	40 %	20 %	0 %	40 %	222149052
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1681	NC_011989	GTACG	2	10	2317145	2317154	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1682	NC_011989	GCCAG	2	10	2317564	2317573	20 %	0 %	40 %	40 %	222149057
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1684	NC_011989	CATAA	2	10	2318695	2318704	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1685	NC_011989	CCAAA	2	10	2319102	2319111	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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1747	NC_011989	CCGCG	2	10	2396447	2396456	0 %	0 %	40 %	60 %	222149124
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1755	NC_011989	ATCCG	2	10	2402464	2402473	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1866	NC_011989	TTCAA	2	10	2569430	2569439	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1997	NC_011989	CGCGG	2	10	2752734	2752743	0 %	0 %	60 %	40 %	222149436
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