MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 2746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011989	GGCGC	2	10	1401519	1401528	0 %	0 %	60 %	40 %	222148250
1002	NC_011989	GATCA	2	10	1402172	1402181	40 %	20 %	20 %	20 %	222148251
1003	NC_011989	GGCGA	2	10	1404301	1404310	20 %	0 %	60 %	20 %	222148254
1004	NC_011989	CTTGT	2	10	1404449	1404458	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1005	NC_011989	TGATG	2	10	1405106	1405115	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_011989	GCCGG	2	10	1408532	1408541	0 %	0 %	60 %	40 %	222148259
1007	NC_011989	ATTCT	2	10	1409820	1409829	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1008	NC_011989	AATCA	2	10	1410133	1410142	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1009	NC_011989	TCGCT	2	10	1410213	1410222	0 %	40 %	20 %	40 %	222148261
1010	NC_011989	CCAGC	2	10	1411556	1411565	20 %	0 %	20 %	60 %	222148262
1011	NC_011989	GCACA	2	10	1412893	1412902	40 %	0 %	20 %	40 %	222148263
1012	NC_011989	TGGCT	2	10	1413261	1413270	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1013	NC_011989	GACCG	2	10	1413600	1413609	20 %	0 %	40 %	40 %	222148264
1014	NC_011989	TACGA	2	10	1413736	1413745	40 %	20 %	20 %	20 %	222148264
1015	NC_011989	TGCGC	2	10	1417817	1417826	0 %	20 %	40 %	40 %	222148266
1016	NC_011989	GGTGA	2	10	1418562	1418571	20 %	20 %	60 %	0 %	222148266
1017	NC_011989	TCGCC	2	10	1419140	1419149	0 %	20 %	20 %	60 %	222148267
1018	NC_011989	GTTCT	2	10	1419585	1419594	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1019	NC_011989	TCCGG	2	10	1421807	1421816	0 %	20 %	40 %	40 %	222148270
1020	NC_011989	CAGCC	2	10	1421963	1421972	20 %	0 %	20 %	60 %	222148270
1021	NC_011989	TATAA	2	10	1424430	1424439	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_011989	GTTTG	2	10	1428484	1428493	0 %	60 %	40 %	0 %	222148275
1023	NC_011989	GTTGA	2	10	1429393	1429402	20 %	40 %	40 %	0 %	222148276
1024	NC_011989	TCTGC	2	10	1430812	1430821	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1025	NC_011989	TGGGA	2	10	1431844	1431853	20 %	20 %	60 %	0 %	222148279
1026	NC_011989	AATGA	2	10	1431892	1431901	60 %	20 %	20 %	0 %	222148279
1027	NC_011989	GCCGT	2	10	1432806	1432815	0 %	20 %	40 %	40 %	222148279
1028	NC_011989	ACGGC	2	10	1435168	1435177	20 %	0 %	40 %	40 %	222148281
1029	NC_011989	GTTTC	2	10	1436224	1436233	0 %	60 %	20 %	20 %	222148282
1030	NC_011989	TGCGT	2	10	1437453	1437462	0 %	40 %	40 %	20 %	222148283
1031	NC_011989	GCCGC	2	10	1437909	1437918	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1032	NC_011989	GCTAT	2	10	1438908	1438917	20 %	40 %	20 %	20 %	222148286
1033	NC_011989	CTTCG	2	10	1439510	1439519	0 %	40 %	20 %	40 %	222148286
1034	NC_011989	AGCGG	2	10	1444253	1444262	20 %	0 %	60 %	20 %	222148289
1035	NC_011989	CCATT	2	10	1445080	1445089	20 %	40 %	0 %	40 %	222148290
1036	NC_011989	GGGTC	2	10	1446446	1446455	0 %	20 %	60 %	20 %	222148291
1037	NC_011989	CGGTT	2	10	1446866	1446875	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1038	NC_011989	GACCT	2	10	1447164	1447173	20 %	20 %	20 %	40 %	222148292
1039	NC_011989	ATCGA	2	10	1451506	1451515	40 %	20 %	20 %	20 %	222148296
1040	NC_011989	CGGTC	2	10	1453477	1453486	0 %	20 %	40 %	40 %	222148298
1041	NC_011989	TGGCA	2	10	1454005	1454014	20 %	20 %	40 %	20 %	222148298
1042	NC_011989	ATCGA	2	10	1455041	1455050	40 %	20 %	20 %	20 %	222148298
1043	NC_011989	TTTCC	2	10	1455843	1455852	0 %	60 %	0 %	40 %	222148298
1044	NC_011989	GCTGT	2	10	1456121	1456130	0 %	40 %	40 %	20 %	222148298
1045	NC_011989	GGGGC	2	10	1457208	1457217	0 %	0 %	80 %	20 %	222148299
1046	NC_011989	GGGCG	2	10	1458687	1458696	0 %	0 %	80 %	20 %	222148300
1047	NC_011989	CGAGG	2	10	1459234	1459243	20 %	0 %	60 %	20 %	222148300
1048	NC_011989	TGATC	2	10	1460699	1460708	20 %	40 %	20 %	20 %	222148303
1049	NC_011989	GCGTG	2	10	1463524	1463533	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1050	NC_011989	CGATC	2	10	1464188	1464197	20 %	20 %	20 %	40 %	222148306
1051	NC_011989	CCGCG	2	10	1465968	1465977	0 %	0 %	40 %	60 %	222148308
1052	NC_011989	GGCGC	2	10	1466333	1466342	0 %	0 %	60 %	40 %	222148308
1053	NC_011989	TTTGG	2	10	1468358	1468367	0 %	60 %	40 %	0 %	222148309
1054	NC_011989	CCAGA	2	10	1469860	1469869	40 %	0 %	20 %	40 %	222148309
1055	NC_011989	CATCG	2	10	1470796	1470805	20 %	20 %	20 %	40 %	222148309
1056	NC_011989	CGGCA	2	10	1471861	1471870	20 %	0 %	40 %	40 %	222148310
1057	NC_011989	TGATG	2	10	1472182	1472191	20 %	40 %	40 %	0 %	222148310
1058	NC_011989	GGCCG	2	10	1472548	1472557	0 %	0 %	60 %	40 %	222148310
1059	NC_011989	AGCGA	2	10	1473230	1473239	40 %	0 %	40 %	20 %	222148311
1060	NC_011989	CATCG	2	10	1473516	1473525	20 %	20 %	20 %	40 %	222148312
1061	NC_011989	CCGCC	2	10	1476365	1476374	0 %	0 %	20 %	80 %	222148314
1062	NC_011989	GGGCC	2	10	1478338	1478347	0 %	0 %	60 %	40 %	222148316
1063	NC_011989	GCGGT	2	10	1479741	1479750	0 %	20 %	60 %	20 %	222148318
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1068	NC_011989	ATGGC	2	10	1490622	1490631	20 %	20 %	40 %	20 %	222148332
1069	NC_011989	CAGGG	2	10	1490882	1490891	20 %	0 %	60 %	20 %	222148332
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1072	NC_011989	CACGG	2	10	1494025	1494034	20 %	0 %	40 %	40 %	222148336
1073	NC_011989	GCCCG	2	10	1494133	1494142	0 %	0 %	40 %	60 %	222148336
1074	NC_011989	GCGTG	2	10	1494537	1494546	0 %	20 %	60 %	20 %	222148336
1075	NC_011989	CACCC	2	10	1495344	1495353	20 %	0 %	0 %	80 %	222148337
1076	NC_011989	GGTGA	2	10	1495546	1495555	20 %	20 %	60 %	0 %	222148337
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1079	NC_011989	CCTGC	2	10	1499316	1499325	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1080	NC_011989	TCGGT	2	10	1499468	1499477	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1081	NC_011989	AGGCA	2	10	1499585	1499594	40 %	0 %	40 %	20 %	222148339
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1093	NC_011989	CAGCT	2	10	1516889	1516898	20 %	20 %	20 %	40 %	222148355
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1096	NC_011989	CCTTT	2	10	1517652	1517661	0 %	60 %	0 %	40 %	222148357
1097	NC_011989	GACCT	2	10	1517923	1517932	20 %	20 %	20 %	40 %	222148357
1098	NC_011989	TCCTG	2	10	1522056	1522065	0 %	40 %	20 %	40 %	222148358
1099	NC_011989	AAGGC	2	10	1523298	1523307	40 %	0 %	40 %	20 %	222148358
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1103	NC_011989	TGGAA	2	10	1532776	1532785	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_011989	CTTGC	2	10	1534989	1534998	0 %	40 %	20 %	40 %	222148369
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1107	NC_011989	CAATC	2	10	1535963	1535972	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1108	NC_011989	TCGGC	2	10	1537058	1537067	0 %	20 %	40 %	40 %	222148373
1109	NC_011989	GTGAT	2	10	1537973	1537982	20 %	40 %	40 %	0 %	222148376
1110	NC_011989	GAAAA	2	10	1540876	1540885	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_011989	CGGAT	2	10	1544219	1544228	20 %	20 %	40 %	20 %	222148387
1112	NC_011989	GCAAT	2	10	1545354	1545363	40 %	20 %	20 %	20 %	222148389
1113	NC_011989	TTATT	2	10	1549732	1549741	20 %	80 %	0 %	0 %	222148393
1114	NC_011989	GTTTG	2	10	1549799	1549808	0 %	60 %	40 %	0 %	222148393
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1116	NC_011989	TAGGG	2	10	1550666	1550675	20 %	20 %	60 %	0 %	222148394
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1123	NC_011989	AGGGC	2	10	1563306	1563315	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1124	NC_011989	CCTGT	2	10	1563883	1563892	0 %	40 %	20 %	40 %	222148403
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1126	NC_011989	CGGGG	2	10	1567677	1567686	0 %	0 %	80 %	20 %	222148405
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1193	NC_011989	TGTTT	2	10	1657539	1657548	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1230	NC_011989	CCCTT	2	10	1714341	1714350	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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1234	NC_011989	CACTT	2	10	1720672	1720681	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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1240	NC_011989	GGAAA	2	10	1727086	1727095	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1241	NC_011989	GCGCC	2	10	1727126	1727135	0 %	0 %	40 %	60 %	222148550
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1246	NC_011989	GACAG	2	10	1729624	1729633	40 %	0 %	40 %	20 %	222148552
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1249	NC_011989	CAATC	2	10	1731391	1731400	40 %	20 %	0 %	40 %	222148554
1250	NC_011989	CGCGC	2	10	1732246	1732255	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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1487	NC_011989	GGCAA	2	10	2067681	2067690	40 %	0 %	40 %	20 %	222148844
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1494	NC_011989	GCCAT	2	10	2076293	2076302	20 %	20 %	20 %	40 %	222148855
1495	NC_011989	CATGA	2	10	2076573	2076582	40 %	20 %	20 %	20 %	222148855
1496	NC_011989	TTCTT	2	10	2077114	2077123	0 %	80 %	0 %	20 %	222148855
1497	NC_011989	CGGCG	2	10	2079183	2079192	0 %	0 %	60 %	40 %	222148856
1498	NC_011989	TCATC	2	10	2081089	2081098	20 %	40 %	0 %	40 %	222148858
1499	NC_011989	CGAGG	2	10	2082043	2082052	20 %	0 %	60 %	20 %	222148859
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