MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pTiS4

Total Repeats: 2698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011982	CGA	2	6	245519	245524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080307
2502	NC_011982	GGC	2	6	245633	245638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080307
2503	NC_011982	CGT	2	6	245667	245672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080307
2504	NC_011982	CGA	2	6	245738	245743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080307
2505	NC_011982	TGA	2	6	245777	245782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080307
2506	NC_011982	CCG	2	6	245896	245901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080307
2507	NC_011982	AAG	2	6	246058	246063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080308
2508	NC_011982	CGC	2	6	246155	246160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080308
2509	NC_011982	CGA	2	6	246173	246178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080308
2510	NC_011982	TCG	2	6	246202	246207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080308
2511	NC_011982	TCA	2	6	246230	246235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080308
2512	NC_011982	GCC	2	6	246633	246638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080308
2513	NC_011982	GCC	2	6	246714	246719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080308
2514	NC_011982	CAC	2	6	246720	246725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080308
2515	NC_011982	AGG	2	6	246803	246808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080308
2516	NC_011982	CTG	2	6	247100	247105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080308
2517	NC_011982	GCC	3	9	247116	247124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080308
2518	NC_011982	GGA	2	6	247334	247339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080309
2519	NC_011982	GCC	2	6	247366	247371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080309
2520	NC_011982	GAA	2	6	247386	247391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080309
2521	NC_011982	TCG	2	6	247432	247437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080309
2522	NC_011982	GAC	2	6	247531	247536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080309
2523	NC_011982	CTT	2	6	247638	247643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080309
2524	NC_011982	ATA	2	6	247806	247811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222080309
2525	NC_011982	TCA	2	6	247840	247845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080309
2526	NC_011982	GAC	2	6	247901	247906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080309
2527	NC_011982	TGC	2	6	247949	247954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080309
2528	NC_011982	GGC	2	6	248022	248027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080309
2529	NC_011982	TGA	2	6	248048	248053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080309
2530	NC_011982	TCA	2	6	248071	248076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080309
2531	NC_011982	CGA	2	6	248246	248251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080310
2532	NC_011982	CCG	2	6	248355	248360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080310
2533	NC_011982	GTT	2	6	248478	248483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080310
2534	NC_011982	GAT	2	6	248565	248570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080310
2535	NC_011982	GAC	2	6	248580	248585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080310
2536	NC_011982	CAG	2	6	248655	248660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080310
2537	NC_011982	ACG	2	6	248800	248805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080310
2538	NC_011982	GTT	2	6	248944	248949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080310
2539	NC_011982	TGT	2	6	248988	248993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080310
2540	NC_011982	TTG	2	6	249105	249110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080310
2541	NC_011982	CCT	2	6	249137	249142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080310
2542	NC_011982	CTG	3	9	249261	249269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080310
2543	NC_011982	ATA	2	6	249280	249285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222080310
2544	NC_011982	AGA	2	6	249398	249403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080310
2545	NC_011982	ACG	3	9	249436	249444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080310
2546	NC_011982	CCG	2	6	249462	249467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080310
2547	NC_011982	CGC	2	6	249544	249549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080311
2548	NC_011982	TCG	2	6	249566	249571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080311
2549	NC_011982	GAC	2	6	249681	249686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080311
2550	NC_011982	TCT	2	6	249704	249709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080311
2551	NC_011982	GAC	2	6	249717	249722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080311
2552	NC_011982	GCC	2	6	249745	249750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080311
2553	NC_011982	GGC	2	6	249827	249832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080311
2554	NC_011982	CGC	2	6	249858	249863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080311
2555	NC_011982	GCG	2	6	249881	249886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080311
2556	NC_011982	GGA	2	6	249935	249940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080311
2557	NC_011982	GGC	2	6	249954	249959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080311
2558	NC_011982	TCA	2	6	250010	250015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080311
2559	NC_011982	TGT	2	6	250044	250049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080312
2560	NC_011982	CCA	2	6	250099	250104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080312
2561	NC_011982	GAC	2	6	250154	250159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080312
2562	NC_011982	GCC	2	6	250243	250248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080312
2563	NC_011982	GCT	2	6	250285	250290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080312
2564	NC_011982	CCG	2	6	250291	250296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080312
2565	NC_011982	CCG	2	6	250436	250441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080312
2566	NC_011982	CAC	2	6	250451	250456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080312
2567	NC_011982	CGC	2	6	250588	250593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080312
2568	NC_011982	GAC	2	6	250631	250636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080312
2569	NC_011982	TCT	2	6	250847	250852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080312
2570	NC_011982	GCG	2	6	250995	251000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080313
2571	NC_011982	CGA	2	6	251075	251080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080313
2572	NC_011982	TGT	2	6	251081	251086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080313
2573	NC_011982	GCA	2	6	251183	251188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080313
2574	NC_011982	GAC	2	6	251220	251225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080313
2575	NC_011982	CTG	2	6	251307	251312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080313
2576	NC_011982	CGA	2	6	251354	251359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080313
2577	NC_011982	GGC	3	9	251454	251462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080313
2578	NC_011982	TGG	2	6	251526	251531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080313
2579	NC_011982	CTT	2	6	251564	251569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080314
2580	NC_011982	CGG	2	6	251579	251584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080314
2581	NC_011982	GGC	2	6	251586	251591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080314
2582	NC_011982	GGC	2	6	251747	251752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080314
2583	NC_011982	CTG	2	6	251788	251793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080314
2584	NC_011982	GCA	2	6	251811	251816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080314
2585	NC_011982	TCC	2	6	251861	251866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080314
2586	NC_011982	CCG	2	6	251889	251894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080314
2587	NC_011982	CGG	2	6	251927	251932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080314
2588	NC_011982	GGT	2	6	251984	251989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080314
2589	NC_011982	ATC	2	6	252060	252065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080314
2590	NC_011982	GAG	2	6	252138	252143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080314
2591	NC_011982	CCG	2	6	252144	252149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080314
2592	NC_011982	CCA	2	6	252220	252225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080314
2593	NC_011982	ACG	2	6	252237	252242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080314
2594	NC_011982	CCG	2	6	252372	252377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080314
2595	NC_011982	ATG	2	6	252465	252470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080314
2596	NC_011982	GCG	2	6	252507	252512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080314
2597	NC_011982	CGG	2	6	252529	252534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080314
2598	NC_011982	AAC	2	6	252567	252572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080314
2599	NC_011982	GCC	2	6	252763	252768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080315
2600	NC_011982	GAA	2	6	252796	252801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080315
2601	NC_011982	ACG	2	6	252808	252813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080315
2602	NC_011982	TTC	2	6	252823	252828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080315
2603	NC_011982	TGC	2	6	252913	252918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080315
2604	NC_011982	CGA	2	6	252921	252926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080315
2605	NC_011982	GCC	2	6	252987	252992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080316
2606	NC_011982	GAA	2	6	253017	253022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080316
2607	NC_011982	CAT	2	6	253083	253088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080316
2608	NC_011982	CTG	2	6	253137	253142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080316
2609	NC_011982	GGC	2	6	253143	253148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080316
2610	NC_011982	GAT	2	6	253189	253194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080316
2611	NC_011982	ACG	2	6	253211	253216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080316
2612	NC_011982	TTC	2	6	253227	253232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080316
2613	NC_011982	GCT	2	6	253379	253384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080316
2614	NC_011982	GAC	2	6	253437	253442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080316
2615	NC_011982	GTT	2	6	253581	253586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080316
2616	NC_011982	CGA	2	6	253607	253612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080316
2617	NC_011982	GTT	2	6	253629	253634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080316
2618	NC_011982	CGC	2	6	253670	253675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080316
2619	NC_011982	CGG	2	6	253715	253720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080316
2620	NC_011982	CGA	2	6	253872	253877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080317
2621	NC_011982	GAC	2	6	253914	253919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080317
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