MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pTiS4

Total Repeats: 2698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_011982	CTC	2	6	193673	193678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080266
2002	NC_011982	GCA	2	6	193681	193686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080266
2003	NC_011982	ACG	2	6	193769	193774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080266
2004	NC_011982	AGA	2	6	193821	193826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080266
2005	NC_011982	GTT	2	6	194145	194150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080267
2006	NC_011982	GAA	2	6	194155	194160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080267
2007	NC_011982	TGA	2	6	194283	194288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080267
2008	NC_011982	GTG	2	6	194402	194407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080267
2009	NC_011982	GAT	2	6	194451	194456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080267
2010	NC_011982	ATG	2	6	194495	194500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080267
2011	NC_011982	CGC	2	6	194563	194568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080267
2012	NC_011982	GGC	3	9	194601	194609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080267
2013	NC_011982	ATC	2	6	194636	194641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080267
2014	NC_011982	AGG	2	6	194733	194738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080267
2015	NC_011982	AGC	2	6	194801	194806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080267
2016	NC_011982	ACG	2	6	194850	194855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080268
2017	NC_011982	CGG	2	6	194902	194907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080268
2018	NC_011982	TAG	2	6	194919	194924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080268
2019	NC_011982	AGT	2	6	194941	194946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080268
2020	NC_011982	ACC	2	6	195071	195076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080268
2021	NC_011982	CGG	2	6	195105	195110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080268
2022	NC_011982	ATT	2	6	195113	195118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222080268
2023	NC_011982	GAA	2	6	195161	195166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080268
2024	NC_011982	GCC	2	6	195254	195259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080268
2025	NC_011982	CAA	2	6	195314	195319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080268
2026	NC_011982	AGC	2	6	195331	195336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080268
2027	NC_011982	GAA	2	6	195431	195436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080268
2028	NC_011982	GGC	2	6	195437	195442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080268
2029	NC_011982	TCG	2	6	195450	195455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080268
2030	NC_011982	CGT	2	6	195523	195528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080268
2031	NC_011982	GCC	2	6	195609	195614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080268
2032	NC_011982	CAA	2	6	195682	195687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080268
2033	NC_011982	CCT	2	6	195703	195708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080268
2034	NC_011982	TCA	2	6	195787	195792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080268
2035	NC_011982	CCT	2	6	195798	195803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080269
2036	NC_011982	GCA	2	6	195837	195842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080269
2037	NC_011982	CGT	2	6	195871	195876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080269
2038	NC_011982	GGT	2	6	195984	195989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080269
2039	NC_011982	GAT	2	6	196041	196046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080269
2040	NC_011982	ATC	2	6	196231	196236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080269
2041	NC_011982	TAA	2	6	196290	196295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222080269
2042	NC_011982	CGG	2	6	196359	196364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080269
2043	NC_011982	CCG	2	6	196407	196412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080269
2044	NC_011982	CAA	2	6	196530	196535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080269
2045	NC_011982	CAA	2	6	197108	197113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080270
2046	NC_011982	AGA	2	6	197264	197269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080270
2047	NC_011982	CGA	2	6	197271	197276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080270
2048	NC_011982	CGC	2	6	197297	197302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080270
2049	NC_011982	AGC	2	6	197315	197320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080270
2050	NC_011982	GAT	2	6	197322	197327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080270
2051	NC_011982	GAT	2	6	197362	197367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080270
2052	NC_011982	TCG	2	6	197379	197384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080270
2053	NC_011982	ATG	2	6	197428	197433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080270
2054	NC_011982	CTC	2	6	197617	197622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080270
2055	NC_011982	CAG	2	6	197623	197628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080270
2056	NC_011982	GTC	2	6	197641	197646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080270
2057	NC_011982	GAA	2	6	197775	197780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080270
2058	NC_011982	TGC	2	6	197831	197836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080270
2059	NC_011982	ACT	2	6	197943	197948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080271
2060	NC_011982	ATG	2	6	197966	197971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080271
2061	NC_011982	CAT	2	6	198019	198024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080271
2062	NC_011982	GCC	2	6	198183	198188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080271
2063	NC_011982	TCA	2	6	198209	198214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080271
2064	NC_011982	CAG	2	6	198384	198389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080271
2065	NC_011982	CCG	2	6	198394	198399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080271
2066	NC_011982	CAG	2	6	198420	198425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080271
2067	NC_011982	CCT	2	6	198440	198445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080271
2068	NC_011982	GGT	2	6	198592	198597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080271
2069	NC_011982	ATG	2	6	198617	198622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080271
2070	NC_011982	TCA	2	6	198642	198647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080271
2071	NC_011982	ATC	2	6	198911	198916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080272
2072	NC_011982	TCT	2	6	199022	199027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080272
2073	NC_011982	GCG	2	6	199103	199108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080272
2074	NC_011982	CCG	2	6	200680	200685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080273
2075	NC_011982	CCT	2	6	200697	200702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080273
2076	NC_011982	TGA	2	6	200811	200816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080273
2077	NC_011982	CTT	2	6	200838	200843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080273
2078	NC_011982	AAG	2	6	200847	200852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080273
2079	NC_011982	AGA	2	6	200874	200879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080273
2080	NC_011982	ATC	2	6	200962	200967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080273
2081	NC_011982	CCT	2	6	201647	201652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080274
2082	NC_011982	ATG	2	6	201718	201723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080274
2083	NC_011982	TTG	2	6	201758	201763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080274
2084	NC_011982	AAT	2	6	201888	201893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222080274
2085	NC_011982	CCA	2	6	202001	202006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080274
2086	NC_011982	GGA	2	6	202015	202020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080274
2087	NC_011982	GCA	2	6	202057	202062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080274
2088	NC_011982	TTG	2	6	202133	202138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080274
2089	NC_011982	CGG	2	6	202192	202197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080274
2090	NC_011982	GTT	2	6	202213	202218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080274
2091	NC_011982	CCT	2	6	202349	202354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080274
2092	NC_011982	ATC	2	6	202413	202418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080274
2093	NC_011982	TTC	2	6	202499	202504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080274
2094	NC_011982	TGG	2	6	202508	202513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080274
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2096	NC_011982	CGC	2	6	203187	203192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080275
2097	NC_011982	GCG	2	6	203335	203340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080275
2098	NC_011982	GGT	2	6	203406	203411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080275
2099	NC_011982	GAA	2	6	203921	203926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080276
2100	NC_011982	ACG	2	6	203946	203951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080276
2101	NC_011982	TGG	2	6	203955	203960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080276
2102	NC_011982	GCC	2	6	204152	204157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080276
2103	NC_011982	CGT	2	6	204206	204211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080276
2104	NC_011982	GGC	2	6	204326	204331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080276
2105	NC_011982	CCT	2	6	204376	204381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080276
2106	NC_011982	CAA	2	6	205061	205066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080277
2107	NC_011982	TCG	2	6	205093	205098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080277
2108	NC_011982	AAG	2	6	205174	205179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080277
2109	NC_011982	CGA	2	6	205258	205263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080277
2110	NC_011982	TAT	2	6	205389	205394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222080277
2111	NC_011982	TTC	2	6	205482	205487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080277
2112	NC_011982	AGC	2	6	205549	205554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080277
2113	NC_011982	CGG	2	6	205604	205609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080277
2114	NC_011982	GTC	2	6	205660	205665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080277
2115	NC_011982	GAC	2	6	205775	205780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080277
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2117	NC_011982	TGT	2	6	205799	205804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080277
2118	NC_011982	CGC	2	6	205807	205812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080277
2119	NC_011982	AAG	2	6	205830	205835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080277
2120	NC_011982	ACG	2	6	205867	205872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080277
2121	NC_011982	CGG	2	6	205984	205989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080277
2122	NC_011982	ATA	2	6	206116	206121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222080277
2123	NC_011982	ATC	2	6	206270	206275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080278
2124	NC_011982	ATG	2	6	206326	206331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080278
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2135	NC_011982	CTT	2	6	207794	207799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080279
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2230	NC_011982	ACG	2	6	219609	219614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080285
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2232	NC_011982	TGA	2	6	220004	220009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080286
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2234	NC_011982	GCG	2	6	220152	220157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080286
2235	NC_011982	TGA	2	6	220203	220208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080286
2236	NC_011982	TGC	2	6	220274	220279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080286
2237	NC_011982	TCA	2	6	220301	220306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080286
2238	NC_011982	TCG	2	6	220320	220325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080286
2239	NC_011982	CTG	2	6	221770	221775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080287
2240	NC_011982	TGA	2	6	221822	221827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080287
2241	NC_011982	TCG	2	6	221863	221868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080287
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2354	NC_011982	CAA	2	6	232475	232480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080297
2355	NC_011982	AGC	2	6	232512	232517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080297
2356	NC_011982	CAT	2	6	232595	232600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080297
2357	NC_011982	GCT	2	6	232702	232707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080297
2358	NC_011982	GAT	2	6	232767	232772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080297
2359	NC_011982	GGT	2	6	233018	233023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080298
2360	NC_011982	GAC	2	6	233026	233031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080298
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2367	NC_011982	CTG	2	6	233735	233740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080298
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2372	NC_011982	CAT	2	6	234349	234354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080299
2373	NC_011982	TGA	2	6	234360	234365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080299
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2376	NC_011982	TGA	2	6	235200	235205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080299
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2378	NC_011982	TCA	2	6	235295	235300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080299
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2382	NC_011982	ACC	2	6	235763	235768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080299
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2471	NC_011982	TTG	2	6	242837	242842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080306
2472	NC_011982	AGA	2	6	243133	243138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080306
2473	NC_011982	TGC	2	6	243289	243294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080306
2474	NC_011982	TCT	2	6	243323	243328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080306
2475	NC_011982	GCC	2	6	243439	243444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080306
2476	NC_011982	GCC	2	6	243466	243471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080306
2477	NC_011982	TCG	2	6	243797	243802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080306
2478	NC_011982	CAG	2	6	243811	243816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080306
2479	NC_011982	GAT	2	6	243906	243911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080307
2480	NC_011982	CGA	2	6	243953	243958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080307
2481	NC_011982	GTG	2	6	243961	243966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080307
2482	NC_011982	ATG	2	6	243982	243987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080307
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2484	NC_011982	GAC	2	6	244164	244169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080307
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2486	NC_011982	ATG	2	6	244675	244680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080307
2487	NC_011982	CTT	2	6	244691	244696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080307
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2490	NC_011982	CAT	2	6	244913	244918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080307
2491	NC_011982	GCC	2	6	244935	244940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080307
2492	NC_011982	GAC	2	6	245000	245005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080307
2493	NC_011982	TCC	2	6	245058	245063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080307
2494	NC_011982	CAT	2	6	245066	245071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080307
2495	NC_011982	TGA	2	6	245075	245080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080307
2496	NC_011982	GCT	2	6	245113	245118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080307
2497	NC_011982	CAA	2	6	245120	245125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080307
2498	NC_011982	CTG	3	9	245129	245137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080307
2499	NC_011982	CCG	2	6	245194	245199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080307
2500	NC_011982	TGA	2	6	245300	245305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080307

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