MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pTiS4

Total Repeats: 2698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011982	TAA	2	6	143194	143199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222080228
1502	NC_011982	TCG	2	6	143238	143243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080228
1503	NC_011982	CGA	2	6	143395	143400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080228
1504	NC_011982	GTT	2	6	143408	143413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080228
1505	NC_011982	CGC	2	6	143619	143624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080228
1506	NC_011982	TAA	2	6	143668	143673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222080228
1507	NC_011982	CGG	2	6	143690	143695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080228
1508	NC_011982	CGG	2	6	143753	143758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080228
1509	NC_011982	CTA	2	6	143790	143795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080228
1510	NC_011982	TAT	2	6	143836	143841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222080228
1511	NC_011982	GCT	2	6	143917	143922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080228
1512	NC_011982	TGC	2	6	144272	144277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080229
1513	NC_011982	GCT	2	6	144335	144340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080229
1514	NC_011982	GAA	2	6	144344	144349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080229
1515	NC_011982	CTT	2	6	144402	144407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080229
1516	NC_011982	GTC	2	6	144442	144447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080229
1517	NC_011982	CAA	2	6	144684	144689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080229
1518	NC_011982	TAA	2	6	144977	144982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222080229
1519	NC_011982	CTC	2	6	145161	145166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080229
1520	NC_011982	GAT	2	6	145193	145198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080229
1521	NC_011982	CAG	2	6	145203	145208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080229
1522	NC_011982	GAT	2	6	145256	145261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080229
1523	NC_011982	AGA	2	6	145294	145299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080229
1524	NC_011982	GGC	2	6	145383	145388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080229
1525	NC_011982	CGG	2	6	145552	145557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080230
1526	NC_011982	CGG	2	6	145630	145635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080230
1527	NC_011982	ACC	2	6	145684	145689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080230
1528	NC_011982	AGG	2	6	145708	145713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080230
1529	NC_011982	AAG	2	6	145854	145859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080230
1530	NC_011982	GCG	2	6	145929	145934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080230
1531	NC_011982	GCT	2	6	145978	145983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080230
1532	NC_011982	GCT	2	6	146014	146019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080230
1533	NC_011982	GAT	2	6	146198	146203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080230
1534	NC_011982	GTG	2	6	146268	146273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080230
1535	NC_011982	CGA	2	6	146287	146292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080230
1536	NC_011982	TCG	2	6	146343	146348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080230
1537	NC_011982	GCG	2	6	146381	146386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080230
1538	NC_011982	TCG	2	6	146541	146546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080230
1539	NC_011982	CGT	2	6	148254	148259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080231
1540	NC_011982	CTT	2	6	148382	148387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080231
1541	NC_011982	GCA	2	6	148510	148515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080231
1542	NC_011982	CGT	2	6	148639	148644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080231
1543	NC_011982	TGG	2	6	148902	148907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080231
1544	NC_011982	GCT	2	6	149109	149114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080231
1545	NC_011982	CGT	2	6	149161	149166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080231
1546	NC_011982	ACT	2	6	149174	149179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080231
1547	NC_011982	TGC	2	6	149291	149296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080231
1548	NC_011982	GTT	2	6	149329	149334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080231
1549	NC_011982	AGA	2	6	149379	149384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080231
1550	NC_011982	GCT	2	6	149497	149502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080231
1551	NC_011982	GTC	2	6	149574	149579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080231
1552	NC_011982	TCA	2	6	149739	149744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080231
1553	NC_011982	CAA	2	6	149851	149856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080231
1554	NC_011982	ATT	2	6	150012	150017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222080231
1555	NC_011982	CTG	2	6	150179	150184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080231
1556	NC_011982	GAA	2	6	150210	150215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080231
1557	NC_011982	GCG	2	6	150216	150221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080231
1558	NC_011982	GTT	2	6	150253	150258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080231
1559	NC_011982	TTC	2	6	150287	150292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080231
1560	NC_011982	CCA	2	6	150313	150318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080231
1561	NC_011982	TAT	2	6	150410	150415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222080231
1562	NC_011982	CGG	2	6	150472	150477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080231
1563	NC_011982	AGA	2	6	150851	150856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080232
1564	NC_011982	CTC	2	6	150877	150882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080232
1565	NC_011982	GCG	2	6	150890	150895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080232
1566	NC_011982	TCA	2	6	150920	150925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080232
1567	NC_011982	AAT	2	6	151176	151181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222080232
1568	NC_011982	TCG	2	6	151241	151246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080232
1569	NC_011982	GCG	2	6	151275	151280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080232
1570	NC_011982	TGT	2	6	151302	151307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080232
1571	NC_011982	TCA	2	6	151397	151402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080232
1572	NC_011982	TCA	2	6	151460	151465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080232
1573	NC_011982	ATG	2	6	151496	151501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080232
1574	NC_011982	GTA	2	6	151532	151537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080232
1575	NC_011982	GAG	2	6	151585	151590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080232
1576	NC_011982	CTG	2	6	151651	151656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080232
1577	NC_011982	CCG	2	6	151732	151737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080232
1578	NC_011982	GCC	2	6	151772	151777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080232
1579	NC_011982	GCC	2	6	151807	151812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080232
1580	NC_011982	TCC	2	6	151904	151909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080232
1581	NC_011982	TGA	2	6	152070	152075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080232
1582	NC_011982	GCA	2	6	152081	152086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080232
1583	NC_011982	CGC	2	6	152162	152167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080232
1584	NC_011982	CGC	2	6	152202	152207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080232
1585	NC_011982	ACG	2	6	152300	152305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080232
1586	NC_011982	CAA	3	9	152334	152342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080232
1587	NC_011982	GTT	2	6	152352	152357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080232
1588	NC_011982	AAC	2	6	152516	152521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080232
1589	NC_011982	CAC	2	6	152551	152556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080232
1590	NC_011982	GAT	2	6	152557	152562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080232
1591	NC_011982	GGT	2	6	152606	152611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080232
1592	NC_011982	TCA	2	6	152643	152648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080232
1593	NC_011982	TGC	2	6	152692	152697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080232
1594	NC_011982	TCA	2	6	152766	152771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080232
1595	NC_011982	GCC	2	6	152875	152880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080233
1596	NC_011982	GCT	2	6	152928	152933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080233
1597	NC_011982	GAA	2	6	153190	153195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080233
1598	NC_011982	CAG	2	6	153285	153290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080233
1599	NC_011982	CTC	2	6	153469	153474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080233
1600	NC_011982	CCT	2	6	153487	153492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080233
1601	NC_011982	AAC	2	6	153529	153534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080233
1602	NC_011982	CGG	2	6	153736	153741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080233
1603	NC_011982	GCC	2	6	153839	153844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080233
1604	NC_011982	GGC	2	6	153847	153852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080233
1605	NC_011982	CCT	2	6	153897	153902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080233
1606	NC_011982	TCG	2	6	153998	154003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080233
1607	NC_011982	GTC	2	6	154018	154023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080233
1608	NC_011982	CGG	2	6	154067	154072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080233
1609	NC_011982	GCA	2	6	154076	154081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080233
1610	NC_011982	TCG	2	6	154223	154228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080233
1611	NC_011982	GTC	2	6	154243	154248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080233
1612	NC_011982	TCC	2	6	154340	154345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080233
1613	NC_011982	CGT	2	6	154356	154361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080233
1614	NC_011982	TCG	2	6	154448	154453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080233
1615	NC_011982	GTC	2	6	154468	154473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080233
1616	NC_011982	CGC	2	6	154575	154580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080233
1617	NC_011982	TGG	2	6	154602	154607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080233
1618	NC_011982	GCG	2	6	154668	154673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080233
1619	NC_011982	TGT	2	6	154677	154682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080233
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1738	NC_011982	TCT	2	6	164297	164302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080243
1739	NC_011982	AAC	2	6	164421	164426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080243
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1759	NC_011982	TGC	2	6	165971	165976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080245
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1853	NC_011982	CCT	2	6	176516	176521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080254
1854	NC_011982	AGG	2	6	176527	176532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080254
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1856	NC_011982	GTC	2	6	176664	176669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080254
1857	NC_011982	CTA	2	6	176914	176919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080254
1858	NC_011982	CTC	2	6	176923	176928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080254
1859	NC_011982	CGG	2	6	177128	177133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080254
1860	NC_011982	GCC	2	6	177227	177232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080254
1861	NC_011982	CGT	2	6	177282	177287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080254
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1971	NC_011982	GCA	2	6	190550	190555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080262
1972	NC_011982	CTC	2	6	190620	190625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080262
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1974	NC_011982	CTG	2	6	190726	190731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080262
1975	NC_011982	ATG	2	6	190770	190775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080262
1976	NC_011982	TCG	2	6	191290	191295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080263
1977	NC_011982	GTG	2	6	191439	191444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080263
1978	NC_011982	CCG	2	6	191452	191457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080263
1979	NC_011982	GCC	2	6	191468	191473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080263
1980	NC_011982	GCG	2	6	191554	191559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080263
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1984	NC_011982	TCG	2	6	192156	192161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080264
1985	NC_011982	TCT	2	6	192252	192257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080264
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1998	NC_011982	ATG	2	6	193586	193591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080266
1999	NC_011982	GGT	2	6	193646	193651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080266
2000	NC_011982	TCG	2	6	193653	193658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080266

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