MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 1911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011312	GTGAG	2	10	4390	4399	20 %	20 %	60 %	0 %	209693638
2	NC_011312	TTGCC	2	10	5261	5270	0 %	40 %	20 %	40 %	209693640
3	NC_011312	ATTTG	2	10	6861	6870	20 %	60 %	20 %	0 %	209693642
4	NC_011312	TTTGT	2	10	7114	7123	0 %	80 %	20 %	0 %	209693642
5	NC_011312	GTTAC	2	10	9505	9514	20 %	40 %	20 %	20 %	209693644
6	NC_011312	GAGTT	2	10	10508	10517	20 %	40 %	40 %	0 %	209693645
7	NC_011312	GAAGT	2	10	12121	12130	40 %	20 %	40 %	0 %	209693646
8	NC_011312	CGCTG	2	10	13032	13041	0 %	20 %	40 %	40 %	209693646
9	NC_011312	CAATA	2	10	16467	16476	60 %	20 %	0 %	20 %	209693648
10	NC_011312	CGCTT	2	10	17845	17854	0 %	40 %	20 %	40 %	209693650
11	NC_011312	AAATG	2	10	22607	22616	60 %	20 %	20 %	0 %	209693654
12	NC_011312	GAAAT	2	10	27379	27388	60 %	20 %	20 %	0 %	209693658
13	NC_011312	TTTCA	2	10	33510	33519	20 %	60 %	0 %	20 %	209693664
14	NC_011312	TTCAA	2	10	33606	33615	40 %	40 %	0 %	20 %	209693664
15	NC_011312	TCATT	2	10	33657	33666	20 %	60 %	0 %	20 %	209693664
16	NC_011312	TTTTA	2	10	33783	33792	20 %	80 %	0 %	0 %	209693664
17	NC_011312	AAGAA	2	10	34574	34583	80 %	0 %	20 %	0 %	209693664
18	NC_011312	ATGAA	2	10	34775	34784	60 %	20 %	20 %	0 %	209693664
19	NC_011312	TATTG	2	10	36229	36238	20 %	60 %	20 %	0 %	209693666
20	NC_011312	GAAAA	2	10	36610	36619	80 %	0 %	20 %	0 %	209693667
21	NC_011312	GCCTA	2	10	40385	40394	20 %	20 %	20 %	40 %	209693669
22	NC_011312	AAATG	2	10	42137	42146	60 %	20 %	20 %	0 %	209693670
23	NC_011312	GAAAG	2	10	45791	45800	60 %	0 %	40 %	0 %	209693672
24	NC_011312	ACAAT	2	10	46689	46698	60 %	20 %	0 %	20 %	209693673
25	NC_011312	GCCAT	2	10	48212	48221	20 %	20 %	20 %	40 %	209693675
26	NC_011312	CTTTG	2	10	50406	50415	0 %	60 %	20 %	20 %	209693676
27	NC_011312	ACGTA	2	10	55763	55772	40 %	20 %	20 %	20 %	209693682
28	NC_011312	AGTTT	2	10	57729	57738	20 %	60 %	20 %	0 %	209693683
29	NC_011312	ATGTA	2	10	58243	58252	40 %	40 %	20 %	0 %	209693684
30	NC_011312	ATTTG	2	10	58289	58298	20 %	60 %	20 %	0 %	209693684
31	NC_011312	TTGAA	2	10	63211	63220	40 %	40 %	20 %	0 %	209693687
32	NC_011312	GCTTT	2	10	64854	64863	0 %	60 %	20 %	20 %	209693690
33	NC_011312	AATTA	2	10	65844	65853	60 %	40 %	0 %	0 %	209693691
34	NC_011312	ATAAA	2	10	69216	69225	80 %	20 %	0 %	0 %	209693692
35	NC_011312	CAATA	2	10	72888	72897	60 %	20 %	0 %	20 %	209693694
36	NC_011312	TTCGT	2	10	76043	76052	0 %	60 %	20 %	20 %	209693696
37	NC_011312	CCTGC	2	10	76248	76257	0 %	20 %	20 %	60 %	209693696
38	NC_011312	AAAAT	2	10	77607	77616	80 %	20 %	0 %	0 %	209693697
39	NC_011312	ATCAT	2	10	79057	79066	40 %	40 %	0 %	20 %	209693699
40	NC_011312	ATTTA	2	10	79501	79510	40 %	60 %	0 %	0 %	209693700
41	NC_011312	TTTAG	2	10	80265	80274	20 %	60 %	20 %	0 %	209693700
42	NC_011312	CCCTG	2	10	82147	82156	0 %	20 %	20 %	60 %	209693703
43	NC_011312	AAGAA	2	10	82437	82446	80 %	0 %	20 %	0 %	209693703
44	NC_011312	AAGCA	2	10	85017	85026	60 %	0 %	20 %	20 %	209693707
45	NC_011312	GTGAC	2	10	85507	85516	20 %	20 %	40 %	20 %	209693707
46	NC_011312	TGTCT	2	10	85897	85906	0 %	60 %	20 %	20 %	209693708
47	NC_011312	TAAAA	2	10	115112	115121	80 %	20 %	0 %	0 %	209693710
48	NC_011312	ATGAA	2	10	117044	117053	60 %	20 %	20 %	0 %	209693711
49	NC_011312	GAATT	2	10	118850	118859	40 %	40 %	20 %	0 %	209693713
50	NC_011312	GCTTG	2	10	118962	118971	0 %	40 %	40 %	20 %	209693713
51	NC_011312	AAGCA	2	10	120755	120764	60 %	0 %	20 %	20 %	209693713
52	NC_011312	TTGGT	2	10	121741	121750	0 %	60 %	40 %	0 %	209693714
53	NC_011312	CTAAG	2	10	122073	122082	40 %	20 %	20 %	20 %	209693715
54	NC_011312	ATGAA	2	10	122542	122551	60 %	20 %	20 %	0 %	209693715
55	NC_011312	CATTC	2	10	122964	122973	20 %	40 %	0 %	40 %	209693716
56	NC_011312	CGTGG	2	10	123462	123471	0 %	20 %	60 %	20 %	209693716
57	NC_011312	TTATT	2	10	123489	123498	20 %	80 %	0 %	0 %	209693716
58	NC_011312	GCATT	2	10	124910	124919	20 %	40 %	20 %	20 %	209693717
59	NC_011312	TACGT	2	10	128752	128761	20 %	40 %	20 %	20 %	209693718
60	NC_011312	GTTAC	2	10	133130	133139	20 %	40 %	20 %	20 %	209693721
61	NC_011312	CTGTG	2	10	133485	133494	0 %	40 %	40 %	20 %	209693721
62	NC_011312	TACCA	2	10	137255	137264	40 %	20 %	0 %	40 %	209693724
63	NC_011312	CAGCT	2	10	138357	138366	20 %	20 %	20 %	40 %	209693726
64	NC_011312	AAAAG	2	10	144393	144402	80 %	0 %	20 %	0 %	209693731
65	NC_011312	GCCTA	2	10	146168	146177	20 %	20 %	20 %	40 %	209693735
66	NC_011312	ATAAA	2	10	147641	147650	80 %	20 %	0 %	0 %	209693738
67	NC_011312	GACTC	2	10	147775	147784	20 %	20 %	20 %	40 %	209693738
68	NC_011312	CGTTG	2	10	150387	150396	0 %	40 %	40 %	20 %	209693739
69	NC_011312	CCTGT	2	10	150652	150661	0 %	40 %	20 %	40 %	209693739
70	NC_011312	AATCC	2	10	150895	150904	40 %	20 %	0 %	40 %	209693739
71	NC_011312	GTTGT	2	10	151669	151678	0 %	60 %	40 %	0 %	209693740
72	NC_011312	TGTTT	2	10	152012	152021	0 %	80 %	20 %	0 %	209693741
73	NC_011312	AACAG	2	10	152401	152410	60 %	0 %	20 %	20 %	209693741
74	NC_011312	AGTTA	2	10	152632	152641	40 %	40 %	20 %	0 %	209693741
75	NC_011312	AAATG	2	10	154067	154076	60 %	20 %	20 %	0 %	209693742
76	NC_011312	TTTAT	2	10	155316	155325	20 %	80 %	0 %	0 %	209693743
77	NC_011312	TTGGG	2	10	157139	157148	0 %	40 %	60 %	0 %	209693745
78	NC_011312	TCCAT	2	10	159034	159043	20 %	40 %	0 %	40 %	209693746
79	NC_011312	TGAAT	2	10	160010	160019	40 %	40 %	20 %	0 %	209693746
80	NC_011312	TTTTC	2	10	162522	162531	0 %	80 %	0 %	20 %	209693749
81	NC_011312	AAATT	2	10	163056	163065	60 %	40 %	0 %	0 %	209693749
82	NC_011312	TCGAC	2	10	164204	164213	20 %	20 %	20 %	40 %	209693751
83	NC_011312	AAATC	2	10	167998	168007	60 %	20 %	0 %	20 %	209693755
84	NC_011312	AATCT	2	10	170411	170420	40 %	40 %	0 %	20 %	209693756
85	NC_011312	TTGGC	2	10	179281	179290	0 %	40 %	40 %	20 %	209693761
86	NC_011312	ATAAA	2	10	182315	182324	80 %	20 %	0 %	0 %	209693766
87	NC_011312	GACTC	2	10	182449	182458	20 %	20 %	20 %	40 %	209693766
88	NC_011312	TAAAT	2	10	186903	186912	60 %	40 %	0 %	0 %	209693768
89	NC_011312	AAAGT	2	10	192035	192044	60 %	20 %	20 %	0 %	209693773
90	NC_011312	AAAAC	2	10	196384	196393	80 %	0 %	0 %	20 %	209693775
91	NC_011312	AGGTA	2	10	196994	197003	40 %	20 %	40 %	0 %	209693775
92	NC_011312	TTCTG	2	10	198105	198114	0 %	60 %	20 %	20 %	209693776
93	NC_011312	GGTGT	2	10	198146	198155	0 %	40 %	60 %	0 %	209693776
94	NC_011312	ACAGA	2	10	200103	200112	60 %	0 %	20 %	20 %	209693778
95	NC_011312	ATCAC	2	10	200744	200753	40 %	20 %	0 %	40 %	209693778
96	NC_011312	GCAGA	2	10	202162	202171	40 %	0 %	40 %	20 %	209693780
97	NC_011312	ATAAG	2	10	203421	203430	60 %	20 %	20 %	0 %	209693781
98	NC_011312	AATAA	2	10	205954	205963	80 %	20 %	0 %	0 %	209693783
99	NC_011312	CGACA	2	10	207539	207548	40 %	0 %	20 %	40 %	209693784
100	NC_011312	TGCAA	2	10	209552	209561	40 %	20 %	20 %	20 %	209693786
101	NC_011312	TGCCA	2	10	209706	209715	20 %	20 %	20 %	40 %	209693786
102	NC_011312	ACTCG	2	10	210806	210815	20 %	20 %	20 %	40 %	209693787
103	NC_011312	ATGCA	2	10	212195	212204	40 %	20 %	20 %	20 %	209693788
104	NC_011312	TTGAA	2	10	213871	213880	40 %	40 %	20 %	0 %	209693790
105	NC_011312	TCAAA	2	10	214323	214332	60 %	20 %	0 %	20 %	209693790
106	NC_011312	AAGTA	2	10	220849	220858	60 %	20 %	20 %	0 %	209693795
107	NC_011312	TAATT	2	10	221243	221252	40 %	60 %	0 %	0 %	209693796
108	NC_011312	TGAGC	2	10	223660	223669	20 %	20 %	40 %	20 %	209693797
109	NC_011312	CTTAT	2	10	225041	225050	20 %	60 %	0 %	20 %	209693798
110	NC_011312	ATAAA	2	10	225564	225573	80 %	20 %	0 %	0 %	209693799
111	NC_011312	TAAAG	2	10	227503	227512	60 %	20 %	20 %	0 %	209693801
112	NC_011312	AAAAC	2	10	228589	228598	80 %	0 %	0 %	20 %	209693802
113	NC_011312	AGGTA	2	10	229199	229208	40 %	20 %	40 %	0 %	209693802
114	NC_011312	TTCTG	2	10	230310	230319	0 %	60 %	20 %	20 %	209693803
115	NC_011312	GGTGT	2	10	230351	230360	0 %	40 %	60 %	0 %	209693803
116	NC_011312	CCAAG	2	10	233659	233668	40 %	0 %	20 %	40 %	209693808
117	NC_011312	TTTGG	2	10	234970	234979	0 %	60 %	40 %	0 %	209693810
118	NC_011312	CAATA	2	10	236027	236036	60 %	20 %	0 %	20 %	209693811
119	NC_011312	TGGTT	2	10	238556	238565	0 %	60 %	40 %	0 %	209693812
120	NC_011312	AATCA	2	10	238732	238741	60 %	20 %	0 %	20 %	209693812
121	NC_011312	CATCA	2	10	239451	239460	40 %	20 %	0 %	40 %	209693813
122	NC_011312	TTAAA	2	10	239701	239710	60 %	40 %	0 %	0 %	209693814
123	NC_011312	GCCTA	2	10	241162	241171	20 %	20 %	20 %	40 %	209693815
124	NC_011312	CAATC	2	10	244589	244598	40 %	20 %	0 %	40 %	209693816
125	NC_011312	ATCAC	2	10	248886	248895	40 %	20 %	0 %	40 %	209693820
126	NC_011312	TAAAA	2	10	250443	250452	80 %	20 %	0 %	0 %	209693822
127	NC_011312	ATCAT	2	10	253777	253786	40 %	40 %	0 %	20 %	209693825
128	NC_011312	GAGTC	2	10	256329	256338	20 %	20 %	40 %	20 %	209693826
129	NC_011312	TTTTA	2	10	256462	256471	20 %	80 %	0 %	0 %	209693826
130	NC_011312	CAATA	2	10	256723	256732	60 %	20 %	0 %	20 %	209693827
131	NC_011312	TGAAA	2	10	258556	258565	60 %	20 %	20 %	0 %	209693830
132	NC_011312	AGAAA	2	10	262005	262014	80 %	0 %	20 %	0 %	209693833
133	NC_011312	TATGG	2	10	262513	262522	20 %	40 %	40 %	0 %	209693833
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