MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 1911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011312	AACGT	2	10	2627921	2627930	40 %	20 %	20 %	20 %	209695878
1502	NC_011312	AATAA	2	10	2629573	2629582	80 %	20 %	0 %	0 %	209695879
1503	NC_011312	ATTAA	2	10	2630230	2630239	60 %	40 %	0 %	0 %	209695880
1504	NC_011312	ATCCA	2	10	2630260	2630269	40 %	20 %	0 %	40 %	209695880
1505	NC_011312	GTAAA	2	10	2636714	2636723	60 %	20 %	20 %	0 %	209695884
1506	NC_011312	GCCTA	2	10	2642389	2642398	20 %	20 %	20 %	40 %	209695889
1507	NC_011312	TTAAC	2	10	2643704	2643713	40 %	40 %	0 %	20 %	209695890
1508	NC_011312	TTAGT	2	10	2645681	2645690	20 %	60 %	20 %	0 %	209695891
1509	NC_011312	ATTTT	2	10	2647155	2647164	20 %	80 %	0 %	0 %	209695892
1510	NC_011312	TGTAA	2	10	2648532	2648541	40 %	40 %	20 %	0 %	209695893
1511	NC_011312	GCTTG	2	10	2648757	2648766	0 %	40 %	40 %	20 %	209695893
1512	NC_011312	ATCGA	2	10	2652101	2652110	40 %	20 %	20 %	20 %	209695896
1513	NC_011312	TTACG	2	10	2652585	2652594	20 %	40 %	20 %	20 %	209695897
1514	NC_011312	GTAAA	2	10	2653442	2653451	60 %	20 %	20 %	0 %	209695899
1515	NC_011312	TAATC	2	10	2653596	2653605	40 %	40 %	0 %	20 %	209695899
1516	NC_011312	ATAAA	2	10	2661551	2661560	80 %	20 %	0 %	0 %	209695905
1517	NC_011312	GACTC	2	10	2661685	2661694	20 %	20 %	20 %	40 %	209695905
1518	NC_011312	CAATA	2	10	2665882	2665891	60 %	20 %	0 %	20 %	209695906
1519	NC_011312	ATTGC	2	10	2667999	2668008	20 %	40 %	20 %	20 %	209695909
1520	NC_011312	CCATG	2	10	2668220	2668229	20 %	20 %	20 %	40 %	209695909
1521	NC_011312	ATTCA	2	10	2671926	2671935	40 %	40 %	0 %	20 %	209695911
1522	NC_011312	TGGTG	2	10	2680286	2680295	0 %	40 %	60 %	0 %	209695918
1523	NC_011312	AAAGT	2	10	2681891	2681900	60 %	20 %	20 %	0 %	209695919
1524	NC_011312	CCATT	2	10	2682857	2682866	20 %	40 %	0 %	40 %	209695920
1525	NC_011312	GAGTG	2	10	2683305	2683314	20 %	20 %	60 %	0 %	209695921
1526	NC_011312	CATTG	2	10	2684509	2684518	20 %	40 %	20 %	20 %	209695921
1527	NC_011312	CTTTG	2	10	2685114	2685123	0 %	60 %	20 %	20 %	209695922
1528	NC_011312	TTAGT	2	10	2685245	2685254	20 %	60 %	20 %	0 %	209695922
1529	NC_011312	TGTTT	2	10	2685941	2685950	0 %	80 %	20 %	0 %	209695923
1530	NC_011312	ATTTT	2	10	2687892	2687901	20 %	80 %	0 %	0 %	209695925
1531	NC_011312	AAATA	2	10	2687982	2687991	80 %	20 %	0 %	0 %	209695925
1532	NC_011312	TTTTA	2	10	2688175	2688184	20 %	80 %	0 %	0 %	209695925
1533	NC_011312	CCAGC	2	10	2690431	2690440	20 %	0 %	20 %	60 %	209695928
1534	NC_011312	AAGCA	2	10	2691011	2691020	60 %	0 %	20 %	20 %	209695929
1535	NC_011312	TTTGA	2	10	2692460	2692469	20 %	60 %	20 %	0 %	209695932
1536	NC_011312	GCTGT	2	10	2693028	2693037	0 %	40 %	40 %	20 %	209695932
1537	NC_011312	TTTGC	2	10	2695619	2695628	0 %	60 %	20 %	20 %	209695934
1538	NC_011312	GGTTC	2	10	2698592	2698601	0 %	40 %	40 %	20 %	209695936
1539	NC_011312	TTCAC	2	10	2699509	2699518	20 %	40 %	0 %	40 %	209695936
1540	NC_011312	CCTAG	2	10	2700131	2700140	20 %	20 %	20 %	40 %	209695937
1541	NC_011312	TGAAT	2	10	2701221	2701230	40 %	40 %	20 %	0 %	209695937
1542	NC_011312	ACTGA	2	10	2703383	2703392	40 %	20 %	20 %	20 %	209695938
1543	NC_011312	GGTGA	2	10	2704442	2704451	20 %	20 %	60 %	0 %	209695939
1544	NC_011312	CAATT	2	10	2704987	2704996	40 %	40 %	0 %	20 %	209695940
1545	NC_011312	ATTGA	2	10	2712054	2712063	40 %	40 %	20 %	0 %	209695947
1546	NC_011312	GGTAT	2	10	2712563	2712572	20 %	40 %	40 %	0 %	209695948
1547	NC_011312	TGAAA	2	10	2714813	2714822	60 %	20 %	20 %	0 %	209695950
1548	NC_011312	TTACA	2	10	2715453	2715462	40 %	40 %	0 %	20 %	209695950
1549	NC_011312	AAGGT	2	10	2715979	2715988	40 %	20 %	40 %	0 %	209695951
1550	NC_011312	GAAAC	2	10	2716118	2716127	60 %	0 %	20 %	20 %	209695952
1551	NC_011312	TATCG	2	10	2717245	2717254	20 %	40 %	20 %	20 %	209695953
1552	NC_011312	TAAAT	2	10	2717387	2717396	60 %	40 %	0 %	0 %	209695953
1553	NC_011312	ACGTT	2	10	2718962	2718971	20 %	40 %	20 %	20 %	209695955
1554	NC_011312	CAAGC	2	10	2721374	2721383	40 %	0 %	20 %	40 %	209695958
1555	NC_011312	ATCTT	2	10	2722269	2722278	20 %	60 %	0 %	20 %	209695959
1556	NC_011312	GCCTA	2	10	2723747	2723756	20 %	20 %	20 %	40 %	209695961
1557	NC_011312	CTCAA	2	10	2725387	2725396	40 %	20 %	0 %	40 %	209695962
1558	NC_011312	ATTTG	2	10	2727554	2727563	20 %	60 %	20 %	0 %	209695964
1559	NC_011312	TTATT	2	10	2728138	2728147	20 %	80 %	0 %	0 %	209695965
1560	NC_011312	ACCAA	2	10	2729669	2729678	60 %	0 %	0 %	40 %	209695966
1561	NC_011312	GTTGT	2	10	2733689	2733698	0 %	60 %	40 %	0 %	209695971
1562	NC_011312	CTTTT	2	10	2734710	2734719	0 %	80 %	0 %	20 %	209695972
1563	NC_011312	CCATA	2	10	2734976	2734985	40 %	20 %	0 %	40 %	209695972
1564	NC_011312	ACGTT	2	10	2736118	2736127	20 %	40 %	20 %	20 %	209695973
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1566	NC_011312	AATTA	2	10	2739224	2739233	60 %	40 %	0 %	0 %	209695975
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1572	NC_011312	TGCAG	2	10	2760279	2760288	20 %	20 %	40 %	20 %	209695985
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1575	NC_011312	ATCTT	2	10	2762921	2762930	20 %	60 %	0 %	20 %	209695986
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1589	NC_011312	ACCAG	2	10	2793814	2793823	40 %	0 %	20 %	40 %	209696005
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1593	NC_011312	TGATT	2	10	2802329	2802338	20 %	60 %	20 %	0 %	209696012
1594	NC_011312	GAGTC	2	10	2806253	2806262	20 %	20 %	40 %	20 %	209696013
1595	NC_011312	TTTTA	2	10	2806386	2806395	20 %	80 %	0 %	0 %	209696013
1596	NC_011312	CAATA	2	10	2806647	2806656	60 %	20 %	0 %	20 %	209696014
1597	NC_011312	TCAAT	2	10	2817745	2817754	40 %	40 %	0 %	20 %	209696016
1598	NC_011312	GTTTT	2	10	2818189	2818198	0 %	80 %	20 %	0 %	209696017
1599	NC_011312	TTCCT	2	10	2819471	2819480	0 %	60 %	0 %	40 %	209696017
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1601	NC_011312	TTTAG	2	10	2821810	2821819	20 %	60 %	20 %	0 %	209696019
1602	NC_011312	GGTAT	2	10	2825076	2825085	20 %	40 %	40 %	0 %	209696022
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1604	NC_011312	GAGTC	2	10	2828075	2828084	20 %	20 %	40 %	20 %	209696024
1605	NC_011312	TTTTA	2	10	2828208	2828217	20 %	80 %	0 %	0 %	209696024
1606	NC_011312	TATGG	2	10	2831360	2831369	20 %	40 %	40 %	0 %	209696028
1607	NC_011312	TCAAT	2	10	2833402	2833411	40 %	40 %	0 %	20 %	209696031
1608	NC_011312	GCTTC	2	10	2842779	2842788	0 %	40 %	20 %	40 %	209696035
1609	NC_011312	ACCAA	2	10	2844204	2844213	60 %	0 %	0 %	40 %	209696037
1610	NC_011312	TAAAC	2	10	2844648	2844657	60 %	20 %	0 %	20 %	209696037
1611	NC_011312	TTTGG	2	10	2845737	2845746	0 %	60 %	40 %	0 %	209696039
1612	NC_011312	GCTTG	2	10	2849306	2849315	0 %	40 %	40 %	20 %	209696040
1613	NC_011312	CCATT	2	10	2849415	2849424	20 %	40 %	0 %	40 %	209696040
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1615	NC_011312	GCATA	2	10	2855978	2855987	40 %	20 %	20 %	20 %	209696047
1616	NC_011312	AACCA	2	10	2857768	2857777	60 %	0 %	0 %	40 %	209696049
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1620	NC_011312	TCTGT	2	10	2861229	2861238	0 %	60 %	20 %	20 %	209696051
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1622	NC_011312	CGCAG	2	10	2865194	2865203	20 %	0 %	40 %	40 %	209696055
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.