MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 1911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011312	TTTTG	2	10	1793054	1793063	0 %	80 %	20 %	0 %	209695190
1002	NC_011312	ATCGT	2	10	1798750	1798759	20 %	40 %	20 %	20 %	209695193
1003	NC_011312	TGATT	2	10	1799314	1799323	20 %	60 %	20 %	0 %	209695193
1004	NC_011312	ATCAA	2	10	1799821	1799830	60 %	20 %	0 %	20 %	209695194
1005	NC_011312	TAGGC	2	10	1802859	1802868	20 %	20 %	40 %	20 %	209695195
1006	NC_011312	TGATT	2	10	1802965	1802974	20 %	60 %	20 %	0 %	209695195
1007	NC_011312	TCAAT	2	10	1822595	1822604	40 %	40 %	0 %	20 %	209695201
1008	NC_011312	CAAAC	2	10	1839101	1839110	60 %	0 %	0 %	40 %	209695212
1009	NC_011312	TTGAA	2	10	1839571	1839580	40 %	40 %	20 %	0 %	209695213
1010	NC_011312	AATTG	2	10	1841158	1841167	40 %	40 %	20 %	0 %	209695214
1011	NC_011312	ATTCA	2	10	1842157	1842166	40 %	40 %	0 %	20 %	209695215
1012	NC_011312	AGAAA	2	10	1842371	1842380	80 %	0 %	20 %	0 %	209695215
1013	NC_011312	CGTTC	2	10	1842829	1842838	0 %	40 %	20 %	40 %	209695215
1014	NC_011312	AATCT	2	10	1850982	1850991	40 %	40 %	0 %	20 %	209695220
1015	NC_011312	AATAA	2	10	1853700	1853709	80 %	20 %	0 %	0 %	209695223
1016	NC_011312	ACCAA	2	10	1853929	1853938	60 %	0 %	0 %	40 %	209695223
1017	NC_011312	ATAAA	2	10	1860788	1860797	80 %	20 %	0 %	0 %	209695227
1018	NC_011312	GACTC	2	10	1860922	1860931	20 %	20 %	20 %	40 %	209695227
1019	NC_011312	GTAAA	2	10	1865477	1865486	60 %	20 %	20 %	0 %	209695230
1020	NC_011312	AATTA	2	10	1868419	1868428	60 %	40 %	0 %	0 %	209695233
1021	NC_011312	ATTTT	2	10	1868479	1868488	20 %	80 %	0 %	0 %	209695234
1022	NC_011312	ATCTC	2	10	1869466	1869475	20 %	40 %	0 %	40 %	209695235
1023	NC_011312	ACCCT	2	10	1870207	1870216	20 %	20 %	0 %	60 %	209695235
1024	NC_011312	AATTT	2	10	1871279	1871288	40 %	60 %	0 %	0 %	209695238
1025	NC_011312	TTTTG	2	10	1871543	1871552	0 %	80 %	20 %	0 %	209695238
1026	NC_011312	ATTTC	2	10	1874214	1874223	20 %	60 %	0 %	20 %	209695240
1027	NC_011312	TGGCT	2	10	1876908	1876917	0 %	40 %	40 %	20 %	209695243
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1029	NC_011312	TGGTA	2	10	1878471	1878480	20 %	40 %	40 %	0 %	209695245
1030	NC_011312	TTGCT	2	10	1880875	1880884	0 %	60 %	20 %	20 %	209695246
1031	NC_011312	AGTTA	2	10	1881532	1881541	40 %	40 %	20 %	0 %	209695246
1032	NC_011312	TCTGT	2	10	1881633	1881642	0 %	60 %	20 %	20 %	209695246
1033	NC_011312	ATCAA	2	10	1882519	1882528	60 %	20 %	0 %	20 %	209695247
1034	NC_011312	TGAAA	2	10	1883732	1883741	60 %	20 %	20 %	0 %	209695248
1035	NC_011312	TACGT	2	10	1884343	1884352	20 %	40 %	20 %	20 %	209695248
1036	NC_011312	CAATT	2	10	1885246	1885255	40 %	40 %	0 %	20 %	209695248
1037	NC_011312	ATTCA	2	10	1886308	1886317	40 %	40 %	0 %	20 %	209695249
1038	NC_011312	TTTCT	2	10	1889913	1889922	0 %	80 %	0 %	20 %	209695251
1039	NC_011312	TAGCT	2	10	1891506	1891515	20 %	40 %	20 %	20 %	209695252
1040	NC_011312	TTAAA	2	10	1893535	1893544	60 %	40 %	0 %	0 %	209695253
1041	NC_011312	AAAGC	2	10	1893840	1893849	60 %	0 %	20 %	20 %	209695254
1042	NC_011312	AATTA	2	10	1893867	1893876	60 %	40 %	0 %	0 %	209695254
1043	NC_011312	ACGAG	2	10	1894096	1894105	40 %	0 %	40 %	20 %	209695254
1044	NC_011312	TCATT	2	10	1894355	1894364	20 %	60 %	0 %	20 %	209695254
1045	NC_011312	TCCAT	2	10	1894536	1894545	20 %	40 %	0 %	40 %	209695254
1046	NC_011312	ACCAT	2	10	1894745	1894754	40 %	20 %	0 %	40 %	209695254
1047	NC_011312	TAGGC	2	10	1895917	1895926	20 %	20 %	40 %	20 %	209695255
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1049	NC_011312	ATAAA	2	10	1897028	1897037	80 %	20 %	0 %	0 %	209695257
1050	NC_011312	GACTC	2	10	1897162	1897171	20 %	20 %	20 %	40 %	209695257
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1054	NC_011312	ATGCC	2	10	1906313	1906322	20 %	20 %	20 %	40 %	209695265
1055	NC_011312	TTTTC	2	10	1907566	1907575	0 %	80 %	0 %	20 %	209695266
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1058	NC_011312	CACTT	2	10	1913804	1913813	20 %	40 %	0 %	40 %	209695268
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1060	NC_011312	GTCTT	2	10	1918408	1918417	0 %	60 %	20 %	20 %	209695271
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1064	NC_011312	TGCTT	2	10	1921374	1921383	0 %	60 %	20 %	20 %	209695273
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1096	NC_011312	GTTTT	2	10	2003927	2003936	0 %	80 %	20 %	0 %	209695337
1097	NC_011312	ATAAG	2	10	2006805	2006814	60 %	20 %	20 %	0 %	209695339
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1104	NC_011312	CTTTC	2	10	2021736	2021745	0 %	60 %	0 %	40 %	209695353
1105	NC_011312	TGATT	2	10	2023977	2023986	20 %	60 %	20 %	0 %	209695355
1106	NC_011312	AATTT	2	10	2026047	2026056	40 %	60 %	0 %	0 %	209695357
1107	NC_011312	GGCAT	2	10	2026253	2026262	20 %	20 %	40 %	20 %	209695357
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1112	NC_011312	TATTT	2	10	2028718	2028727	20 %	80 %	0 %	0 %	209695360
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1118	NC_011312	AAATA	2	10	2036611	2036620	80 %	20 %	0 %	0 %	209695370
1119	NC_011312	ATGCG	2	10	2036800	2036809	20 %	20 %	40 %	20 %	209695370
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1121	NC_011312	ATTAA	2	10	2039093	2039102	60 %	40 %	0 %	0 %	209695372
1122	NC_011312	GTACT	2	10	2039283	2039292	20 %	40 %	20 %	20 %	209695372
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1494	NC_011312	TAAGA	2	10	2614119	2614128	60 %	20 %	20 %	0 %	209695864
1495	NC_011312	TTGCA	2	10	2614287	2614296	20 %	40 %	20 %	20 %	209695864
1496	NC_011312	AATCT	2	10	2620703	2620712	40 %	40 %	0 %	20 %	209695872
1497	NC_011312	TGTAA	2	10	2622756	2622765	40 %	40 %	20 %	0 %	209695875
1498	NC_011312	CCCAA	2	10	2624135	2624144	40 %	0 %	0 %	60 %	209695876
1499	NC_011312	TAACC	2	10	2625570	2625579	40 %	20 %	0 %	40 %	209695877
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