MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 45956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011312	TGG	2	6	227256	227261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693801
3002	NC_011312	GCT	2	6	227705	227710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693802
3003	NC_011312	TGT	2	6	227775	227780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693802
3004	NC_011312	TGA	2	6	227948	227953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693802
3005	NC_011312	ATC	2	6	227961	227966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693802
3006	NC_011312	GTG	2	6	228035	228040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693802
3007	NC_011312	ATA	2	6	228055	228060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693802
3008	NC_011312	CTT	3	9	228113	228121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693802
3009	NC_011312	CAT	2	6	228173	228178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693802
3010	NC_011312	CTT	2	6	228248	228253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693802
3011	NC_011312	CAC	2	6	228305	228310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209693802
3012	NC_011312	AAT	2	6	228386	228391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693802
3013	NC_011312	TAA	2	6	228425	228430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693802
3014	NC_011312	TGC	2	6	228465	228470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693802
3015	NC_011312	GCT	2	6	228472	228477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693802
3016	NC_011312	GAA	2	6	228499	228504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693802
3017	NC_011312	TCG	2	6	228512	228517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693802
3018	NC_011312	TAA	2	6	228627	228632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693802
3019	NC_011312	CAA	2	6	228656	228661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693802
3020	NC_011312	CGT	2	6	228738	228743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693802
3021	NC_011312	CAA	2	6	228764	228769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693802
3022	NC_011312	AGA	2	6	228956	228961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693802
3023	NC_011312	ATC	2	6	228973	228978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693802
3024	NC_011312	AAT	2	6	228996	229001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693802
3025	NC_011312	TGT	2	6	229009	229014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693802
3026	NC_011312	TGC	2	6	229030	229035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693802
3027	NC_011312	AGA	2	6	229070	229075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693802
3028	NC_011312	TAA	2	6	229094	229099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693802
3029	NC_011312	ATC	2	6	229152	229157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693802
3030	NC_011312	ATT	2	6	229273	229278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693802
3031	NC_011312	CGC	2	6	229409	229414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209693802
3032	NC_011312	ATG	2	6	229474	229479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693802
3033	NC_011312	GTT	2	6	229520	229525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693802
3034	NC_011312	TTG	2	6	229533	229538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693802
3035	NC_011312	GGT	2	6	229755	229760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693803
3036	NC_011312	GTT	2	6	229920	229925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693803
3037	NC_011312	ATA	2	6	229927	229932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693803
3038	NC_011312	ACG	2	6	229942	229947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693803
3039	NC_011312	CGG	2	6	230242	230247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209693803
3040	NC_011312	GAT	2	6	230440	230445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_011312	CTT	2	6	230610	230615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693804
3042	NC_011312	CAT	2	6	230653	230658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693804
3043	NC_011312	CTT	2	6	230700	230705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693804
3044	NC_011312	TAC	2	6	230886	230891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693804
3045	NC_011312	TTG	2	6	230929	230934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693804
3046	NC_011312	TAT	2	6	231015	231020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693804
3047	NC_011312	CAA	2	6	231265	231270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_011312	CTT	2	6	231327	231332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693805
3049	NC_011312	ACA	2	6	231353	231358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693805
3050	NC_011312	ACG	2	6	231647	231652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693806
3051	NC_011312	TGG	2	6	231655	231660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693806
3052	NC_011312	GTT	2	6	231680	231685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693806
3053	NC_011312	TCT	2	6	231736	231741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_011312	TGG	2	6	231769	231774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_011312	TAA	2	6	231805	231810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_011312	CCA	2	6	232000	232005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209693807
3057	NC_011312	ATG	2	6	232092	232097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693807
3058	NC_011312	CAA	2	6	232342	232347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693807
3059	NC_011312	AAT	2	6	232419	232424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693807
3060	NC_011312	TAG	2	6	232448	232453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693807
3061	NC_011312	TTC	2	6	232841	232846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693808
3062	NC_011312	GGC	2	6	232858	232863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209693808
3063	NC_011312	TGC	2	6	232866	232871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693808
3064	NC_011312	TCG	2	6	232893	232898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693808
3065	NC_011312	GCG	2	6	232910	232915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209693808
3066	NC_011312	TGA	2	6	232931	232936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693808
3067	NC_011312	TTA	2	6	233008	233013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693808
3068	NC_011312	CCG	2	6	233090	233095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209693808
3069	NC_011312	GCT	2	6	233113	233118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693808
3070	NC_011312	TTA	2	6	233134	233139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693808
3071	NC_011312	CAA	2	6	233194	233199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693808
3072	NC_011312	TCG	2	6	233244	233249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693808
3073	NC_011312	CAA	2	6	233281	233286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693808
3074	NC_011312	TTA	2	6	233386	233391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693808
3075	NC_011312	GCC	2	6	233482	233487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209693808
3076	NC_011312	TGA	2	6	233597	233602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693808
3077	NC_011312	TGC	2	6	233637	233642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693808
3078	NC_011312	GAA	2	6	233685	233690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693808
3079	NC_011312	CCG	2	6	233693	233698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209693808
3080	NC_011312	GAA	2	6	233727	233732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693808
3081	NC_011312	TTG	2	6	233741	233746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693808
3082	NC_011312	TGC	2	6	233754	233759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693808
3083	NC_011312	AAC	2	6	233768	233773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693808
3084	NC_011312	TGC	2	6	233793	233798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693808
3085	NC_011312	ATG	2	6	233870	233875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693808
3086	NC_011312	ACA	2	6	233906	233911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693808
3087	NC_011312	GGC	2	6	233935	233940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209693808
3088	NC_011312	AAC	2	6	234253	234258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_011312	GAC	2	6	234262	234267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693809
3090	NC_011312	TCG	2	6	234283	234288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693809
3091	NC_011312	TGA	2	6	234289	234294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693809
3092	NC_011312	TAC	2	6	234349	234354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693809
3093	NC_011312	AGC	2	6	234388	234393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693809
3094	NC_011312	GAA	2	6	234452	234457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693809
3095	NC_011312	AGA	2	6	234487	234492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693809
3096	NC_011312	TTA	3	9	234521	234529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693809
3097	NC_011312	TGA	2	6	234712	234717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693809
3098	NC_011312	TGC	2	6	234727	234732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693809
3099	NC_011312	TTG	2	6	234738	234743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693809
3100	NC_011312	ATG	2	6	234906	234911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693810
3101	NC_011312	TCG	2	6	235094	235099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693810
3102	NC_011312	CAA	2	6	235385	235390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693810
3103	NC_011312	CAC	2	6	235577	235582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209693810
3104	NC_011312	TCA	2	6	235624	235629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693810
3105	NC_011312	AAT	2	6	235653	235658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693810
3106	NC_011312	ATC	2	6	235660	235665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693810
3107	NC_011312	GAA	2	6	235700	235705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693810
3108	NC_011312	TTC	2	6	235756	235761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693810
3109	NC_011312	ATT	2	6	235856	235861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_011312	GCG	2	6	235988	235993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209693811
3111	NC_011312	TGA	2	6	236206	236211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693811
3112	NC_011312	GCC	2	6	236220	236225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209693811
3113	NC_011312	AAG	2	6	236270	236275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693811
3114	NC_011312	GAA	2	6	236285	236290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693811
3115	NC_011312	TCA	2	6	236504	236509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_011312	ATA	2	6	236544	236549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693812
3117	NC_011312	CAA	2	6	236583	236588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693812
3118	NC_011312	GCT	2	6	236595	236600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693812
3119	NC_011312	GCA	2	6	236620	236625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693812
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3121	NC_011312	GAT	2	6	236727	236732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693812
3122	NC_011312	CGT	2	6	236733	236738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693812
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3148	NC_011312	TTA	2	6	239049	239054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3149	NC_011312	TGC	2	6	239110	239115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3233	NC_011312	GAC	3	9	246462	246470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693817
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3236	NC_011312	CAA	2	6	246639	246644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693817
3237	NC_011312	TAC	2	6	246805	246810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3238	NC_011312	AAG	2	6	246909	246914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693818
3239	NC_011312	TCA	2	6	246922	246927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693818
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3241	NC_011312	TCA	2	6	246986	246991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693818
3242	NC_011312	ATC	2	6	247008	247013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693818
3243	NC_011312	TGG	2	6	247201	247206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693818
3244	NC_011312	TTA	2	6	247264	247269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693818
3245	NC_011312	TTA	2	6	247324	247329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693818
3246	NC_011312	TGC	2	6	247375	247380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693818
3247	NC_011312	GTA	2	6	247405	247410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693818
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3251	NC_011312	TCT	2	6	247714	247719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3252	NC_011312	CTT	2	6	247784	247789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693819
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3272	NC_011312	TAA	2	6	249292	249297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3273	NC_011312	GCG	2	6	249304	249309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3347	NC_011312	CAT	2	6	255243	255248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693826
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3482	NC_011312	GAA	2	6	264474	264479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693834
3483	NC_011312	TTC	2	6	264541	264546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693834
3484	NC_011312	ATC	2	6	264588	264593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693834
3485	NC_011312	TGA	2	6	264599	264604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693834
3486	NC_011312	CAA	2	6	264606	264611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693834
3487	NC_011312	TTA	2	6	264615	264620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693834
3488	NC_011312	GAT	2	6	264648	264653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693834
3489	NC_011312	TCA	2	6	264685	264690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693834
3490	NC_011312	AAG	2	6	264784	264789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693834
3491	NC_011312	TTC	3	9	264826	264834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693834
3492	NC_011312	ATC	2	6	264856	264861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693834
3493	NC_011312	CGA	2	6	264908	264913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693834
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3495	NC_011312	ATG	2	6	264954	264959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693834
3496	NC_011312	GAT	3	9	264993	265001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693834
3497	NC_011312	GTG	2	6	265021	265026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693834
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3499	NC_011312	TGC	2	6	265124	265129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693834
3500	NC_011312	AGA	2	6	265292	265297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693834

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