MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 45956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011312	GAA	2	6	34317	34322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693664
502	NC_011312	CGT	2	6	34347	34352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693664
503	NC_011312	TTA	2	6	34502	34507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693664
504	NC_011312	TAA	2	6	35085	35090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693664
505	NC_011312	TGT	2	6	35133	35138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693664
506	NC_011312	ATT	2	6	35181	35186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693664
507	NC_011312	TCA	2	6	35191	35196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693664
508	NC_011312	TGA	2	6	35355	35360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693664
509	NC_011312	GAC	2	6	35372	35377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693664
510	NC_011312	AAG	2	6	35381	35386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693664
511	NC_011312	TTA	2	6	35421	35426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693665
512	NC_011312	GTT	2	6	35446	35451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693665
513	NC_011312	TAA	2	6	35483	35488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693665
514	NC_011312	GAG	2	6	35538	35543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209693665
515	NC_011312	TAA	2	6	35561	35566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693665
516	NC_011312	GAT	3	9	35610	35618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693665
517	NC_011312	ATT	2	6	35665	35670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693665
518	NC_011312	GAT	2	6	35723	35728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693665
519	NC_011312	TAT	2	6	35748	35753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693665
520	NC_011312	GAT	2	6	35784	35789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693665
521	NC_011312	GGC	2	6	35829	35834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_011312	GAA	2	6	35909	35914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_011312	TAT	2	6	35929	35934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_011312	ATT	2	6	36092	36097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693666
525	NC_011312	CAT	2	6	36172	36177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693666
526	NC_011312	TAC	2	6	36280	36285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693666
527	NC_011312	GTT	2	6	36323	36328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_011312	AAT	2	6	36331	36336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_011312	CTT	2	6	36401	36406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693667
530	NC_011312	TAA	2	6	36444	36449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693667
531	NC_011312	CTA	2	6	36564	36569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693667
532	NC_011312	TAA	2	6	36592	36597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693667
533	NC_011312	TTC	2	6	36601	36606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693667
534	NC_011312	TAA	2	6	36814	36819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693667
535	NC_011312	TAC	2	6	36832	36837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693667
536	NC_011312	ACT	2	6	36877	36882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693667
537	NC_011312	CTT	2	6	36981	36986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693667
538	NC_011312	AAT	2	6	37020	37025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693667
539	NC_011312	ACA	2	6	37059	37064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_011312	TGT	2	6	37094	37099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011312	TTA	2	6	37273	37278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693668
542	NC_011312	TGC	2	6	37279	37284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693668
543	NC_011312	GAC	2	6	37362	37367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693668
544	NC_011312	ACG	3	9	37498	37506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693668
545	NC_011312	GTA	2	6	37522	37527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693668
546	NC_011312	ATC	2	6	37532	37537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693668
547	NC_011312	CTA	2	6	37563	37568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693668
548	NC_011312	ATC	2	6	37577	37582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693668
549	NC_011312	TCT	2	6	37583	37588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693668
550	NC_011312	AAT	2	6	37632	37637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693668
551	NC_011312	TCG	2	6	37725	37730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693668
552	NC_011312	ATT	2	6	37738	37743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693668
553	NC_011312	ACG	2	6	37771	37776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693668
554	NC_011312	TTA	2	6	37814	37819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693668
555	NC_011312	TTC	2	6	37834	37839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693668
556	NC_011312	TCA	2	6	37856	37861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693668
557	NC_011312	CAA	2	6	37898	37903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693668
558	NC_011312	CAG	2	6	38074	38079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693668
559	NC_011312	GCA	2	6	38087	38092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693668
560	NC_011312	AAT	2	6	38099	38104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693668
561	NC_011312	TGT	2	6	38195	38200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693668
562	NC_011312	CAA	2	6	38303	38308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693668
563	NC_011312	TTA	2	6	38396	38401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693668
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565	NC_011312	AAT	2	6	38435	38440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693668
566	NC_011312	CAA	2	6	38492	38497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_011312	AAG	2	6	38551	38556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_011312	GAA	2	6	38697	38702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_011312	TCT	2	6	38771	38776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_011312	GCA	2	6	38787	38792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_011312	GCA	2	6	38799	38804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_011312	TGA	2	6	38843	38848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_011312	AGC	2	6	38861	38866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_011312	CAA	2	6	38881	38886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_011312	AGA	2	6	38927	38932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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577	NC_011312	TGA	2	6	39011	39016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_011312	AGC	2	6	39173	39178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_011312	TAT	2	6	39452	39457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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582	NC_011312	TAA	2	6	39813	39818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_011312	ATT	2	6	40087	40092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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588	NC_011312	TCA	2	6	40322	40327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693669
589	NC_011312	TTG	2	6	40453	40458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693669
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591	NC_011312	GAA	2	6	40850	40855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693669
592	NC_011312	ATT	2	6	41228	41233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_011312	CTT	2	6	41282	41287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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600	NC_011312	TTA	2	6	41811	41816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693670
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607	NC_011312	TTA	2	6	42640	42645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_011312	TTG	2	6	42709	42714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_011312	ATT	2	6	42766	42771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693671
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611	NC_011312	TTG	2	6	42898	42903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693671
612	NC_011312	CAA	2	6	43004	43009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693671
613	NC_011312	TGC	2	6	43117	43122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693671
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615	NC_011312	TTG	2	6	43306	43311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693671
616	NC_011312	TTA	2	6	43345	43350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693671
617	NC_011312	GAA	2	6	43370	43375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693671
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621	NC_011312	CGA	2	6	43479	43484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693671
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625	NC_011312	GAT	2	6	43627	43632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693671
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