MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 45956

< Previous12...678910111213141516...9192Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011312	AGA	2	6	377779	377784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693950
5002	NC_011312	CAG	2	6	377802	377807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693950
5003	NC_011312	TCT	2	6	377837	377842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693950
5004	NC_011312	ACG	2	6	377872	377877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693950
5005	NC_011312	GAA	2	6	377924	377929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693950
5006	NC_011312	TTA	2	6	377981	377986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693950
5007	NC_011312	TGT	3	9	378089	378097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693950
5008	NC_011312	TCA	2	6	378113	378118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693950
5009	NC_011312	ATG	2	6	378204	378209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693950
5010	NC_011312	CGA	2	6	378249	378254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693950
5011	NC_011312	TTA	2	6	378309	378314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_011312	TAT	2	6	378495	378500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693951
5013	NC_011312	GAG	2	6	378539	378544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209693951
5014	NC_011312	TTA	2	6	378619	378624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693951
5015	NC_011312	TTG	2	6	378689	378694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693951
5016	NC_011312	GAC	3	9	378840	378848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693951
5017	NC_011312	AGA	2	6	378873	378878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693951
5018	NC_011312	TCG	2	6	378902	378907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693951
5019	NC_011312	GTG	2	6	378908	378913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693951
5020	NC_011312	AAT	2	6	379048	379053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693951
5021	NC_011312	TGA	2	6	379080	379085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693951
5022	NC_011312	TGC	2	6	379089	379094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693951
5023	NC_011312	CAT	2	6	379111	379116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693951
5024	NC_011312	TAG	2	6	379134	379139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693951
5025	NC_011312	GAA	2	6	379225	379230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693951
5026	NC_011312	ATG	2	6	379289	379294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693951
5027	NC_011312	TCA	2	6	379491	379496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693951
5028	NC_011312	TAA	2	6	379533	379538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693951
5029	NC_011312	ATA	2	6	379547	379552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693951
5030	NC_011312	ATA	2	6	379664	379669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693951
5031	NC_011312	TGA	2	6	379683	379688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693951
5032	NC_011312	TCA	2	6	379722	379727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693951
5033	NC_011312	TTG	2	6	379742	379747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693951
5034	NC_011312	AAG	2	6	379769	379774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693951
5035	NC_011312	TGG	2	6	379800	379805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693951
5036	NC_011312	GCT	2	6	379949	379954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693952
5037	NC_011312	GCA	2	6	379985	379990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693952
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5039	NC_011312	CGG	2	6	380139	380144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209693952
5040	NC_011312	TGG	2	6	380157	380162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693952
5041	NC_011312	GCT	2	6	380231	380236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693952
5042	NC_011312	TGG	2	6	380271	380276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693952
5043	NC_011312	CTG	2	6	380352	380357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693952
5044	NC_011312	ATC	2	6	380370	380375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693952
5045	NC_011312	ATC	2	6	380427	380432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693952
5046	NC_011312	AGA	2	6	380481	380486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693952
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5048	NC_011312	TAC	2	6	380595	380600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_011312	TGC	2	6	380818	380823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693953
5050	NC_011312	CAA	2	6	380841	380846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693953
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5052	NC_011312	ATA	2	6	380976	380981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693953
5053	NC_011312	TAG	2	6	381159	381164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693953
5054	NC_011312	AAC	2	6	381165	381170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693953
5055	NC_011312	GAT	2	6	381173	381178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693953
5056	NC_011312	GAT	2	6	381257	381262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693953
5057	NC_011312	AAC	2	6	381279	381284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693953
5058	NC_011312	ACG	2	6	381374	381379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693953
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5060	NC_011312	CAT	2	6	381771	381776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693954
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5070	NC_011312	GTT	2	6	382321	382326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693954
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5091	NC_011312	AGC	2	6	383800	383805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693955
5092	NC_011312	GTT	2	6	383821	383826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693955
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5100	NC_011312	GTT	2	6	384577	384582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693956
5101	NC_011312	TTA	2	6	384595	384600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693956
5102	NC_011312	TCA	2	6	384603	384608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693956
5103	NC_011312	TAA	2	6	384618	384623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693956
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5108	NC_011312	ATG	2	6	384949	384954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693956
5109	NC_011312	CGT	2	6	384955	384960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693956
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5111	NC_011312	CGT	2	6	385084	385089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693956
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5113	NC_011312	TGT	2	6	385125	385130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693956
5114	NC_011312	TGA	2	6	385131	385136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693956
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5479	NC_011312	ACG	2	6	409463	409468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693976
5480	NC_011312	TTG	2	6	409483	409488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693976
5481	NC_011312	TCG	2	6	409506	409511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693976
5482	NC_011312	GTT	2	6	409516	409521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693976
5483	NC_011312	GCG	2	6	409565	409570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209693976
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5487	NC_011312	TAT	2	6	409788	409793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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