MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 3 str. JL03 chromosome

Total Repeats: 1766

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010278	ATTTA	2	10	1820	1829	40 %	60 %	0 %	0 %	165975459
2	NC_010278	TACCG	2	10	4206	4215	20 %	20 %	20 %	40 %	165975461
3	NC_010278	TTTAA	2	10	7380	7389	40 %	60 %	0 %	0 %	165975465
4	NC_010278	ATTTT	2	10	8258	8267	20 %	80 %	0 %	0 %	165975465
5	NC_010278	ATCGG	2	10	8885	8894	20 %	20 %	40 %	20 %	165975466
6	NC_010278	TGGTG	2	10	8896	8905	0 %	40 %	60 %	0 %	165975466
7	NC_010278	TTAAA	2	10	11347	11356	60 %	40 %	0 %	0 %	165975470
8	NC_010278	GGTAT	2	10	12111	12120	20 %	40 %	40 %	0 %	165975470
9	NC_010278	CGGTT	2	10	13262	13271	0 %	40 %	40 %	20 %	165975470
10	NC_010278	AAATT	2	10	13366	13375	60 %	40 %	0 %	0 %	165975470
11	NC_010278	TCGAT	2	10	16168	16177	20 %	40 %	20 %	20 %	165975472
12	NC_010278	TGTTA	2	10	16630	16639	20 %	60 %	20 %	0 %	165975473
13	NC_010278	CAATA	2	10	16664	16673	60 %	20 %	0 %	20 %	165975473
14	NC_010278	GTTTG	2	10	16925	16934	0 %	60 %	40 %	0 %	165975473
15	NC_010278	CTTTG	2	10	19185	19194	0 %	60 %	20 %	20 %	165975475
16	NC_010278	CGGTG	2	10	19444	19453	0 %	20 %	60 %	20 %	165975475
17	NC_010278	AAAGG	2	10	20631	20640	60 %	0 %	40 %	0 %	165975476
18	NC_010278	CCGGG	2	10	20755	20764	0 %	0 %	60 %	40 %	165975476
19	NC_010278	TGATG	2	10	23845	23854	20 %	40 %	40 %	0 %	165975478
20	NC_010278	GTACC	2	10	25101	25110	20 %	20 %	20 %	40 %	165975480
21	NC_010278	CCGTT	2	10	26548	26557	0 %	40 %	20 %	40 %	165975481
22	NC_010278	AATGA	2	10	28936	28945	60 %	20 %	20 %	0 %	165975483
23	NC_010278	AATTT	2	10	29702	29711	40 %	60 %	0 %	0 %	165975483
24	NC_010278	ATCGG	2	10	30935	30944	20 %	20 %	40 %	20 %	165975484
25	NC_010278	TAAAT	2	10	34331	34340	60 %	40 %	0 %	0 %	165975487
26	NC_010278	TAAGT	2	10	35356	35365	40 %	40 %	20 %	0 %	165975488
27	NC_010278	GTAAA	2	10	36756	36765	60 %	20 %	20 %	0 %	165975488
28	NC_010278	TTAGG	2	10	38135	38144	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010278	CGAAC	2	10	38996	39005	40 %	0 %	20 %	40 %	165975492
30	NC_010278	TTTAT	2	10	40125	40134	20 %	80 %	0 %	0 %	165975493
31	NC_010278	GCTTG	2	10	41203	41212	0 %	40 %	40 %	20 %	165975495
32	NC_010278	TCGTT	2	10	41548	41557	0 %	60 %	20 %	20 %	165975496
33	NC_010278	TTAAA	2	10	43189	43198	60 %	40 %	0 %	0 %	165975497
34	NC_010278	TGCCG	2	10	46075	46084	0 %	20 %	40 %	40 %	165975500
35	NC_010278	GTTTT	2	10	46321	46330	0 %	80 %	20 %	0 %	165975500
36	NC_010278	TGTAA	2	10	48147	48156	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010278	CGCTT	2	10	48377	48386	0 %	40 %	20 %	40 %	165975502
38	NC_010278	ACGAA	2	10	48420	48429	60 %	0 %	20 %	20 %	165975502
39	NC_010278	CGGTT	2	10	51607	51616	0 %	40 %	40 %	20 %	165975503
40	NC_010278	ATGCA	2	10	52114	52123	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_010278	GTAAA	2	10	55502	55511	60 %	20 %	20 %	0 %	165975507
42	NC_010278	AAAGT	2	10	55631	55640	60 %	20 %	20 %	0 %	165975507
43	NC_010278	AAACC	2	10	56574	56583	60 %	0 %	0 %	40 %	165975509
44	NC_010278	CGGCA	2	10	57124	57133	20 %	0 %	40 %	40 %	165975509
45	NC_010278	GTGAA	2	10	58649	58658	40 %	20 %	40 %	0 %	165975510
46	NC_010278	CATCG	2	10	59993	60002	20 %	20 %	20 %	40 %	165975512
47	NC_010278	ATCAC	2	10	60060	60069	40 %	20 %	0 %	40 %	165975512
48	NC_010278	GGTGA	2	10	62163	62172	20 %	20 %	60 %	0 %	165975514
49	NC_010278	ATTTT	2	10	62419	62428	20 %	80 %	0 %	0 %	165975515
50	NC_010278	ATTAA	2	10	65596	65605	60 %	40 %	0 %	0 %	165975517
51	NC_010278	GCCAA	2	10	66070	66079	40 %	0 %	20 %	40 %	165975518
52	NC_010278	AGTGA	2	10	66121	66130	40 %	20 %	40 %	0 %	165975518
53	NC_010278	TTCAC	2	10	66627	66636	20 %	40 %	0 %	40 %	165975519
54	NC_010278	TTGAA	2	10	67926	67935	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010278	AGTCG	2	10	71127	71136	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_010278	AGGTT	2	10	71454	71463	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010278	GGTGT	2	10	72855	72864	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010278	ATGCC	2	10	76119	76128	20 %	20 %	20 %	40 %	165975521
59	NC_010278	TTCGT	2	10	77315	77324	0 %	60 %	20 %	20 %	165975522
60	NC_010278	ATTTA	2	10	78037	78046	40 %	60 %	0 %	0 %	165975522
61	NC_010278	ATTAA	2	10	80889	80898	60 %	40 %	0 %	0 %	165975525
62	NC_010278	AATTT	2	10	81550	81559	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010278	TTCAT	2	10	82410	82419	20 %	60 %	0 %	20 %	165975528
64	NC_010278	GTTTG	2	10	82519	82528	0 %	60 %	40 %	0 %	165975528
65	NC_010278	GAATA	2	10	82832	82841	60 %	20 %	20 %	0 %	165975529
66	NC_010278	CAACA	2	10	87157	87166	60 %	0 %	0 %	40 %	165975535
67	NC_010278	GTGAA	2	10	88543	88552	40 %	20 %	40 %	0 %	165975537
68	NC_010278	GGTAC	2	10	90239	90248	20 %	20 %	40 %	20 %	165975540
69	NC_010278	ATTGA	2	10	90806	90815	40 %	40 %	20 %	0 %	165975540
70	NC_010278	TTCAA	2	10	94522	94531	40 %	40 %	0 %	20 %	165975545
71	NC_010278	AATAA	2	10	96210	96219	80 %	20 %	0 %	0 %	165975547
72	NC_010278	AGGTG	2	10	97708	97717	20 %	20 %	60 %	0 %	165975549
73	NC_010278	AATAA	2	10	97854	97863	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010278	TAGTT	2	10	98945	98954	20 %	60 %	20 %	0 %	165975551
75	NC_010278	AGCGA	2	10	99099	99108	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_010278	TTGAA	2	10	100843	100852	40 %	40 %	20 %	0 %	165975554
77	NC_010278	ACCGG	2	10	104062	104071	20 %	0 %	40 %	40 %	165975556
78	NC_010278	GAATC	2	10	104249	104258	40 %	20 %	20 %	20 %	165975556
79	NC_010278	ATTTA	2	10	104685	104694	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010278	TTTAT	3	15	104817	104831	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010278	CAAAG	2	10	105905	105914	60 %	0 %	20 %	20 %	165975557
82	NC_010278	GGTGC	2	10	107858	107867	0 %	20 %	60 %	20 %	165975560
83	NC_010278	GCAGT	2	10	110572	110581	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_010278	GTAAT	2	10	113104	113113	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010278	GTGGC	2	10	114299	114308	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_010278	AAGTA	2	10	115113	115122	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010278	ACGGT	2	10	116195	116204	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_010278	GAACG	2	10	116529	116538	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_010278	TTCAG	2	10	117727	117736	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_010278	CGAAA	2	10	118257	118266	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_010278	CGTAT	2	10	118270	118279	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_010278	TAACT	2	10	118410	118419	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_010278	TTCGG	2	10	118522	118531	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_010278	AACCT	2	10	120361	120370	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_010278	TAGAA	2	10	121371	121380	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010278	CGCTT	2	10	123250	123259	0 %	40 %	20 %	40 %	165975562
97	NC_010278	GGCAC	2	10	124721	124730	20 %	0 %	40 %	40 %	165975562
98	NC_010278	TAATT	2	10	128031	128040	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010278	ACGTA	2	10	128636	128645	40 %	20 %	20 %	20 %	165975564
100	NC_010278	TGCGG	2	10	129084	129093	0 %	20 %	60 %	20 %	165975564
101	NC_010278	TTTGT	2	10	129709	129718	0 %	80 %	20 %	0 %	165975565
102	NC_010278	AAACC	2	10	134018	134027	60 %	0 %	0 %	40 %	165975571
103	NC_010278	CCAAG	2	10	134064	134073	40 %	0 %	20 %	40 %	165975571
104	NC_010278	TACGA	2	10	134304	134313	40 %	20 %	20 %	20 %	165975571
105	NC_010278	TGTAT	2	10	135022	135031	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010278	ATGAC	2	10	135102	135111	40 %	20 %	20 %	20 %	165975573
107	NC_010278	TTGAA	2	10	136351	136360	40 %	40 %	20 %	0 %	165975574
108	NC_010278	ATGAA	2	10	138528	138537	60 %	20 %	20 %	0 %	165975576
109	NC_010278	AAGGG	2	10	139279	139288	40 %	0 %	60 %	0 %	165975576
110	NC_010278	AATCA	2	10	141242	141251	60 %	20 %	0 %	20 %	165975578
111	NC_010278	AAATT	2	10	141437	141446	60 %	40 %	0 %	0 %	165975578
112	NC_010278	ACGCG	2	10	141605	141614	20 %	0 %	40 %	40 %	165975578
113	NC_010278	GCAAA	2	10	144883	144892	60 %	0 %	20 %	20 %	165975584
114	NC_010278	AACTA	2	10	145884	145893	60 %	20 %	0 %	20 %	165975585
115	NC_010278	AATTA	2	10	146551	146560	60 %	40 %	0 %	0 %	165975586
116	NC_010278	TTAAA	2	10	148099	148108	60 %	40 %	0 %	0 %	165975587
117	NC_010278	GTAAA	2	10	149055	149064	60 %	20 %	20 %	0 %	165975588
118	NC_010278	TGATT	2	10	149997	150006	20 %	60 %	20 %	0 %	165975589
119	NC_010278	AGTTA	2	10	150770	150779	40 %	40 %	20 %	0 %	165975590
120	NC_010278	TTTGG	2	10	151156	151165	0 %	60 %	40 %	0 %	165975591
121	NC_010278	CCGTG	2	10	151830	151839	0 %	20 %	40 %	40 %	165975591
122	NC_010278	ACCAA	2	10	153031	153040	60 %	0 %	0 %	40 %	165975592
123	NC_010278	ACGTA	2	10	153639	153648	40 %	20 %	20 %	20 %	165975592
124	NC_010278	TTAAT	2	10	155372	155381	40 %	60 %	0 %	0 %	165975595
125	NC_010278	CGGTG	2	10	157266	157275	0 %	20 %	60 %	20 %	165975596
126	NC_010278	AAGCG	2	10	157554	157563	40 %	0 %	40 %	20 %	165975596
127	NC_010278	CTTAT	2	10	157896	157905	20 %	60 %	0 %	20 %	165975596
128	NC_010278	GGTTC	2	10	159777	159786	0 %	40 %	40 %	20 %	165975598
129	NC_010278	GATCC	2	10	163635	163644	20 %	20 %	20 %	40 %	165975601
130	NC_010278	CGGTG	2	10	164982	164991	0 %	20 %	60 %	20 %	165975602
131	NC_010278	AAAGC	2	10	165005	165014	60 %	0 %	20 %	20 %	165975602
132	NC_010278	AATTT	2	10	165572	165581	40 %	60 %	0 %	0 %	165975603
133	NC_010278	CAAGC	2	10	166154	166163	40 %	0 %	20 %	40 %	165975603
134	NC_010278	TTTTA	2	10	167632	167641	20 %	80 %	0 %	0 %	165975604
135	NC_010278	TTTAT	2	10	169115	169124	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010278	CAATG	2	10	169735	169744	40 %	20 %	20 %	20 %	165975606
137	NC_010278	ATTGC	2	10	172702	172711	20 %	40 %	20 %	20 %	165975609
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268	NC_010278	TGCGG	2	10	334757	334766	0 %	20 %	60 %	20 %	165975752
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