MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 3 str. JL03 chromosome

Total Repeats: 1766

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010278	GCTCT	2	10	1258674	1258683	0 %	40 %	20 %	40 %	165976542
1002	NC_010278	CGGTA	2	10	1258790	1258799	20 %	20 %	40 %	20 %	165976542
1003	NC_010278	GATAA	2	10	1260063	1260072	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_010278	AATCC	2	10	1261784	1261793	40 %	20 %	0 %	40 %	165976546
1005	NC_010278	ACGGT	2	10	1263667	1263676	20 %	20 %	40 %	20 %	165976548
1006	NC_010278	AAGGA	3	15	1264904	1264918	60 %	0 %	40 %	0 %	165976549
1007	NC_010278	ACCAC	2	10	1266020	1266029	40 %	0 %	0 %	60 %	165976550
1008	NC_010278	TCGCT	2	10	1267702	1267711	0 %	40 %	20 %	40 %	165976552
1009	NC_010278	TTAAA	2	10	1268067	1268076	60 %	40 %	0 %	0 %	165976552
1010	NC_010278	TGGAT	2	10	1269733	1269742	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_010278	CGCAC	2	10	1271899	1271908	20 %	0 %	20 %	60 %	165976556
1012	NC_010278	TCCTC	2	10	1273264	1273273	0 %	40 %	0 %	60 %	165976557
1013	NC_010278	TTTAC	2	10	1273532	1273541	20 %	60 %	0 %	20 %	165976557
1014	NC_010278	CCGAG	2	10	1273597	1273606	20 %	0 %	40 %	40 %	165976557
1015	NC_010278	TATTT	2	10	1274334	1274343	20 %	80 %	0 %	0 %	165976557
1016	NC_010278	TTTTA	2	10	1274494	1274503	20 %	80 %	0 %	0 %	165976557
1017	NC_010278	ATTTG	2	10	1275200	1275209	20 %	60 %	20 %	0 %	165976558
1018	NC_010278	TACGT	2	10	1275221	1275230	20 %	40 %	20 %	20 %	165976558
1019	NC_010278	GCCAC	2	10	1275380	1275389	20 %	0 %	20 %	60 %	165976558
1020	NC_010278	AAAAG	2	10	1276314	1276323	80 %	0 %	20 %	0 %	165976559
1021	NC_010278	AAACA	3	15	1278330	1278344	80 %	0 %	0 %	20 %	165976562
1022	NC_010278	TGGGT	2	10	1280251	1280260	0 %	40 %	60 %	0 %	165976563
1023	NC_010278	CTAAC	2	10	1280769	1280778	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1024	NC_010278	ATTTT	2	10	1281119	1281128	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_010278	CATTT	2	10	1281260	1281269	20 %	60 %	0 %	20 %	165976565
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1030	NC_010278	ATTTT	2	10	1286353	1286362	20 %	80 %	0 %	0 %	165976572
1031	NC_010278	CCAAG	2	10	1287268	1287277	40 %	0 %	20 %	40 %	165976573
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1034	NC_010278	GTGAA	2	10	1291782	1291791	40 %	20 %	40 %	0 %	165976577
1035	NC_010278	TCGGC	2	10	1293943	1293952	0 %	20 %	40 %	40 %	165976580
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1039	NC_010278	CGAAC	2	10	1301528	1301537	40 %	0 %	20 %	40 %	165976585
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1041	NC_010278	TCATT	2	10	1306167	1306176	20 %	60 %	0 %	20 %	165976590
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1043	NC_010278	ATTGT	2	10	1307418	1307427	20 %	60 %	20 %	0 %	165976591
1044	NC_010278	CACTG	2	10	1309250	1309259	20 %	20 %	20 %	40 %	165976593
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1046	NC_010278	CCGCC	2	10	1314719	1314728	0 %	0 %	20 %	80 %	165976601
1047	NC_010278	TACGT	2	10	1317025	1317034	20 %	40 %	20 %	20 %	165976603
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1049	NC_010278	CGATA	2	10	1318078	1318087	40 %	20 %	20 %	20 %	165976605
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1051	NC_010278	TAAAA	2	10	1319174	1319183	80 %	20 %	0 %	0 %	165976606
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1055	NC_010278	TAAAC	2	10	1323662	1323671	60 %	20 %	0 %	20 %	165976609
1056	NC_010278	TGTGG	2	10	1325302	1325311	0 %	40 %	60 %	0 %	165976610
1057	NC_010278	GTATC	2	10	1326169	1326178	20 %	40 %	20 %	20 %	165976610
1058	NC_010278	CAAAA	2	10	1326324	1326333	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1059	NC_010278	TCAAG	2	10	1326365	1326374	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1060	NC_010278	TCAAA	2	10	1327412	1327421	60 %	20 %	0 %	20 %	165976612
1061	NC_010278	TAAAT	2	10	1327644	1327653	60 %	40 %	0 %	0 %	165976612
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