MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 3 str. JL03 chromosome

Total Repeats: 1766

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010278	TGCCG	2	10	1883158	1883167	0 %	20 %	40 %	40 %	165977126
1502	NC_010278	CGGAT	2	10	1884760	1884769	20 %	20 %	40 %	20 %	165977128
1503	NC_010278	TTGAT	2	10	1885261	1885270	20 %	60 %	20 %	0 %	165977129
1504	NC_010278	ACGAC	2	10	1886209	1886218	40 %	0 %	20 %	40 %	165977130
1505	NC_010278	TATTG	2	10	1886931	1886940	20 %	60 %	20 %	0 %	165977130
1506	NC_010278	TTTAA	2	10	1891658	1891667	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_010278	ACCGA	2	10	1891847	1891856	40 %	0 %	20 %	40 %	165977135
1508	NC_010278	GTTGC	2	10	1892967	1892976	0 %	40 %	40 %	20 %	165977135
1509	NC_010278	GTTAA	2	10	1893582	1893591	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_010278	ATTTT	2	10	1893692	1893701	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_010278	AAGCA	2	10	1895225	1895234	60 %	0 %	20 %	20 %	165977137
1512	NC_010278	GTTTT	2	10	1895969	1895978	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_010278	AAATT	2	10	1896746	1896755	60 %	40 %	0 %	0 %	165977138
1514	NC_010278	CACAA	2	10	1897230	1897239	60 %	0 %	0 %	40 %	165977139
1515	NC_010278	ACCGT	2	10	1897948	1897957	20 %	20 %	20 %	40 %	165977140
1516	NC_010278	CAATT	2	10	1899138	1899147	40 %	40 %	0 %	20 %	165977141
1517	NC_010278	TGAAT	2	10	1901103	1901112	40 %	40 %	20 %	0 %	165977143
1518	NC_010278	GAGCA	2	10	1901926	1901935	40 %	0 %	40 %	20 %	165977144
1519	NC_010278	ACGCT	2	10	1903451	1903460	20 %	20 %	20 %	40 %	165977145
1520	NC_010278	TGCGG	2	10	1904507	1904516	0 %	20 %	60 %	20 %	165977146
1521	NC_010278	GCGCA	2	10	1904892	1904901	20 %	0 %	40 %	40 %	165977147
1522	NC_010278	TGAAA	2	10	1910136	1910145	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_010278	AAAAT	2	10	1916473	1916482	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_010278	CGGTA	2	10	1918332	1918341	20 %	20 %	40 %	20 %	165977163
1525	NC_010278	CGTGC	2	10	1919416	1919425	0 %	20 %	40 %	40 %	165977163
1526	NC_010278	CAACA	2	10	1919969	1919978	60 %	0 %	0 %	40 %	165977163
1527	NC_010278	TCGTA	2	10	1920192	1920201	20 %	40 %	20 %	20 %	165977163
1528	NC_010278	TCAAA	2	10	1920277	1920286	60 %	20 %	0 %	20 %	165977163
1529	NC_010278	TACTT	2	10	1922569	1922578	20 %	60 %	0 %	20 %	165977164
1530	NC_010278	TACCG	2	10	1923765	1923774	20 %	20 %	20 %	40 %	165977164
1531	NC_010278	GTGAT	2	10	1924762	1924771	20 %	40 %	40 %	0 %	165977164
1532	NC_010278	ATTAA	2	10	1925028	1925037	60 %	40 %	0 %	0 %	165977164
1533	NC_010278	CGGTG	2	10	1925153	1925162	0 %	20 %	60 %	20 %	165977164
1534	NC_010278	GAACT	2	10	1927718	1927727	40 %	20 %	20 %	20 %	165977165
1535	NC_010278	TCTAC	2	10	1927856	1927865	20 %	40 %	0 %	40 %	165977165
1536	NC_010278	TTTAG	2	10	1928151	1928160	20 %	60 %	20 %	0 %	165977166
1537	NC_010278	TTTAA	2	10	1929493	1929502	40 %	60 %	0 %	0 %	165977168
1538	NC_010278	ACCAA	2	10	1930192	1930201	60 %	0 %	0 %	40 %	165977169
1539	NC_010278	CGATT	2	10	1930922	1930931	20 %	40 %	20 %	20 %	165977170
1540	NC_010278	GATAA	2	10	1931367	1931376	60 %	20 %	20 %	0 %	165977171
1541	NC_010278	GGCTG	2	10	1932232	1932241	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1542	NC_010278	GTTCG	2	10	1932598	1932607	0 %	40 %	40 %	20 %	165977172
1543	NC_010278	GCGAA	2	10	1934150	1934159	40 %	0 %	40 %	20 %	165977173
1544	NC_010278	ATCCG	2	10	1936041	1936050	20 %	20 %	20 %	40 %	165977176
1545	NC_010278	GCGAA	2	10	1936667	1936676	40 %	0 %	40 %	20 %	165977176
1546	NC_010278	CGGTG	2	10	1938374	1938383	0 %	20 %	60 %	20 %	165977178
1547	NC_010278	CAAGC	2	10	1938481	1938490	40 %	0 %	20 %	40 %	165977178
1548	NC_010278	GTTTT	2	10	1939150	1939159	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_010278	AAAGC	2	10	1939415	1939424	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1550	NC_010278	TACGT	2	10	1939628	1939637	20 %	40 %	20 %	20 %	165977179
1551	NC_010278	GCGAA	2	10	1939801	1939810	40 %	0 %	40 %	20 %	165977179
1552	NC_010278	GCGGT	2	10	1941954	1941963	0 %	20 %	60 %	20 %	165977180
1553	NC_010278	TCATC	2	10	1942193	1942202	20 %	40 %	0 %	40 %	165977180
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1555	NC_010278	ATTTC	2	10	1942433	1942442	20 %	60 %	0 %	20 %	165977180
1556	NC_010278	TACGA	2	10	1942641	1942650	40 %	20 %	20 %	20 %	165977180
1557	NC_010278	TGGCT	2	10	1944477	1944486	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1558	NC_010278	AGAAA	2	10	1944680	1944689	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_010278	GAATT	2	10	1945557	1945566	40 %	40 %	20 %	0 %	165977183
1560	NC_010278	AGATT	2	10	1946901	1946910	40 %	40 %	20 %	0 %	165977184
1561	NC_010278	ATTGA	2	10	1947733	1947742	40 %	40 %	20 %	0 %	165977185
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1563	NC_010278	TGATT	2	10	1953239	1953248	20 %	60 %	20 %	0 %	165977190
1564	NC_010278	CGGTG	2	10	1954998	1955007	0 %	20 %	60 %	20 %	165977192
1565	NC_010278	AAATG	2	10	1955948	1955957	60 %	20 %	20 %	0 %	165977193
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1572	NC_010278	GGTAA	2	10	1963867	1963876	40 %	20 %	40 %	0 %	165977207
1573	NC_010278	AAAGT	2	10	1965959	1965968	60 %	20 %	20 %	0 %	165977211
1574	NC_010278	GCTCA	2	10	1968981	1968990	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1575	NC_010278	AAAAC	2	10	1973889	1973898	80 %	0 %	0 %	20 %	165977226
1576	NC_010278	CTTTT	2	10	1974250	1974259	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1577	NC_010278	GAATG	2	10	1975550	1975559	40 %	20 %	40 %	0 %	165977227
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1581	NC_010278	GGCGA	2	10	1978599	1978608	20 %	0 %	60 %	20 %	165977230
1582	NC_010278	AAATT	2	10	1983646	1983655	60 %	40 %	0 %	0 %	165977235
1583	NC_010278	CAGAA	2	10	1984888	1984897	60 %	0 %	20 %	20 %	165977236
1584	NC_010278	GGATC	2	10	1986771	1986780	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1585	NC_010278	GTGGC	2	10	1988097	1988106	0 %	20 %	60 %	20 %	165977240
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1587	NC_010278	CAAGC	2	10	1990314	1990323	40 %	0 %	20 %	40 %	165977242
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1590	NC_010278	AATAA	2	10	1992800	1992809	80 %	20 %	0 %	0 %	165977245
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1596	NC_010278	AATAC	2	10	2000141	2000150	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1597	NC_010278	TATTT	2	10	2000390	2000399	20 %	80 %	0 %	0 %	165977253
1598	NC_010278	GGTCG	2	10	2002302	2002311	0 %	20 %	60 %	20 %	165977255
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1600	NC_010278	CATCA	2	10	2004698	2004707	40 %	20 %	0 %	40 %	165977257
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1604	NC_010278	TTTAC	2	10	2012250	2012259	20 %	60 %	0 %	20 %	165977264
1605	NC_010278	TAGCG	2	10	2012559	2012568	20 %	20 %	40 %	20 %	165977264
1606	NC_010278	TAAAA	2	10	2014339	2014348	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_010278	CAATT	2	10	2015162	2015171	40 %	40 %	0 %	20 %	165977268
1608	NC_010278	ACGTA	2	10	2015515	2015524	40 %	20 %	20 %	20 %	165977268
1609	NC_010278	GTAGC	2	10	2016830	2016839	20 %	20 %	40 %	20 %	165977270
1610	NC_010278	CTTAC	2	10	2017603	2017612	20 %	40 %	0 %	40 %	165977271
1611	NC_010278	TTGTG	2	10	2017994	2018003	0 %	60 %	40 %	0 %	165977272
1612	NC_010278	CTTAT	2	10	2018293	2018302	20 %	60 %	0 %	20 %	165977272
1613	NC_010278	CCAAG	2	10	2019071	2019080	40 %	0 %	20 %	40 %	165977273
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1615	NC_010278	AATCC	2	10	2020454	2020463	40 %	20 %	0 %	40 %	165977274
1616	NC_010278	ATTGT	2	10	2026326	2026335	20 %	60 %	20 %	0 %	165977281
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1618	NC_010278	TTGAA	2	10	2027094	2027103	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_010278	AGTCG	2	10	2030297	2030306	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1620	NC_010278	AGGTT	2	10	2030624	2030633	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_010278	GGTGT	2	10	2032025	2032034	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_010278	GTTTG	2	10	2037905	2037914	0 %	60 %	40 %	0 %	165977284
1623	NC_010278	CGACC	2	10	2041903	2041912	20 %	0 %	20 %	60 %	165977288
1624	NC_010278	TTTGC	2	10	2043128	2043137	0 %	60 %	20 %	20 %	165977289
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1752	NC_010278	CAATT	2	10	2219359	2219368	40 %	40 %	0 %	20 %	165977470
1753	NC_010278	TGATT	2	10	2219786	2219795	20 %	60 %	20 %	0 %	165977471
1754	NC_010278	AAGCG	2	10	2222463	2222472	40 %	0 %	40 %	20 %	165977474
1755	NC_010278	TAAAT	2	10	2224506	2224515	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1763	NC_010278	AGTTG	2	10	2238225	2238234	20 %	40 %	40 %	0 %	165977490
1764	NC_010278	TAAGC	2	10	2241482	2241491	40 %	20 %	20 %	20 %	165977493
1765	NC_010278	CGGTA	2	10	2241530	2241539	20 %	20 %	40 %	20 %	165977493
1766	NC_010278	GAGTA	2	10	2241731	2241740	40 %	20 %	40 %	0 %	165977493

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