MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Azorhizobium caulinodans ORS 571 chromosome

Total Repeats: 3783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009937	CCGCGC	2	12	4969356	4969367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158426001
3502	NC_009937	CGCTGG	2	12	4972067	4972078	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158426003
3503	NC_009937	CAGGCG	2	12	4973437	4973448	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158426005
3504	NC_009937	CTATGC	2	12	4973850	4973861	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158426005
3505	NC_009937	TCGCGC	2	12	4974894	4974905	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158426007
3506	NC_009937	GCCGTT	2	12	4976003	4976014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158426008
3507	NC_009937	TTGCCG	2	12	4976598	4976609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158426008
3508	NC_009937	TCGGCG	2	12	4978142	4978153	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158426009
3509	NC_009937	CACCGT	2	12	4980099	4980110	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158426011
3510	NC_009937	GCCAGG	2	12	4982623	4982634	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158426014
3511	NC_009937	GCACAG	2	12	4982682	4982693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158426014
3512	NC_009937	CGCTGG	2	12	4983495	4983506	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158426015
3513	NC_009937	TCGCGG	2	12	4984653	4984664	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158426015
3514	NC_009937	GGCCGC	2	12	4985452	4985463	0 %	0 %	50 %	50 %	158426015
3515	NC_009937	TGGCGA	2	12	4987607	4987618	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158426017
3516	NC_009937	TGCCAA	2	12	4989539	4989550	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158426018
3517	NC_009937	GCGCTG	2	12	4992262	4992273	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158426021
3518	NC_009937	TCGTGC	2	12	4993747	4993758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158426022
3519	NC_009937	TTCCTC	2	12	4994301	4994312	0 %	50 %	0 %	50 %	158426022
3520	NC_009937	CCTGCC	2	12	4995458	4995469	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	158426024
3521	NC_009937	CTGAAG	2	12	4995519	4995530	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158426024
3522	NC_009937	CCCAAG	2	12	4997144	4997155	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158426026
3523	NC_009937	CTGCGC	2	12	4999220	4999231	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158426026
3524	NC_009937	GCCATG	2	12	5002475	5002486	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158426029
3525	NC_009937	ACGCTG	2	12	5009903	5009914	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158426036
3526	NC_009937	CGGCAC	2	12	5012855	5012866	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158426039
3527	NC_009937	GAGCGG	2	12	5013569	5013580	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	158426040
3528	NC_009937	ATCGCC	2	12	5014037	5014048	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158426040
3529	NC_009937	CGCTGG	2	12	5022241	5022252	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158426047
3530	NC_009937	TCACCA	2	12	5022779	5022790	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	158426047
3531	NC_009937	AGCACC	2	12	5023671	5023682	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158426048
3532	NC_009937	CGGCCT	2	12	5025190	5025201	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158426050
3533	NC_009937	CTCGAC	2	12	5028473	5028484	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158426052
3534	NC_009937	GCGCCC	2	12	5028954	5028965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158426052
3535	NC_009937	GGCGCC	2	12	5029885	5029896	0 %	0 %	50 %	50 %	158426053
3536	NC_009937	CACCGG	2	12	5031252	5031263	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158426053
3537	NC_009937	CGGCCA	2	12	5031794	5031805	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158426053
3538	NC_009937	CGAGAA	2	12	5032485	5032496	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	158426053
3539	NC_009937	GCTTCG	2	12	5032547	5032558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158426053
3540	NC_009937	GCCGGC	2	12	5035627	5035638	0 %	0 %	50 %	50 %	158426056
3541	NC_009937	GCGGGC	2	12	5035723	5035734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158426056
3542	NC_009937	CACGCG	2	12	5036226	5036237	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158426056
3543	NC_009937	GCAGGA	2	12	5036531	5036542	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158426057
3544	NC_009937	GCCGGC	2	12	5039278	5039289	0 %	0 %	50 %	50 %	158426058
3545	NC_009937	ATCGAC	2	12	5040292	5040303	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158426058
3546	NC_009937	GCAGGC	2	12	5048728	5048739	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158426060
3547	NC_009937	AGGCCG	2	12	5048943	5048954	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158426060
3548	NC_009937	CGCGTG	2	12	5049329	5049340	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158426060
3549	NC_009937	GGCGCA	2	12	5051601	5051612	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158426062
3550	NC_009937	GCTGCC	2	12	5052498	5052509	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158426063
3551	NC_009937	GCGCAG	2	12	5052549	5052560	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158426063
3552	NC_009937	CAAGCT	2	12	5053317	5053328	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158426064
3553	NC_009937	GGGCCA	2	12	5054448	5054459	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158426064
3554	NC_009937	CCGGAA	2	12	5054775	5054786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158426065
3555	NC_009937	GCCATA	2	12	5055520	5055531	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158426065
3556	NC_009937	ATCCGC	2	12	5059006	5059017	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158426068
3557	NC_009937	ATTGGC	2	12	5059703	5059714	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158426069
3558	NC_009937	CCAGCC	2	12	5060515	5060526	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158426070
3559	NC_009937	GCCTGC	2	12	5065962	5065973	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158426075
3560	NC_009937	GCCCGC	2	12	5067181	5067192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158426076
3561	NC_009937	ACGCTG	2	12	5069183	5069194	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158426078
3562	NC_009937	GCCGAG	2	12	5070236	5070247	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158426080
3563	NC_009937	GGACAG	2	12	5071961	5071972	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158426083
3564	NC_009937	CGAGGC	2	12	5073954	5073965	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158426085
3565	NC_009937	CTCGAC	2	12	5074357	5074368	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158426085
3566	NC_009937	TCGGCT	2	12	5074748	5074759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158426085
3567	NC_009937	GCCGGT	2	12	5075217	5075228	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158426085
3568	NC_009937	CAGCGC	2	12	5076433	5076444	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158426086
3569	NC_009937	CAGGCG	2	12	5078189	5078200	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158426088
3570	NC_009937	CGGCAT	2	12	5078431	5078442	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158426088
3571	NC_009937	CGACCC	2	12	5078737	5078748	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158426088
3572	NC_009937	CGCTGG	2	12	5079081	5079092	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158426088
3573	NC_009937	GGGCAA	2	12	5079418	5079429	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158426088
3574	NC_009937	CGGCCT	2	12	5083436	5083447	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158426091
3575	NC_009937	CTCGCC	2	12	5084641	5084652	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	158426092
3576	NC_009937	GCGCGA	2	12	5084880	5084891	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158426093
3577	NC_009937	GCGGGC	2	12	5087758	5087769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158426096
3578	NC_009937	CTTCCG	2	12	5089657	5089668	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	158426097
3579	NC_009937	GCCGGC	2	12	5090858	5090869	0 %	0 %	50 %	50 %	158426099
3580	NC_009937	GTCACC	2	12	5091734	5091745	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158426099
3581	NC_009937	CGCGGG	2	12	5092569	5092580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158426099
3582	NC_009937	CTCACC	2	12	5093815	5093826	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	158426101
3583	NC_009937	CGCTGG	2	12	5093831	5093842	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158426101
3584	NC_009937	GGTGGC	2	12	5094876	5094887	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	158426102
3585	NC_009937	ATCGAG	2	12	5095138	5095149	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158426102
3586	NC_009937	GGGCAC	2	12	5095254	5095265	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158426102
3587	NC_009937	AGGGCA	2	12	5099545	5099556	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158426106
3588	NC_009937	GGCACG	2	12	5100348	5100359	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158426106
3589	NC_009937	CGCCCG	2	12	5100767	5100778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158426106
3590	NC_009937	CACCGC	2	12	5102066	5102077	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158426106
3591	NC_009937	GCTCCC	2	12	5102364	5102375	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	158426106
3592	NC_009937	CTGGAA	2	12	5103559	5103570	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158426108
3593	NC_009937	GGAAGC	2	12	5104209	5104220	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158426108
3594	NC_009937	GCTCTC	2	12	5104303	5104314	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	158426108
3595	NC_009937	CCCGCG	2	12	5106032	5106043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158426110
3596	NC_009937	GCACGC	2	12	5106753	5106764	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158426111
3597	NC_009937	TCGCCT	2	12	5108333	5108344	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	158426113
3598	NC_009937	GTGGCG	2	12	5109404	5109415	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	158426114
3599	NC_009937	GGCCTC	2	12	5111003	5111014	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158426115
3600	NC_009937	GCCTCG	2	12	5112048	5112059	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158426115
3601	NC_009937	CGTGGA	2	12	5113391	5113402	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158426116
3602	NC_009937	CCGCGA	2	12	5115576	5115587	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158426118
3603	NC_009937	GAAGGC	2	12	5115829	5115840	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158426118
3604	NC_009937	TCCACC	2	12	5119148	5119159	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	158426120
3605	NC_009937	CCACCG	2	12	5119422	5119433	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158426120
3606	NC_009937	GATCGG	2	12	5121933	5121944	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158426124
3607	NC_009937	GCAGGT	2	12	5123108	5123119	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158426126
3608	NC_009937	TCCGGC	2	12	5124215	5124226	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158426127
3609	NC_009937	TCGATC	2	12	5125932	5125943	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158426128
3610	NC_009937	GAGGAT	2	12	5127734	5127745	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	158426131
3611	NC_009937	GACGAG	2	12	5128118	5128129	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158426131
3612	NC_009937	GTTGCG	2	12	5129768	5129779	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158426132
3613	NC_009937	GGCAGG	2	12	5131209	5131220	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	158426132
3614	NC_009937	GATGGC	2	12	5131247	5131258	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158426132
3615	NC_009937	AGCGGC	2	12	5131863	5131874	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158426132
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3617	NC_009937	GGCGGT	2	12	5132597	5132608	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	158426132
3618	NC_009937	CCTGAC	2	12	5137686	5137697	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158426137
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3628	NC_009937	CTCTAT	2	12	5144530	5144541	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	158426143
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3632	NC_009937	CGGTCT	2	12	5149149	5149160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158426147
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3644	NC_009937	TCTGCG	2	12	5164154	5164165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158426160
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3700	NC_009937	TCCGCT	2	12	5251505	5251516	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	158426243
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3702	NC_009937	CGTCCA	2	12	5252037	5252048	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158426243
3703	NC_009937	TCGGGC	2	12	5252331	5252342	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158426243
3704	NC_009937	TCACCG	2	12	5263935	5263946	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158426251
3705	NC_009937	CAGCGG	2	12	5267646	5267657	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158426254
3706	NC_009937	GGCGCG	2	12	5270207	5270218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158426256
3707	NC_009937	CAGGCG	2	12	5270911	5270922	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158426257
3708	NC_009937	GCTTCG	2	12	5271416	5271427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158426257
3709	NC_009937	CACCGG	2	12	5272005	5272016	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158426257
3710	NC_009937	CGCAGC	2	12	5273685	5273696	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158426259
3711	NC_009937	CTCCAG	2	12	5274387	5274398	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158426260
3712	NC_009937	AGCGCG	2	12	5275068	5275079	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158426261
3713	NC_009937	GAAGCC	2	12	5275568	5275579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158426261
3714	NC_009937	GATCAG	2	12	5276030	5276041	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158426261
3715	NC_009937	TGGAAG	2	12	5277648	5277659	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	158426263
3716	NC_009937	GCTTCG	2	12	5278519	5278530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158426264
3717	NC_009937	GCCTCG	2	12	5280324	5280335	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158426266
3718	NC_009937	CGGCTT	2	12	5281998	5282009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158426267
3719	NC_009937	TGCCGG	2	12	5282754	5282765	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158426268
3720	NC_009937	GTGACG	2	12	5283277	5283288	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158426269
3721	NC_009937	CGCCAC	2	12	5287115	5287126	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158426273
3722	NC_009937	CTCATC	2	12	5288029	5288040	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	158426274
3723	NC_009937	TCACGC	2	12	5288117	5288128	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158426274
3724	NC_009937	CACGGC	2	12	5288244	5288255	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158426274
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3749	NC_009937	AGCGCC	2	12	5324402	5324413	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158426303
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3769	NC_009937	CGGCGA	2	12	5353007	5353018	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158426330
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