MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Azorhizobium caulinodans ORS 571 chromosome

Total Repeats: 3783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009937	ACCAAC	2	12	723102	723113	50 %	0 %	0 %	50 %	158422276
502	NC_009937	TGCGCA	2	12	725582	725593	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158422278
503	NC_009937	GGTGGG	2	12	726404	726415	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	158422279
504	NC_009937	CCTCGA	2	12	734570	734581	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158422288
505	NC_009937	GGCAGG	2	12	738230	738241	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	158422291
506	NC_009937	TCGGCA	2	12	743618	743629	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158422296
507	NC_009937	CTGGTG	2	12	743740	743751	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158422296
508	NC_009937	ATCTCG	2	12	744623	744634	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158422297
509	NC_009937	GCGAGA	2	12	745907	745918	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158422299
510	NC_009937	TCGGCG	2	12	747569	747580	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158422302
511	NC_009937	CCGGGG	2	12	748755	748766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158422303
512	NC_009937	CGGGGG	2	12	748770	748781	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	158422303
513	NC_009937	GGTGCG	2	12	751712	751723	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	158422304
514	NC_009937	GCATCC	2	12	752617	752628	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158422305
515	NC_009937	GCCGAT	2	12	752802	752813	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158422305
516	NC_009937	CGGCAG	2	12	754789	754800	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158422306
517	NC_009937	GCGCGG	2	12	755773	755784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158422308
518	NC_009937	AGGCCG	2	12	757072	757083	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158422309
519	NC_009937	GAGGTG	2	12	757626	757637	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	158422310
520	NC_009937	GGCCTG	2	12	760024	760035	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158422311
521	NC_009937	GAGCGC	2	12	761439	761450	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158422313
522	NC_009937	GCAGGC	2	12	761473	761484	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158422313
523	NC_009937	GTTGAG	2	12	765840	765851	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158422315
524	NC_009937	GGCCGA	2	12	765884	765895	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158422315
525	NC_009937	CTCGAT	2	12	765996	766007	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158422315
526	NC_009937	CTTCAT	2	12	766208	766219	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	158422316
527	NC_009937	GCTTCT	2	12	766867	766878	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158422317
528	NC_009937	AGCGGC	2	12	767439	767450	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158422317
529	NC_009937	CACCGT	2	12	768998	769009	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158422317
530	NC_009937	GCTGGC	2	12	769259	769270	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158422317
531	NC_009937	TTTCGA	2	12	770857	770868	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158422318
532	NC_009937	TCACCG	2	12	771845	771856	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158422319
533	NC_009937	GGCGGA	2	12	773027	773038	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	158422321
534	NC_009937	CACCGC	2	12	773228	773239	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158422321
535	NC_009937	CTTCGC	2	12	774345	774356	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	158422322
536	NC_009937	GTCCGG	2	12	776540	776551	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158422323
537	NC_009937	GCACCT	2	12	777358	777369	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158422323
538	NC_009937	CGATGC	2	12	777565	777576	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158422323
539	NC_009937	GCCTGT	2	12	781175	781186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158422326
540	NC_009937	CCGAGC	2	12	782931	782942	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158422327
541	NC_009937	TCGGCA	2	12	783036	783047	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158422327
542	NC_009937	CGATGG	2	12	785972	785983	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158422330
543	NC_009937	CATCCA	2	12	786185	786196	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	158422330
544	NC_009937	CGCAGG	2	12	789552	789563	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158422334
545	NC_009937	CGCGTG	2	12	789764	789775	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158422334
546	NC_009937	CTCGAC	2	12	790898	790909	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158422334
547	NC_009937	CTGGAA	2	12	790985	790996	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158422334
548	NC_009937	GGAAGG	2	12	794236	794247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158422337
549	NC_009937	GGGCGC	2	12	794521	794532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158422337
550	NC_009937	CGCATC	2	12	795671	795682	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158422337
551	NC_009937	CGAGCG	2	12	796402	796413	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158422337
552	NC_009937	GCCATG	2	12	796745	796756	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158422337
553	NC_009937	AAGGTG	2	12	798562	798573	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	158422338
554	NC_009937	GTGCTG	2	12	798721	798732	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158422338
555	NC_009937	CCGTGC	2	12	799409	799420	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158422338
556	NC_009937	TCGCCC	2	12	801331	801342	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	158422340
557	NC_009937	CGCCGA	2	12	802154	802165	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158422341
558	NC_009937	ATGCCC	2	12	803135	803146	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158422342
559	NC_009937	CAGCGC	2	12	804924	804935	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158422343
560	NC_009937	GCCACC	2	12	805002	805013	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158422343
561	NC_009937	AGCTGG	2	12	807956	807967	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158422346
562	NC_009937	GTGCGG	2	12	809036	809047	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	158422346
563	NC_009937	CCATCG	2	12	809710	809721	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158422347
564	NC_009937	CGAAGC	2	12	810124	810135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158422347
565	NC_009937	ATCTCG	2	12	810520	810531	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158422347
566	NC_009937	CGGCGA	2	12	811277	811288	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158422348
567	NC_009937	GGAGGC	2	12	811482	811493	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	158422348
568	NC_009937	TCGGCC	2	12	811564	811575	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158422348
569	NC_009937	CGGCGA	2	12	813503	813514	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158422349
570	NC_009937	GGAGGC	2	12	813708	813719	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	158422349
571	NC_009937	TCGGCT	2	12	813817	813828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158422349
572	NC_009937	CGGCGA	2	12	815716	815727	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158422350
573	NC_009937	GGAGGC	2	12	815921	815932	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	158422350
574	NC_009937	TCGGCT	2	12	816030	816041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158422350
575	NC_009937	GTGCTG	2	12	819841	819852	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158422352
576	NC_009937	CATTGG	2	12	821316	821327	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158422353
577	NC_009937	CACCGG	2	12	822518	822529	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158422354
578	NC_009937	GAGGCG	2	12	825351	825362	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	158422357
579	NC_009937	GCCGGC	2	12	830524	830535	0 %	0 %	50 %	50 %	158422360
580	NC_009937	GCCGCT	2	12	831178	831189	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158422361
581	NC_009937	CGTGGA	2	12	831864	831875	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158422361
582	NC_009937	CGTCGC	2	12	832623	832634	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158422362
583	NC_009937	CGAGGC	2	12	832914	832925	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158422362
584	NC_009937	TCGCGA	2	12	833359	833370	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158422363
585	NC_009937	CTCGTG	2	12	838013	838024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158422367
586	NC_009937	CAGCGT	2	12	838959	838970	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158422368
587	NC_009937	GCAGCC	2	12	839468	839479	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158422368
588	NC_009937	GCTTGG	2	12	839486	839497	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158422368
589	NC_009937	CTCTTC	2	12	839655	839666	0 %	50 %	0 %	50 %	158422368
590	NC_009937	GCGGTG	2	12	840206	840217	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	158422368
591	NC_009937	GCGGGG	2	12	840308	840319	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	158422368
592	NC_009937	GCGGGG	2	12	840869	840880	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	158422368
593	NC_009937	GGCTTG	2	12	840958	840969	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158422368
594	NC_009937	CGATCT	2	12	842293	842304	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158422369
595	NC_009937	GGAGGC	2	12	846135	846146	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	158422375
596	NC_009937	GGAGCG	2	12	846388	846399	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	158422375
597	NC_009937	GCCGAG	2	12	846988	846999	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158422376
598	NC_009937	GCCCAT	2	12	847063	847074	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158422376
599	NC_009937	CCCTGG	2	12	848205	848216	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158422377
600	NC_009937	CGATCT	2	12	848907	848918	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158422378
601	NC_009937	CACCGC	2	12	852658	852669	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158422380
602	NC_009937	GGGAGA	2	12	853392	853403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158422380
603	NC_009937	GGAGAG	2	12	854053	854064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158422380
604	NC_009937	GCCGAT	2	12	854113	854124	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158422380
605	NC_009937	AGCACG	2	12	854246	854257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158422380
606	NC_009937	GGTGAT	2	12	855897	855908	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158422381
607	NC_009937	CCGCAG	2	12	857780	857791	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158422383
608	NC_009937	TCTCCA	2	12	858637	858648	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	158422383
609	NC_009937	GAGCAG	2	12	859187	859198	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158422383
610	NC_009937	GCCCAT	2	12	860206	860217	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158422384
611	NC_009937	ACCGCC	2	12	861258	861269	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158422385
612	NC_009937	TCATCT	2	12	861583	861594	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	158422385
613	NC_009937	CATGCC	2	12	863220	863231	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158422387
614	NC_009937	GATGGT	2	12	863265	863276	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158422387
615	NC_009937	CCCTTT	2	12	863565	863576	0 %	50 %	0 %	50 %	158422388
616	NC_009937	CGCGGG	2	12	863785	863796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158422388
617	NC_009937	CGCTGG	2	12	865030	865041	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158422389
618	NC_009937	CGTGGG	2	12	865415	865426	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	158422389
619	NC_009937	AAGGCG	2	12	866346	866357	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158422390
620	NC_009937	CGCGCT	2	12	867221	867232	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158422390
621	NC_009937	CGAATA	2	12	867734	867745	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158422391
622	NC_009937	ATAGAG	2	12	868499	868510	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	158422392
623	NC_009937	CGATGC	2	12	871585	871596	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158422394
624	NC_009937	CACGGC	2	12	873198	873209	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158422395
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626	NC_009937	GCGCTG	2	12	873801	873812	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158422396
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630	NC_009937	ATGGCC	2	12	877124	877135	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158422399
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632	NC_009937	GCCTTG	2	12	877970	877981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158422400
633	NC_009937	CGGTCA	2	12	879050	879061	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158422401
634	NC_009937	TGGGGA	2	12	879583	879594	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	158422401
635	NC_009937	ATGCCG	2	12	881576	881587	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158422403
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639	NC_009937	GCGGTG	2	12	884095	884106	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	158422406
640	NC_009937	CGCTGG	2	12	885964	885975	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158422408
641	NC_009937	CCTCGC	2	12	886067	886078	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	158422408
642	NC_009937	CGCCCG	2	12	886903	886914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158422409
643	NC_009937	CAGCGC	2	12	886982	886993	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158422409
644	NC_009937	GGCGCT	2	12	887158	887169	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158422409
645	NC_009937	CTTGCG	2	12	887422	887433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158422409
646	NC_009937	CGTCCG	2	12	889197	889208	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158422411
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653	NC_009937	CGGTGG	2	12	909660	909671	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	158422430
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700	NC_009937	CGGCCT	2	12	987430	987441	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158422510
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702	NC_009937	TCGACA	2	12	989274	989285	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158422511
703	NC_009937	CTACAT	2	12	991537	991548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158422511
704	NC_009937	CGTCCG	2	12	994910	994921	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158422512
705	NC_009937	TCGTGG	2	12	994984	994995	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158422512
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707	NC_009937	CCAGCC	2	12	997003	997014	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158422513
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709	NC_009937	CGCTGG	2	12	1002173	1002184	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158422518
710	NC_009937	TGCGCG	2	12	1003224	1003235	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158422519
711	NC_009937	CTTCTG	2	12	1003885	1003896	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158422520
712	NC_009937	GCCCGG	2	12	1004459	1004470	0 %	0 %	50 %	50 %	158422520
713	NC_009937	TCGACA	2	12	1006043	1006054	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158422521
714	NC_009937	CTCACC	2	12	1008526	1008537	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	158422523
715	NC_009937	GGCTCG	2	12	1010486	1010497	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158422525
716	NC_009937	GAAGCC	2	12	1011182	1011193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158422526
717	NC_009937	GGTGGC	2	12	1012716	1012727	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	158422527
718	NC_009937	TCGTGG	2	12	1016722	1016733	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158422532
719	NC_009937	GCTCTC	2	12	1017725	1017736	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	158422532
720	NC_009937	ACCGGA	2	12	1018295	1018306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158422534
721	NC_009937	CGGCAC	2	12	1018523	1018534	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158422534
722	NC_009937	CCTCGC	2	12	1019541	1019552	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	158422535
723	NC_009937	GCTTCG	2	12	1027713	1027724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158422539
724	NC_009937	GGAGGC	2	12	1027802	1027813	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	158422539
725	NC_009937	TGAAGC	2	12	1029994	1030005	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158422541
726	NC_009937	CGCTGG	2	12	1031759	1031770	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158422543
727	NC_009937	CGCCTG	2	12	1033022	1033033	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158422544
728	NC_009937	CATACA	2	12	1038046	1038057	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	158422549
729	NC_009937	CATCGT	2	12	1039522	1039533	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158422552
730	NC_009937	ACGGCG	2	12	1040324	1040335	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158422552
731	NC_009937	AGGTGC	2	12	1041880	1041891	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158422553
732	NC_009937	CTATCC	2	12	1048237	1048248	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	158422560
733	NC_009937	AGCTGC	2	12	1049203	1049214	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158422562
734	NC_009937	TGAACT	2	12	1051327	1051338	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158422564
735	NC_009937	GCTTCA	2	12	1051390	1051401	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158422564
736	NC_009937	GCTGGT	2	12	1051597	1051608	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158422564
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742	NC_009937	GCCGGG	2	12	1062670	1062681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158422573
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751	NC_009937	GGCATA	2	12	1071006	1071017	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158422582
752	NC_009937	CGGTGC	2	12	1071134	1071145	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158422582
753	NC_009937	GCCATG	2	12	1077292	1077303	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158422590
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759	NC_009937	CAGGCC	2	12	1095657	1095668	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158422607
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801	NC_009937	TGGACG	2	12	1176400	1176411	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158422671
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812	NC_009937	GCCGAT	2	12	1191830	1191841	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158422687
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822	NC_009937	CCATCG	2	12	1200482	1200493	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158422698
823	NC_009937	GGCGCT	2	12	1201281	1201292	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158422698
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826	NC_009937	GCGCTG	2	12	1210578	1210589	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158422704
827	NC_009937	AGATGG	2	12	1210712	1210723	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	158422704
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829	NC_009937	CCTCGA	2	12	1212019	1212030	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158422706
830	NC_009937	GCCATA	2	12	1214239	1214250	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158422708
831	NC_009937	CCCGCA	2	12	1215147	1215158	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158422708
832	NC_009937	CGCAGG	2	12	1218321	1218332	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158422713
833	NC_009937	CTGGTG	2	12	1218555	1218566	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158422714
834	NC_009937	ATCTTC	2	12	1218762	1218773	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	158422714
835	NC_009937	GGGGCA	2	12	1219413	1219424	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	158422716
836	NC_009937	GCTGGC	2	12	1219659	1219670	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158422716
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838	NC_009937	CCGCGC	2	12	1220669	1220680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158422717
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951	NC_009937	GCGATG	2	12	1352948	1352959	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158422834
952	NC_009937	TCGGTT	2	12	1356804	1356815	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	158422836
953	NC_009937	TCCGGC	2	12	1357137	1357148	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158422836
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962	NC_009937	GATGTC	2	12	1363133	1363144	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158422841
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984	NC_009937	GGTGTT	2	12	1400871	1400882	0 %	50 %	50 %	0 %	158422875
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