MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Azorhizobium caulinodans ORS 571 chromosome

Total Repeats: 3783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009937	CGAAGG	2	12	4308628	4308639	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158425378
3002	NC_009937	CTGCAC	2	12	4308959	4308970	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158425378
3003	NC_009937	GACCTC	2	12	4310039	4310050	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158425379
3004	NC_009937	TCGTGA	2	12	4310459	4310470	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158425380
3005	NC_009937	GCTGGC	2	12	4310595	4310606	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158425380
3006	NC_009937	ATGCTG	2	12	4313742	4313753	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158425383
3007	NC_009937	GGCGCT	2	12	4313951	4313962	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158425383
3008	NC_009937	TCTTCG	2	12	4313998	4314009	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158425383
3009	NC_009937	TCGGCA	2	12	4314271	4314282	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158425384
3010	NC_009937	CGGCCT	2	12	4314677	4314688	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158425384
3011	NC_009937	CTCATC	2	12	4315271	4315282	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	158425385
3012	NC_009937	TGCCCC	2	12	4316402	4316413	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	158425387
3013	NC_009937	CGAGGC	2	12	4316434	4316445	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158425387
3014	NC_009937	GAGACC	2	12	4316909	4316920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158425387
3015	NC_009937	CCGAGC	2	12	4317303	4317314	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158425387
3016	NC_009937	GCCACG	2	12	4317513	4317524	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158425387
3017	NC_009937	CCACGC	2	12	4317931	4317942	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158425387
3018	NC_009937	AGGCGA	2	12	4318738	4318749	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158425387
3019	NC_009937	CACCAG	2	12	4318873	4318884	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158425388
3020	NC_009937	CCCGCC	2	12	4321250	4321261	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	158425390
3021	NC_009937	GCGCTG	2	12	4321569	4321580	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158425391
3022	NC_009937	GCGCGA	2	12	4330045	4330056	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158425399
3023	NC_009937	CCTCGG	2	12	4330201	4330212	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158425399
3024	NC_009937	AGGCGC	2	12	4331954	4331965	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158425401
3025	NC_009937	CCAGCG	2	12	4333088	4333099	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158425402
3026	NC_009937	CGCCAT	2	12	4333115	4333126	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158425402
3027	NC_009937	AGCGCC	2	12	4333411	4333422	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158425402
3028	NC_009937	GCCAAG	2	12	4334516	4334527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158425403
3029	NC_009937	ACCGCC	2	12	4336418	4336429	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158425404
3030	NC_009937	CGCCAT	2	12	4338247	4338258	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158425406
3031	NC_009937	GGCGCT	2	12	4339016	4339027	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158425408
3032	NC_009937	CGCAGA	2	12	4339087	4339098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158425408
3033	NC_009937	AAGAAC	2	12	4340853	4340864	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	158425411
3034	NC_009937	CCCCTC	2	12	4341844	4341855	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	158425412
3035	NC_009937	TTGAAG	2	12	4343913	4343924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158425414
3036	NC_009937	GCTTCT	2	12	4344454	4344465	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158425414
3037	NC_009937	CGCGCC	2	12	4345489	4345500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158425415
3038	NC_009937	AGGGCG	2	12	4351090	4351101	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	158425420
3039	NC_009937	GCGGAA	2	12	4352381	4352392	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158425422
3040	NC_009937	ACAGGA	2	12	4353060	4353071	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	158425423
3041	NC_009937	TAACGA	2	12	4354099	4354110	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158425424
3042	NC_009937	TCCCGT	2	12	4355507	4355518	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	158425425
3043	NC_009937	GAACGC	2	12	4359994	4360005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158425430
3044	NC_009937	GCGATC	2	12	4362416	4362427	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158425432
3045	NC_009937	ATCAAA	2	12	4365038	4365049	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	158425435
3046	NC_009937	ACAGTT	2	12	4367500	4367511	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158425437
3047	NC_009937	CAAAGC	2	12	4369225	4369236	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	158425438
3048	NC_009937	AGCGAA	2	12	4370278	4370289	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	158425440
3049	NC_009937	GAACGC	2	12	4374722	4374733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158425445
3050	NC_009937	TGTGGA	2	12	4376785	4376796	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158425448
3051	NC_009937	TCGAAC	2	12	4378785	4378796	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158425451
3052	NC_009937	AAGGCC	2	12	4380683	4380694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158425452
3053	NC_009937	CGAAGG	2	12	4382506	4382517	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158425452
3054	NC_009937	ACCTCG	2	12	4385610	4385621	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158425458
3055	NC_009937	GAAGGC	2	12	4388641	4388652	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158425462
3056	NC_009937	TGCCGG	2	12	4389789	4389800	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158425465
3057	NC_009937	GCTCGA	2	12	4390290	4390301	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158425465
3058	NC_009937	TCGGCC	2	12	4393354	4393365	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158425467
3059	NC_009937	AGGAAG	2	12	4394892	4394903	50 %	0 %	50 %	0 %	158425468
3060	NC_009937	TTCATG	2	12	4395537	4395548	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158425468
3061	NC_009937	TCCCGT	2	12	4396628	4396639	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	158425469
3062	NC_009937	GCCCGC	2	12	4398520	4398531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158425471
3063	NC_009937	CGATGT	2	12	4403302	4403313	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158425473
3064	NC_009937	CCCCAT	2	12	4410173	4410184	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	158425481
3065	NC_009937	CGTCAT	2	12	4411540	4411551	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158425483
3066	NC_009937	GCTGGC	2	12	4411564	4411575	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158425483
3067	NC_009937	GCCATC	2	12	4411786	4411797	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158425484
3068	NC_009937	ACCTTC	2	12	4412345	4412356	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	158425485
3069	NC_009937	GACGGT	2	12	4412983	4412994	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158425485
3070	NC_009937	CCGTCG	2	12	4414445	4414456	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158425486
3071	NC_009937	TCGCCC	2	12	4414475	4414486	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	158425486
3072	NC_009937	TCATCG	2	12	4415560	4415571	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158425488
3073	NC_009937	GGGCTG	2	12	4415721	4415732	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	158425488
3074	NC_009937	GGTCGA	2	12	4416898	4416909	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158425489
3075	NC_009937	CTCAGC	2	12	4422425	4422436	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158425495
3076	NC_009937	ATGTGG	2	12	4423884	4423895	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158425497
3077	NC_009937	GCGCCA	2	12	4425721	4425732	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158425499
3078	NC_009937	TCGGGC	2	12	4425834	4425845	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158425499
3079	NC_009937	AGGCGC	2	12	4426066	4426077	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158425499
3080	NC_009937	TCCCTT	2	12	4426995	4427006	0 %	50 %	0 %	50 %	158425500
3081	NC_009937	CGGAGG	2	12	4427096	4427107	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	158425500
3082	NC_009937	GCCGAG	2	12	4438117	4438128	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158425510
3083	NC_009937	GCCATA	2	12	4439292	4439303	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158425511
3084	NC_009937	GAATAG	2	12	4440023	4440034	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	158425512
3085	NC_009937	GAAGGC	2	12	4440373	4440384	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158425512
3086	NC_009937	CACCGG	2	12	4442189	4442200	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158425514
3087	NC_009937	CTGGAA	2	12	4442557	4442568	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158425515
3088	NC_009937	CAAAAA	2	12	4443612	4443623	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	158425515
3089	NC_009937	CAGCGC	2	12	4444318	4444329	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158425516
3090	NC_009937	CCAGCA	2	12	4445191	4445202	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158425517
3091	NC_009937	ATCGCG	2	12	4445928	4445939	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158425517
3092	NC_009937	CGAGCA	2	12	4447518	4447529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158425519
3093	NC_009937	ATCGGC	2	12	4449293	4449304	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158425521
3094	NC_009937	GTGCAC	2	12	4450256	4450267	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158425521
3095	NC_009937	CTTGAG	2	12	4451235	4451246	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158425522
3096	NC_009937	ATCTTG	2	12	4452250	4452261	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158425523
3097	NC_009937	CCTCGT	2	12	4453702	4453713	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	158425525
3098	NC_009937	AGATCG	2	12	4453995	4454006	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158425525
3099	NC_009937	GCCACA	2	12	4456742	4456753	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158425527
3100	NC_009937	TTGCCC	2	12	4457887	4457898	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	158425528
3101	NC_009937	CGGCAG	2	12	4458087	4458098	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158425528
3102	NC_009937	GGCATC	2	12	4458216	4458227	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158425528
3103	NC_009937	AGCTTC	2	12	4460773	4460784	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158425528
3104	NC_009937	AAGCCG	2	12	4461962	4461973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158425529
3105	NC_009937	GGGCGA	2	12	4462491	4462502	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	158425529
3106	NC_009937	GGCAAG	2	12	4462768	4462779	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158425529
3107	NC_009937	AGCGCC	2	12	4465643	4465654	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158425533
3108	NC_009937	CGGCGC	2	12	4466838	4466849	0 %	0 %	50 %	50 %	158425534
3109	NC_009937	CTGCAC	2	12	4469518	4469529	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158425534
3110	NC_009937	TTCGCC	2	12	4470726	4470737	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	158425535
3111	NC_009937	GGCGAG	2	12	4471517	4471528	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	158425536
3112	NC_009937	CGATGG	2	12	4471906	4471917	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158425536
3113	NC_009937	GCGTCA	2	12	4472359	4472370	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158425536
3114	NC_009937	CAGCAC	2	12	4472444	4472455	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158425536
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3129	NC_009937	CACCGC	2	12	4498830	4498841	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158425559
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3208	NC_009937	GCGAAG	2	12	4609036	4609047	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158425664
3209	NC_009937	GATGCC	2	12	4609284	4609295	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158425664
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3211	NC_009937	CCAGCA	2	12	4611517	4611528	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158425665
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3216	NC_009937	GTGCCG	2	12	4614331	4614342	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158425667
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3219	NC_009937	CTGGCC	2	12	4616510	4616521	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158425669
3220	NC_009937	CCCTGC	2	12	4617347	4617358	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	158425670
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3322	NC_009937	CTATGG	2	12	4745396	4745407	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158425788
3323	NC_009937	GCTTCG	2	12	4745437	4745448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158425788
3324	NC_009937	TGAACG	2	12	4745539	4745550	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158425788
3325	NC_009937	GGGCAT	2	12	4746656	4746667	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158425789
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3327	NC_009937	CCAGCG	2	12	4746977	4746988	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158425789
3328	NC_009937	GCTCTC	2	12	4747155	4747166	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	158425789
3329	NC_009937	TCGACC	2	12	4753964	4753975	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158425796
3330	NC_009937	CTCGCG	2	12	4754428	4754439	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158425797
3331	NC_009937	AGGACC	2	12	4754741	4754752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158425797
3332	NC_009937	GCCCTC	2	12	4756820	4756831	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	158425799
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3438	NC_009937	CCGCAG	2	12	4898618	4898629	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158425933
3439	NC_009937	CGCCGG	2	12	4900752	4900763	0 %	0 %	50 %	50 %	158425936
3440	NC_009937	GCGGTC	2	12	4900801	4900812	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158425936
3441	NC_009937	GCCAAG	2	12	4900921	4900932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158425936
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3466	NC_009937	CGCCGG	2	12	4921338	4921349	0 %	0 %	50 %	50 %	158425955
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