MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 3535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009525	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	148659758
2	NC_009525	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	148659759
3	NC_009525	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	148659759
4	NC_009525	GTCGG	2	10	4589	4598	0 %	20 %	60 %	20 %	148659761
5	NC_009525	GCAGC	2	10	7373	7382	20 %	0 %	40 %	40 %	148659763
6	NC_009525	CGGTG	2	10	9281	9290	0 %	20 %	60 %	20 %	148659763
7	NC_009525	CAGAC	2	10	9799	9808	40 %	0 %	20 %	40 %	148659763
8	NC_009525	CGCAA	2	10	10323	10332	40 %	0 %	20 %	40 %	148659764
9	NC_009525	CGGCG	2	10	10449	10458	0 %	0 %	60 %	40 %	148659764
10	NC_009525	ACCCG	2	10	11279	11288	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_009525	TCGAC	2	10	14528	14537	20 %	20 %	20 %	40 %	148659768
12	NC_009525	TCAGC	2	10	14701	14710	20 %	20 %	20 %	40 %	148659769
13	NC_009525	CGACC	2	10	15030	15039	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_009525	GGCGT	2	10	15512	15521	0 %	20 %	60 %	20 %	148659771
15	NC_009525	GGGCC	2	10	15795	15804	0 %	0 %	60 %	40 %	148659771
16	NC_009525	GCGTT	2	10	16540	16549	0 %	40 %	40 %	20 %	148659772
17	NC_009525	CCAGC	2	10	17080	17089	20 %	0 %	20 %	60 %	148659773
18	NC_009525	ACCGA	2	10	17843	17852	40 %	0 %	20 %	40 %	148659773
19	NC_009525	ATCGG	2	10	18235	18244	20 %	20 %	40 %	20 %	148659773
20	NC_009525	CGGCC	2	10	19244	19253	0 %	0 %	40 %	60 %	148659774
21	NC_009525	TTAGC	2	10	20395	20404	20 %	40 %	20 %	20 %	148659775
22	NC_009525	GGTCC	2	10	20467	20476	0 %	20 %	40 %	40 %	148659775
23	NC_009525	GTCGT	2	10	22986	22995	0 %	40 %	40 %	20 %	148659776
24	NC_009525	ATCAC	2	10	25259	25268	40 %	20 %	0 %	40 %	148659779
25	NC_009525	GCCGG	2	10	25946	25955	0 %	0 %	60 %	40 %	148659779
26	NC_009525	CGAGC	2	10	28326	28335	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_009525	GGCAA	2	10	30659	30668	40 %	0 %	40 %	20 %	148659785
28	NC_009525	CGATC	2	10	31485	31494	20 %	20 %	20 %	40 %	148659786
29	NC_009525	CGACG	2	10	33668	33677	20 %	0 %	40 %	40 %	148659789
30	NC_009525	GCGTC	2	10	33723	33732	0 %	20 %	40 %	40 %	148659789
31	NC_009525	GACAC	2	10	33820	33829	40 %	0 %	20 %	40 %	148659789
32	NC_009525	CCGCC	2	10	35166	35175	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
33	NC_009525	TCCTG	2	10	38825	38834	0 %	40 %	20 %	40 %	148659795
34	NC_009525	CTCGG	2	10	38918	38927	0 %	20 %	40 %	40 %	148659795
35	NC_009525	GGCGC	2	10	39461	39470	0 %	0 %	60 %	40 %	148659795
36	NC_009525	TGGCC	2	10	39609	39618	0 %	20 %	40 %	40 %	148659795
37	NC_009525	CGGCG	2	10	40141	40150	0 %	0 %	60 %	40 %	148659795
38	NC_009525	GTCCA	2	10	40753	40762	20 %	20 %	20 %	40 %	148659796
39	NC_009525	GCCAA	2	10	42887	42896	40 %	0 %	20 %	40 %	148659798
40	NC_009525	GCGTC	2	10	43302	43311	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_009525	GCACA	2	10	43686	43695	40 %	0 %	20 %	40 %	148659799
42	NC_009525	GGTAC	2	10	46220	46229	20 %	20 %	40 %	20 %	148659801
43	NC_009525	TCGAA	2	10	46452	46461	40 %	20 %	20 %	20 %	148659801
44	NC_009525	GCACC	2	10	47382	47391	20 %	0 %	20 %	60 %	148659801
45	NC_009525	CGGTG	2	10	48416	48425	0 %	20 %	60 %	20 %	148659802
46	NC_009525	TCATG	2	10	48562	48571	20 %	40 %	20 %	20 %	148659802
47	NC_009525	ATCGG	2	10	48709	48718	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_009525	GCAGC	2	10	49956	49965	20 %	0 %	40 %	40 %	148659804
49	NC_009525	CCCGA	2	10	50039	50048	20 %	0 %	20 %	60 %	148659804
50	NC_009525	CAGCG	2	10	51164	51173	20 %	0 %	40 %	40 %	148659805
51	NC_009525	CTCCC	2	10	57598	57607	0 %	20 %	0 %	80 %	148659811
52	NC_009525	CGGCG	2	10	58047	58056	0 %	0 %	60 %	40 %	148659811
53	NC_009525	CGACC	2	10	59579	59588	20 %	0 %	20 %	60 %	148659813
54	NC_009525	CTTCG	2	10	60266	60275	0 %	40 %	20 %	40 %	148659814
55	NC_009525	CGGTG	2	10	61322	61331	0 %	20 %	60 %	20 %	148659817
56	NC_009525	TCAGG	2	10	63808	63817	20 %	20 %	40 %	20 %	148659818
57	NC_009525	TGCCG	2	10	66839	66848	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_009525	GGCGA	2	10	67771	67780	20 %	0 %	60 %	20 %	148659822
59	NC_009525	GGTGT	2	10	70347	70356	0 %	40 %	60 %	0 %	148659824
60	NC_009525	ATCGG	2	10	70984	70993	20 %	20 %	40 %	20 %	148659824
61	NC_009525	CCGCG	2	10	71521	71530	0 %	0 %	40 %	60 %	148659824
62	NC_009525	GGCAA	2	10	71872	71881	40 %	0 %	40 %	20 %	148659824
63	NC_009525	CGACC	2	10	72161	72170	20 %	0 %	20 %	60 %	148659824
64	NC_009525	CGGGT	2	10	72615	72624	0 %	20 %	60 %	20 %	148659824
65	NC_009525	GGTCG	2	10	72675	72684	0 %	20 %	60 %	20 %	148659824
66	NC_009525	TGCCT	2	10	73379	73388	0 %	40 %	20 %	40 %	148659825
67	NC_009525	GTCCA	2	10	74250	74259	20 %	20 %	20 %	40 %	148659826
68	NC_009525	TGACC	2	10	76874	76883	20 %	20 %	20 %	40 %	148659828
69	NC_009525	GCCAA	2	10	77188	77197	40 %	0 %	20 %	40 %	148659828
70	NC_009525	GTCGC	2	10	77265	77274	0 %	20 %	40 %	40 %	148659828
71	NC_009525	GCGCG	2	10	78353	78362	0 %	0 %	60 %	40 %	148659829
72	NC_009525	CACGA	2	10	81210	81219	40 %	0 %	20 %	40 %	148659831
73	NC_009525	GCACC	2	10	81650	81659	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
74	NC_009525	CCACC	2	10	81843	81852	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
75	NC_009525	GAGCA	2	10	83748	83757	40 %	0 %	40 %	20 %	148659833
76	NC_009525	GCCGG	2	10	83847	83856	0 %	0 %	60 %	40 %	148659833
77	NC_009525	GCGAC	2	10	83923	83932	20 %	0 %	40 %	40 %	148659833
78	NC_009525	ATCCG	2	10	84693	84702	20 %	20 %	20 %	40 %	148659834
79	NC_009525	CACCG	2	10	85473	85482	20 %	0 %	20 %	60 %	148659835
80	NC_009525	TGGTC	2	10	87608	87617	0 %	40 %	40 %	20 %	148659837
81	NC_009525	GCTGG	2	10	88245	88254	0 %	20 %	60 %	20 %	148659838
82	NC_009525	TGGGT	2	10	91283	91292	0 %	40 %	60 %	0 %	148659844
83	NC_009525	TCGCC	2	10	91490	91499	0 %	20 %	20 %	60 %	148659844
84	NC_009525	GGGCC	2	10	92463	92472	0 %	0 %	60 %	40 %	148659845
85	NC_009525	GGCCG	2	10	93782	93791	0 %	0 %	60 %	40 %	148659846
86	NC_009525	GCGCC	2	10	94434	94443	0 %	0 %	40 %	60 %	148659846
87	NC_009525	GCTTG	2	10	96466	96475	0 %	40 %	40 %	20 %	148659848
88	NC_009525	CGTGT	2	10	96898	96907	0 %	40 %	40 %	20 %	148659849
89	NC_009525	AGATC	2	10	96977	96986	40 %	20 %	20 %	20 %	148659849
90	NC_009525	CGGCG	2	10	100558	100567	0 %	0 %	60 %	40 %	148659852
91	NC_009525	CGGCG	2	10	100685	100694	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
92	NC_009525	GCGGT	2	10	101634	101643	0 %	20 %	60 %	20 %	148659853
93	NC_009525	GGTGA	2	10	101852	101861	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009525	GCGCC	2	10	104466	104475	0 %	0 %	40 %	60 %	148659855
95	NC_009525	GGTGG	2	10	105154	105163	0 %	20 %	80 %	0 %	148659856
96	NC_009525	GGCTT	2	10	106167	106176	0 %	40 %	40 %	20 %	148659857
97	NC_009525	CTGGC	2	10	106889	106898	0 %	20 %	40 %	40 %	148659858
98	NC_009525	GCACA	2	10	108010	108019	40 %	0 %	20 %	40 %	148659858
99	NC_009525	CTGAA	2	10	110340	110349	40 %	20 %	20 %	20 %	148659861
100	NC_009525	ATCGC	2	10	110835	110844	20 %	20 %	20 %	40 %	148659861
101	NC_009525	TCTGA	2	10	112169	112178	20 %	40 %	20 %	20 %	148659864
102	NC_009525	CGGTC	2	10	112444	112453	0 %	20 %	40 %	40 %	148659864
103	NC_009525	GACCA	2	10	113582	113591	40 %	0 %	20 %	40 %	148659864
104	NC_009525	GGCTG	2	10	116146	116155	0 %	20 %	60 %	20 %	148659864
105	NC_009525	CCGCG	2	10	120066	120075	0 %	0 %	40 %	60 %	148659865
106	NC_009525	TCGTG	2	10	124019	124028	0 %	40 %	40 %	20 %	148659867
107	NC_009525	GCACG	2	10	125674	125683	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_009525	CCGGA	2	10	125800	125809	20 %	0 %	40 %	40 %	148659869
109	NC_009525	TGCGC	2	10	128272	128281	0 %	20 %	40 %	40 %	148659870
110	NC_009525	GCGAG	2	10	128783	128792	20 %	0 %	60 %	20 %	148659870
111	NC_009525	GGGGT	2	10	129792	129801	0 %	20 %	80 %	0 %	148659870
112	NC_009525	CCCAC	2	10	130354	130363	20 %	0 %	0 %	80 %	148659870
113	NC_009525	CCGGC	2	10	130864	130873	0 %	0 %	40 %	60 %	148659870
114	NC_009525	TGCGG	2	10	131274	131283	0 %	20 %	60 %	20 %	148659870
115	NC_009525	ATCAC	2	10	132753	132762	40 %	20 %	0 %	40 %	148659872
116	NC_009525	ATCGG	2	10	132801	132810	20 %	20 %	40 %	20 %	148659872
117	NC_009525	CGGGC	2	10	133892	133901	0 %	0 %	60 %	40 %	148659872
118	NC_009525	GCGAT	2	10	135697	135706	20 %	20 %	40 %	20 %	148659874
119	NC_009525	GTTCG	2	10	135918	135927	0 %	40 %	40 %	20 %	148659874
120	NC_009525	CCTGG	2	10	136310	136319	0 %	20 %	40 %	40 %	148659874
121	NC_009525	GGCCC	2	10	136416	136425	0 %	0 %	40 %	60 %	148659874
122	NC_009525	CGTTG	2	10	136928	136937	0 %	40 %	40 %	20 %	148659874
123	NC_009525	CGACC	2	10	137000	137009	20 %	0 %	20 %	60 %	148659874
124	NC_009525	GAGAT	2	10	140020	140029	40 %	20 %	40 %	0 %	148659878
125	NC_009525	CGGCG	2	10	142174	142183	0 %	0 %	60 %	40 %	148659880
126	NC_009525	TGCGG	2	10	142807	142816	0 %	20 %	60 %	20 %	148659881
127	NC_009525	CGCTG	2	10	143514	143523	0 %	20 %	40 %	40 %	148659882
128	NC_009525	GTTGC	2	10	144060	144069	0 %	40 %	40 %	20 %	148659882
129	NC_009525	CCGAT	2	10	144808	144817	20 %	20 %	20 %	40 %	148659882
130	NC_009525	ATCGC	2	10	145499	145508	20 %	20 %	20 %	40 %	148659883
131	NC_009525	AACCG	2	10	146238	146247	40 %	0 %	20 %	40 %	148659883
132	NC_009525	CCGCC	2	10	146825	146834	0 %	0 %	20 %	80 %	148659883
133	NC_009525	CCGCC	2	10	147468	147477	0 %	0 %	20 %	80 %	148659884
134	NC_009525	GGGTC	2	10	149222	149231	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
135	NC_009525	ATCGG	2	10	150952	150961	20 %	20 %	40 %	20 %	148659888
136	NC_009525	ATTGG	2	10	153607	153616	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009525	AGCGA	2	10	155510	155519	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_009525	AGCGA	2	10	155563	155572	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_009525	TCGTC	2	10	155910	155919	0 %	40 %	20 %	40 %	148659891
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150	NC_009525	GCCGG	2	10	163211	163220	0 %	0 %	60 %	40 %	148659898
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250	NC_009525	CGGCC	2	10	303505	303514	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
251	NC_009525	TGCGC	2	10	303552	303561	0 %	20 %	40 %	40 %	148660016
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256	NC_009525	TGCCA	2	10	312165	312174	20 %	20 %	20 %	40 %	148660024
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262	NC_009525	CGCAG	2	10	315982	315991	20 %	0 %	40 %	40 %	148660027
263	NC_009525	GGCCG	2	10	316297	316306	0 %	0 %	60 %	40 %	148660028
264	NC_009525	GCCCG	2	10	316795	316804	0 %	0 %	40 %	60 %	148660028
265	NC_009525	TCGGC	2	10	317823	317832	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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302	NC_009525	TCGCA	2	10	387422	387431	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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379	NC_009525	CCCGG	2	10	481077	481086	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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387	NC_009525	GGGTG	2	10	490760	490769	0 %	20 %	80 %	0 %	148660170
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393	NC_009525	CGCAA	2	10	494081	494090	40 %	0 %	20 %	40 %	148660173
394	NC_009525	ATCGA	2	10	495902	495911	40 %	20 %	20 %	20 %	148660174
395	NC_009525	GCCGT	2	10	496704	496713	0 %	20 %	40 %	40 %	148660175
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