MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 3535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009525	CGGCC	2	10	3122981	3122990	0 %	0 %	40 %	60 %	148662644
2502	NC_009525	GGCCG	2	10	3124480	3124489	0 %	0 %	60 %	40 %	148662646
2503	NC_009525	ACCCG	3	15	3124496	3124510	20 %	0 %	20 %	60 %	148662646
2504	NC_009525	ATCCG	2	10	3124598	3124607	20 %	20 %	20 %	40 %	148662646
2505	NC_009525	GCAGT	2	10	3127742	3127751	20 %	20 %	40 %	20 %	148662652
2506	NC_009525	TGAGC	2	10	3128160	3128169	20 %	20 %	40 %	20 %	148662653
2507	NC_009525	CGGGT	2	10	3128380	3128389	0 %	20 %	60 %	20 %	148662653
2508	NC_009525	GCGGT	2	10	3128470	3128479	0 %	20 %	60 %	20 %	148662653
2509	NC_009525	TGGGC	2	10	3129153	3129162	0 %	20 %	60 %	20 %	148662654
2510	NC_009525	GCAAC	2	10	3129181	3129190	40 %	0 %	20 %	40 %	148662654
2511	NC_009525	CACCG	2	10	3130030	3130039	20 %	0 %	20 %	60 %	148662654
2512	NC_009525	ATGCC	2	10	3130757	3130766	20 %	20 %	20 %	40 %	148662655
2513	NC_009525	ACACC	2	10	3131005	3131014	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2514	NC_009525	TGTGG	2	10	3131357	3131366	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_009525	GTCGT	2	10	3132153	3132162	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2516	NC_009525	GCTGA	2	10	3132365	3132374	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2517	NC_009525	TCGAC	2	10	3133397	3133406	20 %	20 %	20 %	40 %	148662656
2518	NC_009525	TCAGC	2	10	3133570	3133579	20 %	20 %	20 %	40 %	148662657
2519	NC_009525	GCTGA	2	10	3133969	3133978	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2520	NC_009525	CTTAT	2	10	3135686	3135695	20 %	60 %	0 %	20 %	148662658
2521	NC_009525	CGATT	2	10	3136113	3136122	20 %	40 %	20 %	20 %	148662659
2522	NC_009525	CGACG	2	10	3139529	3139538	20 %	0 %	40 %	40 %	148662662
2523	NC_009525	GCCGC	2	10	3139906	3139915	0 %	0 %	40 %	60 %	148662662
2524	NC_009525	TCGGC	2	10	3142278	3142287	0 %	20 %	40 %	40 %	148662665
2525	NC_009525	CGCAG	2	10	3143517	3143526	20 %	0 %	40 %	40 %	148662665
2526	NC_009525	CGCGC	2	10	3143945	3143954	0 %	0 %	40 %	60 %	148662666
2527	NC_009525	ACCGA	2	10	3144813	3144822	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2528	NC_009525	ACTAT	2	10	3147498	3147507	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2529	NC_009525	GTCGG	2	10	3148352	3148361	0 %	20 %	60 %	20 %	148662671
2530	NC_009525	CAAGC	2	10	3148860	3148869	40 %	0 %	20 %	40 %	148662671
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2532	NC_009525	GCCGC	2	10	3156043	3156052	0 %	0 %	40 %	60 %	148662678
2533	NC_009525	AGCGA	2	10	3157293	3157302	40 %	0 %	40 %	20 %	148662680
2534	NC_009525	GCCTT	2	10	3157569	3157578	0 %	40 %	20 %	40 %	148662680
2535	NC_009525	CGGGC	2	10	3159325	3159334	0 %	0 %	60 %	40 %	148662680
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2537	NC_009525	GGGGT	2	10	3159473	3159482	0 %	20 %	80 %	0 %	148662680
2538	NC_009525	CTGTT	2	10	3159968	3159977	0 %	60 %	20 %	20 %	148662681
2539	NC_009525	CCCCG	2	10	3160123	3160132	0 %	0 %	20 %	80 %	148662681
2540	NC_009525	ACCGG	2	10	3165209	3165218	20 %	0 %	40 %	40 %	148662687
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2542	NC_009525	CCGGC	2	10	3168116	3168125	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2543	NC_009525	CACCG	2	10	3168185	3168194	20 %	0 %	20 %	60 %	148662689
2544	NC_009525	AGCAG	2	10	3169164	3169173	40 %	0 %	40 %	20 %	148662689
2545	NC_009525	GGCCG	2	10	3169339	3169348	0 %	0 %	60 %	40 %	148662689
2546	NC_009525	GCCAC	2	10	3170161	3170170	20 %	0 %	20 %	60 %	148662691
2547	NC_009525	CCGGC	2	10	3170354	3170363	0 %	0 %	40 %	60 %	148662691
2548	NC_009525	GTTCG	2	10	3173961	3173970	0 %	40 %	40 %	20 %	148662693
2549	NC_009525	CACAC	2	10	3176292	3176301	40 %	0 %	0 %	60 %	148662695
2550	NC_009525	CGATC	2	10	3177460	3177469	20 %	20 %	20 %	40 %	148662696
2551	NC_009525	CGCAT	2	10	3177857	3177866	20 %	20 %	20 %	40 %	148662696
2552	NC_009525	TCTGC	2	10	3178174	3178183	0 %	40 %	20 %	40 %	148662696
2553	NC_009525	GTTGG	2	10	3179626	3179635	0 %	40 %	60 %	0 %	148662697
2554	NC_009525	CGCTG	2	10	3181893	3181902	0 %	20 %	40 %	40 %	148662701
2555	NC_009525	CGCTG	2	10	3182603	3182612	0 %	20 %	40 %	40 %	148662701
2556	NC_009525	GCACG	2	10	3182931	3182940	20 %	0 %	40 %	40 %	148662702
2557	NC_009525	GACCG	2	10	3188202	3188211	20 %	0 %	40 %	40 %	148662707
2558	NC_009525	GTGCC	2	10	3188702	3188711	0 %	20 %	40 %	40 %	148662707
2559	NC_009525	GCGTG	2	10	3190305	3190314	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2560	NC_009525	CCGAG	2	10	3190781	3190790	20 %	0 %	40 %	40 %	148662710
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2563	NC_009525	GCCGC	2	10	3194574	3194583	0 %	0 %	40 %	60 %	148662713
2564	NC_009525	TGCGG	2	10	3195225	3195234	0 %	20 %	60 %	20 %	148662714
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2569	NC_009525	GTTCT	2	10	3205333	3205342	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2570	NC_009525	ACTTG	2	10	3206160	3206169	20 %	40 %	20 %	20 %	148662729
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2573	NC_009525	CGGCA	2	10	3207183	3207192	20 %	0 %	40 %	40 %	148662729
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2583	NC_009525	GACCC	2	10	3217240	3217249	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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2592	NC_009525	AATCG	2	10	3241856	3241865	40 %	20 %	20 %	20 %	148662762
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2598	NC_009525	CGGCG	2	10	3252082	3252091	0 %	0 %	60 %	40 %	148662771
2599	NC_009525	TCGCC	2	10	3252222	3252231	0 %	20 %	20 %	60 %	148662771
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2607	NC_009525	GACGC	2	10	3261337	3261346	20 %	0 %	40 %	40 %	148662777
2608	NC_009525	TGCAG	2	10	3261890	3261899	20 %	20 %	40 %	20 %	148662777
2609	NC_009525	CAGGG	2	10	3262379	3262388	20 %	0 %	60 %	20 %	148662777
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2871	NC_009525	CGTCG	2	10	3567585	3567594	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2872	NC_009525	AGCGA	2	10	3567822	3567831	40 %	0 %	40 %	20 %	148663045
2873	NC_009525	GGACC	2	10	3568412	3568421	20 %	0 %	40 %	40 %	148663046
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2998	NC_009525	GTCGA	2	10	3721663	3721672	20 %	20 %	40 %	20 %	148663190
2999	NC_009525	TCAGA	2	10	3722540	3722549	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3000	NC_009525	ACGTC	2	10	3724576	3724585	20 %	20 %	20 %	40 %	148663192

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