MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 3535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009525	CGTGG	2	10	4375562	4375571	0 %	20 %	60 %	20 %	148663752
3502	NC_009525	CGCGG	2	10	4375664	4375673	0 %	0 %	60 %	40 %	148663752
3503	NC_009525	GGATG	2	10	4377129	4377138	20 %	20 %	60 %	0 %	148663753
3504	NC_009525	CGGCG	2	10	4378095	4378104	0 %	0 %	60 %	40 %	148663753
3505	NC_009525	CGTGC	2	10	4378212	4378221	0 %	20 %	40 %	40 %	148663753
3506	NC_009525	TGAAA	2	10	4380968	4380977	60 %	20 %	20 %	0 %	148663755
3507	NC_009525	CACAC	2	10	4381247	4381256	40 %	0 %	0 %	60 %	148663756
3508	NC_009525	GTCGC	2	10	4381849	4381858	0 %	20 %	40 %	40 %	148663756
3509	NC_009525	ACCAG	2	10	4382675	4382684	40 %	0 %	20 %	40 %	148663758
3510	NC_009525	GCTGA	2	10	4383425	4383434	20 %	20 %	40 %	20 %	148663759
3511	NC_009525	GGCGA	2	10	4387036	4387045	20 %	0 %	60 %	20 %	148663761
3512	NC_009525	GCCGC	2	10	4387526	4387535	0 %	0 %	40 %	60 %	148663761
3513	NC_009525	GACCA	2	10	4391332	4391341	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3514	NC_009525	CGTCG	2	10	4391487	4391496	0 %	20 %	40 %	40 %	148663764
3515	NC_009525	GCCGG	2	10	4392397	4392406	0 %	0 %	60 %	40 %	148663765
3516	NC_009525	CCAGG	2	10	4392641	4392650	20 %	0 %	40 %	40 %	148663766
3517	NC_009525	CCGGC	2	10	4393564	4393573	0 %	0 %	40 %	60 %	148663766
3518	NC_009525	CAGCG	2	10	4395123	4395132	20 %	0 %	40 %	40 %	148663768
3519	NC_009525	TATCT	2	10	4395747	4395756	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3520	NC_009525	GCCAC	2	10	4398404	4398413	20 %	0 %	20 %	60 %	148663770
3521	NC_009525	AGCCC	2	10	4402759	4402768	20 %	0 %	20 %	60 %	148663776
3522	NC_009525	CTGGC	2	10	4404220	4404229	0 %	20 %	40 %	40 %	148663776
3523	NC_009525	GCCGT	2	10	4405003	4405012	0 %	20 %	40 %	40 %	148663776
3524	NC_009525	CCCGT	2	10	4408274	4408283	0 %	20 %	20 %	60 %	148663777
3525	NC_009525	CGGCC	2	10	4408460	4408469	0 %	0 %	40 %	60 %	148663777
3526	NC_009525	CCGGG	2	10	4408598	4408607	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3527	NC_009525	CGGAC	2	10	4408987	4408996	20 %	0 %	40 %	40 %	148663778
3528	NC_009525	CCGCC	2	10	4410177	4410186	0 %	0 %	20 %	80 %	148663780
3529	NC_009525	CCGCG	2	10	4411646	4411655	0 %	0 %	40 %	60 %	148663782
3530	NC_009525	TGCGC	2	10	4411666	4411675	0 %	20 %	40 %	40 %	148663782
3531	NC_009525	CTGCG	2	10	4412441	4412450	0 %	20 %	40 %	40 %	148663782
3532	NC_009525	GTCGC	2	10	4414122	4414131	0 %	20 %	40 %	40 %	148663784
3533	NC_009525	TCCGG	2	10	4414242	4414251	0 %	20 %	40 %	40 %	148663784
3534	NC_009525	CGCGC	2	10	4415005	4415014	0 %	0 %	40 %	60 %	148663785
3535	NC_009525	CCGAG	2	10	4418920	4418929	20 %	0 %	40 %	40 %	148663790

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.