MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 3453

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009484	CGGCT	2	10	1158	1167	0 %	20 %	40 %	40 %	148259022
2	NC_009484	CGCGC	2	10	5558	5567	0 %	0 %	40 %	60 %	148259027
3	NC_009484	CCGGC	2	10	5841	5850	0 %	0 %	40 %	60 %	148259027
4	NC_009484	CGGGC	2	10	6925	6934	0 %	0 %	60 %	40 %	148259027
5	NC_009484	TGACG	2	10	7537	7546	20 %	20 %	40 %	20 %	148259027
6	NC_009484	GGGCA	2	10	8046	8055	20 %	0 %	60 %	20 %	148259028
7	NC_009484	CCGCG	2	10	9774	9783	0 %	0 %	40 %	60 %	148259029
8	NC_009484	CGCGG	2	10	11063	11072	0 %	0 %	60 %	40 %	148259031
9	NC_009484	CGCCC	2	10	11599	11608	0 %	0 %	20 %	80 %	148259031
10	NC_009484	CGCGG	2	10	11714	11723	0 %	0 %	60 %	40 %	148259031
11	NC_009484	CGACC	2	10	13158	13167	20 %	0 %	20 %	60 %	148259034
12	NC_009484	CTGAT	2	10	13536	13545	20 %	40 %	20 %	20 %	148259034
13	NC_009484	GGGCA	2	10	14699	14708	20 %	0 %	60 %	20 %	148259036
14	NC_009484	GATTC	2	10	14731	14740	20 %	40 %	20 %	20 %	148259037
15	NC_009484	GATGA	2	10	15633	15642	40 %	20 %	40 %	0 %	148259038
16	NC_009484	CGCGG	2	10	15701	15710	0 %	0 %	60 %	40 %	148259039
17	NC_009484	GATCT	2	10	16029	16038	20 %	40 %	20 %	20 %	148259039
18	NC_009484	GCGCC	2	10	17084	17093	0 %	0 %	40 %	60 %	148259041
19	NC_009484	TGCCG	2	10	17264	17273	0 %	20 %	40 %	40 %	148259041
20	NC_009484	GGTCG	2	10	18261	18270	0 %	20 %	60 %	20 %	148259041
21	NC_009484	CGCCT	2	10	19487	19496	0 %	20 %	20 %	60 %	148259043
22	NC_009484	ATCAC	2	10	19563	19572	40 %	20 %	0 %	40 %	148259043
23	NC_009484	GGCCG	2	10	19585	19594	0 %	0 %	60 %	40 %	148259043
24	NC_009484	CCGGC	2	10	20141	20150	0 %	0 %	40 %	60 %	148259044
25	NC_009484	GCCGC	2	10	21467	21476	0 %	0 %	40 %	60 %	148259044
26	NC_009484	CCGGC	2	10	22428	22437	0 %	0 %	40 %	60 %	148259045
27	NC_009484	GCCGC	2	10	22680	22689	0 %	0 %	40 %	60 %	148259046
28	NC_009484	TGCGC	2	10	22693	22702	0 %	20 %	40 %	40 %	148259046
29	NC_009484	AGCGC	2	10	26774	26783	20 %	0 %	40 %	40 %	148259050
30	NC_009484	CGGCG	2	10	27534	27543	0 %	0 %	60 %	40 %	148259050
31	NC_009484	CCGCG	2	10	29573	29582	0 %	0 %	40 %	60 %	148259052
32	NC_009484	CGACC	2	10	31927	31936	20 %	0 %	20 %	60 %	148259055
33	NC_009484	CGCGC	2	10	32333	32342	0 %	0 %	40 %	60 %	148259055
34	NC_009484	GCCGG	2	10	35105	35114	0 %	0 %	60 %	40 %	148259058
35	NC_009484	GCATC	2	10	35116	35125	20 %	20 %	20 %	40 %	148259058
36	NC_009484	GGACG	2	10	35437	35446	20 %	0 %	60 %	20 %	148259058
37	NC_009484	GCGCC	2	10	35570	35579	0 %	0 %	40 %	60 %	148259058
38	NC_009484	CGCCC	2	10	35686	35695	0 %	0 %	20 %	80 %	148259058
39	NC_009484	GCGCC	2	10	36064	36073	0 %	0 %	40 %	60 %	148259058
40	NC_009484	TCGAC	2	10	36638	36647	20 %	20 %	20 %	40 %	148259059
41	NC_009484	CGCGC	2	10	37002	37011	0 %	0 %	40 %	60 %	148259059
42	NC_009484	CCGGG	2	10	37125	37134	0 %	0 %	60 %	40 %	148259059
43	NC_009484	CACGG	2	10	37369	37378	20 %	0 %	40 %	40 %	148259059
44	NC_009484	CCGGG	2	10	38079	38088	0 %	0 %	60 %	40 %	148259059
45	NC_009484	GACCG	2	10	39784	39793	20 %	0 %	40 %	40 %	148259062
46	NC_009484	CGGCG	2	10	40309	40318	0 %	0 %	60 %	40 %	148259062
47	NC_009484	GGCCG	2	10	41590	41599	0 %	0 %	60 %	40 %	148259064
48	NC_009484	AGCCG	2	10	42243	42252	20 %	0 %	40 %	40 %	148259064
49	NC_009484	CAATG	2	10	42748	42757	40 %	20 %	20 %	20 %	148259064
50	NC_009484	CGCGC	2	10	43665	43674	0 %	0 %	40 %	60 %	148259065
51	NC_009484	GGGGA	2	10	45246	45255	20 %	0 %	80 %	0 %	148259066
52	NC_009484	CGGTC	2	10	45628	45637	0 %	20 %	40 %	40 %	148259066
53	NC_009484	GCCGG	2	10	47636	47645	0 %	0 %	60 %	40 %	148259069
54	NC_009484	CGCGG	2	10	47671	47680	0 %	0 %	60 %	40 %	148259069
55	NC_009484	CGGCG	3	15	47887	47901	0 %	0 %	60 %	40 %	148259069
56	NC_009484	GCCGC	2	10	48309	48318	0 %	0 %	40 %	60 %	148259069
57	NC_009484	GCCGC	2	10	51559	51568	0 %	0 %	40 %	60 %	148259072
58	NC_009484	TCGGC	2	10	51794	51803	0 %	20 %	40 %	40 %	148259072
59	NC_009484	CGGCG	2	10	52110	52119	0 %	0 %	60 %	40 %	148259072
60	NC_009484	TCGGC	2	10	53228	53237	0 %	20 %	40 %	40 %	148259072
61	NC_009484	TGCGA	2	10	53572	53581	20 %	20 %	40 %	20 %	148259072
62	NC_009484	GCTGG	2	10	54368	54377	0 %	20 %	60 %	20 %	148259073
63	NC_009484	GCCGC	2	10	54620	54629	0 %	0 %	40 %	60 %	148259074
64	NC_009484	GGCCG	2	10	57493	57502	0 %	0 %	60 %	40 %	148259076
65	NC_009484	GCGCG	2	10	58997	59006	0 %	0 %	60 %	40 %	148259078
66	NC_009484	TCCCG	2	10	59162	59171	0 %	20 %	20 %	60 %	148259078
67	NC_009484	GCCGG	2	10	62661	62670	0 %	0 %	60 %	40 %	148259080
68	NC_009484	TCGGC	2	10	62992	63001	0 %	20 %	40 %	40 %	148259080
69	NC_009484	TCGGT	2	10	64635	64644	0 %	40 %	40 %	20 %	148259081
70	NC_009484	GCCGA	2	10	64805	64814	20 %	0 %	40 %	40 %	148259081
71	NC_009484	CGGCG	2	10	65029	65038	0 %	0 %	60 %	40 %	148259082
72	NC_009484	ACCGG	2	10	68383	68392	20 %	0 %	40 %	40 %	148259084
73	NC_009484	GGGGC	2	10	68926	68935	0 %	0 %	80 %	20 %	148259085
74	NC_009484	CCGCC	2	10	70097	70106	0 %	0 %	20 %	80 %	148259086
75	NC_009484	CGGGA	2	10	70449	70458	20 %	0 %	60 %	20 %	148259086
76	NC_009484	CGCGG	2	10	70577	70586	0 %	0 %	60 %	40 %	148259086
77	NC_009484	GGCGA	2	10	70770	70779	20 %	0 %	60 %	20 %	148259086
78	NC_009484	TGCCG	2	10	70876	70885	0 %	20 %	40 %	40 %	148259086
79	NC_009484	GCCTC	2	10	70947	70956	0 %	20 %	20 %	60 %	148259087
80	NC_009484	GCCGC	2	10	73931	73940	0 %	0 %	40 %	60 %	148259089
81	NC_009484	CCGCG	2	10	74780	74789	0 %	0 %	40 %	60 %	148259090
82	NC_009484	GGGTG	2	10	75835	75844	0 %	20 %	80 %	0 %	148259091
83	NC_009484	CATCG	2	10	76120	76129	20 %	20 %	20 %	40 %	148259091
84	NC_009484	GGGTG	2	10	77145	77154	0 %	20 %	80 %	0 %	148259092
85	NC_009484	TGGGG	2	10	77636	77645	0 %	20 %	80 %	0 %	148259092
86	NC_009484	GCGCG	2	10	78117	78126	0 %	0 %	60 %	40 %	148259092
87	NC_009484	AGGCG	2	10	79928	79937	20 %	0 %	60 %	20 %	148259094
88	NC_009484	CGGCG	2	10	82151	82160	0 %	0 %	60 %	40 %	148259097
89	NC_009484	CCGCG	2	10	85934	85943	0 %	0 %	40 %	60 %	148259099
90	NC_009484	AATGA	2	10	86228	86237	60 %	20 %	20 %	0 %	148259099
91	NC_009484	TCGCG	2	10	88737	88746	0 %	20 %	40 %	40 %	148259103
92	NC_009484	TGATC	2	10	88986	88995	20 %	40 %	20 %	20 %	148259103
93	NC_009484	GTCGA	2	10	89107	89116	20 %	20 %	40 %	20 %	148259103
94	NC_009484	GAGCG	2	10	89884	89893	20 %	0 %	60 %	20 %	148259104
95	NC_009484	CGTGC	2	10	91203	91212	0 %	20 %	40 %	40 %	148259105
96	NC_009484	GGCGG	2	10	91313	91322	0 %	0 %	80 %	20 %	148259105
97	NC_009484	GGGCC	2	10	91493	91502	0 %	0 %	60 %	40 %	148259105
98	NC_009484	CCGGC	2	10	91800	91809	0 %	0 %	40 %	60 %	148259105
99	NC_009484	GAGCC	2	10	92667	92676	20 %	0 %	40 %	40 %	148259105
100	NC_009484	CGGGG	2	10	92905	92914	0 %	0 %	80 %	20 %	148259105
101	NC_009484	CAGGG	2	10	93143	93152	20 %	0 %	60 %	20 %	148259105
102	NC_009484	GTGCT	2	10	96757	96766	0 %	40 %	40 %	20 %	148259108
103	NC_009484	CCGCG	2	10	98184	98193	0 %	0 %	40 %	60 %	148259110
104	NC_009484	TCCGT	2	10	99452	99461	0 %	40 %	20 %	40 %	148259111
105	NC_009484	GTTTC	2	10	100052	100061	0 %	60 %	20 %	20 %	148259111
106	NC_009484	GCTGC	2	10	102722	102731	0 %	20 %	40 %	40 %	148259113
107	NC_009484	GGAGG	2	10	103112	103121	20 %	0 %	80 %	0 %	148259113
108	NC_009484	CTGAA	2	10	104048	104057	40 %	20 %	20 %	20 %	148259113
109	NC_009484	GCCGT	2	10	104628	104637	0 %	20 %	40 %	40 %	148259114
110	NC_009484	CCCGG	2	10	105369	105378	0 %	0 %	40 %	60 %	148259115
111	NC_009484	CCGGC	2	10	106777	106786	0 %	0 %	40 %	60 %	148259116
112	NC_009484	ACCGG	2	10	108726	108735	20 %	0 %	40 %	40 %	148259119
113	NC_009484	CCCGG	2	10	110511	110520	0 %	0 %	40 %	60 %	148259121
114	NC_009484	GCGCA	3	15	111686	111700	20 %	0 %	40 %	40 %	148259122
115	NC_009484	ATCAG	2	10	116710	116719	40 %	20 %	20 %	20 %	148259128
116	NC_009484	AGGGA	2	10	119012	119021	40 %	0 %	60 %	0 %	148259129
117	NC_009484	GCGAT	2	10	119582	119591	20 %	20 %	40 %	20 %	148259129
118	NC_009484	CGTTC	2	10	120795	120804	0 %	40 %	20 %	40 %	148259130
119	NC_009484	GGGGA	2	10	122882	122891	20 %	0 %	80 %	0 %	148259132
120	NC_009484	TGGCC	2	10	124989	124998	0 %	20 %	40 %	40 %	148259134
121	NC_009484	CCGGG	2	10	125782	125791	0 %	0 %	60 %	40 %	148259134
122	NC_009484	TGGAA	2	10	126112	126121	40 %	20 %	40 %	0 %	148259135
123	NC_009484	GATCG	2	10	129395	129404	20 %	20 %	40 %	20 %	148259137
124	NC_009484	CGGCG	2	10	130754	130763	0 %	0 %	60 %	40 %	148259138
125	NC_009484	GCATC	2	10	131680	131689	20 %	20 %	20 %	40 %	148259139
126	NC_009484	CCAGC	2	10	132558	132567	20 %	0 %	20 %	60 %	148259140
127	NC_009484	GCGCC	2	10	133056	133065	0 %	0 %	40 %	60 %	148259140
128	NC_009484	CCATG	2	10	136415	136424	20 %	20 %	20 %	40 %	148259144
129	NC_009484	GGGCG	2	10	137127	137136	0 %	0 %	80 %	20 %	148259144
130	NC_009484	GCCGC	2	10	137767	137776	0 %	0 %	40 %	60 %	148259145
131	NC_009484	GCCGG	2	10	139598	139607	0 %	0 %	60 %	40 %	148259147
132	NC_009484	CGGGC	2	10	140553	140562	0 %	0 %	60 %	40 %	148259148
133	NC_009484	AGGGC	2	10	141698	141707	20 %	0 %	60 %	20 %	148259149
134	NC_009484	TCCGT	2	10	142415	142424	0 %	40 %	20 %	40 %	148259150
135	NC_009484	GCCGC	2	10	146635	146644	0 %	0 %	40 %	60 %	148259152
136	NC_009484	GGCCG	2	10	147209	147218	0 %	0 %	60 %	40 %	148259152
137	NC_009484	GTCAT	2	10	147888	147897	20 %	40 %	20 %	20 %	148259153
138	NC_009484	TTGCG	2	10	149996	150005	0 %	40 %	40 %	20 %	148259153
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140	NC_009484	AGCGC	2	10	155321	155330	20 %	0 %	40 %	40 %	148259156
141	NC_009484	TTGCG	2	10	155911	155920	0 %	40 %	40 %	20 %	148259156
142	NC_009484	GCCGC	2	10	156750	156759	0 %	0 %	40 %	60 %	148259157
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151	NC_009484	CGCCT	2	10	164543	164552	0 %	20 %	20 %	60 %	148259164
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155	NC_009484	CTGCG	2	10	168108	168117	0 %	20 %	40 %	40 %	148259167
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158	NC_009484	CCCGG	2	10	169472	169481	0 %	0 %	40 %	60 %	148259169
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