MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 3453

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009484	CGGGC	2	10	481865	481874	0 %	0 %	60 %	40 %	148259443
502	NC_009484	CCAGA	2	10	482215	482224	40 %	0 %	20 %	40 %	148259443
503	NC_009484	TCGAT	2	10	483721	483730	20 %	40 %	20 %	20 %	148259446
504	NC_009484	TGCGT	2	10	486260	486269	0 %	40 %	40 %	20 %	148259449
505	NC_009484	GCGTG	2	10	487031	487040	0 %	20 %	60 %	20 %	148259450
506	NC_009484	GCGAG	2	10	488155	488164	20 %	0 %	60 %	20 %	148259452
507	NC_009484	GGGCG	2	10	488269	488278	0 %	0 %	80 %	20 %	148259452
508	NC_009484	GAGGG	2	10	491205	491214	20 %	0 %	80 %	0 %	148259455
509	NC_009484	CTGGG	2	10	492220	492229	0 %	20 %	60 %	20 %	148259456
510	NC_009484	CCGAC	2	10	493317	493326	20 %	0 %	20 %	60 %	148259457
511	NC_009484	CCAGC	2	10	498419	498428	20 %	0 %	20 %	60 %	148259466
512	NC_009484	ATCGC	2	10	500340	500349	20 %	20 %	20 %	40 %	148259468
513	NC_009484	CTGAC	2	10	503130	503139	20 %	20 %	20 %	40 %	148259470
514	NC_009484	GCCGA	2	10	504084	504093	20 %	0 %	40 %	40 %	148259470
515	NC_009484	GCCGA	2	10	504345	504354	20 %	0 %	40 %	40 %	148259470
516	NC_009484	GCCGC	2	10	507144	507153	0 %	0 %	40 %	60 %	148259471
517	NC_009484	CCCGG	2	10	507543	507552	0 %	0 %	40 %	60 %	148259472
518	NC_009484	GCCGC	2	10	508586	508595	0 %	0 %	40 %	60 %	148259472
519	NC_009484	GCGCA	2	10	508879	508888	20 %	0 %	40 %	40 %	148259472
520	NC_009484	CGTCC	2	10	508989	508998	0 %	20 %	20 %	60 %	148259472
521	NC_009484	GGTCG	2	10	509280	509289	0 %	20 %	60 %	20 %	148259473
522	NC_009484	GCGCT	2	10	509707	509716	0 %	20 %	40 %	40 %	148259473
523	NC_009484	CCAGC	2	10	510377	510386	20 %	0 %	20 %	60 %	148259474
524	NC_009484	CGGAC	2	10	515507	515516	20 %	0 %	40 %	40 %	148259478
525	NC_009484	AAGGC	2	10	515737	515746	40 %	0 %	40 %	20 %	148259479
526	NC_009484	TCACC	2	10	516101	516110	20 %	20 %	0 %	60 %	148259479
527	NC_009484	TGAAC	2	10	517139	517148	40 %	20 %	20 %	20 %	148259480
528	NC_009484	CGCGG	2	10	520460	520469	0 %	0 %	60 %	40 %	148259482
529	NC_009484	GCGCG	2	10	521649	521658	0 %	0 %	60 %	40 %	148259484
530	NC_009484	CGGTC	2	10	522336	522345	0 %	20 %	40 %	40 %	148259484
531	NC_009484	CGCGC	2	10	523486	523495	0 %	0 %	40 %	60 %	148259485
532	NC_009484	GCGCC	2	10	523813	523822	0 %	0 %	40 %	60 %	148259485
533	NC_009484	AGGGC	2	10	524246	524255	20 %	0 %	60 %	20 %	148259486
534	NC_009484	CCCCG	2	10	525910	525919	0 %	0 %	20 %	80 %	148259488
535	NC_009484	TCGCC	2	10	527752	527761	0 %	20 %	20 %	60 %	148259490
536	NC_009484	GGTGC	2	10	527857	527866	0 %	20 %	60 %	20 %	148259491
537	NC_009484	CCGCG	2	10	528414	528423	0 %	0 %	40 %	60 %	148259491
538	NC_009484	CTGCT	2	10	528571	528580	0 %	40 %	20 %	40 %	148259491
539	NC_009484	TGATG	2	10	530447	530456	20 %	40 %	40 %	0 %	148259493
540	NC_009484	AGCCG	2	10	531176	531185	20 %	0 %	40 %	40 %	148259493
541	NC_009484	TTCCG	2	10	531732	531741	0 %	40 %	20 %	40 %	148259494
542	NC_009484	GTGCC	2	10	531908	531917	0 %	20 %	40 %	40 %	148259494
543	NC_009484	CAGCG	2	10	532407	532416	20 %	0 %	40 %	40 %	148259495
544	NC_009484	GAGGG	2	10	534816	534825	20 %	0 %	80 %	0 %	148259497
545	NC_009484	TGCGA	2	10	535625	535634	20 %	20 %	40 %	20 %	148259498
546	NC_009484	CTCGG	2	10	537109	537118	0 %	20 %	40 %	40 %	148259499
547	NC_009484	CTCGG	2	10	537178	537187	0 %	20 %	40 %	40 %	148259499
548	NC_009484	GCAGG	2	10	537888	537897	20 %	0 %	60 %	20 %	148259500
549	NC_009484	CGGCG	2	10	538626	538635	0 %	0 %	60 %	40 %	148259501
550	NC_009484	TGGAA	2	10	540444	540453	40 %	20 %	40 %	0 %	148259502
551	NC_009484	CGTGC	2	10	542965	542974	0 %	20 %	40 %	40 %	148259505
552	NC_009484	CAAGC	2	10	546774	546783	40 %	0 %	20 %	40 %	148259507
553	NC_009484	GGCGC	2	10	548381	548390	0 %	0 %	60 %	40 %	148259509
554	NC_009484	GATCG	2	10	550718	550727	20 %	20 %	40 %	20 %	148259512
555	NC_009484	CGGAG	2	10	552764	552773	20 %	0 %	60 %	20 %	148259513
556	NC_009484	GGTCG	2	10	552996	553005	0 %	20 %	60 %	20 %	148259513
557	NC_009484	CGTGC	2	10	556768	556777	0 %	20 %	40 %	40 %	148259516
558	NC_009484	CGGCG	2	10	557900	557909	0 %	0 %	60 %	40 %	148259517
559	NC_009484	ACGAT	2	10	558136	558145	40 %	20 %	20 %	20 %	148259517
560	NC_009484	CGGCA	2	10	560082	560091	20 %	0 %	40 %	40 %	148259518
561	NC_009484	GTCGA	2	10	561413	561422	20 %	20 %	40 %	20 %	148259519
562	NC_009484	GCCGA	2	10	562828	562837	20 %	0 %	40 %	40 %	148259520
563	NC_009484	CGGCA	2	10	562975	562984	20 %	0 %	40 %	40 %	148259520
564	NC_009484	GCGCC	2	10	564076	564085	0 %	0 %	40 %	60 %	148259521
565	NC_009484	GCCGC	2	10	567273	567282	0 %	0 %	40 %	60 %	148259525
566	NC_009484	GGCGC	2	10	567745	567754	0 %	0 %	60 %	40 %	148259525
567	NC_009484	GATGC	2	10	567942	567951	20 %	20 %	40 %	20 %	148259525
568	NC_009484	AGGTC	2	10	568474	568483	20 %	20 %	40 %	20 %	148259525
569	NC_009484	GCCGG	2	10	569509	569518	0 %	0 %	60 %	40 %	148259526
570	NC_009484	CGCAT	2	10	569634	569643	20 %	20 %	20 %	40 %	148259526
571	NC_009484	GGCGG	2	10	570021	570030	0 %	0 %	80 %	20 %	148259526
572	NC_009484	GCGCA	2	10	570736	570745	20 %	0 %	40 %	40 %	148259528
573	NC_009484	CCTGG	2	10	571494	571503	0 %	20 %	40 %	40 %	148259529
574	NC_009484	CGGCG	2	10	571899	571908	0 %	0 %	60 %	40 %	148259529
575	NC_009484	CGGCG	2	10	572235	572244	0 %	0 %	60 %	40 %	148259530
576	NC_009484	GGCCC	2	10	572838	572847	0 %	0 %	40 %	60 %	148259530
577	NC_009484	GGATC	2	10	572904	572913	20 %	20 %	40 %	20 %	148259530
578	NC_009484	GCGCC	2	10	573209	573218	0 %	0 %	40 %	60 %	148259531
579	NC_009484	CGGCG	2	10	574400	574409	0 %	0 %	60 %	40 %	148259532
580	NC_009484	GCCGG	2	10	576255	576264	0 %	0 %	60 %	40 %	148259535
581	NC_009484	GTTGC	2	10	577010	577019	0 %	40 %	40 %	20 %	148259536
582	NC_009484	TATCG	2	10	579670	579679	20 %	40 %	20 %	20 %	148259538
583	NC_009484	CCGTC	2	10	581951	581960	0 %	20 %	20 %	60 %	148259538
584	NC_009484	GCGCC	2	10	584541	584550	0 %	0 %	40 %	60 %	148259541
585	NC_009484	GCGCA	2	10	585962	585971	20 %	0 %	40 %	40 %	148259542
586	NC_009484	CGCAT	2	10	585996	586005	20 %	20 %	20 %	40 %	148259542
587	NC_009484	GCGCG	2	10	588310	588319	0 %	0 %	60 %	40 %	148259542
588	NC_009484	CGGCG	2	10	588398	588407	0 %	0 %	60 %	40 %	148259542
589	NC_009484	CGGAC	2	10	591242	591251	20 %	0 %	40 %	40 %	148259547
590	NC_009484	CGGCT	2	10	593792	593801	0 %	20 %	40 %	40 %	148259549
591	NC_009484	GCCGC	2	10	595920	595929	0 %	0 %	40 %	60 %	148259550
592	NC_009484	GACCC	2	10	596463	596472	20 %	0 %	20 %	60 %	148259550
593	NC_009484	CGGCG	2	10	596755	596764	0 %	0 %	60 %	40 %	148259551
594	NC_009484	GGCGA	2	10	598203	598212	20 %	0 %	60 %	20 %	148259552
595	NC_009484	CGCGC	2	10	598783	598792	0 %	0 %	40 %	60 %	148259552
596	NC_009484	AGGGC	2	10	598802	598811	20 %	0 %	60 %	20 %	148259552
597	NC_009484	CGCAG	2	10	600191	600200	20 %	0 %	40 %	40 %	148259553
598	NC_009484	GCCCG	2	10	603071	603080	0 %	0 %	40 %	60 %	148259556
599	NC_009484	GCCGC	2	10	604316	604325	0 %	0 %	40 %	60 %	148259557
600	NC_009484	GGCCC	2	10	604586	604595	0 %	0 %	40 %	60 %	148259557
601	NC_009484	GGGGA	2	10	606293	606302	20 %	0 %	80 %	0 %	148259559
602	NC_009484	GGCGA	2	10	607705	607714	20 %	0 %	60 %	20 %	148259560
603	NC_009484	GACCA	2	10	608164	608173	40 %	0 %	20 %	40 %	148259561
604	NC_009484	CGATG	2	10	608316	608325	20 %	20 %	40 %	20 %	148259561
605	NC_009484	GCCGC	2	10	609822	609831	0 %	0 %	40 %	60 %	148259562
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607	NC_009484	TGCGC	2	10	610198	610207	0 %	20 %	40 %	40 %	148259562
608	NC_009484	CCGCG	2	10	610713	610722	0 %	0 %	40 %	60 %	148259562
609	NC_009484	GCCGC	2	10	611005	611014	0 %	0 %	40 %	60 %	148259563
610	NC_009484	CGGCG	2	10	613830	613839	0 %	0 %	60 %	40 %	148259565
611	NC_009484	GCGCG	2	10	614483	614492	0 %	0 %	60 %	40 %	148259566
612	NC_009484	CGCAA	2	10	614940	614949	40 %	0 %	20 %	40 %	148259566
613	NC_009484	CCGCG	2	10	615095	615104	0 %	0 %	40 %	60 %	148259566
614	NC_009484	CCGGC	2	10	616557	616566	0 %	0 %	40 %	60 %	148259568
615	NC_009484	GCCGC	2	10	620195	620204	0 %	0 %	40 %	60 %	148259570
616	NC_009484	CCGCG	2	10	620948	620957	0 %	0 %	40 %	60 %	148259571
617	NC_009484	AGGGC	2	10	622972	622981	20 %	0 %	60 %	20 %	148259573
618	NC_009484	TGGTC	2	10	624123	624132	0 %	40 %	40 %	20 %	148259575
619	NC_009484	TCGTC	2	10	624548	624557	0 %	40 %	20 %	40 %	148259575
620	NC_009484	GCTCG	2	10	624900	624909	0 %	20 %	40 %	40 %	148259575
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624	NC_009484	GCGCA	2	10	632196	632205	20 %	0 %	40 %	40 %	148259580
625	NC_009484	CCGGG	2	10	633147	633156	0 %	0 %	60 %	40 %	148259581
626	NC_009484	CCCGC	2	10	635312	635321	0 %	0 %	20 %	80 %	148259583
627	NC_009484	TCGCC	2	10	636381	636390	0 %	20 %	20 %	60 %	148259584
628	NC_009484	CCGTT	2	10	637053	637062	0 %	40 %	20 %	40 %	148259584
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