MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 3453

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009484	CGGCG	2	10	2430322	2430331	0 %	0 %	60 %	40 %	148261189
2502	NC_009484	GCCCC	2	10	2430893	2430902	0 %	0 %	20 %	80 %	148261190
2503	NC_009484	AGCCG	2	10	2433796	2433805	20 %	0 %	40 %	40 %	148261194
2504	NC_009484	GCTGC	2	10	2434031	2434040	0 %	20 %	40 %	40 %	148261194
2505	NC_009484	GGTCG	2	10	2435233	2435242	0 %	20 %	60 %	20 %	148261195
2506	NC_009484	AACGG	2	10	2436633	2436642	40 %	0 %	40 %	20 %	148261196
2507	NC_009484	CGGCG	2	10	2436946	2436955	0 %	0 %	60 %	40 %	148261197
2508	NC_009484	CCCGC	2	10	2438607	2438616	0 %	0 %	20 %	80 %	148261198
2509	NC_009484	GCGGG	2	10	2440012	2440021	0 %	0 %	80 %	20 %	148261199
2510	NC_009484	ATCTG	2	10	2440659	2440668	20 %	40 %	20 %	20 %	148261199
2511	NC_009484	CGGCG	2	10	2440924	2440933	0 %	0 %	60 %	40 %	148261199
2512	NC_009484	CTCGG	2	10	2441572	2441581	0 %	20 %	40 %	40 %	148261200
2513	NC_009484	CGCGG	2	10	2442621	2442630	0 %	0 %	60 %	40 %	148261200
2514	NC_009484	CGCGG	2	10	2444072	2444081	0 %	0 %	60 %	40 %	148261201
2515	NC_009484	CCGAG	2	10	2447019	2447028	20 %	0 %	40 %	40 %	148261203
2516	NC_009484	ACCGC	2	10	2449579	2449588	20 %	0 %	20 %	60 %	148261205
2517	NC_009484	CGCAC	2	10	2449734	2449743	20 %	0 %	20 %	60 %	148261205
2518	NC_009484	GGCCG	2	10	2457992	2458001	0 %	0 %	60 %	40 %	148261215
2519	NC_009484	GCGGT	2	10	2460848	2460857	0 %	20 %	60 %	20 %	148261217
2520	NC_009484	CGGCG	2	10	2463455	2463464	0 %	0 %	60 %	40 %	148261220
2521	NC_009484	CCGAG	2	10	2467889	2467898	20 %	0 %	40 %	40 %	148261223
2522	NC_009484	ACCGC	2	10	2470449	2470458	20 %	0 %	20 %	60 %	148261225
2523	NC_009484	CGCAC	2	10	2470604	2470613	20 %	0 %	20 %	60 %	148261225
2524	NC_009484	CCGAC	2	10	2471213	2471222	20 %	0 %	20 %	60 %	148261226
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2526	NC_009484	CGCGG	2	10	2475053	2475062	0 %	0 %	60 %	40 %	148261228
2527	NC_009484	GCCGC	2	10	2476722	2476731	0 %	0 %	40 %	60 %	148261230
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2529	NC_009484	GCCGC	2	10	2477865	2477874	0 %	0 %	40 %	60 %	148261231
2530	NC_009484	GCGCG	2	10	2479873	2479882	0 %	0 %	60 %	40 %	148261233
2531	NC_009484	CCTCG	2	10	2480460	2480469	0 %	20 %	20 %	60 %	148261233
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2533	NC_009484	CCGGT	2	10	2482332	2482341	0 %	20 %	40 %	40 %	148261234
2534	NC_009484	TGCCG	2	10	2483511	2483520	0 %	20 %	40 %	40 %	148261236
2535	NC_009484	TGGCC	2	10	2485753	2485762	0 %	20 %	40 %	40 %	148261239
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2538	NC_009484	GGGCG	2	10	2490681	2490690	0 %	0 %	80 %	20 %	148261245
2539	NC_009484	CGCGA	2	10	2490907	2490916	20 %	0 %	40 %	40 %	148261245
2540	NC_009484	GCGCG	2	10	2491005	2491014	0 %	0 %	60 %	40 %	148261246
2541	NC_009484	GCCGC	2	10	2491825	2491834	0 %	0 %	40 %	60 %	148261246
2542	NC_009484	GGGGC	2	10	2493720	2493729	0 %	0 %	80 %	20 %	148261247
2543	NC_009484	GCCCA	2	10	2493967	2493976	20 %	0 %	20 %	60 %	148261247
2544	NC_009484	GCCGG	2	10	2494283	2494292	0 %	0 %	60 %	40 %	148261247
2545	NC_009484	CGCGT	2	10	2494376	2494385	0 %	20 %	40 %	40 %	148261248
2546	NC_009484	GGCGC	2	10	2494501	2494510	0 %	0 %	60 %	40 %	148261248
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2548	NC_009484	GCCGC	2	10	2495785	2495794	0 %	0 %	40 %	60 %	148261249
2549	NC_009484	GCGCG	2	10	2497496	2497505	0 %	0 %	60 %	40 %	148261251
2550	NC_009484	GCCCT	2	10	2497605	2497614	0 %	20 %	20 %	60 %	148261251
2551	NC_009484	ACGGC	2	10	2497984	2497993	20 %	0 %	40 %	40 %	148261251
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2553	NC_009484	CGCCC	2	10	2499514	2499523	0 %	0 %	20 %	80 %	148261255
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2556	NC_009484	GGCGC	2	10	2501665	2501674	0 %	0 %	60 %	40 %	148261257
2557	NC_009484	GCGGT	2	10	2503070	2503079	0 %	20 %	60 %	20 %	148261259
2558	NC_009484	ACGCC	2	10	2505021	2505030	20 %	0 %	20 %	60 %	148261261
2559	NC_009484	GCCAT	2	10	2505461	2505470	20 %	20 %	20 %	40 %	148261261
2560	NC_009484	GCACC	2	10	2506746	2506755	20 %	0 %	20 %	60 %	148261262
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2563	NC_009484	TCGCC	2	10	2510712	2510721	0 %	20 %	20 %	60 %	148261267
2564	NC_009484	CCGCC	2	10	2510736	2510745	0 %	0 %	20 %	80 %	148261267
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2588	NC_009484	GCCGG	2	10	2545248	2545257	0 %	0 %	60 %	40 %	148261301
2589	NC_009484	CGCGC	2	10	2546308	2546317	0 %	0 %	40 %	60 %	148261301
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2599	NC_009484	GGGCG	2	10	2558511	2558520	0 %	0 %	80 %	20 %	148261314
2600	NC_009484	GCGGG	2	10	2558634	2558643	0 %	0 %	80 %	20 %	148261314
2601	NC_009484	CCGGG	2	10	2558734	2558743	0 %	0 %	60 %	40 %	148261314
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2608	NC_009484	TCGTC	2	10	2563145	2563154	0 %	40 %	20 %	40 %	148261318
2609	NC_009484	AGGCC	2	10	2563800	2563809	20 %	0 %	40 %	40 %	148261318
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2622	NC_009484	CCGCC	2	10	2577772	2577781	0 %	0 %	20 %	80 %	148261332
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2997	NC_009484	GAGCG	2	10	2951233	2951242	20 %	0 %	60 %	20 %	148261671
2998	NC_009484	CGGCG	2	10	2951422	2951431	0 %	0 %	60 %	40 %	148261671
2999	NC_009484	GCCCG	2	10	2955120	2955129	0 %	0 %	40 %	60 %	148261676
3000	NC_009484	GCGGT	2	10	2955822	2955831	0 %	20 %	60 %	20 %	148261677

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