MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 4221

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008340	TAA	2	6	1602	1607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008340	ATT	2	6	1635	1640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008340	GGT	2	6	2780	2785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008340	GTG	2	6	2801	2806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008340	CCT	2	6	15753	15758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_008340	CCG	2	6	15769	15774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_008340	GCC	2	6	15796	15801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_008340	CGG	2	6	15827	15832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008340	CAA	2	6	15866	15871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008340	ACG	2	6	17461	17466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008340	CCG	2	6	17503	17508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_008340	TTG	2	6	17516	17521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008340	GCC	2	6	17523	17528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_008340	TGG	2	6	17547	17552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008340	CGG	2	6	18101	18106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008340	CGG	2	6	20703	20708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008340	CGG	2	6	22759	22764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008340	CGG	2	6	22774	22779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008340	CGG	2	6	24503	24508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008340	CGG	2	6	24959	24964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008340	CCG	2	6	27767	27772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_008340	CGA	2	6	27802	27807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008340	ACA	3	9	27813	27821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008340	GCG	2	6	27841	27846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008340	TGT	2	6	27848	27853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008340	CGC	2	6	28804	28809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_008340	GAG	2	6	30202	30207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008340	GGC	2	6	30806	30811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008340	ACA	2	6	38381	38386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008340	CGG	2	6	38453	38458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008340	AGG	2	6	38467	38472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008340	ATG	2	6	38482	38487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008340	GAC	2	6	38595	38600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008340	CGA	2	6	38659	38664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008340	CTC	2	6	38724	38729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_008340	CGG	2	6	38743	38748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008340	TGC	2	6	38829	38834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008340	CAT	2	6	38845	38850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008340	TCG	2	6	39123	39128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008340	CGC	2	6	39138	39143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_008340	ACG	2	6	39339	39344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008340	GAT	2	6	39380	39385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008340	GTC	2	6	39407	39412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008340	CGA	2	6	39445	39450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008340	GCG	2	6	39523	39528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008340	CAC	2	6	39569	39574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_008340	TCG	2	6	39579	39584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008340	CCA	2	6	39633	39638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_008340	CAT	2	6	39821	39826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008340	GCC	2	6	41842	41847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_008340	AGC	2	6	41888	41893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008340	TTG	2	6	43272	43277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008340	CGG	2	6	48508	48513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008340	GTC	2	6	48564	48569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008340	CCG	2	6	48674	48679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_008340	AGC	2	6	48758	48763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008340	ACC	2	6	48794	48799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_008340	CAC	2	6	49060	49065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_008340	GAG	2	6	49609	49614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008340	CGG	2	6	65070	65075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008340	GGT	2	6	65169	65174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008340	TCT	2	6	66259	66264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008340	CGC	3	9	66985	66993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_008340	GGT	2	6	71365	71370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008340	ACC	2	6	78820	78825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_008340	GGT	2	6	78827	78832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008340	GCC	2	6	78839	78844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_008340	GCG	2	6	84453	84458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008340	CCG	2	6	84522	84527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_008340	CGG	3	9	87341	87349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008340	TAA	2	6	87433	87438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008340	CGC	2	6	87439	87444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_008340	GGC	2	6	87447	87452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008340	GTG	2	6	88812	88817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008340	TGC	2	6	89240	89245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008340	GTT	2	6	89287	89292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008340	CGG	2	6	89302	89307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008340	CAC	2	6	89327	89332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_008340	AGG	2	6	89773	89778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008340	AGC	2	6	91318	91323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008340	CAC	2	6	91894	91899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_008340	TGG	2	6	91900	91905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008340	AAT	2	6	91919	91924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008340	CGG	2	6	91980	91985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008340	TGG	2	6	93022	93027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008340	GCC	2	6	93051	93056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_008340	CTG	2	6	93057	93062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008340	GCA	2	6	93116	93121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008340	CTG	2	6	93125	93130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008340	CAG	2	6	93159	93164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008340	GGC	2	6	93165	93170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008340	CCG	2	6	95741	95746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_008340	ACG	2	6	95763	95768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008340	TCT	2	6	97595	97600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008340	TCT	2	6	97678	97683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008340	CTC	2	6	97689	97694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_008340	GAG	2	6	97858	97863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008340	CGC	2	6	97897	97902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_008340	CGC	2	6	97941	97946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_008340	GAG	2	6	98023	98028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008340	GAA	2	6	98083	98088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008340	GAG	2	6	98132	98137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008340	TCC	2	6	98156	98161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_008340	CGC	2	6	98171	98176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_008340	GCC	2	6	98216	98221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_008340	CGC	2	6	98231	98236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_008340	GAG	2	6	98356	98361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008340	GTC	2	6	98433	98438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008340	GCA	2	6	98515	98520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008340	GCC	2	6	102186	102191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_008340	GAA	2	6	102771	102776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008340	CCT	2	6	102920	102925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_008340	CCT	2	6	102948	102953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_008340	TTC	2	6	103021	103026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008340	GAG	2	6	103058	103063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008340	CTC	2	6	103113	103118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_008340	GTG	3	9	103151	103159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008340	TCC	2	6	103577	103582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_008340	GGC	2	6	103645	103650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008340	CCG	2	6	103652	103657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_008340	GAA	2	6	108062	108067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008340	CGG	2	6	108068	108073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008340	GTC	2	6	108104	108109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008340	TCA	2	6	109139	109144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008340	CGG	2	6	110640	110645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008340	GCC	2	6	114027	114032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_008340	CTG	2	6	114903	114908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008340	CGC	2	6	114977	114982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_008340	GCC	2	6	115039	115044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_008340	GCT	2	6	115059	115064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008340	CCA	2	6	115100	115105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_008340	GGC	2	6	115161	115166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008340	GAT	2	6	119869	119874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008340	TTG	2	6	120134	120139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008340	GCC	2	6	123761	123766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_008340	GAG	2	6	123830	123835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008340	TGA	2	6	124861	124866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008340	ACG	2	6	126031	126036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_008340	ATT	2	6	126395	126400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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