MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 4221

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008340	GCG	2	6	368296	368301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_008340	TGG	2	6	368448	368453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_008340	CGA	2	6	368472	368477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_008340	GAT	2	6	368497	368502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_008340	GCA	2	6	368546	368551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_008340	GAA	2	6	368605	368610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_008340	CAG	2	6	368635	368640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_008340	GGA	2	6	368641	368646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_008340	AGA	2	6	368688	368693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_008340	CAG	2	6	368714	368719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_008340	GGA	2	6	368905	368910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_008340	GAA	2	6	369169	369174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_008340	TGC	2	6	369245	369250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_008340	GTC	2	6	369257	369262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_008340	GGA	2	6	369370	369375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_008340	TCA	2	6	369395	369400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_008340	TGC	2	6	369561	369566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_008340	CCT	2	6	369732	369737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_008340	GGT	2	6	369867	369872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_008340	ATT	2	6	369894	369899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_008340	CGA	2	6	369977	369982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_008340	GTC	2	6	370110	370115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_008340	CCA	2	6	370135	370140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_008340	TCG	2	6	370282	370287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_008340	GTT	2	6	370314	370319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_008340	AGG	2	6	370406	370411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_008340	GGA	2	6	370577	370582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_008340	GCG	2	6	370611	370616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_008340	TCC	2	6	370773	370778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_008340	AAC	2	6	371333	371338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_008340	AGG	2	6	371407	371412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_008340	AGC	2	6	371423	371428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_008340	CGA	2	6	371557	371562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_008340	CGG	2	6	372253	372258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_008340	TAC	2	6	372427	372432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_008340	TGG	2	6	372503	372508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_008340	ACC	2	6	372524	372529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_008340	TCC	2	6	372610	372615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_008340	GGA	2	6	372627	372632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_008340	GGT	2	6	372747	372752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_008340	TCC	2	6	372812	372817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_008340	GGA	2	6	372835	372840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_008340	TCA	2	6	372862	372867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_008340	CGT	2	6	372942	372947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_008340	GCT	2	6	372996	373001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_008340	GAC	2	6	373173	373178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_008340	GCA	2	6	373205	373210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_008340	AAG	2	6	373359	373364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_008340	ACC	2	6	373406	373411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_008340	AGG	2	6	373626	373631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_008340	CGG	2	6	375089	375094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_008340	GCC	2	6	375125	375130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_008340	GTG	2	6	375136	375141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_008340	TGA	2	6	375834	375839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_008340	GTT	2	6	376031	376036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_008340	CGG	2	6	376112	376117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_008340	TGC	2	6	376878	376883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_008340	GCC	2	6	377959	377964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_008340	ACC	2	6	378291	378296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_008340	CTC	2	6	380457	380462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_008340	AAT	2	6	383061	383066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_008340	AAC	2	6	383113	383118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_008340	AGC	2	6	385300	385305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_008340	CCT	2	6	387775	387780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_008340	GGT	2	6	387817	387822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_008340	GCC	2	6	392352	392357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_008340	GTA	2	6	396278	396283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_008340	CAT	2	6	396800	396805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_008340	TTG	2	6	407677	407682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_008340	GGC	2	6	407766	407771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_008340	GCC	2	6	407778	407783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_008340	CTC	2	6	407869	407874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_008340	CGC	2	6	407926	407931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_008340	TCT	2	6	407990	407995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_008340	TGC	2	6	408065	408070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_008340	GTT	2	6	410696	410701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_008340	GCT	2	6	410706	410711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_008340	GCT	2	6	411540	411545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_008340	GCC	2	6	411574	411579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_008340	CCA	2	6	411584	411589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_008340	GAG	2	6	411600	411605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_008340	GGC	2	6	412833	412838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_008340	ATG	2	6	414900	414905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_008340	ACC	2	6	415746	415751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_008340	GCG	2	6	415773	415778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_008340	CGC	3	9	417222	417230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_008340	GCG	2	6	417241	417246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_008340	GCG	2	6	418140	418145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_008340	CGC	2	6	418162	418167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_008340	CGG	2	6	418185	418190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_008340	GTT	2	6	421247	421252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_008340	CGC	2	6	424081	424086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_008340	CCG	2	6	424105	424110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_008340	GAG	2	6	424187	424192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
595	NC_008340	CGG	2	6	424200	424205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_008340	AGA	2	6	425862	425867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_008340	GCC	2	6	425907	425912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_008340	CGC	2	6	425993	425998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_008340	GCC	2	6	426188	426193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_008340	GTG	2	6	426216	426221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_008340	AGC	2	6	426284	426289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_008340	CTG	2	6	426331	426336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_008340	ACC	2	6	426338	426343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_008340	CCA	2	6	426377	426382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_008340	ACC	2	6	426422	426427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_008340	GGC	2	6	428579	428584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_008340	TCC	2	6	428585	428590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_008340	CTG	2	6	428696	428701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_008340	CTA	2	6	428820	428825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_008340	CAA	2	6	428854	428859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_008340	GTG	2	6	429050	429055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_008340	GCC	2	6	429101	429106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_008340	CCG	2	6	429151	429156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_008340	AGC	2	6	429163	429168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_008340	CCG	2	6	429219	429224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_008340	GCC	2	6	429250	429255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_008340	GAA	2	6	429459	429464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_008340	CAA	2	6	429589	429594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_008340	GGT	2	6	429723	429728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_008340	AAG	2	6	429785	429790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_008340	CGC	2	6	431275	431280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_008340	AGA	2	6	432519	432524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_008340	AGG	2	6	432963	432968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_008340	GCA	2	6	433057	433062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_008340	CAA	2	6	433094	433099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_008340	CGC	2	6	433124	433129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_008340	GCA	2	6	435497	435502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_008340	GAC	2	6	438086	438091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_008340	CCT	2	6	439058	439063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_008340	ACG	2	6	439153	439158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_008340	TCC	2	6	439626	439631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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633	NC_008340	GCC	2	6	445949	445954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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