MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 4221

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008340	AAC	2	6	2393652	2393657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_008340	TGA	2	6	2394561	2394566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_008340	GAG	2	6	2394640	2394645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_008340	CGC	2	6	2398140	2398145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3005	NC_008340	CCA	2	6	2398200	2398205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3006	NC_008340	GAG	2	6	2398213	2398218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_008340	GAG	2	6	2398250	2398255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_008340	TGA	2	6	2398340	2398345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_008340	GAG	2	6	2398412	2398417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_008340	CGC	2	6	2398451	2398456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3011	NC_008340	GAC	2	6	2398503	2398508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_008340	TTC	2	6	2398545	2398550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_008340	TGC	2	6	2399233	2399238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_008340	CAG	2	6	2399265	2399270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_008340	GTC	2	6	2399327	2399332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_008340	AAC	2	6	2399355	2399360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_008340	AGG	2	6	2399378	2399383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_008340	CCG	2	6	2399540	2399545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_008340	CTT	2	6	2399568	2399573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_008340	GCC	2	6	2399581	2399586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3021	NC_008340	CCA	2	6	2400776	2400781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3022	NC_008340	CGG	2	6	2401712	2401717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_008340	GCA	2	6	2402846	2402851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_008340	ACC	2	6	2403366	2403371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3025	NC_008340	GAG	2	6	2403392	2403397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_008340	CGC	2	6	2407699	2407704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3030	NC_008340	TGA	2	6	2407803	2407808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_008340	GCG	2	6	2411032	2411037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_008340	GGC	2	6	2411101	2411106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_008340	CCG	2	6	2411111	2411116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_008340	TCG	2	6	2412623	2412628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_008340	TCC	2	6	2415188	2415193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3038	NC_008340	CTC	2	6	2423070	2423075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3039	NC_008340	TCC	2	6	2423082	2423087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_008340	CGC	2	6	2423105	2423110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3041	NC_008340	CGG	2	6	2423124	2423129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_008340	CGC	2	6	2423136	2423141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_008340	GAC	2	6	2424042	2424047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3045	NC_008340	GCC	2	6	2425495	2425500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3046	NC_008340	CGG	2	6	2429301	2429306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_008340	CCG	2	6	2429361	2429366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3054	NC_008340	GAG	2	6	2433123	2433128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_008340	CGA	2	6	2433134	2433139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_008340	CGG	2	6	2433273	2433278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_008340	GCC	2	6	2433380	2433385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3058	NC_008340	CGG	2	6	2434907	2434912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_008340	CGG	2	6	2438058	2438063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_008340	CAG	2	6	2439359	2439364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_008340	GCC	2	6	2439365	2439370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3062	NC_008340	AGC	2	6	2439372	2439377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3064	NC_008340	CAG	2	6	2439437	2439442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3070	NC_008340	GAG	2	6	2445105	2445110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3089	NC_008340	TAA	2	6	2468806	2468811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3092	NC_008340	ACC	2	6	2468947	2468952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3093	NC_008340	GCA	2	6	2470200	2470205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3099	NC_008340	GTG	2	6	2481647	2481652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3103	NC_008340	CGG	2	6	2491788	2491793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3110	NC_008340	AGG	2	6	2509742	2509747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3112	NC_008340	AGC	2	6	2509835	2509840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_008340	CGG	2	6	2509970	2509975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_008340	TCC	2	6	2510054	2510059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3115	NC_008340	CGG	2	6	2510133	2510138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_008340	CAC	2	6	2511112	2511117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3117	NC_008340	GCC	2	6	2511134	2511139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3119	NC_008340	GCC	2	6	2513439	2513444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3120	NC_008340	CCA	2	6	2513477	2513482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3121	NC_008340	CCG	2	6	2513483	2513488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3122	NC_008340	GCC	2	6	2514117	2514122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3123	NC_008340	GCC	2	6	2514552	2514557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3124	NC_008340	GCC	3	9	2515224	2515232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3125	NC_008340	AAG	2	6	2517982	2517987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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