MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 chromosome

Total Repeats: 2136

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_007413	TGGTGC	2	12	5922116	5922127	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	75910924
2002	NC_007413	ACTGGT	2	12	5922279	5922290	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	75910924
2003	NC_007413	TGTTGG	2	12	5922317	5922328	0 %	50 %	50 %	0 %	75910924
2004	NC_007413	TTACCG	2	12	5922340	5922351	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	75910924
2005	NC_007413	GAACCG	2	12	5923555	5923566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75910924
2006	NC_007413	GTTACC	2	12	5924175	5924186	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	75910924
2007	NC_007413	GACGCT	2	12	5925753	5925764	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	75910924
2008	NC_007413	CACAGC	2	12	5926451	5926462	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	75910924
2009	NC_007413	TAATGG	2	12	5934071	5934082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75910928
2010	NC_007413	CGTTTG	2	12	5935057	5935068	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	75910929
2011	NC_007413	ATTTTT	2	12	5941965	5941976	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	75910933
2012	NC_007413	GTTGCG	2	12	5942878	5942889	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	75910933
2013	NC_007413	GCAACA	2	12	5950248	5950259	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	75910938
2014	NC_007413	CTCTCG	2	12	5952822	5952833	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	75910939
2015	NC_007413	AATACT	2	12	5968615	5968626	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	75910945
2016	NC_007413	CTTCTG	2	12	5974701	5974712	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	75910946
2017	NC_007413	TTATAA	2	12	5980540	5980551	50 %	50 %	0 %	0 %	75910949
2018	NC_007413	TTGGTT	2	12	5981739	5981750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75910951
2019	NC_007413	ATGGGG	2	12	5982887	5982898	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	75910952
2020	NC_007413	TCCTTG	2	12	5987631	5987642	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	75910956
2021	NC_007413	TCAGCA	2	12	5990803	5990814	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	75910960
2022	NC_007413	TGCGTG	2	12	5992113	5992124	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	75910961
2023	NC_007413	CTCTCG	2	12	5997230	5997241	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	75910966
2024	NC_007413	ACAGCC	2	12	6000140	6000151	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	75910968
2025	NC_007413	CAGAAG	2	12	6003704	6003715	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	75910971
2026	NC_007413	GGTATT	2	12	6009156	6009167	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	75910975
2027	NC_007413	AGGTTT	2	12	6009245	6009256	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	75910975
2028	NC_007413	TGATAT	2	12	6011133	6011144	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	75910976
2029	NC_007413	TGGGAC	2	12	6016650	6016661	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	75910981
2030	NC_007413	GTGAAC	2	12	6022047	6022058	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75910988
2031	NC_007413	CTAAAC	2	12	6024283	6024294	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	75910989
2032	NC_007413	CCAGCG	2	12	6027060	6027071	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	75910991
2033	NC_007413	TGGAAG	2	12	6032242	6032253	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	75910998
2034	NC_007413	GGGTTA	2	12	6034306	6034317	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	75911000
2035	NC_007413	ATACCT	2	12	6038197	6038208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75911003
2036	NC_007413	ATGCCA	2	12	6040012	6040023	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	75911003
2037	NC_007413	GCTACC	2	12	6045817	6045828	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	75911007
2038	NC_007413	TCGATT	2	12	6046922	6046933	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	75911008
2039	NC_007413	TTACTA	2	12	6048300	6048311	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	75911009
2040	NC_007413	CGCCCT	2	12	6050724	6050735	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	75911009
2041	NC_007413	GATATT	2	12	6055853	6055864	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	75911013
2042	NC_007413	GACAAG	2	12	6061153	6061164	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	75911020
2043	NC_007413	GGTTGG	2	12	6065312	6065323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75911021
2044	NC_007413	AAGCTA	2	12	6065344	6065355	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	75911021
2045	NC_007413	TTAGAG	2	12	6065359	6065370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75911021
2046	NC_007413	TTATGC	2	12	6065550	6065561	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	75911022
2047	NC_007413	AATGGT	2	12	6066402	6066413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75911023
2048	NC_007413	TGCCCT	2	12	6077202	6077213	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	75911030
2049	NC_007413	AAAGTT	2	12	6078976	6078987	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	75911030
2050	NC_007413	AATCCC	2	12	6083459	6083470	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	75911033
2051	NC_007413	TGAAAT	2	12	6085986	6085997	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	75911033
2052	NC_007413	GAGGCT	2	12	6087072	6087083	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	75911034
2053	NC_007413	TAGGTG	2	12	6088339	6088350	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	75911034
2054	NC_007413	TCATAA	2	12	6092981	6092992	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	75911036
2055	NC_007413	TGTTTT	2	12	6096762	6096773	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	75911039
2056	NC_007413	TGGTAA	2	12	6098558	6098569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75911041
2057	NC_007413	TCAAGG	2	12	6098864	6098875	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75911041
2058	NC_007413	TAGATT	2	12	6100372	6100383	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	75911042
2059	NC_007413	ACCTGT	2	12	6113008	6113019	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	75911047
2060	NC_007413	TAGAGT	2	12	6115981	6115992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75911050
2061	NC_007413	ACCAGA	2	12	6122400	6122411	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	75911054
2062	NC_007413	GTTCTT	2	12	6126780	6126791	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	75911058
2063	NC_007413	TTTTAC	2	12	6129403	6129414	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	75911059
2064	NC_007413	CAAAGA	2	12	6132216	6132227	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	75911061
2065	NC_007413	TAGAAA	2	12	6139568	6139579	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	75911069
2066	NC_007413	GATTTT	2	12	6140596	6140607	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	75911071
2067	NC_007413	ATTAAA	2	12	6141075	6141086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75911071
2068	NC_007413	AACTAA	2	12	6145068	6145079	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	75911076
2069	NC_007413	AAAGCA	2	12	6146904	6146915	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	75911078
2070	NC_007413	CAATGG	2	12	6148672	6148683	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75911080
2071	NC_007413	CTAACC	2	12	6153507	6153518	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	75911082
2072	NC_007413	CAAGCA	2	12	6154906	6154917	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	75911083
2073	NC_007413	ATTAGC	2	12	6155286	6155297	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	75911084
2074	NC_007413	CTTCAG	2	12	6162675	6162686	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	75911090
2075	NC_007413	TGCGGG	2	12	6165998	6166009	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	75911093
2076	NC_007413	AATTCT	2	12	6169964	6169975	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	75911096
2077	NC_007413	GTGAAT	2	12	6173058	6173069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75911097
2078	NC_007413	TATTTC	2	12	6173096	6173107	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	75911097
2079	NC_007413	ATTGGC	2	12	6174678	6174689	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	75911099
2080	NC_007413	CAGTTC	2	12	6176116	6176127	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	75911101
2081	NC_007413	CTTAGC	2	12	6186442	6186453	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	75911113
2082	NC_007413	ACAGCC	2	12	6189172	6189183	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	75911117
2083	NC_007413	AACTTT	2	12	6193676	6193687	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	75911121
2084	NC_007413	GGGGTT	2	12	6195219	6195230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75911122
2085	NC_007413	TTGAAT	2	12	6197560	6197571	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	75911124
2086	NC_007413	ATTTAA	2	12	6197809	6197820	50 %	50 %	0 %	0 %	75911124
2087	NC_007413	AGGTGC	2	12	6202273	6202284	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	75911127
2088	NC_007413	GCTAGA	2	12	6204302	6204313	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75911129
2089	NC_007413	CAGTTG	2	12	6209306	6209317	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	75911134
2090	NC_007413	ATCAAA	2	12	6210163	6210174	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	75911135
2091	NC_007413	TCTATA	2	12	6214573	6214584	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	75911137
2092	NC_007413	TCGGTA	2	12	6220361	6220372	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	75911142
2093	NC_007413	TTCGGT	2	12	6220489	6220500	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	75911142
2094	NC_007413	GTTTTG	2	12	6220579	6220590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75911142
2095	NC_007413	GTTGCT	2	12	6220818	6220829	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	75911142
2096	NC_007413	AAGCCA	2	12	6221974	6221985	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	75911144
2097	NC_007413	ATCTAC	2	12	6223227	6223238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75911144
2098	NC_007413	AGTGAC	2	12	6226331	6226342	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75911145
2099	NC_007413	AGCTGG	2	12	6227547	6227558	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	75911146
2100	NC_007413	GTTACC	2	12	6228382	6228393	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	75911147
2101	NC_007413	GTTACA	2	12	6230438	6230449	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	75911147
2102	NC_007413	CAGCCG	2	12	6234920	6234931	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	75911152
2103	NC_007413	AGACCA	2	12	6237630	6237641	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	75911155
2104	NC_007413	GCGATC	2	12	6239419	6239430	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	75911157
2105	NC_007413	ATCTAA	2	12	6248257	6248268	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	75911163
2106	NC_007413	AACAGC	2	12	6254037	6254048	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	75911168
2107	NC_007413	CTGCAT	2	12	6255203	6255214	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	75911169
2108	NC_007413	ATTCAA	2	12	6259739	6259750	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	75911173
2109	NC_007413	GACAAA	2	12	6259922	6259933	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	75911173
2110	NC_007413	TGGGTG	2	12	6269864	6269875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75911185
2111	NC_007413	TTGGGT	2	12	6270679	6270690	0 %	50 %	50 %	0 %	75911185
2112	NC_007413	CTTGTT	2	12	6282718	6282729	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	75911194
2113	NC_007413	GCTCTA	2	12	6283697	6283708	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	75911195
2114	NC_007413	TCAAAA	2	12	6287622	6287633	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	75911198
2115	NC_007413	ATTGTG	2	12	6292151	6292162	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	75911201
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