MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 chromosome

Total Repeats: 2136

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007413	CCAGAA	2	12	3141800	3141811	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	75908755
1002	NC_007413	TTAGTA	2	12	3144950	3144961	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	75908758
1003	NC_007413	CTAGCA	2	12	3147739	3147750	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	75908758
1004	NC_007413	TACAAA	2	12	3148729	3148740	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	75908759
1005	NC_007413	TTGTAG	2	12	3149536	3149547	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	75908759
1006	NC_007413	GCGATC	2	12	3150456	3150467	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	75908761
1007	NC_007413	TCTCTG	2	12	3156134	3156145	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	75908769
1008	NC_007413	TTGGCA	2	12	3158781	3158792	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	75908771
1009	NC_007413	TGTCTT	2	12	3160877	3160888	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	75908773
1010	NC_007413	GCGATC	2	12	3162372	3162383	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	75908774
1011	NC_007413	TAATTG	2	12	3163729	3163740	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	75908776
1012	NC_007413	TCTTTC	2	12	3166094	3166105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75908777
1013	NC_007413	AGTGCG	2	12	3167551	3167562	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	75908777
1014	NC_007413	TTCTGC	2	12	3169699	3169710	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	75908779
1015	NC_007413	TAGGTC	2	12	3177647	3177658	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	75908783
1016	NC_007413	TAGGCT	2	12	3178072	3178083	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	75908783
1017	NC_007413	TCGCTG	2	12	3178587	3178598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75908783
1018	NC_007413	TCTTCC	2	12	3180323	3180334	0 %	50 %	0 %	50 %	75908786
1019	NC_007413	CGTTAG	2	12	3180612	3180623	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	75908786
1020	NC_007413	GCTAAC	2	12	3180838	3180849	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	75908786
1021	NC_007413	CTTAGT	2	12	3185657	3185668	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	75908791
1022	NC_007413	CTCAAT	2	12	3188634	3188645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75908794
1023	NC_007413	AAAATC	2	12	3188713	3188724	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	75908794
1024	NC_007413	CTTTAT	2	12	3194826	3194837	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	75908799
1025	NC_007413	CAGCTA	2	12	3196128	3196139	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	75908800
1026	NC_007413	TCTACA	2	12	3196762	3196773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75908801
1027	NC_007413	TTTAGC	2	12	3196800	3196811	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	75908801
1028	NC_007413	ACCCCA	2	12	3201907	3201918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75908804
1029	NC_007413	TGGCGA	2	12	3202132	3202143	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	75908804
1030	NC_007413	TGAGCC	2	12	3205406	3205417	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	75908804
1031	NC_007413	CCTGCA	2	12	3205461	3205472	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	75908804
1032	NC_007413	CTGGAA	2	12	3205575	3205586	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75908804
1033	NC_007413	CATCCA	2	12	3206516	3206527	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	75908804
1034	NC_007413	TGATGT	2	12	3207413	3207424	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	75908805
1035	NC_007413	TATGGT	2	12	3208555	3208566	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	75908805
1036	NC_007413	TCAAAT	2	12	3215006	3215017	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	75908808
1037	NC_007413	CTGCTA	2	12	3216495	3216506	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	75908809
1038	NC_007413	ATAGCT	2	12	3220847	3220858	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	75908812
1039	NC_007413	TAACTG	2	12	3221355	3221366	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	75908813
1040	NC_007413	CGACAA	2	12	3221727	3221738	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	75908813
1041	NC_007413	TCAACC	2	12	3225941	3225952	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	75908818
1042	NC_007413	CTCTTC	2	12	3226072	3226083	0 %	50 %	0 %	50 %	75908818
1043	NC_007413	AGCTTG	2	12	3233899	3233910	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	161567476
1044	NC_007413	CAGGTG	2	12	3234303	3234314	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	161567476
1045	NC_007413	TGCTTG	2	12	3235696	3235707	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	75908827
1046	NC_007413	AAACCA	2	12	3235901	3235912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75908827
1047	NC_007413	AATGAC	2	12	3237124	3237135	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	75908830
1048	NC_007413	AACAAA	2	12	3237592	3237603	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	75908830
1049	NC_007413	AAACTC	2	12	3239080	3239091	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	75908832
1050	NC_007413	GTGGGT	2	12	3243853	3243864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75908833
1051	NC_007413	CAATGG	2	12	3246623	3246634	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75908837
1052	NC_007413	CTTTAG	2	12	3246803	3246814	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	75908837
1053	NC_007413	AATGAA	2	12	3250202	3250213	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	75908842
1054	NC_007413	AGAACT	2	12	3251170	3251181	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	75908842
1055	NC_007413	CAACTA	2	12	3251270	3251281	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	75908842
1056	NC_007413	CTACAA	2	12	3256378	3256389	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	75908844
1057	NC_007413	ATTAGC	2	12	3257726	3257737	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	75908845
1058	NC_007413	CCAAAC	2	12	3259445	3259456	50 %	0 %	0 %	50 %	75908846
1059	NC_007413	CGAGAG	2	12	3260348	3260359	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	75908847
1060	NC_007413	TAACTA	2	12	3262250	3262261	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	75908848
1061	NC_007413	ATAGAA	2	12	3263991	3264002	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	75908849
1062	NC_007413	AAAGGT	2	12	3264881	3264892	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	75908850
1063	NC_007413	TTCTGG	2	12	3271297	3271308	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	75908856
1064	NC_007413	ATAGAA	2	12	3274680	3274691	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	75908860
1065	NC_007413	CTAATA	2	12	3276112	3276123	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	75908861
1066	NC_007413	ATGCGA	2	12	3278606	3278617	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75908863
1067	NC_007413	TTAGTT	2	12	3287811	3287822	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	75908869
1068	NC_007413	GATACC	2	12	3311709	3311720	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	75908889
1069	NC_007413	ATCACA	2	12	3312803	3312814	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	75908890
1070	NC_007413	GAAATT	2	12	3316171	3316182	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	75908893
1071	NC_007413	ACCTTT	2	12	3318446	3318457	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	75908894
1072	NC_007413	GCCATT	2	12	3322990	3323001	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	75908898
1073	NC_007413	AGCCGC	2	12	3325798	3325809	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	75908901
1074	NC_007413	CTAAAG	2	12	3327591	3327602	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	75908903
1075	NC_007413	TAGGTA	2	12	3328567	3328578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75908904
1076	NC_007413	GTACTG	2	12	3328753	3328764	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	75908904
1077	NC_007413	TGGTCA	2	12	3329085	3329096	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	75908904
1078	NC_007413	GCCACA	2	12	3333223	3333234	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	75908908
1079	NC_007413	CGCAAA	2	12	3334603	3334614	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	75908908
1080	NC_007413	GATACC	2	12	3338451	3338462	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	75908912
1081	NC_007413	TTTCTT	2	12	3344138	3344149	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	75908919
1082	NC_007413	CAGAAG	2	12	3352164	3352175	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	75908926
1083	NC_007413	TCCCAT	2	12	3352306	3352317	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	75908926
1084	NC_007413	TTAGGT	2	12	3355841	3355852	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	75908931
1085	NC_007413	AGGATT	2	12	3355987	3355998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75908931
1086	NC_007413	CTGTAA	2	12	3356853	3356864	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	75908932
1087	NC_007413	ACACTG	2	12	3357137	3357148	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	75908932
1088	NC_007413	GGGTTG	2	12	3360331	3360342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75908935
1089	NC_007413	CGCAAG	2	12	3367533	3367544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75908940
1090	NC_007413	CCCTAG	2	12	3369302	3369313	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	75908941
1091	NC_007413	ACAGCA	2	12	3385033	3385044	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	75908955
1092	NC_007413	CTCAAT	2	12	3387358	3387369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75908959
1093	NC_007413	GCGGCT	2	12	3388695	3388706	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	75908961
1094	NC_007413	TTCCTG	2	12	3390042	3390053	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	75908962
1095	NC_007413	TGGCAA	2	12	3395708	3395719	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75908967
1096	NC_007413	TACTCA	2	12	3396637	3396648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75908968
1097	NC_007413	TTCACC	2	12	3397242	3397253	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	75908968
1098	NC_007413	AACCAA	2	12	3398840	3398851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75908969
1099	NC_007413	ATGAGT	2	12	3403994	3404005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75908974
1100	NC_007413	ATATTG	2	12	3405390	3405401	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	75908974
1101	NC_007413	CGGTGG	2	12	3405646	3405657	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	75908974
1102	NC_007413	GTTAGT	2	12	3409696	3409707	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	75908976
1103	NC_007413	CTGGTT	2	12	3410738	3410749	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	75908977
1104	NC_007413	CGGAAA	2	12	3413074	3413085	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	75908979
1105	NC_007413	GACTGC	2	12	3413174	3413185	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	75908979
1106	NC_007413	ACCTCA	2	12	3415909	3415920	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	75908979
1107	NC_007413	ATAGGC	2	12	3418711	3418722	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75908980
1108	NC_007413	GGGAGT	2	12	3423153	3423164	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	75908983
1109	NC_007413	TAACTC	2	12	3431040	3431051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75908989
1110	NC_007413	TGCGAT	2	12	3432560	3432571	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	75908990
1111	NC_007413	GTAACT	2	12	3434215	3434226	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	75908992
1112	NC_007413	TCCAAC	2	12	3437346	3437357	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	75908996
1113	NC_007413	AATGGC	2	12	3439214	3439225	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75908999
1114	NC_007413	CTGATA	2	12	3442942	3442953	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	75909001
1115	NC_007413	GGATCA	2	12	3447909	3447920	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75909005
1116	NC_007413	AGATCA	2	12	3456890	3456901	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	75909014
1117	NC_007413	GCTACG	2	12	3461245	3461256	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	75909015
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1120	NC_007413	TAAAGC	2	12	3470216	3470227	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	75909020
1121	NC_007413	AGCTTA	2	12	3473772	3473783	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	75909022
1122	NC_007413	CTGGTG	2	12	3474550	3474561	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	75909022
1123	NC_007413	ATATTA	2	12	3475222	3475233	50 %	50 %	0 %	0 %	75909022
1124	NC_007413	AATAGA	2	12	3475454	3475465	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	75909022
1125	NC_007413	TGGTGC	2	12	3475889	3475900	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	75909022
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1127	NC_007413	CAATAT	2	12	3478234	3478245	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	75909023
1128	NC_007413	AATAGA	2	12	3478870	3478881	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	75909023
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1130	NC_007413	AATATT	2	12	3479930	3479941	50 %	50 %	0 %	0 %	75909023
1131	NC_007413	AGTCAG	2	12	3493138	3493149	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75909033
1132	NC_007413	TAAAGA	2	12	3498153	3498164	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	75909038
1133	NC_007413	ATATTA	2	12	3498240	3498251	50 %	50 %	0 %	0 %	75909038
1134	NC_007413	CTACAT	2	12	3504798	3504809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75909043
1135	NC_007413	GCGATT	2	12	3507243	3507254	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	75909045
1136	NC_007413	ACCAAT	2	12	3511748	3511759	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	75909047
1137	NC_007413	TCAAGT	2	12	3513922	3513933	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	75909049
1138	NC_007413	TGTATT	2	12	3514062	3514073	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	75909049
1139	NC_007413	GTGACT	2	12	3518469	3518480	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	75909052
1140	NC_007413	ATGGTG	2	12	3518917	3518928	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	75909052
1141	NC_007413	CTGTAT	2	12	3519646	3519657	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	75909052
1142	NC_007413	CTTACC	2	12	3523982	3523993	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	75909056
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1145	NC_007413	CTGGCA	2	12	3538969	3538980	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	75909063
1146	NC_007413	GTATAG	2	12	3552320	3552331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75909071
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1219	NC_007413	GGCTTG	2	12	3710248	3710259	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	75909199
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1221	NC_007413	CGGCTT	2	12	3712006	3712017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75909202
1222	NC_007413	CTAGCA	2	12	3713865	3713876	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	75909203
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1333	NC_007413	TAGAAG	2	12	3990248	3990259	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	75909416
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1434	NC_007413	ACTGGT	2	12	4278076	4278087	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	75909653
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1442	NC_007413	TGTCAT	2	12	4290128	4290139	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	75909666
1443	NC_007413	GAGCTT	2	12	4295586	4295597	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	75909670
1444	NC_007413	TGAACA	2	12	4295704	4295715	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	75909671
1445	NC_007413	CAGTAT	2	12	4297831	4297842	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	75909673
1446	NC_007413	CGTCAT	2	12	4300858	4300869	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	75909674
1447	NC_007413	ACTAGT	2	12	4303760	4303771	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	75909676
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