MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 chromosome

Total Repeats: 2136

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007413	TTCGAT	2	12	1605528	1605539	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	75907528
502	NC_007413	TGGGGA	2	12	1611086	1611097	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	75907536
503	NC_007413	GTTCTC	2	12	1611318	1611329	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	75907536
504	NC_007413	GTTTAA	2	12	1612567	1612578	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	75907537
505	NC_007413	TAGAAG	2	12	1620166	1620177	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	75907545
506	NC_007413	ATTTCT	2	12	1624648	1624659	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	75907546
507	NC_007413	TCTATT	2	12	1624668	1624679	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	75907546
508	NC_007413	GCTTGG	2	12	1630468	1630479	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	75907549
509	NC_007413	AATAGT	2	12	1632004	1632015	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	75907549
510	NC_007413	ATGGGA	2	12	1632567	1632578	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	75907549
511	NC_007413	CCTTCC	2	12	1632923	1632934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75907549
512	NC_007413	TTCTGT	2	12	1635007	1635018	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	75907551
513	NC_007413	ACCAAA	2	12	1638145	1638156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75907552
514	NC_007413	GAAAAA	2	12	1639237	1639248	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	75907552
515	NC_007413	AGCAAC	2	12	1640266	1640277	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	75907553
516	NC_007413	ACCAAA	2	12	1640503	1640514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75907553
517	NC_007413	ACCGAA	2	12	1640595	1640606	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	75907553
518	NC_007413	TACCGA	2	12	1640723	1640734	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	75907553
519	NC_007413	AGAAAT	2	12	1647604	1647615	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	75907560
520	NC_007413	AAGCGT	2	12	1648375	1648386	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75907561
521	NC_007413	TCATCT	2	12	1654499	1654510	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	75907565
522	NC_007413	AAGGTA	2	12	1656585	1656596	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	75907566
523	NC_007413	AGCTAA	2	12	1658570	1658581	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	75907568
524	NC_007413	TGAAAA	2	12	1661772	1661783	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	75907571
525	NC_007413	AAGCTA	2	12	1661925	1661936	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	75907571
526	NC_007413	TAAATA	2	12	1663325	1663336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75907573
527	NC_007413	AACTGG	2	12	1663841	1663852	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75907573
528	NC_007413	GTTGGA	2	12	1665261	1665272	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	75907574
529	NC_007413	ACTCAA	2	12	1666903	1666914	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	75907574
530	NC_007413	ACCAAC	2	12	1669424	1669435	50 %	0 %	0 %	50 %	75907575
531	NC_007413	GCTTCA	2	12	1671576	1671587	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	75907577
532	NC_007413	GGCTTT	2	12	1677405	1677416	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	75907583
533	NC_007413	AAAGTC	2	12	1677948	1677959	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	75907584
534	NC_007413	ACAGCC	2	12	1678771	1678782	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	75907584
535	NC_007413	TTTTCC	2	12	1683831	1683842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75907590
536	NC_007413	TGTCCT	2	12	1688702	1688713	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	75907592
537	NC_007413	ATCACA	2	12	1689610	1689621	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	75907593
538	NC_007413	GTAAAA	2	12	1694966	1694977	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	75907597
539	NC_007413	CATCCC	2	12	1696372	1696383	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	75907598
540	NC_007413	TTGAAT	2	12	1703085	1703096	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	75907604
541	NC_007413	CTTTTT	2	12	1703980	1703991	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	75907604
542	NC_007413	CCCAAC	2	12	1704918	1704929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75907606
543	NC_007413	TAATTA	2	12	1707722	1707733	50 %	50 %	0 %	0 %	75907608
544	NC_007413	TTGTGC	2	12	1709488	1709499	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	75907609
545	NC_007413	CATTCA	2	12	1709937	1709948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75907609
546	NC_007413	ATTGAT	2	12	1714650	1714661	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	75907612
547	NC_007413	CCATCA	2	12	1715908	1715919	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	75907612
548	NC_007413	CTGTAC	2	12	1720302	1720313	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	75907615
549	NC_007413	ACGCCT	2	12	1726139	1726150	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	75907619
550	NC_007413	GAAGCC	2	12	1727222	1727233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75907620
551	NC_007413	TGATTT	2	12	1731435	1731446	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	75907623
552	NC_007413	CGCGAT	2	12	1734615	1734626	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	75907628
553	NC_007413	ACCAGT	2	12	1735165	1735176	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	75907628
554	NC_007413	TAGGTG	2	12	1735563	1735574	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	75907628
555	NC_007413	GCTGGT	2	12	1737134	1737145	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	75907630
556	NC_007413	CTGTTG	2	12	1737189	1737200	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	75907630
557	NC_007413	AGGTGC	2	12	1738156	1738167	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	75907630
558	NC_007413	GAATAT	2	12	1744663	1744674	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	75907635
559	NC_007413	TGGCAC	2	12	1750858	1750869	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	75907641
560	NC_007413	CAGTAT	2	12	1757348	1757359	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	75907647
561	NC_007413	GTTAGA	2	12	1757739	1757750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75907647
562	NC_007413	GATACT	2	12	1767696	1767707	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	75907651
563	NC_007413	TATTTT	2	12	1772559	1772570	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	75907654
564	NC_007413	GATTAA	2	12	1772847	1772858	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	75907654
565	NC_007413	GAGGTA	2	12	1773745	1773756	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	75907655
566	NC_007413	TCTTCA	2	12	1778334	1778345	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	75907659
567	NC_007413	GCGATC	2	12	1782326	1782337	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	75907661
568	NC_007413	AAAGTT	2	12	1783260	1783271	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	75907663
569	NC_007413	TTTCTT	2	12	1787780	1787791	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	75907668
570	NC_007413	AATATT	2	12	1787964	1787975	50 %	50 %	0 %	0 %	75907668
571	NC_007413	CCCAGA	2	12	1789492	1789503	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	75907670
572	NC_007413	ATTGGT	2	12	1793630	1793641	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	75907673
573	NC_007413	TAACAA	2	12	1800839	1800850	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	75907681
574	NC_007413	TCAAGT	2	12	1807604	1807615	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	75907687
575	NC_007413	ATTGGT	2	12	1808397	1808408	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	75907687
576	NC_007413	CGCAGG	2	12	1808588	1808599	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	75907687
577	NC_007413	CCAAAT	2	12	1810459	1810470	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	75907688
578	NC_007413	AACCAG	3	18	1815993	1816010	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	75907693
579	NC_007413	TAGCTG	2	12	1829907	1829918	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	75907706
580	NC_007413	AAGCGG	2	12	1830363	1830374	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	75907706
581	NC_007413	TAGAGC	2	12	1833477	1833488	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75907711
582	NC_007413	GTTCCC	2	12	1840574	1840585	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	75907715
583	NC_007413	GTAGAA	2	12	1841030	1841041	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	75907715
584	NC_007413	CCGCGC	2	12	1844377	1844388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75907719
585	NC_007413	GGCTAC	2	12	1849224	1849235	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	75907723
586	NC_007413	TCCTGG	2	12	1859845	1859856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75907733
587	NC_007413	CCTGGG	2	12	1861456	1861467	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	75907734
588	NC_007413	TTGCTG	2	12	1861879	1861890	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	75907734
589	NC_007413	CTGATT	2	12	1865648	1865659	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	75907739
590	NC_007413	GGTAAG	2	12	1870425	1870436	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	75907743
591	NC_007413	ATTACC	2	12	1873653	1873664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75907746
592	NC_007413	TTAAAT	2	12	1887032	1887043	50 %	50 %	0 %	0 %	75907760
593	NC_007413	ACCATT	2	12	1893136	1893147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75907765
594	NC_007413	AACCAG	2	12	1894984	1894995	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	75907766
595	NC_007413	GCTACA	2	12	1895932	1895943	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	75907767
596	NC_007413	ACCCAG	2	12	1900725	1900736	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	75907770
597	NC_007413	CAACAG	2	12	1901612	1901623	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	75907770
598	NC_007413	GGTAAA	2	12	1903095	1903106	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	75907771
599	NC_007413	CGGCTG	2	12	1910480	1910491	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	75907777
600	NC_007413	AGATAA	2	12	1916838	1916849	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	75907779
601	NC_007413	TACCAT	2	12	1924853	1924864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75907785
602	NC_007413	CTGTCG	2	12	1929079	1929090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75907786
603	NC_007413	TTGGGC	2	12	1929109	1929120	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	75907786
604	NC_007413	ACCGCG	2	12	1931830	1931841	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	75907787
605	NC_007413	AAATAA	2	12	1935066	1935077	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	75907790
606	NC_007413	AGGGAT	2	12	1944241	1944252	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	75907795
607	NC_007413	GGGTTT	2	12	1944565	1944576	0 %	50 %	50 %	0 %	75907795
608	NC_007413	GGGTTT	2	12	1944610	1944621	0 %	50 %	50 %	0 %	75907795
609	NC_007413	GATCAG	2	12	1945579	1945590	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75907796
610	NC_007413	AATATC	2	12	1948584	1948595	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	75907799
611	NC_007413	ATTTAA	2	12	1952250	1952261	50 %	50 %	0 %	0 %	75907803
612	NC_007413	CGGTTA	2	12	1958325	1958336	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	75907808
613	NC_007413	GGCTGT	2	12	1962417	1962428	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	75907812
614	NC_007413	AGCTTG	2	12	1964757	1964768	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	75907814
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724	NC_007413	GCTTCT	2	12	2319569	2319580	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	75908088
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