MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 15739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003552	AAT	2	6	114	119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003552	ATT	2	6	1796	1801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003552	ATT	2	6	1845	1850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003552	ATT	2	6	1940	1945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003552	TAT	2	6	2180	2185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003552	TTA	2	6	2202	2207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003552	AAT	3	9	2381	2389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003552	GAA	2	6	2514	2519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003552	ATC	2	6	2526	2531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_003552	GAA	2	6	2610	2615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003552	ATA	2	6	2675	2680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003552	ATA	2	6	2731	2736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003552	CTG	2	6	3044	3049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_003552	TAC	2	6	3082	3087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_003552	CTA	2	6	3108	3113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_003552	ATA	2	6	5356	5361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003552	CTT	2	6	5394	5399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_003552	CTT	2	6	5486	5491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_003552	ATG	2	6	5672	5677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003552	AAT	2	6	5774	5779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003552	AAT	2	6	5793	5798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003552	TTA	2	6	5945	5950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003552	AAG	2	6	6060	6065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003552	TTA	2	6	6091	6096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003552	TTA	2	6	6106	6111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003552	TTC	2	6	6177	6182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_003552	AAT	2	6	6280	6285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003552	TGT	2	6	6440	6445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003552	TTA	2	6	6564	6569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003552	AAT	2	6	6691	6696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003552	CTA	2	6	6769	6774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_003552	TAT	2	6	7008	7013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003552	CTG	2	6	7018	7023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_003552	TAA	2	6	7079	7084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003552	TTC	2	6	7131	7136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_003552	ATT	2	6	7216	7221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003552	CCG	2	6	9428	9433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_003552	TTC	2	6	9474	9479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_003552	GAG	2	6	9504	9509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003552	AAT	2	6	10814	10819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003552	GAT	3	9	10823	10831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003552	AAT	2	6	10881	10886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003552	ATG	2	6	10926	10931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003552	TAA	2	6	10968	10973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003552	ATA	2	6	11003	11008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003552	TCA	2	6	11314	11319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_003552	TAT	2	6	11328	11333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003552	AAT	2	6	12467	12472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003552	TGC	2	6	12497	12502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_003552	AGT	2	6	12802	12807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003552	TAA	2	6	12924	12929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003552	TAA	2	6	14611	14616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003552	TAA	2	6	14644	14649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003552	AAT	2	6	14661	14666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003552	ATT	2	6	16366	16371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003552	ATT	2	6	16486	16491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003552	ATT	2	6	16542	16547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003552	ATT	2	6	16595	16600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003552	TAT	2	6	16727	16732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003552	AGC	2	6	16886	16891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_003552	GTA	2	6	16923	16928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003552	GTA	2	6	16930	16935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003552	AAG	2	6	16984	16989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003552	TTA	2	6	16993	16998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003552	ATA	2	6	17012	17017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003552	AGA	2	6	17057	17062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003552	TTG	2	6	17071	17076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003552	CCT	2	6	17570	17575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_003552	ATC	2	6	17588	17593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_003552	CTG	2	6	17602	17607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_003552	TAT	2	6	19599	19604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003552	TTA	2	6	21666	21671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003552	ATT	2	6	21673	21678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003552	TTG	2	6	22796	22801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003552	AAT	2	6	22900	22905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003552	ATT	2	6	23622	23627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003552	ATA	2	6	23631	23636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003552	TGA	2	6	24112	24117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003552	ATG	2	6	24213	24218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003552	AGG	2	6	24231	24236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003552	TAA	2	6	24273	24278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003552	TAT	2	6	24288	24293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003552	AAT	2	6	24518	24523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003552	CAC	2	6	24547	24552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_003552	ATT	2	6	24574	24579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003552	AAG	2	6	24598	24603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003552	AGA	3	9	25090	25098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003552	TTC	2	6	25169	25174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_003552	AAT	2	6	25608	25613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003552	TAT	2	6	25689	25694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003552	AAG	2	6	25715	25720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003552	CTT	2	6	30172	30177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_003552	TAC	2	6	30187	30192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_003552	TTC	2	6	30787	30792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_003552	GAG	2	6	33051	33056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003552	ATA	2	6	33059	33064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003552	TAT	2	6	33937	33942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003552	TTA	2	6	34198	34203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003552	AAG	2	6	34232	34237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003552	TAC	2	6	34263	34268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_003552	CCA	2	6	34507	34512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_003552	CAG	2	6	34521	34526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_003552	CTC	2	6	35172	35177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_003552	CTA	2	6	35254	35259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_003552	GGT	2	6	35294	35299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003552	TAT	2	6	35391	35396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003552	AAT	2	6	36774	36779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003552	GAA	2	6	36948	36953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003552	ATG	2	6	39394	39399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003552	ATA	2	6	39540	39545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003552	ATA	2	6	39549	39554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003552	ATG	2	6	39772	39777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003552	ACT	2	6	39824	39829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_003552	CTT	2	6	40200	40205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_003552	ATC	2	6	41058	41063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_003552	AAT	2	6	41144	41149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003552	TCC	2	6	41168	41173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_003552	TAT	2	6	44245	44250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003552	CTG	2	6	44327	44332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_003552	TTA	2	6	44361	44366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003552	TTC	2	6	44424	44429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_003552	ATT	2	6	44526	44531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003552	ATA	2	6	44591	44596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003552	ATT	3	9	44603	44611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003552	ATT	2	6	44662	44667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003552	TAT	3	9	44680	44688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003552	AAG	2	6	45829	45834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003552	TCC	2	6	45879	45884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_003552	GAA	2	6	45887	45892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003552	ATA	2	6	46040	46045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003552	ATC	2	6	46070	46075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_003552	CAG	2	6	46911	46916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_003552	CTC	2	6	46962	46967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_003552	AAT	2	6	46975	46980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003552	GAA	2	6	47030	47035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003552	AAC	2	6	49429	49434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_003552	AGT	2	6	49494	49499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003552	TCA	2	6	49555	49560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_003552	AGG	2	6	49617	49622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003552	ATT	2	6	50982	50987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003552	ATT	2	6	51098	51103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_003552	ATC	2	6	52504	52509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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453	NC_003552	TCC	2	6	190364	190369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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