MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 15739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_003552	AAG	2	6	2022241	2022246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_003552	AGA	2	6	2022259	2022264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_003552	TCT	2	6	2022818	2022823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_003552	TAT	2	6	2022957	2022962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_003552	TGA	2	6	2023458	2023463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_003552	CTG	2	6	2025493	2025498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_003552	AGG	2	6	2025674	2025679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_003552	TCT	2	6	2025787	2025792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_003552	ACT	2	6	2025957	2025962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_003552	AGG	2	6	2026003	2026008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_003552	TAC	2	6	2026063	2026068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_003552	GAA	2	6	2026100	2026105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_003552	AAC	2	6	2026238	2026243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_003552	ATT	2	6	2026584	2026589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_003552	GTT	2	6	2026597	2026602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_003552	GAA	2	6	2026630	2026635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_003552	TTA	2	6	2026663	2026668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_003552	GAA	2	6	2026717	2026722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_003552	CTT	2	6	2026783	2026788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_003552	TAT	2	6	2026813	2026818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_003552	ATT	2	6	2026826	2026831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_003552	GCT	2	6	2027985	2027990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_003552	TTC	2	6	2028014	2028019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_003552	AAT	2	6	2028034	2028039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_003552	TAA	2	6	2029390	2029395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_003552	TTC	2	6	2029402	2029407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_003552	CAA	2	6	2029429	2029434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_003552	ATG	2	6	2029462	2029467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_003552	ATG	2	6	2029488	2029493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_003552	TAA	2	6	2029511	2029516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_003552	TAA	2	6	2029525	2029530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_003552	AAC	2	6	2029592	2029597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_003552	AGA	2	6	2029607	2029612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_003552	CAA	2	6	2029651	2029656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_003552	AAT	2	6	2029668	2029673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_003552	ATA	2	6	2030067	2030072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_003552	AAT	2	6	2032635	2032640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_003552	ATA	2	6	2032679	2032684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_003552	AGG	2	6	2032712	2032717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_003552	TAA	2	6	2032866	2032871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_003552	ACT	2	6	2032877	2032882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_003552	AAT	3	9	2032921	2032929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_003552	TCT	2	6	2033111	2033116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_003552	TAG	2	6	2033155	2033160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_003552	GGA	2	6	2033268	2033273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_003552	TGC	2	6	2033324	2033329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_003552	TTC	2	6	2033371	2033376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_003552	CAA	2	6	2033473	2033478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_003552	TCT	2	6	2036025	2036030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_003552	GAA	2	6	2036089	2036094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_003552	GAA	2	6	2036331	2036336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_003552	TGA	2	6	2037274	2037279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_003552	TAG	2	6	2037397	2037402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_003552	GAA	2	6	2037446	2037451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_003552	CTT	2	6	2038459	2038464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_003552	TCC	2	6	2038589	2038594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5057	NC_003552	GGA	3	9	2038700	2038708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_003552	GAC	2	6	2038730	2038735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_003552	CCT	2	6	2039172	2039177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5060	NC_003552	GCA	2	6	2039275	2039280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_003552	AGA	2	6	2039422	2039427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_003552	TCT	3	9	2039472	2039480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_003552	CTT	2	6	2039484	2039489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_003552	CTT	2	6	2039495	2039500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_003552	ATG	2	6	2039722	2039727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_003552	CTC	2	6	2041020	2041025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5067	NC_003552	TCA	2	6	2041116	2041121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_003552	TTA	2	6	2041302	2041307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_003552	CAC	2	6	2041308	2041313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5070	NC_003552	GGA	2	6	2042100	2042105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_003552	GTA	2	6	2042298	2042303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_003552	TGT	2	6	2042371	2042376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_003552	ATG	2	6	2042400	2042405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_003552	ATA	2	6	2042534	2042539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_003552	TAA	2	6	2042711	2042716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_003552	AGG	2	6	2042808	2042813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_003552	CAA	2	6	2042818	2042823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_003552	TCT	2	6	2042825	2042830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_003552	TTA	2	6	2042856	2042861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_003552	TCA	2	6	2042925	2042930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_003552	GAC	2	6	2042945	2042950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_003552	ATT	2	6	2044321	2044326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_003552	ATT	2	6	2044328	2044333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_003552	TTA	2	6	2044346	2044351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_003552	TAT	2	6	2044379	2044384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_003552	AAG	2	6	2044821	2044826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_003552	TTC	2	6	2044832	2044837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_003552	GAT	2	6	2044863	2044868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_003552	GAT	2	6	2044876	2044881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_003552	AAT	2	6	2044898	2044903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_003552	ATT	2	6	2044950	2044955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_003552	AAC	2	6	2045591	2045596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_003552	ATT	2	6	2045642	2045647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_003552	TCT	2	6	2045666	2045671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_003552	AAT	2	6	2045694	2045699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_003552	AGT	2	6	2045705	2045710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_003552	AGA	2	6	2046081	2046086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_003552	TCT	2	6	2046174	2046179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_003552	TGT	2	6	2046181	2046186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_003552	TTC	2	6	2046187	2046192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_003552	GTT	2	6	2046240	2046245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_003552	ATA	2	6	2046404	2046409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_003552	CTT	2	6	2046519	2046524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_003552	CAA	2	6	2046628	2046633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_003552	CCT	2	6	2046675	2046680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5106	NC_003552	GTT	2	6	2046763	2046768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_003552	AAC	2	6	2046843	2046848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_003552	GAA	2	6	2047707	2047712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_003552	AAG	2	6	2047907	2047912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_003552	TTG	2	6	2048178	2048183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_003552	GTA	2	6	2048241	2048246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_003552	AGT	2	6	2048273	2048278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_003552	ATA	2	6	2048281	2048286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_003552	CTT	2	6	2048391	2048396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_003552	ATT	3	9	2048525	2048533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_003552	ATG	2	6	2048612	2048617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_003552	TAA	2	6	2048623	2048628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_003552	ATG	2	6	2048677	2048682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_003552	TAT	2	6	2049950	2049955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_003552	TAT	2	6	2049969	2049974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_003552	TTC	2	6	2050011	2050016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_003552	AAC	2	6	2050041	2050046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_003552	GTT	2	6	2050100	2050105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_003552	CCA	2	6	2050304	2050309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5125	NC_003552	AAC	2	6	2050368	2050373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5127	NC_003552	AAG	2	6	2051737	2051742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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