MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 15739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_003552	ATC	2	6	600754	600759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_003552	GTT	2	6	600877	600882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_003552	TTC	2	6	600903	600908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_003552	GAA	2	6	600933	600938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_003552	GAT	2	6	600998	601003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_003552	GTG	2	6	601122	601127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_003552	AAT	2	6	601221	601226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_003552	AGG	2	6	601271	601276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_003552	GAA	2	6	601766	601771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_003552	TAA	2	6	601821	601826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_003552	TTA	2	6	601831	601836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_003552	TCA	2	6	601842	601847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_003552	TCT	2	6	602703	602708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_003552	TAA	2	6	602814	602819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_003552	AAG	2	6	602830	602835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_003552	GAA	2	6	602866	602871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_003552	CCG	2	6	602910	602915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1518	NC_003552	TAA	2	6	602973	602978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_003552	CTT	2	6	603003	603008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_003552	TAA	2	6	603157	603162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_003552	TAA	2	6	603166	603171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_003552	ATT	2	6	603180	603185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_003552	TCT	2	6	604002	604007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_003552	TCT	2	6	604020	604025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_003552	CTT	2	6	604052	604057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_003552	TTC	2	6	604654	604659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_003552	GAA	2	6	605802	605807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_003552	CAG	2	6	605902	605907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_003552	ATA	2	6	606051	606056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_003552	CAT	2	6	606070	606075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_003552	ATG	2	6	606197	606202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_003552	TTC	2	6	606333	606338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_003552	TTC	2	6	608420	608425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_003552	TTC	2	6	608468	608473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_003552	TTC	2	6	608492	608497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_003552	TCT	2	6	608500	608505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_003552	AGC	2	6	611496	611501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_003552	CAT	2	6	611589	611594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_003552	CTT	2	6	611639	611644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_003552	AGG	2	6	611683	611688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_003552	CTT	2	6	612098	612103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_003552	AAT	2	6	612160	612165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_003552	GCA	2	6	612408	612413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_003552	GCA	2	6	612432	612437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_003552	TGG	2	6	612472	612477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_003552	GAT	2	6	612571	612576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_003552	GTA	2	6	612623	612628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_003552	CTT	2	6	614909	614914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_003552	TAA	2	6	615191	615196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_003552	ATG	2	6	615454	615459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_003552	GTA	2	6	615570	615575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_003552	CTT	2	6	615610	615615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_003552	ATT	2	6	615664	615669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_003552	GGA	2	6	615717	615722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_003552	GCA	2	6	618729	618734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_003552	GCT	2	6	618793	618798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_003552	CTG	2	6	618809	618814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_003552	CAG	2	6	620423	620428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_003552	AAT	2	6	620598	620603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_003552	GCA	2	6	622110	622115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_003552	CTT	2	6	622513	622518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_003552	ACT	2	6	622556	622561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_003552	CCT	2	6	622562	622567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1564	NC_003552	TTG	2	6	623468	623473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_003552	CAG	2	6	623478	623483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_003552	TCT	2	6	623583	623588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_003552	GTT	2	6	623652	623657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_003552	TTG	2	6	623665	623670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_003552	TTC	2	6	623885	623890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_003552	CTC	2	6	623906	623911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_003552	ATT	2	6	624086	624091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_003552	TCT	2	6	626575	626580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_003552	TTA	2	6	626654	626659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_003552	ATT	2	6	627012	627017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_003552	AGT	2	6	627045	627050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_003552	AGG	2	6	630429	630434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_003552	TAA	2	6	630984	630989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_003552	ATT	2	6	631120	631125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_003552	TTA	2	6	632454	632459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_003552	CAG	2	6	632497	632502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_003552	TTA	2	6	632545	632550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_003552	CTT	2	6	632560	632565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_003552	AGT	2	6	632835	632840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_003552	CTT	2	6	632859	632864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_003552	CTG	2	6	633005	633010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_003552	AGT	2	6	633496	633501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_003552	TTA	2	6	633543	633548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_003552	TTC	2	6	635850	635855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_003552	TCC	2	6	635864	635869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1590	NC_003552	GAA	2	6	635921	635926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_003552	TAT	2	6	636683	636688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_003552	ATT	2	6	636714	636719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_003552	CAG	2	6	638273	638278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_003552	CAG	2	6	638313	638318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_003552	TTC	2	6	638320	638325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_003552	CAA	2	6	640410	640415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_003552	TAA	2	6	640480	640485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_003552	ATT	3	9	640492	640500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_003552	ATT	2	6	640524	640529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_003552	TTC	2	6	644773	644778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_003552	ACT	2	6	644930	644935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_003552	ATT	3	9	644988	644996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_003552	CTG	2	6	645005	645010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_003552	AAG	2	6	650856	650861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_003552	AGA	2	6	650961	650966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_003552	ATC	2	6	651014	651019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_003552	TGA	2	6	651105	651110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_003552	AGA	2	6	651285	651290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_003552	GAA	2	6	651365	651370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_003552	GTT	2	6	651374	651379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_003552	ATT	2	6	651435	651440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_003552	CTG	2	6	651453	651458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_003552	TAT	2	6	651482	651487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_003552	TGC	2	6	652745	652750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_003552	CTT	2	6	652796	652801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_003552	CTG	2	6	652877	652882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_003552	CAG	2	6	652918	652923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_003552	GAA	2	6	652952	652957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_003552	CAG	3	9	655297	655305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_003552	AAG	2	6	655317	655322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_003552	GAA	2	6	655331	655336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_003552	CAG	3	9	657670	657678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_003552	CTT	2	6	659967	659972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_003552	ATA	2	6	660061	660066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_003552	AAT	2	6	660102	660107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_003552	GAA	2	6	660751	660756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_003552	GTA	2	6	660837	660842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_003552	TTG	2	6	660847	660852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_003552	ATA	2	6	660904	660909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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