MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 chromosome circular

Total Repeats: 2014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003062	GACCA	2	10	1281	1290	40 %	0 %	20 %	40 %	159184119
2	NC_003062	TGCTC	2	10	2822	2831	0 %	40 %	20 %	40 %	159184121
3	NC_003062	CCCGG	2	10	2929	2938	0 %	0 %	40 %	60 %	159184121
4	NC_003062	TCGAA	2	10	3147	3156	40 %	20 %	20 %	20 %	15887364
5	NC_003062	GTTTT	2	10	3869	3878	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003062	CGAAG	2	10	9197	9206	40 %	0 %	40 %	20 %	159184123
7	NC_003062	GCCGC	2	10	10442	10451	0 %	0 %	40 %	60 %	159184123
8	NC_003062	CCCAT	2	10	10800	10809	20 %	20 %	0 %	60 %	15887372
9	NC_003062	AAACG	2	10	11032	11041	60 %	0 %	20 %	20 %	15887372
10	NC_003062	TACCG	2	10	11598	11607	20 %	20 %	20 %	40 %	15887373
11	NC_003062	ATGAA	2	10	12319	12328	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003062	AGCCA	2	10	16223	16232	40 %	0 %	20 %	40 %	159184125
13	NC_003062	CGCCC	2	10	16412	16421	0 %	0 %	20 %	80 %	159184126
14	NC_003062	TGGTG	2	10	17050	17059	0 %	40 %	60 %	0 %	159184126
15	NC_003062	GGTGA	2	10	19231	19240	20 %	20 %	60 %	0 %	15887380
16	NC_003062	CTTCA	2	10	21218	21227	20 %	40 %	0 %	40 %	159184128
17	NC_003062	TGAAA	2	10	21425	21434	60 %	20 %	20 %	0 %	159184128
18	NC_003062	TCGCG	2	10	21524	21533	0 %	20 %	40 %	40 %	159184128
19	NC_003062	GGTTT	2	10	21815	21824	0 %	60 %	40 %	0 %	159184128
20	NC_003062	GCCCG	2	10	24083	24092	0 %	0 %	40 %	60 %	15887383
21	NC_003062	GCCCA	2	10	25082	25091	20 %	0 %	20 %	60 %	15887383
22	NC_003062	CATCG	2	10	26283	26292	20 %	20 %	20 %	40 %	15887383
23	NC_003062	CCGGG	2	10	27199	27208	0 %	0 %	60 %	40 %	159184129
24	NC_003062	TGCGC	2	10	27690	27699	0 %	20 %	40 %	40 %	15887385
25	NC_003062	GCCGG	2	10	29094	29103	0 %	0 %	60 %	40 %	15887386
26	NC_003062	CGCTG	2	10	29285	29294	0 %	20 %	40 %	40 %	15887386
27	NC_003062	CCGCG	2	10	35770	35779	0 %	0 %	40 %	60 %	15887391
28	NC_003062	CCGCA	2	10	41600	41609	20 %	0 %	20 %	60 %	15887397
29	NC_003062	GGCAT	2	10	43087	43096	20 %	20 %	40 %	20 %	159184136
30	NC_003062	GGTGA	2	10	44722	44731	20 %	20 %	60 %	0 %	426327210
31	NC_003062	GGGCC	2	10	45166	45175	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
32	NC_003062	AATGA	2	10	45895	45904	60 %	20 %	20 %	0 %	15887403
33	NC_003062	TTTTA	2	10	46570	46579	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003062	TTCAA	2	10	48439	48448	40 %	40 %	0 %	20 %	15887405
35	NC_003062	CACGC	2	10	49437	49446	20 %	0 %	20 %	60 %	15887405
36	NC_003062	AAAGC	2	10	49950	49959	60 %	0 %	20 %	20 %	15887405
37	NC_003062	CGGAG	2	10	50772	50781	20 %	0 %	60 %	20 %	159184139
38	NC_003062	AAATC	2	10	51244	51253	60 %	20 %	0 %	20 %	159184140
39	NC_003062	GATCG	2	10	52122	52131	20 %	20 %	40 %	20 %	15887408
40	NC_003062	GGTCT	2	10	52161	52170	0 %	40 %	40 %	20 %	15887408
41	NC_003062	GCCGG	2	10	53979	53988	0 %	0 %	60 %	40 %	159184142
42	NC_003062	CGCCC	2	10	54461	54470	0 %	0 %	20 %	80 %	159184142
43	NC_003062	TCGTG	2	10	57755	57764	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_003062	GGGCT	2	10	57900	57909	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_003062	TGATC	2	10	58873	58882	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_003062	GAAGA	2	10	59027	59036	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003062	CTGAA	2	10	61334	61343	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_003062	TCTGT	2	10	62380	62389	0 %	60 %	20 %	20 %	159184144
49	NC_003062	TTAAA	2	10	62526	62535	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003062	ACCAC	2	10	65556	65565	40 %	0 %	0 %	60 %	15887416
51	NC_003062	CGGCG	2	10	68064	68073	0 %	0 %	60 %	40 %	159184145
52	NC_003062	ACCGC	2	10	68474	68483	20 %	0 %	20 %	60 %	159184145
53	NC_003062	CGGTG	2	10	69038	69047	0 %	20 %	60 %	20 %	15887419
54	NC_003062	AGCGA	2	10	72798	72807	40 %	0 %	40 %	20 %	159184147
55	NC_003062	CCACT	2	10	73403	73412	20 %	20 %	0 %	60 %	159184147
56	NC_003062	TCGGC	2	10	75698	75707	0 %	20 %	40 %	40 %	15887425
57	NC_003062	GTTTC	2	10	76183	76192	0 %	60 %	20 %	20 %	159184149
58	NC_003062	CGATA	2	10	79544	79553	40 %	20 %	20 %	20 %	15887430
59	NC_003062	CCAGC	2	10	79763	79772	20 %	0 %	20 %	60 %	15887430
60	NC_003062	TGCAT	2	10	80390	80399	20 %	40 %	20 %	20 %	159184151
61	NC_003062	GACGG	2	10	80624	80633	20 %	0 %	60 %	20 %	159184151
62	NC_003062	GTGCC	2	10	80815	80824	0 %	20 %	40 %	40 %	159184151
63	NC_003062	GGTTT	2	10	81571	81580	0 %	60 %	40 %	0 %	15887433
64	NC_003062	ATTCC	2	10	82294	82303	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_003062	CTTCG	2	10	85743	85752	0 %	40 %	20 %	40 %	15887437
66	NC_003062	AGCGA	2	10	89297	89306	40 %	0 %	40 %	20 %	15887441
67	NC_003062	CGGCG	2	10	90859	90868	0 %	0 %	60 %	40 %	15887441
68	NC_003062	GGCTC	2	10	90893	90902	0 %	20 %	40 %	40 %	15887441
69	NC_003062	CCTGC	2	10	91692	91701	0 %	20 %	20 %	60 %	15887442
70	NC_003062	CGGAC	2	10	91890	91899	20 %	0 %	40 %	40 %	15887442
71	NC_003062	CCGGC	2	10	92010	92019	0 %	0 %	40 %	60 %	15887442
72	NC_003062	GAACG	2	10	94098	94107	40 %	0 %	40 %	20 %	15887444
73	NC_003062	CGGCC	2	10	95330	95339	0 %	0 %	40 %	60 %	159184153
74	NC_003062	CTTCG	2	10	96059	96068	0 %	40 %	20 %	40 %	159184153
75	NC_003062	CATGG	2	10	98264	98273	20 %	20 %	40 %	20 %	15887447
76	NC_003062	GGTCA	2	10	99188	99197	20 %	20 %	40 %	20 %	15887449
77	NC_003062	CCGGC	2	10	99366	99375	0 %	0 %	40 %	60 %	15887449
78	NC_003062	GCGCC	2	10	100190	100199	0 %	0 %	40 %	60 %	15887450
79	NC_003062	CCGCG	2	10	100360	100369	0 %	0 %	40 %	60 %	15887450
80	NC_003062	CGGCT	2	10	100709	100718	0 %	20 %	40 %	40 %	15887450
81	NC_003062	CAAGC	2	10	101579	101588	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_003062	CGCAT	2	10	103038	103047	20 %	20 %	20 %	40 %	15887453
83	NC_003062	ATGCG	2	10	107292	107301	20 %	20 %	40 %	20 %	15887457
84	NC_003062	GATGG	2	10	109069	109078	20 %	20 %	60 %	0 %	15887458
85	NC_003062	CGCTG	2	10	109637	109646	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_003062	TCGAT	2	10	112256	112265	20 %	40 %	20 %	20 %	159184161
87	NC_003062	GCATG	2	10	114788	114797	20 %	20 %	40 %	20 %	159184162
88	NC_003062	AGGTG	2	10	117013	117022	20 %	20 %	60 %	0 %	15887466
89	NC_003062	TACGA	2	10	121256	121265	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_003062	CGGCG	2	10	121411	121420	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_003062	CGGCG	2	10	122908	122917	0 %	0 %	60 %	40 %	15887472
92	NC_003062	CCCGC	2	10	123779	123788	0 %	0 %	20 %	80 %	15887472
93	NC_003062	TTCGC	2	10	124060	124069	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_003062	CCGGA	2	10	124416	124425	20 %	0 %	40 %	40 %	15887474
95	NC_003062	GCACA	2	10	124593	124602	40 %	0 %	20 %	40 %	15887474
96	NC_003062	GCGCG	2	10	125574	125583	0 %	0 %	60 %	40 %	15887475
97	NC_003062	ACTTC	2	10	127464	127473	20 %	40 %	0 %	40 %	15887476
98	NC_003062	CTCGA	2	10	128787	128796	20 %	20 %	20 %	40 %	159184169
99	NC_003062	ATGAT	2	10	130967	130976	40 %	40 %	20 %	0 %	159184171
100	NC_003062	AGGTT	2	10	131038	131047	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003062	GATGC	2	10	134087	134096	20 %	20 %	40 %	20 %	15887484
102	NC_003062	GCTCT	2	10	134906	134915	0 %	40 %	20 %	40 %	159184173
103	NC_003062	CGATC	2	10	135163	135172	20 %	20 %	20 %	40 %	15887486
104	NC_003062	TCGCA	2	10	136062	136071	20 %	20 %	20 %	40 %	159184174
105	NC_003062	ATTCC	2	10	137158	137167	20 %	40 %	0 %	40 %	15887488
106	NC_003062	AGGCG	2	10	137510	137519	20 %	0 %	60 %	20 %	15887488
107	NC_003062	AGCAG	2	10	139100	139109	40 %	0 %	40 %	20 %	15887490
108	NC_003062	GTGCG	2	10	139384	139393	0 %	20 %	60 %	20 %	15887491
109	NC_003062	TCTTT	2	10	139936	139945	0 %	80 %	0 %	20 %	15887491
110	NC_003062	GCCGC	2	10	145644	145653	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
111	NC_003062	GTTTC	2	10	145688	145697	0 %	60 %	20 %	20 %	159184178
112	NC_003062	TGCCG	2	10	148915	148924	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_003062	CGGCC	2	10	149788	149797	0 %	0 %	40 %	60 %	159184180
114	NC_003062	CCGCA	2	10	151750	151759	20 %	0 %	20 %	60 %	159184180
115	NC_003062	GCTCG	2	10	153517	153526	0 %	20 %	40 %	40 %	159184180
116	NC_003062	AAGCC	2	10	153717	153726	40 %	0 %	20 %	40 %	159184180
117	NC_003062	AACGG	2	10	153821	153830	40 %	0 %	40 %	20 %	159184180
118	NC_003062	AAATG	2	10	159393	159402	60 %	20 %	20 %	0 %	159184184
119	NC_003062	CTTGG	2	10	159408	159417	0 %	40 %	40 %	20 %	159184184
120	NC_003062	ACTTC	2	10	159749	159758	20 %	40 %	0 %	40 %	159184185
121	NC_003062	CAGGA	2	10	160042	160051	40 %	0 %	40 %	20 %	159184185
122	NC_003062	CCGAT	2	10	164270	164279	20 %	20 %	20 %	40 %	15887513
123	NC_003062	GGCCG	2	10	165556	165565	0 %	0 %	60 %	40 %	159184190
124	NC_003062	CGGTG	2	10	166774	166783	0 %	20 %	60 %	20 %	15887516
125	NC_003062	TTACC	2	10	169169	169178	20 %	40 %	0 %	40 %	15887518
126	NC_003062	AATAA	2	10	171129	171138	80 %	20 %	0 %	0 %	159184193
127	NC_003062	GGGTC	2	10	171585	171594	0 %	20 %	60 %	20 %	15887520
128	NC_003062	CCGAG	2	10	173813	173822	20 %	0 %	40 %	40 %	15887522
129	NC_003062	CTTTT	2	10	180279	180288	0 %	80 %	0 %	20 %	159184198
130	NC_003062	GTCGT	2	10	182374	182383	0 %	40 %	40 %	20 %	15887532
131	NC_003062	TCCTC	2	10	184481	184490	0 %	40 %	0 %	60 %	15887535
132	NC_003062	TGGCG	2	10	185557	185566	0 %	20 %	60 %	20 %	15887536
133	NC_003062	GGTGA	2	10	186351	186360	20 %	20 %	60 %	0 %	159184200
134	NC_003062	GAGAG	2	10	186724	186733	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003062	GGTCT	2	10	192123	192132	0 %	40 %	40 %	20 %	15887542
136	NC_003062	CGTGC	2	10	194029	194038	0 %	20 %	40 %	40 %	159184203
137	NC_003062	CCGAA	2	10	194546	194555	40 %	0 %	20 %	40 %	159184203
138	NC_003062	GCGCC	2	10	196592	196601	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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161	NC_003062	TTTTG	2	10	233201	233210	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_003062	TCCGC	2	10	395006	395015	0 %	20 %	20 %	60 %	159184293
272	NC_003062	ATTTG	2	10	395605	395614	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_003062	GAAAA	2	10	400151	400160	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
280	NC_003062	GTTCA	2	10	400186	400195	20 %	40 %	20 %	20 %	15887754
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305	NC_003062	GGTGC	2	10	429754	429763	0 %	20 %	60 %	20 %	15887780
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313	NC_003062	TACGG	2	10	441303	441312	20 %	20 %	40 %	20 %	159184307
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342	NC_003062	CGAAG	2	10	469344	469353	40 %	0 %	40 %	20 %	159184330
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369	NC_003062	CCGCA	2	10	510036	510045	20 %	0 %	20 %	60 %	15887867
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372	NC_003062	GAATG	2	10	514110	514119	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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377	NC_003062	TGGGG	2	10	523519	523528	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
378	NC_003062	CGGTG	2	10	524811	524820	0 %	20 %	60 %	20 %	159184356
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382	NC_003062	ACCGC	2	10	528666	528675	20 %	0 %	20 %	60 %	15887885
383	NC_003062	AAACG	2	10	529598	529607	60 %	0 %	20 %	20 %	159184360
384	NC_003062	GAAGC	2	10	531049	531058	40 %	0 %	40 %	20 %	15887887
385	NC_003062	ACCGA	2	10	533522	533531	40 %	0 %	20 %	40 %	159184361
386	NC_003062	AAACC	2	10	535523	535532	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
387	NC_003062	CGACG	2	10	538228	538237	20 %	0 %	40 %	40 %	15887895
388	NC_003062	AGGGC	2	10	539360	539369	20 %	0 %	60 %	20 %	15887896
389	NC_003062	TCGCC	2	10	539746	539755	0 %	20 %	20 %	60 %	159184363
390	NC_003062	TGAGG	2	10	545650	545659	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
391	NC_003062	AGCCG	2	10	548584	548593	20 %	0 %	40 %	40 %	15887909
392	NC_003062	CGCAG	2	10	548973	548982	20 %	0 %	40 %	40 %	15887909
393	NC_003062	CCGGC	2	10	553933	553942	0 %	0 %	40 %	60 %	15887914
394	NC_003062	ATCGG	2	10	554424	554433	20 %	20 %	40 %	20 %	15887914
395	NC_003062	CCGAG	2	10	554802	554811	20 %	0 %	40 %	40 %	15887915
396	NC_003062	GGCAA	2	10	557267	557276	40 %	0 %	40 %	20 %	15887916
397	NC_003062	GCCGC	2	10	558607	558616	0 %	0 %	40 %	60 %	15887918
398	NC_003062	CTCTT	2	10	560447	560456	0 %	60 %	0 %	40 %	15887920
399	NC_003062	TGGCG	2	10	561002	561011	0 %	20 %	60 %	20 %	15887920
400	NC_003062	TTCAT	2	10	561732	561741	20 %	60 %	0 %	20 %	15887921
401	NC_003062	TGAAA	2	10	563195	563204	60 %	20 %	20 %	0 %	15887922
402	NC_003062	CCTTC	2	10	565493	565502	0 %	40 %	0 %	60 %	159184372
403	NC_003062	CATTG	2	10	566692	566701	20 %	40 %	20 %	20 %	159184373
404	NC_003062	GTCCT	2	10	570205	570214	0 %	40 %	20 %	40 %	15887932
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