MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 chromosome circular

Total Repeats: 2014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_003062	AGCCG	2	10	2088494	2088503	20 %	0 %	40 %	40 %	15889405
1502	NC_003062	CAGCC	2	10	2091092	2091101	20 %	0 %	20 %	60 %	159185059
1503	NC_003062	ATTCC	2	10	2093805	2093814	20 %	40 %	0 %	40 %	159185062
1504	NC_003062	GGCGA	2	10	2094122	2094131	20 %	0 %	60 %	20 %	159185062
1505	NC_003062	TCCTC	2	10	2094510	2094519	0 %	40 %	0 %	60 %	159185062
1506	NC_003062	AGCGA	2	10	2095932	2095941	40 %	0 %	40 %	20 %	15889410
1507	NC_003062	TGAAG	2	10	2096134	2096143	40 %	20 %	40 %	0 %	15889410
1508	NC_003062	ACGAA	2	10	2096267	2096276	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1509	NC_003062	GGCCG	2	10	2096301	2096310	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1510	NC_003062	AGTGC	2	10	2097658	2097667	20 %	20 %	40 %	20 %	15889413
1511	NC_003062	GGCGA	2	10	2099112	2099121	20 %	0 %	60 %	20 %	159185065
1512	NC_003062	GCAAG	2	10	2100168	2100177	40 %	0 %	40 %	20 %	159185066
1513	NC_003062	ACGCC	2	10	2100296	2100305	20 %	0 %	20 %	60 %	159185066
1514	NC_003062	CATCG	2	10	2101334	2101343	20 %	20 %	20 %	40 %	159185067
1515	NC_003062	GCCCT	2	10	2102813	2102822	0 %	20 %	20 %	60 %	15889418
1516	NC_003062	GTCGC	2	10	2106526	2106535	0 %	20 %	40 %	40 %	15889423
1517	NC_003062	GAACG	2	10	2108043	2108052	40 %	0 %	40 %	20 %	159185071
1518	NC_003062	GTCCG	2	10	2108714	2108723	0 %	20 %	40 %	40 %	159185071
1519	NC_003062	GCGTG	2	10	2110091	2110100	0 %	20 %	60 %	20 %	15889425
1520	NC_003062	GCCTC	2	10	2113200	2113209	0 %	20 %	20 %	60 %	159185074
1521	NC_003062	TGCCC	2	10	2114268	2114277	0 %	20 %	20 %	60 %	159185075
1522	NC_003062	CCATG	2	10	2116607	2116616	20 %	20 %	20 %	40 %	159185076
1523	NC_003062	ACGCG	2	10	2117736	2117745	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1524	NC_003062	GGCGT	2	10	2119434	2119443	0 %	20 %	60 %	20 %	15889435
1525	NC_003062	GCCGC	2	10	2120900	2120909	0 %	0 %	40 %	60 %	159185077
1526	NC_003062	CGAGC	2	10	2122424	2122433	20 %	0 %	40 %	40 %	159185077
1527	NC_003062	TGGCG	2	10	2123126	2123135	0 %	20 %	60 %	20 %	159185077
1528	NC_003062	AGTCA	2	10	2123917	2123926	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1529	NC_003062	CCCTG	2	10	2124108	2124117	0 %	20 %	20 %	60 %	159185078
1530	NC_003062	CGTGG	2	10	2126801	2126810	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1531	NC_003062	CTATG	2	10	2127129	2127138	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1532	NC_003062	TGCCA	2	10	2127932	2127941	20 %	20 %	20 %	40 %	159185081
1533	NC_003062	CGGCG	2	10	2129730	2129739	0 %	0 %	60 %	40 %	15889442
1534	NC_003062	CGGCT	2	10	2134260	2134269	0 %	20 %	40 %	40 %	159185083
1535	NC_003062	GCGAG	2	10	2134724	2134733	20 %	0 %	60 %	20 %	15889446
1536	NC_003062	CCGGA	2	10	2135981	2135990	20 %	0 %	40 %	40 %	15889446
1537	NC_003062	CGCCC	3	15	2137580	2137594	0 %	0 %	20 %	80 %	15889447
1538	NC_003062	GGCTT	2	10	2137857	2137866	0 %	40 %	40 %	20 %	15889447
1539	NC_003062	GCGCG	2	10	2138199	2138208	0 %	0 %	60 %	40 %	15889447
1540	NC_003062	CCACG	2	10	2139678	2139687	20 %	0 %	20 %	60 %	15889448
1541	NC_003062	GCCCG	2	10	2141255	2141264	0 %	0 %	40 %	60 %	159185084
1542	NC_003062	AGACA	2	10	2143369	2143378	60 %	0 %	20 %	20 %	159185085
1543	NC_003062	TGCGC	2	10	2148169	2148178	0 %	20 %	40 %	40 %	15889454
1544	NC_003062	TCCAT	2	10	2149006	2149015	20 %	40 %	0 %	40 %	15889454
1545	NC_003062	TTCGC	2	10	2152442	2152451	0 %	40 %	20 %	40 %	159185089
1546	NC_003062	TTTTG	2	10	2154224	2154233	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_003062	GCCGC	2	10	2154336	2154345	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1548	NC_003062	TCGAA	2	10	2154414	2154423	40 %	20 %	20 %	20 %	15889458
1549	NC_003062	CCGCT	2	10	2155109	2155118	0 %	20 %	20 %	60 %	159185090
1550	NC_003062	CGCCC	2	10	2157312	2157321	0 %	0 %	20 %	80 %	15889460
1551	NC_003062	CGATG	2	10	2159279	2159288	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1552	NC_003062	CCGAT	2	10	2161327	2161336	20 %	20 %	20 %	40 %	159185092
1553	NC_003062	CTGGA	2	10	2163975	2163984	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1554	NC_003062	GGCTG	2	10	2164210	2164219	0 %	20 %	60 %	20 %	15889468
1555	NC_003062	TGCGG	2	10	2166048	2166057	0 %	20 %	60 %	20 %	159185095
1556	NC_003062	GTGCC	2	10	2167603	2167612	0 %	20 %	40 %	40 %	15889471
1557	NC_003062	CTGCC	2	10	2167740	2167749	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1558	NC_003062	GGCAG	2	10	2167870	2167879	20 %	0 %	60 %	20 %	159185096
1559	NC_003062	GGGAA	2	10	2168439	2168448	40 %	0 %	60 %	0 %	159185098
1560	NC_003062	TCTCG	2	10	2168599	2168608	0 %	40 %	20 %	40 %	15889473
1561	NC_003062	CGAAA	2	10	2169561	2169570	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1562	NC_003062	CATAT	2	10	2171496	2171505	40 %	40 %	0 %	20 %	15889475
1563	NC_003062	ATGAC	2	10	2174445	2174454	40 %	20 %	20 %	20 %	15889480
1564	NC_003062	CGGCC	2	10	2174955	2174964	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1565	NC_003062	GAACC	2	10	2175446	2175455	40 %	0 %	20 %	40 %	159185099
1566	NC_003062	AAGAC	2	10	2177667	2177676	60 %	0 %	20 %	20 %	15889484
1567	NC_003062	CGCGG	2	10	2177873	2177882	0 %	0 %	60 %	40 %	15889484
1568	NC_003062	GGCCG	2	10	2179208	2179217	0 %	0 %	60 %	40 %	159185101
1569	NC_003062	GACCG	2	10	2179271	2179280	20 %	0 %	40 %	40 %	159185101
1570	NC_003062	CGAAA	2	10	2179418	2179427	60 %	0 %	20 %	20 %	159185101
1571	NC_003062	ACCCT	2	10	2182667	2182676	20 %	20 %	0 %	60 %	15889490
1572	NC_003062	AACGC	2	10	2183335	2183344	40 %	0 %	20 %	40 %	15889491
1573	NC_003062	AAGGC	2	10	2183928	2183937	40 %	0 %	40 %	20 %	15889491
1574	NC_003062	GTCCA	2	10	2186488	2186497	20 %	20 %	20 %	40 %	159185103
1575	NC_003062	GGCGA	2	10	2187208	2187217	20 %	0 %	60 %	20 %	159185103
1576	NC_003062	ACCGC	2	10	2187221	2187230	20 %	0 %	20 %	60 %	159185103
1577	NC_003062	TGCGA	2	10	2187773	2187782	20 %	20 %	40 %	20 %	15889495
1578	NC_003062	CTGAA	2	10	2187945	2187954	40 %	20 %	20 %	20 %	15889495
1579	NC_003062	GCCCG	2	10	2188428	2188437	0 %	0 %	40 %	60 %	159185104
1580	NC_003062	TTCGC	2	10	2188516	2188525	0 %	40 %	20 %	40 %	159185104
1581	NC_003062	CCAGC	2	10	2189337	2189346	20 %	0 %	20 %	60 %	159185104
1582	NC_003062	AGCGA	2	10	2197978	2197987	40 %	0 %	40 %	20 %	159185109
1583	NC_003062	CCGTT	2	10	2199380	2199389	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1584	NC_003062	CGCAG	2	10	2199600	2199609	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1585	NC_003062	TGCCC	2	10	2204577	2204586	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1586	NC_003062	TGCCG	2	10	2204773	2204782	0 %	20 %	40 %	40 %	159185112
1587	NC_003062	GCGCG	2	10	2204872	2204881	0 %	0 %	60 %	40 %	159185112
1588	NC_003062	CGCAG	2	10	2206117	2206126	20 %	0 %	40 %	40 %	159185113
1589	NC_003062	CCGCC	2	10	2207355	2207364	0 %	0 %	20 %	80 %	159185114
1590	NC_003062	CGGCG	2	10	2207442	2207451	0 %	0 %	60 %	40 %	159185114
1591	NC_003062	TCTGG	2	10	2211066	2211075	0 %	40 %	40 %	20 %	159185117
1592	NC_003062	CACCG	2	10	2212815	2212824	20 %	0 %	20 %	60 %	159185118
1593	NC_003062	CCGTC	2	10	2215051	2215060	0 %	20 %	20 %	60 %	159185119
1594	NC_003062	GGTCA	2	10	2216804	2216813	20 %	20 %	40 %	20 %	15889519
1595	NC_003062	ACCGA	2	10	2218325	2218334	40 %	0 %	20 %	40 %	159185120
1596	NC_003062	TCCGG	2	10	2218562	2218571	0 %	20 %	40 %	40 %	159185120
1597	NC_003062	CATCT	2	10	2218709	2218718	20 %	40 %	0 %	40 %	159185120
1598	NC_003062	CATCA	2	10	2221353	2221362	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1599	NC_003062	CCGTG	2	10	2222628	2222637	0 %	20 %	40 %	40 %	159185123
1600	NC_003062	TCCCG	2	10	2223108	2223117	0 %	20 %	20 %	60 %	15889527
1601	NC_003062	GGAAA	2	10	2223241	2223250	60 %	0 %	40 %	0 %	15889527
1602	NC_003062	CGACA	2	10	2224912	2224921	40 %	0 %	20 %	40 %	15889529
1603	NC_003062	TCCGC	2	10	2225040	2225049	0 %	20 %	20 %	60 %	15889529
1604	NC_003062	AACCT	2	10	2225314	2225323	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1605	NC_003062	CACCG	2	10	2226167	2226176	20 %	0 %	20 %	60 %	159185124
1606	NC_003062	ACGGC	2	10	2226785	2226794	20 %	0 %	40 %	40 %	15889531
1607	NC_003062	TTCGC	2	10	2227442	2227451	0 %	40 %	20 %	40 %	15889531
1608	NC_003062	GCCGA	2	10	2227639	2227648	20 %	0 %	40 %	40 %	15889531
1609	NC_003062	CGCCC	2	10	2228128	2228137	0 %	0 %	20 %	80 %	15889531
1610	NC_003062	TGACA	2	10	2229061	2229070	40 %	20 %	20 %	20 %	15889531
1611	NC_003062	GCCGG	2	10	2230217	2230226	0 %	0 %	60 %	40 %	15889532
1612	NC_003062	CCGCA	2	10	2233383	2233392	20 %	0 %	20 %	60 %	159185126
1613	NC_003062	CACCG	2	10	2233416	2233425	20 %	0 %	20 %	60 %	159185126
1614	NC_003062	CTGCC	2	10	2236490	2236499	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1615	NC_003062	GGCAG	2	10	2236620	2236629	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1616	NC_003062	GGCCC	2	10	2240383	2240392	0 %	0 %	40 %	60 %	15889541
1617	NC_003062	GCCCG	2	10	2240783	2240792	0 %	0 %	40 %	60 %	15889541
1618	NC_003062	CATCG	2	10	2241808	2241817	20 %	20 %	20 %	40 %	15889542
1619	NC_003062	ATGCC	2	10	2243262	2243271	20 %	20 %	20 %	40 %	159185132
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1621	NC_003062	GCCGC	2	10	2243821	2243830	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1622	NC_003062	TCGGC	2	10	2244404	2244413	0 %	20 %	40 %	40 %	159185133
1623	NC_003062	CGGCG	2	10	2246041	2246050	0 %	0 %	60 %	40 %	159185136
1624	NC_003062	AGGTC	2	10	2247445	2247454	20 %	20 %	40 %	20 %	15889551
1625	NC_003062	TGCCG	2	10	2249042	2249051	0 %	20 %	40 %	40 %	15889552
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1627	NC_003062	GAAAA	2	10	2250880	2250889	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1741	NC_003062	GGCAG	2	10	2411522	2411531	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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1755	NC_003062	GCGTG	2	10	2433885	2433894	0 %	20 %	60 %	20 %	15889735
1756	NC_003062	CGGCG	2	10	2434202	2434211	0 %	0 %	60 %	40 %	15889736
1757	NC_003062	TCGCC	2	10	2434540	2434549	0 %	20 %	20 %	60 %	15889736
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1766	NC_003062	CGCAT	2	10	2460062	2460071	20 %	20 %	20 %	40 %	159185240
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1770	NC_003062	CTCAT	2	10	2469108	2469117	20 %	40 %	0 %	40 %	15889766
1771	NC_003062	AAATA	2	10	2470135	2470144	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1774	NC_003062	CGCCC	2	10	2471695	2471704	0 %	0 %	20 %	80 %	15889768
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1784	NC_003062	TTGGG	2	10	2495730	2495739	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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1803	NC_003062	CACGA	2	10	2517606	2517615	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1811	NC_003062	CAAAT	2	10	2532320	2532329	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1824	NC_003062	AAATG	2	10	2553321	2553330	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1850	NC_003062	CATGG	2	10	2589136	2589145	20 %	20 %	40 %	20 %	15889866
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1854	NC_003062	CCATG	2	10	2593372	2593381	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1855	NC_003062	GGCTA	2	10	2596172	2596181	20 %	20 %	40 %	20 %	159185292
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1861	NC_003062	CACGA	2	10	2603518	2603527	40 %	0 %	20 %	40 %	159185295
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1864	NC_003062	TTTGA	2	10	2608584	2608593	20 %	60 %	20 %	0 %	15889879
1865	NC_003062	CGCGG	2	10	2608617	2608626	0 %	0 %	60 %	40 %	15889879
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1872	NC_003062	CAACA	2	10	2617716	2617725	60 %	0 %	0 %	40 %	159185303
1873	NC_003062	CATTC	2	10	2617994	2618003	20 %	40 %	0 %	40 %	159185303
1874	NC_003062	TCGCT	2	10	2619371	2619380	0 %	40 %	20 %	40 %	15889890
1875	NC_003062	GCAGC	2	10	2622600	2622609	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1876	NC_003062	TTCAA	2	10	2625777	2625786	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1877	NC_003062	GGAAT	2	10	2627141	2627150	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1878	NC_003062	AAGCG	2	10	2627161	2627170	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1879	NC_003062	GACGC	2	10	2627943	2627952	20 %	0 %	40 %	40 %	15889898
1880	NC_003062	GCATC	2	10	2630282	2630291	20 %	20 %	20 %	40 %	15889899
1881	NC_003062	CCTCA	2	10	2633520	2633529	20 %	20 %	0 %	60 %	15889906
1882	NC_003062	GCCGA	2	10	2633644	2633653	20 %	0 %	40 %	40 %	15889906
1883	NC_003062	GAGAC	2	10	2633836	2633845	40 %	0 %	40 %	20 %	15889906
1884	NC_003062	GCCCG	2	10	2634097	2634106	0 %	0 %	40 %	60 %	15889906
1885	NC_003062	GCGCG	2	10	2634579	2634588	0 %	0 %	60 %	40 %	159185308
1886	NC_003062	CATCC	2	10	2636711	2636720	20 %	20 %	0 %	60 %	15889909
1887	NC_003062	ACCTC	2	10	2637360	2637369	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1888	NC_003062	CATCG	2	10	2638472	2638481	20 %	20 %	20 %	40 %	159185309
1889	NC_003062	CAGGC	2	10	2638947	2638956	20 %	0 %	40 %	40 %	159185310
1890	NC_003062	GCCGT	2	10	2640403	2640412	0 %	20 %	40 %	40 %	159185310
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1894	NC_003062	TCCAC	2	10	2646873	2646882	20 %	20 %	0 %	60 %	15889919
1895	NC_003062	GCATC	2	10	2647236	2647245	20 %	20 %	20 %	40 %	159185314
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1897	NC_003062	TCAAT	2	10	2649327	2649336	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1898	NC_003062	CACGC	2	10	2649874	2649883	20 %	0 %	20 %	60 %	15889921
1899	NC_003062	TCTGG	2	10	2654018	2654027	0 %	40 %	40 %	20 %	159185318
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1901	NC_003062	GGTCA	2	10	2656012	2656021	20 %	20 %	40 %	20 %	15889927
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1904	NC_003062	CCCTT	2	10	2659443	2659452	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1905	NC_003062	CGATC	2	10	2661148	2661157	20 %	20 %	20 %	40 %	159185324
1906	NC_003062	ATGCA	2	10	2661375	2661384	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1907	NC_003062	CTTCG	2	10	2663462	2663471	0 %	40 %	20 %	40 %	15889936
1908	NC_003062	CGCTG	2	10	2665878	2665887	0 %	20 %	40 %	40 %	15889937
1909	NC_003062	CCGGT	2	10	2667225	2667234	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1910	NC_003062	CGGAT	2	10	2667267	2667276	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1911	NC_003062	TGTGA	2	10	2667932	2667941	20 %	40 %	40 %	0 %	159185326
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1927	NC_003062	GCGCC	2	10	2704201	2704210	0 %	0 %	40 %	60 %	159185345
1928	NC_003062	CATCG	2	10	2711121	2711130	20 %	20 %	20 %	40 %	15889977
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1942	NC_003062	ACCGA	2	10	2726207	2726216	40 %	0 %	20 %	40 %	159185353
1943	NC_003062	GGCAT	2	10	2727504	2727513	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1944	NC_003062	GCGAT	2	10	2727777	2727786	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1945	NC_003062	CCGGA	2	10	2728865	2728874	20 %	0 %	40 %	40 %	159185354
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1975	NC_003062	ATTAC	2	10	2776243	2776252	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1976	NC_003062	TCCGG	2	10	2778612	2778621	0 %	20 %	40 %	40 %	15890022
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1979	NC_003062	AGCGA	2	10	2781936	2781945	40 %	0 %	40 %	20 %	15890025
1980	NC_003062	GCCGG	2	10	2782110	2782119	0 %	0 %	60 %	40 %	15890025
1981	NC_003062	CATGC	2	10	2786823	2786832	20 %	20 %	20 %	40 %	159185379
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1983	NC_003062	AGACC	2	10	2789578	2789587	40 %	0 %	20 %	40 %	159185381
1984	NC_003062	TGCTT	2	10	2792309	2792318	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1985	NC_003062	GCTGG	2	10	2793930	2793939	0 %	20 %	60 %	20 %	159185384
1986	NC_003062	CATGG	2	10	2795305	2795314	20 %	20 %	40 %	20 %	15890040
1987	NC_003062	CGGCG	2	10	2795665	2795674	0 %	0 %	60 %	40 %	15890040
1988	NC_003062	ATGAA	2	10	2799037	2799046	60 %	20 %	20 %	0 %	15890043
1989	NC_003062	CGAAA	2	10	2803439	2803448	60 %	0 %	20 %	20 %	15890049
1990	NC_003062	GCGTG	2	10	2806783	2806792	0 %	20 %	60 %	20 %	15890051
1991	NC_003062	GGCAG	2	10	2806795	2806804	20 %	0 %	60 %	20 %	15890051
1992	NC_003062	CAGAA	2	10	2807844	2807853	60 %	0 %	20 %	20 %	15890051
1993	NC_003062	GGAGG	2	10	2808168	2808177	20 %	0 %	80 %	0 %	15890051
1994	NC_003062	GGCAA	2	10	2809647	2809656	40 %	0 %	40 %	20 %	159185390
1995	NC_003062	TGACA	2	10	2810936	2810945	40 %	20 %	20 %	20 %	159185391
1996	NC_003062	GCCCA	2	10	2811670	2811679	20 %	0 %	20 %	60 %	15890055
1997	NC_003062	CAGCG	2	10	2812254	2812263	20 %	0 %	40 %	40 %	15890055
1998	NC_003062	TCCGG	2	10	2814065	2814074	0 %	20 %	40 %	40 %	15890057
1999	NC_003062	CAGCG	2	10	2819342	2819351	20 %	0 %	40 %	40 %	159185395
2000	NC_003062	ACCGA	2	10	2821901	2821910	40 %	0 %	20 %	40 %	159185397

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