MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 chromosome circular

Total Repeats: 2014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003062	CGGCG	2	10	697089	697098	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
502	NC_003062	GCCCG	2	10	697447	697456	0 %	0 %	40 %	60 %	159184423
503	NC_003062	AGGGC	2	10	698664	698673	20 %	0 %	60 %	20 %	159184423
504	NC_003062	CGTTG	2	10	702463	702472	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
505	NC_003062	AGGGC	2	10	703415	703424	20 %	0 %	60 %	20 %	159184424
506	NC_003062	GGAAG	2	10	704203	704212	40 %	0 %	60 %	0 %	15888047
507	NC_003062	GGGGC	2	10	707036	707045	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
508	NC_003062	GGCGC	2	10	707501	707510	0 %	0 %	60 %	40 %	159184428
509	NC_003062	GCCGA	2	10	711071	711080	20 %	0 %	40 %	40 %	15888054
510	NC_003062	TGCTG	2	10	712978	712987	0 %	40 %	40 %	20 %	15888055
511	NC_003062	CGCCA	2	10	713869	713878	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
512	NC_003062	GCCTC	2	10	714795	714804	0 %	20 %	20 %	60 %	159184431
513	NC_003062	GAAGT	2	10	718118	718127	40 %	20 %	40 %	0 %	15888061
514	NC_003062	CGGCG	2	10	720046	720055	0 %	0 %	60 %	40 %	159184435
515	NC_003062	GACAT	2	10	720934	720943	40 %	20 %	20 %	20 %	159184436
516	NC_003062	GCCGC	2	10	722636	722645	0 %	0 %	40 %	60 %	159184437
517	NC_003062	GATGC	2	10	722762	722771	20 %	20 %	40 %	20 %	15888067
518	NC_003062	GCCGG	2	10	722789	722798	0 %	0 %	60 %	40 %	15888067
519	NC_003062	CGGAA	2	10	723065	723074	40 %	0 %	40 %	20 %	15888067
520	NC_003062	CGCGG	2	10	724199	724208	0 %	0 %	60 %	40 %	159184438
521	NC_003062	GGGCC	2	10	724889	724898	0 %	0 %	60 %	40 %	159184438
522	NC_003062	CACAT	2	10	725489	725498	40 %	20 %	0 %	40 %	159184439
523	NC_003062	ACGTC	2	10	725968	725977	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
524	NC_003062	CGTCT	2	10	726476	726485	0 %	40 %	20 %	40 %	159184440
525	NC_003062	CCGCA	2	10	726683	726692	20 %	0 %	20 %	60 %	159184440
526	NC_003062	CTGCC	2	10	728283	728292	0 %	20 %	20 %	60 %	159184441
527	NC_003062	GCCAG	2	10	728294	728303	20 %	0 %	40 %	40 %	159184441
528	NC_003062	GCGCC	2	10	733964	733973	0 %	0 %	40 %	60 %	15888077
529	NC_003062	CCGCG	2	10	738420	738429	0 %	0 %	40 %	60 %	159184445
530	NC_003062	GGGCA	2	10	741182	741191	20 %	0 %	60 %	20 %	159185406
531	NC_003062	TCGTT	2	10	742523	742532	0 %	60 %	20 %	20 %	159184447
532	NC_003062	AGGAG	2	10	743120	743129	40 %	0 %	60 %	0 %	15888088
533	NC_003062	CGGGA	2	10	743569	743578	20 %	0 %	60 %	20 %	15888088
534	NC_003062	TGGCT	2	10	743706	743715	0 %	40 %	40 %	20 %	15888088
535	NC_003062	CCTTG	2	10	748855	748864	0 %	40 %	20 %	40 %	159184450
536	NC_003062	GCTTG	2	10	748865	748874	0 %	40 %	40 %	20 %	159184450
537	NC_003062	CCGGT	2	10	749548	749557	0 %	20 %	40 %	40 %	15888095
538	NC_003062	CTGAC	2	10	749959	749968	20 %	20 %	20 %	40 %	15888095
539	NC_003062	CAGGG	2	10	750922	750931	20 %	0 %	60 %	20 %	15888096
540	NC_003062	CGCTT	2	10	751411	751420	0 %	40 %	20 %	40 %	15888096
541	NC_003062	CGCGC	2	10	753960	753969	0 %	0 %	40 %	60 %	15888099
542	NC_003062	TTCGC	2	10	755367	755376	0 %	40 %	20 %	40 %	159184453
543	NC_003062	AGGGC	2	10	757778	757787	20 %	0 %	60 %	20 %	159184454
544	NC_003062	GACGG	2	10	758714	758723	20 %	0 %	60 %	20 %	15888105
545	NC_003062	AACCG	2	10	759554	759563	40 %	0 %	20 %	40 %	159184455
546	NC_003062	GATCC	2	10	764363	764372	20 %	20 %	20 %	40 %	159184458
547	NC_003062	GCCGC	2	10	764989	764998	0 %	0 %	40 %	60 %	159184458
548	NC_003062	CGTTT	2	10	765548	765557	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
549	NC_003062	ACAGG	2	10	765604	765613	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
550	NC_003062	CGCGC	2	10	765912	765921	0 %	0 %	40 %	60 %	15888112
551	NC_003062	CGGGC	2	10	771886	771895	0 %	0 %	60 %	40 %	15888119
552	NC_003062	TTTTC	2	10	772979	772988	0 %	80 %	0 %	20 %	159184461
553	NC_003062	CATGC	2	10	773604	773613	20 %	20 %	20 %	40 %	159184461
554	NC_003062	GTTCG	2	10	776166	776175	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
555	NC_003062	CGGGA	2	10	776791	776800	20 %	0 %	60 %	20 %	15888123
556	NC_003062	GGCGG	2	10	780401	780410	0 %	0 %	80 %	20 %	15888127
557	NC_003062	ACGAG	2	10	780508	780517	40 %	0 %	40 %	20 %	15888127
558	NC_003062	CGCCA	2	10	781595	781604	20 %	0 %	20 %	60 %	15888127
559	NC_003062	TGGTC	2	10	784041	784050	0 %	40 %	40 %	20 %	159184464
560	NC_003062	TCCGG	2	10	785178	785187	0 %	20 %	40 %	40 %	426327213
561	NC_003062	CGGTT	2	10	786121	786130	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
562	NC_003062	GCGCC	2	10	787367	787376	0 %	0 %	40 %	60 %	15888132
563	NC_003062	TCTGC	2	10	788895	788904	0 %	40 %	20 %	40 %	159184466
564	NC_003062	TCCGC	2	10	789441	789450	0 %	20 %	20 %	60 %	159185429
565	NC_003062	TCCGG	2	10	793867	793876	0 %	20 %	40 %	40 %	15888141
566	NC_003062	GCCGC	2	10	795136	795145	0 %	0 %	40 %	60 %	15888142
567	NC_003062	GCCCG	2	10	795768	795777	0 %	0 %	40 %	60 %	15888143
568	NC_003062	GCGCT	2	10	796498	796507	0 %	20 %	40 %	40 %	159184469
569	NC_003062	ACCGC	2	10	796634	796643	20 %	0 %	20 %	60 %	159184469
570	NC_003062	AGGCG	2	10	797103	797112	20 %	0 %	60 %	20 %	159184469
571	NC_003062	GGCGC	2	10	797959	797968	0 %	0 %	60 %	40 %	159184469
572	NC_003062	TGCTT	2	10	800194	800203	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
573	NC_003062	GCGTT	2	10	800442	800451	0 %	40 %	40 %	20 %	15888145
574	NC_003062	AGGGC	2	10	801127	801136	20 %	0 %	60 %	20 %	15888145
575	NC_003062	CTCCG	2	10	803637	803646	0 %	20 %	20 %	60 %	159184470
576	NC_003062	CGGCG	2	10	804267	804276	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
577	NC_003062	GGATC	2	10	805301	805310	20 %	20 %	40 %	20 %	159184471
578	NC_003062	CAGGA	2	10	807871	807880	40 %	0 %	40 %	20 %	15888150
579	NC_003062	GCGCC	2	10	810394	810403	0 %	0 %	40 %	60 %	159184474
580	NC_003062	GGCGC	2	10	812340	812349	0 %	0 %	60 %	40 %	17934721
581	NC_003062	GGGAA	2	10	816244	816253	40 %	0 %	60 %	0 %	159184475
582	NC_003062	TGACA	2	10	816876	816885	40 %	20 %	20 %	20 %	159184476
583	NC_003062	TCCTG	2	10	819344	819353	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
584	NC_003062	ACAAA	2	10	819361	819370	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
585	NC_003062	CGCAC	2	10	821321	821330	20 %	0 %	20 %	60 %	159184480
586	NC_003062	CGGCA	2	10	821775	821784	20 %	0 %	40 %	40 %	159184480
587	NC_003062	TGTGA	2	10	822471	822480	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
588	NC_003062	AGGGC	2	10	823594	823603	20 %	0 %	60 %	20 %	159184482
589	NC_003062	GCCGT	2	10	829634	829643	0 %	20 %	40 %	40 %	159184484
590	NC_003062	TGCCG	2	10	834087	834096	0 %	20 %	40 %	40 %	159184486
591	NC_003062	CTCCG	2	10	838071	838080	0 %	20 %	20 %	60 %	159184489
592	NC_003062	GAAGC	2	10	838393	838402	40 %	0 %	40 %	20 %	159184489
593	NC_003062	TGAAA	2	10	839729	839738	60 %	20 %	20 %	0 %	159184490
594	NC_003062	GCGCG	2	10	840089	840098	0 %	0 %	60 %	40 %	159184491
595	NC_003062	GTCAT	2	10	842685	842694	20 %	40 %	20 %	20 %	159184492
596	NC_003062	TGCCG	3	15	844448	844462	0 %	20 %	40 %	40 %	159184493
597	NC_003062	TGCGC	2	10	848575	848584	0 %	20 %	40 %	40 %	15888187
598	NC_003062	ATGCC	2	10	848848	848857	20 %	20 %	20 %	40 %	15888188
599	NC_003062	AAGGA	2	10	849367	849376	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
600	NC_003062	GCAGG	2	10	849423	849432	20 %	0 %	60 %	20 %	159184496
601	NC_003062	CCACA	2	10	854865	854874	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
602	NC_003062	GGGCA	2	10	855097	855106	20 %	0 %	60 %	20 %	159184500
603	NC_003062	GTCAT	2	10	862184	862193	20 %	40 %	20 %	20 %	15888206
604	NC_003062	GGCAC	2	10	862674	862683	20 %	0 %	40 %	40 %	15888206
605	NC_003062	GACCG	2	10	863772	863781	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
606	NC_003062	ATATC	2	10	864730	864739	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
607	NC_003062	CCTCG	2	10	868635	868644	0 %	20 %	20 %	60 %	15888213
608	NC_003062	TCGGT	2	10	869132	869141	0 %	40 %	40 %	20 %	15888213
609	NC_003062	CCGTG	2	10	869322	869331	0 %	20 %	40 %	40 %	15888213
610	NC_003062	CGCTT	2	10	869703	869712	0 %	40 %	20 %	40 %	15888213
611	NC_003062	ACGGC	2	10	870385	870394	20 %	0 %	40 %	40 %	15888213
612	NC_003062	CCCGT	2	10	870458	870467	0 %	20 %	20 %	60 %	15888213
613	NC_003062	TGGCC	2	10	870718	870727	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
614	NC_003062	TGCGG	2	10	871372	871381	0 %	20 %	60 %	20 %	159184509
615	NC_003062	GATCC	2	10	873308	873317	20 %	20 %	20 %	40 %	15888217
616	NC_003062	GATCG	2	10	874353	874362	20 %	20 %	40 %	20 %	159184511
617	NC_003062	TGGCG	2	10	874568	874577	0 %	20 %	60 %	20 %	159184512
618	NC_003062	GCCGC	2	10	875838	875847	0 %	0 %	40 %	60 %	159184513
619	NC_003062	GCGAT	2	10	876965	876974	20 %	20 %	40 %	20 %	15888222
620	NC_003062	GGGCC	2	10	877255	877264	0 %	0 %	60 %	40 %	15888222
621	NC_003062	AGGCA	2	10	877571	877580	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
622	NC_003062	GGAGT	2	10	878939	878948	20 %	20 %	60 %	0 %	15888225
623	NC_003062	GCCTT	2	10	879010	879019	0 %	40 %	20 %	40 %	15888225
624	NC_003062	GGCGT	2	10	879801	879810	0 %	20 %	60 %	20 %	15888226
625	NC_003062	AATGC	2	10	880578	880587	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
626	NC_003062	GCGCG	2	10	881710	881719	0 %	0 %	60 %	40 %	159184518
627	NC_003062	CATTG	2	10	882022	882031	20 %	40 %	20 %	20 %	159184519
628	NC_003062	GGGGC	2	10	883363	883372	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
629	NC_003062	ACCGC	2	10	884644	884653	20 %	0 %	20 %	60 %	159184520
630	NC_003062	ATGGG	2	10	885647	885656	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
631	NC_003062	GGCAG	2	10	885817	885826	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
632	NC_003062	CCTTG	2	10	889057	889066	0 %	40 %	20 %	40 %	15888236
633	NC_003062	CGGCG	2	10	892383	892392	0 %	0 %	60 %	40 %	15888240
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646	NC_003062	CCGGC	2	10	911490	911499	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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760	NC_003062	TGCGA	2	10	1044636	1044645	20 %	20 %	40 %	20 %	15888392
761	NC_003062	ATTCT	2	10	1048447	1048456	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
762	NC_003062	TATCT	2	10	1049101	1049110	20 %	60 %	0 %	20 %	159184596
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